| Definition | Shewanella sp. ANA-3 chromosome chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008577 |
| Length | 4,972,204 |
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The map label for this gene is 117920478
Identifier: 117920478
GI number: 117920478
Start: 2432306
End: 2434015
Strand: Direct
Name: 117920478
Synonym: Shewana3_2033
Alternate gene names: NA
Gene position: 2432306-2434015 (Clockwise)
Preceding gene: 117920477
Following gene: 117920479
Centisome position: 48.92
GC content: 39.77
Gene sequence:
>1710_bases ATGGAACAATTGAAACAGTTTGAAGTAGAGAAGCAATCGGCTATTAGTACCTTACAGCAGTTGAAAGAAGTGTTGACTGA GTTAGGGGCTATAGGAATGGATGTTTCAGTCGATATTCAAAAATTAGAAGCTGCATTGAATACAATCAAAGATGATGTAT TGCGGATTGCTTTGCTCGGTGCTTTTTCCGATGGGAAGACCAGTGTAATTGCGGCTTGGTTGGGCAAGATTATGGCTGAT ATGAAGATTGATATGGATGAATCCTCAGACCGTTTAGCTATTTACAGACCTGAAGGCCTGCCTGATAAATGCGAAATTGT TGATACTCCGGGGCTATTTGGCGATAAGCAAAAAGAAGATGAAAACCTTCAGATTATGTACGAGGATATAACTCGCAATT ACATATCTGAGGCTCATTTGATTCTGTATGTAGTAGATGCTACCAATCCGCTAAAAGAAAGCCATCACCAGATAGTACGT TGGGTACTACGGGATTTGAATAAGCTAAGCTCTACCGTATTTATCATTAACAAAATGGATGAAGTAACAGATTTGTCTGA TCCTACACTATTTTCCGAACAGGCAGCCATAAAAACGGAAACTCTAAAAGAGAAACTCCAACGTGCAGCAAGCCTCACAG ATGAGGAAGTTAAGGCACTTCGTATAGTCTGTATCGCATCAAATCCGAATGGGCGCGGCTTACCGTTTTGGTTTGAAAAG CTTGATGTATATCGAAACCGCTCTCGCATTGATGAGTTGAAAAAAACTACTACATCGATTTTAGATAGCAGTGTACGTAG TACTATTATCGCTAAAACTGGTATTGATGTCGTCGCAGGAGTTGTTAGTCAGCGGGTTCTTGCTGCGCAGAATTCCCTTG ATGAACTTGAAGTCTTTGCCAAGCAACGTGAGCAGGAATGCGAAAGGATCCGTGAGGATTTAAATAACGGGAAAAGGGAA GTTAAGCGCTTGGCTGGTCAGCTTTTTAATGAACTAGAGGGCTTAGAAAAGCAGCTGATGGGAAAGCTACGTCCTTTAGA TTTTGAAGATATACGTCCTTTTATGGAGGATGAAATTGGTTATACGCAAGATAATATTGGCTACAAACTTTCGATCAAAA TTAAAACAATAGTTGACTCTTATTATGACCAAACGTCTCTTATTACGTCTAGATTAAATCAGGAGATCAATAGCCAGCTA GACTCAAGTACCAGCTTCTTAGACTCATTAGGTAGCGATGCACTTAAGTTTGTTGGGAGCGGCCTGTCAAATGTTTCAAA GATAAGCCCAGATGCTATTAAAGCAACAATTTTTGTGGCCAGAGATCTCTTAGCTAAAACCACAGGAGTTGTTTATAAAT TTAAACCTTGGCAGGCTTCTAAACTTGCTGCTGGTATCAGTAAGTGGGCCGGGCCTGCGGGTATGGTGTTTAGTCTAACG GCTGATTTCTACAATGCTTATAAAGCAAGTGAGCTAGAAGCAGAGCTTAAAGAGACTAAGAATGAGATTAGCACAATGAT CAAAGAAGCGTTTAAAGACTTATATGATATTGTCAGTGATGATCAGAAACTTTTTGATTTCTTCGCACCACAACTAAAAA TCTTTGACCAACTGATAACTGATACTGAATCGCAAGTGAAAGATATCCGAGTTAGTCAAAATTCACTTCGGGGGATTAGT GAAAAATTAAAATCGCTCCCCAGTTATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTAACACACTAGAGAACAATCTAAATGTTCCAGTGCATGTTCTCGAGAAGCAGATAAAAGTTCTTACCATTATTTTGAA TAAAGTCAGGGATATGCAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAACTCATTATAATATTGAAATTTATCGCCTTACAGCTGATACTGCGGGGCGGTAATTTTTCAACGAGTTTGAAGGTAA TGTAATACGCCCATTGTTAC
Product: GTP-binding protein, HSR1-related
Products: NA
Alternate protein names: LeoA Protein
Number of amino acids: Translated: 569; Mature: 569
Protein sequence:
>569_residues MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLGAFSDGKTSVIAAWLGKIMAD MKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKEDENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVR WVLRDLNKLSSTVFIINKMDEVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFAKQREQECERIREDLNNGKRE VKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIGYTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQL DSSTSFLDSLGSDALKFVGSGLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLITDTESQVKDIRVSQNSLRGIS EKLKSLPSY
Sequences:
>Translated_569_residues MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLGAFSDGKTSVIAAWLGKIMAD MKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKEDENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVR WVLRDLNKLSSTVFIINKMDEVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFAKQREQECERIREDLNNGKRE VKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIGYTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQL DSSTSFLDSLGSDALKFVGSGLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLITDTESQVKDIRVSQNSLRGIS EKLKSLPSY >Mature_569_residues MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLGAFSDGKTSVIAAWLGKIMAD MKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKEDENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVR WVLRDLNKLSSTVFIINKMDEVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFAKQREQECERIREDLNNGKRE VKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIGYTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQL DSSTSFLDSLGSDALKFVGSGLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLITDTESQVKDIRVSQNSLRGIS EKLKSLPSY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 64002; Mature: 64002
Theoretical pI: Translated: 4.74; Mature: 4.74
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFSDGKTSVIAAWLGKIMADMKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKED CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC ENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVRWVLRDLNKLSSTVFIINKMD CCCEEHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHH EVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHH LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH KQREQECERIREDLNNGKREVKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIG HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHCC YTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQLDSSTSFLDSLGSDALKFVGS CCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHC GLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT CHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEH ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DTESQVKDIRVSQNSLRGISEKLKSLPSY CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MEQLKQFEVEKQSAISTLQQLKEVLTELGAIGMDVSVDIQKLEAALNTIKDDVLRIALLG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFSDGKTSVIAAWLGKIMADMKIDMDESSDRLAIYRPEGLPDKCEIVDTPGLFGDKQKED CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC ENLQIMYEDITRNYISEAHLILYVVDATNPLKESHHQIVRWVLRDLNKLSSTVFIINKMD CCCEEHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHH EVTDLSDPTLFSEQAAIKTETLKEKLQRAASLTDEEVKALRIVCIASNPNGRGLPFWFEK HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHH LDVYRNRSRIDELKKTTTSILDSSVRSTIIAKTGIDVVAGVVSQRVLAAQNSLDELEVFA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH KQREQECERIREDLNNGKREVKRLAGQLFNELEGLEKQLMGKLRPLDFEDIRPFMEDEIG HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCHHHHHHCC YTQDNIGYKLSIKIKTIVDSYYDQTSLITSRLNQEINSQLDSSTSFLDSLGSDALKFVGS CCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHC GLSNVSKISPDAIKATIFVARDLLAKTTGVVYKFKPWQASKLAAGISKWAGPAGMVFSLT CHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEH ADFYNAYKASELEAELKETKNEISTMIKEAFKDLYDIVSDDQKLFDFFAPQLKIFDQLIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DTESQVKDIRVSQNSLRGISEKLKSLPSY CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA