Definition Shewanella sp. ANA-3 chromosome chromosome 1, complete sequence.
Accession NC_008577
Length 4,972,204

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 117920478

Identifier: 117920478

GI number: 117920478

Start: 2432306

End: 2434015

Strand: Direct

Name: 117920478

Synonym: Shewana3_2033

Alternate gene names: NA

Gene position: 2432306-2434015 (Clockwise)

Preceding gene: 117920477

Following gene: 117920479

Centisome position: 48.92

GC content: 39.77

Gene sequence:

>1710_bases
ATGGAACAATTGAAACAGTTTGAAGTAGAGAAGCAATCGGCTATTAGTACCTTACAGCAGTTGAAAGAAGTGTTGACTGA
GTTAGGGGCTATAGGAATGGATGTTTCAGTCGATATTCAAAAATTAGAAGCTGCATTGAATACAATCAAAGATGATGTAT
TGCGGATTGCTTTGCTCGGTGCTTTTTCCGATGGGAAGACCAGTGTAATTGCGGCTTGGTTGGGCAAGATTATGGCTGAT
ATGAAGATTGATATGGATGAATCCTCAGACCGTTTAGCTATTTACAGACCTGAAGGCCTGCCTGATAAATGCGAAATTGT
TGATACTCCGGGGCTATTTGGCGATAAGCAAAAAGAAGATGAAAACCTTCAGATTATGTACGAGGATATAACTCGCAATT
ACATATCTGAGGCTCATTTGATTCTGTATGTAGTAGATGCTACCAATCCGCTAAAAGAAAGCCATCACCAGATAGTACGT
TGGGTACTACGGGATTTGAATAAGCTAAGCTCTACCGTATTTATCATTAACAAAATGGATGAAGTAACAGATTTGTCTGA
TCCTACACTATTTTCCGAACAGGCAGCCATAAAAACGGAAACTCTAAAAGAGAAACTCCAACGTGCAGCAAGCCTCACAG
ATGAGGAAGTTAAGGCACTTCGTATAGTCTGTATCGCATCAAATCCGAATGGGCGCGGCTTACCGTTTTGGTTTGAAAAG
CTTGATGTATATCGAAACCGCTCTCGCATTGATGAGTTGAAAAAAACTACTACATCGATTTTAGATAGCAGTGTACGTAG
TACTATTATCGCTAAAACTGGTATTGATGTCGTCGCAGGAGTTGTTAGTCAGCGGGTTCTTGCTGCGCAGAATTCCCTTG
ATGAACTTGAAGTCTTTGCCAAGCAACGTGAGCAGGAATGCGAAAGGATCCGTGAGGATTTAAATAACGGGAAAAGGGAA
GTTAAGCGCTTGGCTGGTCAGCTTTTTAATGAACTAGAGGGCTTAGAAAAGCAGCTGATGGGAAAGCTACGTCCTTTAGA
TTTTGAAGATATACGTCCTTTTATGGAGGATGAAATTGGTTATACGCAAGATAATATTGGCTACAAACTTTCGATCAAAA
TTAAAACAATAGTTGACTCTTATTATGACCAAACGTCTCTTATTACGTCTAGATTAAATCAGGAGATCAATAGCCAGCTA
GACTCAAGTACCAGCTTCTTAGACTCATTAGGTAGCGATGCACTTAAGTTTGTTGGGAGCGGCCTGTCAAATGTTTCAAA
GATAAGCCCAGATGCTATTAAAGCAACAATTTTTGTGGCCAGAGATCTCTTAGCTAAAACCACAGGAGTTGTTTATAAAT
TTAAACCTTGGCAGGCTTCTAAACTTGCTGCTGGTATCAGTAAGTGGGCCGGGCCTGCGGGTATGGTGTTTAGTCTAACG
GCTGATTTCTACAATGCTTATAAAGCAAGTGAGCTAGAAGCAGAGCTTAAAGAGACTAAGAATGAGATTAGCACAATGAT
CAAAGAAGCGTTTAAAGACTTATATGATATTGTCAGTGATGATCAGAAACTTTTTGATTTCTTCGCACCACAACTAAAAA
TCTTTGACCAACTGATAACTGATACTGAATCGCAAGTGAAAGATATCCGAGTTAGTCAAAATTCACTTCGGGGGATTAGT
GAAAAATTAAAATCGCTCCCCAGTTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTAACACACTAGAGAACAATCTAAATGTTCCAGTGCATGTTCTCGAGAAGCAGATAAAAGTTCTTACCATTATTTTGAA
TAAAGTCAGGGATATGCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAACTCATTATAATATTGAAATTTATCGCCTTACAGCTGATACTGCGGGGCGGTAATTTTTCAACGAGTTTGAAGGTAA
TGTAATACGCCCATTGTTAC

Product: GTP-binding protein, HSR1-related

Products: NA

Alternate protein names: LeoA Protein

Number of amino acids: Translated: 569; Mature: 569

Protein sequence:

>569_residues
MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLGAFSDGKTSVIAAWLGKIMAD
MKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKEDENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVR
WVLRDLNKLSSTVFIINKMDEVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK
LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFAKQREQECERIREDLNNGKRE
VKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIGYTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQL
DSSTSFLDSLGSDALKFVGSGLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT
ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLITDTESQVKDIRVSQNSLRGIS
EKLKSLPSY

Sequences:

>Translated_569_residues
MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLGAFSDGKTSVIAAWLGKIMAD
MKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKEDENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVR
WVLRDLNKLSSTVFIINKMDEVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK
LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFAKQREQECERIREDLNNGKRE
VKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIGYTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQL
DSSTSFLDSLGSDALKFVGSGLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT
ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLITDTESQVKDIRVSQNSLRGIS
EKLKSLPSY
>Mature_569_residues
MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLGAFSDGKTSVIAAWLGKIMAD
MKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKEDENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVR
WVLRDLNKLSSTVFIINKMDEVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK
LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFAKQREQECERIREDLNNGKRE
VKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIGYTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQL
DSSTSFLDSLGSDALKFVGSGLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT
ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLITDTESQVKDIRVSQNSLRGIS
EKLKSLPSY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64002; Mature: 64002

Theoretical pI: Translated: 4.74; Mature: 4.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFSDGKTSVIAAWLGKIMADMKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKED
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC
ENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVRWVLRDLNKLSSTVFIINKMD
CCCEEHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHH
EVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHH
LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
KQREQECERIREDLNNGKREVKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIG
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHCC
YTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQLDSSTSFLDSLGSDALKFVGS
CCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHC
GLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT
CHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEH
ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLIT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DTESQVKDIRVSQNSLRGISEKLKSLPSY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFSDGKTSVIAAWLGKIMADMKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKED
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC
ENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVRWVLRDLNKLSSTVFIINKMD
CCCEEHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHH
EVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHH
LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
KQREQECERIREDLNNGKREVKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIG
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHCC
YTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQLDSSTSFLDSLGSDALKFVGS
CCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHC
GLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT
CHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEH
ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLIT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DTESQVKDIRVSQNSLRGISEKLKSLPSY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA