| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is yhaN [H]
Identifier: 118476628
GI number: 118476628
Start: 1034184
End: 1037108
Strand: Direct
Name: yhaN [H]
Synonym: BALH_0904
Alternate gene names: 118476628
Gene position: 1034184-1037108 (Clockwise)
Preceding gene: 118476627
Following gene: 118476629
Centisome position: 19.67
GC content: 39.32
Gene sequence:
>2925_bases ATGAGAATGGAAAAACTCCATATTTATGGGTACGGAAAATTAGAAAATGTGGAAATGGATCTGTCAATGTTGACGGTGTT GTACGGTGAAAATGAAGCGGGGAAATCGACAATTCGTTCATTTATGAAAAGTATTTTATTCGGTTTTCCGACGAGAGGAC AGCGCCGTTATGAGCCGAAAGAAGGCGGCAAGTACGGCGGTGCGATGACTGTGCAAACAGAGAAGTACGGCCGTTTGAAA ATTGAACGATTGCCAAAGACGGCAGCTGGTGAGGTGACCGTTTATTTTGAAGACGGGAAAACGGGCGGCGAGGAAATTTT ACACGATATATTAAGCGGGATGAATGAGAGTTTATTTGAATCTGTCTTTTCATTCGATATGCACGGTCTTCAAAACATTC ATCAGCTTGGTGAAGCGGATATCGGCAATTATTTATTTTCAGCAAGCGCAGTCGGAAGTGATGCGTTATTGCAGCTAGAT AAAAAGCTAGAAAAAGAAATGGATCAGCGCTTTAAACCGAGCGGGCGTAAACCAGAAATTAACGTGTCACTACAAGAGAT GAAGAAACTTGAAGAGAAGATGAAAGAGTGGCAAGGGAAAATTGGCACGTATGAAAAGCAAGTGGAGCAGTTAAAAGAAA GTGAAGAGAAACTTGCTTCTGTTCGCGTGGAAAAAGAGAATGCAGAAAAGCGAAAGCAAGATTATGAAATATTAGCAGCA CTTGAACCTCTCGTTATTGAAAAGCGTGCGCACGAGAAAGTGTTAGAAAACGAGAACGTGCAATTTCCTGTAAACGGAAT GGCGCGTTATGAAGCAATTAAGGCGAAGATGGAGCCGCTTCAATTACAAGTTGATTCGCTGCATAAAAAAATAGAGAATG TGCAGTCAGAAATAGAATCGATTCAAATAGATGAAGATTTTTTACAAAAAGAAAGTTATGTAGAAGAACTTCGTATGCAG CATATGTCTTACGAAAATGCACGCCAAGAAATGCGTGATCTGACAGGAGCAATTACGAATATAAAAGAAGAGCTGGCAGA ACTAGAGCAACAAATTGGTGCTACTTTTGAAAAAGAAACAGTCCTTTCGTTTGATATGAGTTTGGCAACGAAAGAGTTAA TTACGCAAGCAGTACAAAAGGCGCGCGAATTAGAAACGCAAAAAGCACAGCTTGATGATCGTTTTAAAGTAGCGCAGGAG CAATTAGAAGAACAAGAAGAAAATATAAGACAAATTAAGCAACAAATGTTAGCGGATGAAGAGCGAAATGCGTTAGTTGA GAAAGAGAAGTCGTTCCAAGATGCAGCGTTTATCGGTATGGGTGCTGAGAGAATGAAGCGCAAGTACGAGGAAAAAGCAG GATCGGCTATGCAAAAGAAAAAGCAGTGGCAAAGAGTTTGTCTTCTGTTACTCCTTATTAACACAGGCATTTTATTCACA AGCTTATTTATAGACAATCGCCCGCTTTTATTTATTAGTGTCATCGTTTTTGTAGGGATTGTTCTTGCCCTCGTTTTATA TAAAGATCCGTCAAGTGGATTACAAGAAGAACTTCTGACTCTTCAGCAAAGTGCTGGCGGAAGACAAAGTGAAGAAGCGA TGTCTGTGCGCTATGAGTTAGAAAAAGATGAAGAGATACGTAAATTATTTGAGCGTGAGTCTTATAAATTACAGCAAATG GAGCGAGCGTATGATAAAGTCGTTTCATCGTATGAGGAATGGGAGAGGGAAACGTTCCGCACGAGCGAACAAGTAAATGC GTATAAAAAGCGCTATACGTTCCCTGAGTTTTATACGTATGCACACATCTTGCCGGCGTTTGAGCGTATGGAAAAGATGC AGCAATTATATCGTGATTTAGAGAAGAAAAGTGAGCGCAAATCTTCATTATTTGAAATGATTTCGCAATTTGAACATAAA CTAGAAACTGTTATCGGTAGTGTAGAGTATAGTAAGCTGCACGAGGCGCAAAGCCGTATGCAAAATGAGAAAGAGAAGCG CCAAACTTGTAAGCAGTTAAAAGAGAAACTAGCTGAATGGCAAGAAGAATATGAGTTTATGCAAGAGCAATTAAAGCAAC TATTAGTAGAACGAGACAGTTTATGGCATATTGCAGAGTCTACAAATGAAGAGATGTTTTTGGAAGCAGGTAAACTAGCG GAAAAACGTGAAGATGCTGAGAAGCAAGTAGGGCGTTTATTACCGCAAATTGATCTGTTAGAACAGCGTTTAACGAGTTT ATCATTAGCTGAACATTATGAGGCTGAAGGTTATGATGAAAAATTAAAGCGAGAACTGACAACTGTTCAAAACTGTCTTA CGAAAGAGAAAGAACTAACAGAGCGTATTGCGAAACATCGTATGGAAATTGCGAATTTAGAAGAAGGTAGTACGTACGGT GATTTACTACACGAATGGGAAATGAAAAAAGCGCAAGTGCGTGAACAAGTAAAGAAGTGGGCTGCTTATGCGGCCGCAAA GACAGTGTTAACGAAAACGAAGCAATATTATCATGAAGTACATCTTCCTCGTATTTTACAAAAATCAGAAGAGTATTTCG TCTATTTAACGGGCGGCCGATATAGTAAAATCTTTTCACCGTCAGAGGCGGAACCGTTTATTGTGGAGCGTAATGATGGT ATGCGTTTTTATAGTCATGAACTAAGCCAAGCGACAGCGGAGCAGTTGTATTTATCGCTGAGATTTGCATTAGCAAAAAC ATTTGAGCATGATTATCCATTTATTATTGATGACAGTTTCGTGCACTTTGATGCGGTAAGGACAAATCGGACGATTGAAC TTATAAAGGAAATTGCACAAGATAGACAAGTGATCTTCTTTACATGTCATGCGCATTTATTAACGTATTTTACAGAAAAA CAGATTATAAAATTAACGCATAAGCGTAAAGAAAATGAGTTGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAGTATTGAATCTTTTACAGAAGAAGAGAAGAAAGAGATTCAAAAGGAAGCAGAAAACATTATTTTAGAACAATTATTC CAGCAAGAGAGGGATAAGAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTGCTATACTAAAAGTAACTGATTTGGTGGAGGAATTCGAATGAAAAAGAAAATTGCAGAGTATGAAGTTGGTGAACAA GTCGATATTTTCTTGTTAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 974; Mature: 974
Protein sequence:
>974_residues MRMEKLHIYGYGKLENVEMDLSMLTVLYGENEAGKSTIRSFMKSILFGFPTRGQRRYEPKEGGKYGGAMTVQTEKYGRLK IERLPKTAAGEVTVYFEDGKTGGEEILHDILSGMNESLFESVFSFDMHGLQNIHQLGEADIGNYLFSASAVGSDALLQLD KKLEKEMDQRFKPSGRKPEINVSLQEMKKLEEKMKEWQGKIGTYEKQVEQLKESEEKLASVRVEKENAEKRKQDYEILAA LEPLVIEKRAHEKVLENENVQFPVNGMARYEAIKAKMEPLQLQVDSLHKKIENVQSEIESIQIDEDFLQKESYVEELRMQ HMSYENARQEMRDLTGAITNIKEELAELEQQIGATFEKETVLSFDMSLATKELITQAVQKARELETQKAQLDDRFKVAQE QLEEQEENIRQIKQQMLADEERNALVEKEKSFQDAAFIGMGAERMKRKYEEKAGSAMQKKKQWQRVCLLLLLINTGILFT SLFIDNRPLLFISVIVFVGIVLALVLYKDPSSGLQEELLTLQQSAGGRQSEEAMSVRYELEKDEEIRKLFERESYKLQQM ERAYDKVVSSYEEWERETFRTSEQVNAYKKRYTFPEFYTYAHILPAFERMEKMQQLYRDLEKKSERKSSLFEMISQFEHK LETVIGSVEYSKLHEAQSRMQNEKEKRQTCKQLKEKLAEWQEEYEFMQEQLKQLLVERDSLWHIAESTNEEMFLEAGKLA EKREDAEKQVGRLLPQIDLLEQRLTSLSLAEHYEAEGYDEKLKRELTTVQNCLTKEKELTERIAKHRMEIANLEEGSTYG DLLHEWEMKKAQVREQVKKWAAYAAAKTVLTKTKQYYHEVHLPRILQKSEEYFVYLTGGRYSKIFSPSEAEPFIVERNDG MRFYSHELSQATAEQLYLSLRFALAKTFEHDYPFIIDDSFVHFDAVRTNRTIELIKEIAQDRQVIFFTCHAHLLTYFTEK QIIKLTHKRKENEL
Sequences:
>Translated_974_residues MRMEKLHIYGYGKLENVEMDLSMLTVLYGENEAGKSTIRSFMKSILFGFPTRGQRRYEPKEGGKYGGAMTVQTEKYGRLK IERLPKTAAGEVTVYFEDGKTGGEEILHDILSGMNESLFESVFSFDMHGLQNIHQLGEADIGNYLFSASAVGSDALLQLD KKLEKEMDQRFKPSGRKPEINVSLQEMKKLEEKMKEWQGKIGTYEKQVEQLKESEEKLASVRVEKENAEKRKQDYEILAA LEPLVIEKRAHEKVLENENVQFPVNGMARYEAIKAKMEPLQLQVDSLHKKIENVQSEIESIQIDEDFLQKESYVEELRMQ HMSYENARQEMRDLTGAITNIKEELAELEQQIGATFEKETVLSFDMSLATKELITQAVQKARELETQKAQLDDRFKVAQE QLEEQEENIRQIKQQMLADEERNALVEKEKSFQDAAFIGMGAERMKRKYEEKAGSAMQKKKQWQRVCLLLLLINTGILFT SLFIDNRPLLFISVIVFVGIVLALVLYKDPSSGLQEELLTLQQSAGGRQSEEAMSVRYELEKDEEIRKLFERESYKLQQM ERAYDKVVSSYEEWERETFRTSEQVNAYKKRYTFPEFYTYAHILPAFERMEKMQQLYRDLEKKSERKSSLFEMISQFEHK LETVIGSVEYSKLHEAQSRMQNEKEKRQTCKQLKEKLAEWQEEYEFMQEQLKQLLVERDSLWHIAESTNEEMFLEAGKLA EKREDAEKQVGRLLPQIDLLEQRLTSLSLAEHYEAEGYDEKLKRELTTVQNCLTKEKELTERIAKHRMEIANLEEGSTYG DLLHEWEMKKAQVREQVKKWAAYAAAKTVLTKTKQYYHEVHLPRILQKSEEYFVYLTGGRYSKIFSPSEAEPFIVERNDG MRFYSHELSQATAEQLYLSLRFALAKTFEHDYPFIIDDSFVHFDAVRTNRTIELIKEIAQDRQVIFFTCHAHLLTYFTEK QIIKLTHKRKENEL >Mature_974_residues MRMEKLHIYGYGKLENVEMDLSMLTVLYGENEAGKSTIRSFMKSILFGFPTRGQRRYEPKEGGKYGGAMTVQTEKYGRLK IERLPKTAAGEVTVYFEDGKTGGEEILHDILSGMNESLFESVFSFDMHGLQNIHQLGEADIGNYLFSASAVGSDALLQLD KKLEKEMDQRFKPSGRKPEINVSLQEMKKLEEKMKEWQGKIGTYEKQVEQLKESEEKLASVRVEKENAEKRKQDYEILAA LEPLVIEKRAHEKVLENENVQFPVNGMARYEAIKAKMEPLQLQVDSLHKKIENVQSEIESIQIDEDFLQKESYVEELRMQ HMSYENARQEMRDLTGAITNIKEELAELEQQIGATFEKETVLSFDMSLATKELITQAVQKARELETQKAQLDDRFKVAQE QLEEQEENIRQIKQQMLADEERNALVEKEKSFQDAAFIGMGAERMKRKYEEKAGSAMQKKKQWQRVCLLLLLINTGILFT SLFIDNRPLLFISVIVFVGIVLALVLYKDPSSGLQEELLTLQQSAGGRQSEEAMSVRYELEKDEEIRKLFERESYKLQQM ERAYDKVVSSYEEWERETFRTSEQVNAYKKRYTFPEFYTYAHILPAFERMEKMQQLYRDLEKKSERKSSLFEMISQFEHK LETVIGSVEYSKLHEAQSRMQNEKEKRQTCKQLKEKLAEWQEEYEFMQEQLKQLLVERDSLWHIAESTNEEMFLEAGKLA EKREDAEKQVGRLLPQIDLLEQRLTSLSLAEHYEAEGYDEKLKRELTTVQNCLTKEKELTERIAKHRMEIANLEEGSTYG DLLHEWEMKKAQVREQVKKWAAYAAAKTVLTKTKQYYHEVHLPRILQKSEEYFVYLTGGRYSKIFSPSEAEPFIVERNDG MRFYSHELSQATAEQLYLSLRFALAKTFEHDYPFIIDDSFVHFDAVRTNRTIELIKEIAQDRQVIFFTCHAHLLTYFTEK QIIKLTHKRKENEL
Specific function: Unknown
COG id: COG4717
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Single-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 114198; Mature: 114198
Theoretical pI: Translated: 5.31; Mature: 5.31
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRMEKLHIYGYGKLENVEMDLSMLTVLYGENEAGKSTIRSFMKSILFGFPTRGQRRYEPK CCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC EGGKYGGAMTVQTEKYGRLKIERLPKTAAGEVTVYFEDGKTGGEEILHDILSGMNESLFE CCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHH SVFSFDMHGLQNIHQLGEADIGNYLFSASAVGSDALLQLDKKLEKEMDQRFKPSGRKPEI HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC NVSLQEMKKLEEKMKEWQGKIGTYEKQVEQLKESEEKLASVRVEKENAEKRKQDYEILAA CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEPLVIEKRAHEKVLENENVQFPVNGMARYEAIKAKMEPLQLQVDSLHKKIENVQSEIES HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IQIDEDFLQKESYVEELRMQHMSYENARQEMRDLTGAITNIKEELAELEQQIGATFEKET CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH VLSFDMSLATKELITQAVQKARELETQKAQLDDRFKVAQEQLEEQEENIRQIKQQMLADE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH ERNALVEKEKSFQDAAFIGMGAERMKRKYEEKAGSAMQKKKQWQRVCLLLLLINTGILFT HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLFIDNRPLLFISVIVFVGIVLALVLYKDPSSGLQEELLTLQQSAGGRQSEEAMSVRYEL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC EKDEEIRKLFERESYKLQQMERAYDKVVSSYEEWERETFRTSEQVNAYKKRYTFPEFYTY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH AHILPAFERMEKMQQLYRDLEKKSERKSSLFEMISQFEHKLETVIGSVEYSKLHEAQSRM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QNEKEKRQTCKQLKEKLAEWQEEYEFMQEQLKQLLVERDSLWHIAESTNEEMFLEAGKLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH EKREDAEKQVGRLLPQIDLLEQRLTSLSLAEHYEAEGYDEKLKRELTTVQNCLTKEKELT HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ERIAKHRMEIANLEEGSTYGDLLHEWEMKKAQVREQVKKWAAYAAAKTVLTKTKQYYHEV HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLPRILQKSEEYFVYLTGGRYSKIFSPSEAEPFIVERNDGMRFYSHELSQATAEQLYLSL HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RFALAKTFEHDYPFIIDDSFVHFDAVRTNRTIELIKEIAQDRQVIFFTCHAHLLTYFTEK HHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH QIIKLTHKRKENEL HHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MRMEKLHIYGYGKLENVEMDLSMLTVLYGENEAGKSTIRSFMKSILFGFPTRGQRRYEPK CCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC EGGKYGGAMTVQTEKYGRLKIERLPKTAAGEVTVYFEDGKTGGEEILHDILSGMNESLFE CCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHH SVFSFDMHGLQNIHQLGEADIGNYLFSASAVGSDALLQLDKKLEKEMDQRFKPSGRKPEI HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC NVSLQEMKKLEEKMKEWQGKIGTYEKQVEQLKESEEKLASVRVEKENAEKRKQDYEILAA CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEPLVIEKRAHEKVLENENVQFPVNGMARYEAIKAKMEPLQLQVDSLHKKIENVQSEIES HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IQIDEDFLQKESYVEELRMQHMSYENARQEMRDLTGAITNIKEELAELEQQIGATFEKET CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH VLSFDMSLATKELITQAVQKARELETQKAQLDDRFKVAQEQLEEQEENIRQIKQQMLADE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH ERNALVEKEKSFQDAAFIGMGAERMKRKYEEKAGSAMQKKKQWQRVCLLLLLINTGILFT HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLFIDNRPLLFISVIVFVGIVLALVLYKDPSSGLQEELLTLQQSAGGRQSEEAMSVRYEL HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC EKDEEIRKLFERESYKLQQMERAYDKVVSSYEEWERETFRTSEQVNAYKKRYTFPEFYTY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH AHILPAFERMEKMQQLYRDLEKKSERKSSLFEMISQFEHKLETVIGSVEYSKLHEAQSRM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QNEKEKRQTCKQLKEKLAEWQEEYEFMQEQLKQLLVERDSLWHIAESTNEEMFLEAGKLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH EKREDAEKQVGRLLPQIDLLEQRLTSLSLAEHYEAEGYDEKLKRELTTVQNCLTKEKELT HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ERIAKHRMEIANLEEGSTYGDLLHEWEMKKAQVREQVKKWAAYAAAKTVLTKTKQYYHEV HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLPRILQKSEEYFVYLTGGRYSKIFSPSEAEPFIVERNDGMRFYSHELSQATAEQLYLSL HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RFALAKTFEHDYPFIIDDSFVHFDAVRTNRTIELIKEIAQDRQVIFFTCHAHLLTYFTEK HHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH QIIKLTHKRKENEL HHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377 [H]