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The map label for this gene is ag45 [H]

Identifier: 117921786

GI number: 117921786

Start: 4016318

End: 4017787

Strand: Reverse

Name: ag45 [H]

Synonym: Shewana3_3348

Alternate gene names: 117921786

Gene position: 4017787-4016318 (Counterclockwise)

Preceding gene: 117921787

Following gene: 117921785

Centisome position: 80.8

GC content: 51.43

Gene sequence:

>1470_bases
ATGAAATTACAGCGGTGGTTTAAAAACAGTGGAGTGGTGCTCGCTAGCCTATTCTGCGTTGCAATATTGAGCGGATTCTC
ACCAGCAGTTTGGGCAATGACCGAAGGAACAGAACGGCTCGATTTAACCGCTGCATCAGTGGGGTATATTGCCGTATGCG
TCTTCGTGCTCGCCTATATTTTGGTGATGGCCGAAGAGGCGCTGCACCTGCGTAAATCCAAACCCGTATTGGTCGCAGCC
GGCATTATTTGGGGCATGATAGGTTTTGTGTATGTGCAAAATGGCATGTCGGAGGTTTCCGAGGCAGCCTTTAAGCACAA
TCTACTGGAATACGCCGAGTTATTACTCTTCCTATTAGTGGCGATGACTTATATCAACGCCATGGAGGAACGTAACTTAT
TCGATGCGATCCGCGGTTGGCTAGTCGGACGGGGATTTAGTCTGCGAACCGTGTTCTGGCTGACGGGGTTTATGGCGTTC
TTTATCTCGCCAGTGGCCGATAACTTAACCACTGCATTATTGATGTGTGCCGTGGTGATGAAGGTCGGCGCGGGGCAGCG
CAAATTTATTACGCTGGCGTGTATCAACATTGTGGTTGCGGCGAATGCGGGCGGTGCCTTTAGTCCCTTTGGTGATATCA
CCACCCTGATGGTGTGGCAAAAGGGCTTAGTGCACTTTGCTGACTTCTTCCATCTGTTTATTCCCGCCTTGGTCAACTTT
GCCTTGCCTGCGGCGATTATGAGCGTGTTTATCCCACGTTATGTGCCAGAGCCTGAAAAAGAGCAGGTGTACACTAAACC
CGGTGCTAAACGTATCGTGGCGTTATTCCTGCTGACCATTGCGACGGCGGTGTGTGCTCATTCCTTCTTCGGCATGCCAC
CTGTGCTTGGGATGATGACGGGTCTGGGCTTCCTGCAGTTCTTCGGTTATTACCTGCGTAAGACCTTCGATAAATCCGTT
GCTCGTGAGCGTGCGAAGGCGGAATTACGTCAGGATAAACAACGGCTACAACAACTTGGCAGCGTGGTGCCCTTCGATGT
GTTTAGCCGGATTTCCCGCGCCGAATGGGATACCTTACTGTTCTTCTACGGTGTGGTGTTATGTGTGGGCGGCCTTGGCT
TTATGGGGTATTTAAGCTTAGTGTCTGAGGCACTGTATTCCCATTGGGATGCAACCTATGCCAACGTGGCTATCGGTCTG
TTGTCTTCCATTGTCGATAACATTCCAGTGATGTTCGCCGTGTTGACCATGAACCCAGAGATGGCCCTCGGTCAATGGTT
ACTGGTGACCTTAACCGCGGGCGTTGGGGGCAGTTTGTTATCCATCGGCAGTGCGGCAGGGGTTGCCTTGATGGGACAGG
CGAGGGGGATTTACACCTTCGGCGCCCATTTACGTTGGACGCCTGTGATCGCGCTTGGCTATATTGCTAGCATTTTGGTA
CATATGTGGCTCAATGCGGCAATGTTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTTATCGGGAAATGCATAGAAAGTTGCGTTTTGTCAAAATTTACAGAGCCCGAGCTATGGTAATTTTCGAACTAATTTC
CCTTGCAGAGATCAACTTTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAACAAATGAAACACAATGTATCGTTGTTTGTTTTTAGCATTAAATGTTTTATTGATGTGTTTCACAGATTATTCATCTG
ACCATGTTAGGTGGTATTAA

Product: Na+/H+ antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 489; Mature: 489

Protein sequence:

>489_residues
MKLQRWFKNSGVVLASLFCVAILSGFSPAVWAMTEGTERLDLTAASVGYIAVCVFVLAYILVMAEEALHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYVQNGMSEVSEAAFKHNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLACINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFADFFHLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPRYVPEPEKEQVYTKPGAKRIVALFLLTIATAVCAHSFFGMPPVLGMMTGLGFLQFFGYYLRKTFDKSV
ARERAKAELRQDKQRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEALYSHWDATYANVAIGL
LSSIVDNIPVMFAVLTMNPEMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYIASILV
HMWLNAAMF

Sequences:

>Translated_489_residues
MKLQRWFKNSGVVLASLFCVAILSGFSPAVWAMTEGTERLDLTAASVGYIAVCVFVLAYILVMAEEALHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYVQNGMSEVSEAAFKHNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLACINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFADFFHLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPRYVPEPEKEQVYTKPGAKRIVALFLLTIATAVCAHSFFGMPPVLGMMTGLGFLQFFGYYLRKTFDKSV
ARERAKAELRQDKQRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEALYSHWDATYANVAIGL
LSSIVDNIPVMFAVLTMNPEMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYIASILV
HMWLNAAMF
>Mature_489_residues
MKLQRWFKNSGVVLASLFCVAILSGFSPAVWAMTEGTERLDLTAASVGYIAVCVFVLAYILVMAEEALHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYVQNGMSEVSEAAFKHNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLACINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFADFFHLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPRYVPEPEKEQVYTKPGAKRIVALFLLTIATAVCAHSFFGMPPVLGMMTGLGFLQFFGYYLRKTFDKSV
ARERAKAELRQDKQRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEALYSHWDATYANVAIGL
LSSIVDNIPVMFAVLTMNPEMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYIASILV
HMWLNAAMF

Specific function: Unknown

COG id: COG1055

COG function: function code P; Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CitM (TC 2.A.11) transporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000802
- InterPro:   IPR004680 [H]

Pfam domain/function: PF03600 CitMHS [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53597; Mature: 53597

Theoretical pI: Translated: 8.72; Mature: 8.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
4.5 %Met     (Translated Protein)
5.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
4.5 %Met     (Mature Protein)
5.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKLQRWFKNSGVVLASLFCVAILSGFSPAVWAMTEGTERLDLTAASVGYIAVCVFVLAYI
CCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVMAEEALHLRKSKPVLVAAGIIWGMIGFVYVQNGMSEVSEAAFKHNLLEYAELLLFLLV
HHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAFFISPVADNLTTALLMCAVVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVGAGQRKFITLACINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFADFFHLFIPALVNF
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALPAAIMSVFIPRYVPEPEKEQVYTKPGAKRIVALFLLTIATAVCAHSFFGMPPVLGMMT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
GLGFLQFFGYYLRKTFDKSVARERAKAELRQDKQRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
FFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEALYSHWDATYANVAIGLLSSIVDNIPVMFAVLTMNPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCC
MALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYIASILV
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
HMWLNAAMF
HHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11234002 [H]