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The map label for this gene is 117918789

Identifier: 117918789

GI number: 117918789

Start: 366472

End: 368991

Strand: Reverse

Name: 117918789

Synonym: Shewana3_0332

Alternate gene names: NA

Gene position: 368991-366472 (Counterclockwise)

Preceding gene: 117918790

Following gene: 117918788

Centisome position: 7.42

GC content: 52.82

Gene sequence:

>2520_bases
ATGGCGCCCAAGATTGCCACGCGTATTGGCCACAGCCTGATGCAAACCTCAACTAAATGGCGCTTCGCTATTTGGTTGTG
TTTGATGCTGGCGGCGAGCCTGTGGACGCTGCAACTGTGGCAAAATGGGGCAAAGGTACAAAGCGATATTCTCGCCATGT
TGCCCCATCTTCAGCAGGACGCACTCACGGCGCGCGCCCTCGAACAAGTGGAATCGACACTCGCCGATCAAGTGTATCTC
GCCCTGATTGCCAAGGATGAACCTCAGGCGATTGCGGCGGCCACACTCCTGATGGAGCAGCTTAAGACTCAAAACACCGC
CTTTACCGATATTCGCAGCGCCGATCTGCAAATGGGTGAAGCCCTAGGGCAATTTTATTTGCCCTATCGCTTTAAACTGC
TCACACCTGAGCAAACCGAAGCCTTAAGCCATAATGGCCTCGAGCACTTAATTGCCTCAGCCACTCAGCAGCTCTACAAC
GCCTTTAGTTATGCCAATAGCCAACTCTTGACCCAAGATCCTTTGCTGTTGTTCCCCGACAATTTGCTCGCCCTTGCGCC
TAGTTCGAAGCTGAGCGCCAACCAAGGGATTTTACTTGCTCATCCACAAAGTGTTGATACCAAACAAGGTGTTAATAGCA
GTGAAGGCGTGGCCGCCATTGTGATGGCAAAGGGCACCGAAAGCGCCTTTAACCCTAATGCGCAATTACGCCAGCAAGCG
GCACTGACTCAGGCACTGAATGCCGTCAGCGCGCAATACCCCAGCATTAAAGTGTTACAGGCGGGCGCGCTGTTCCATGC
CATCGAGGCTACCAATACCGCGAAGAGTGAAATCTCTGTCCTCGGTCTCGCCTCTTTGCTTGGCGTAGTGTTATTGGTTT
GGCTAGCGTTTCGCTCCGTGATGCCACTCTTGCTGGCGATGGTGACAATCGGCAGCGGCCTGCTGCTGGCGGTGACTTTT
ACCTTAAGCGTGTTCGGGGAGCTACATTTACTCACTCTCGTCTTTGGCACCAGCCTGATTGGGATTGCCATCGACTACAG
CTTCCATTTTTACTGTGAGCGGTTAAGCGATCATCAGCGTAGCGCGCAGGCGACCGTGGCCTATATCTTCCCCACAGTGT
CACTGGCCTTTATCACCAGTGCCTTAGCCTATGTCGGTATCGGTTTAGCGCCGTTTCCTGGCATGCAGCAAGTAGCGATT
TTCTGCGCCTCGGGTTTACTCGGCGCCTACCTGACGTTAGTGCTCGCCTATCCATTATTGGCGGGCAGCAAGTTACCTTC
GGGAGAGCGTCCGCTAAACCTTGCTCAGGCCTATCTTGCGAAACTCACCGGATTCTCCAATAAACTGATCTCGCCATGGG
GATTGAGTCTGTTTGCCTTAGTGCTCGCGGGAGTCTGCCTATTGGGGATCAGCAAGCTTAACGTCGACGATGATATTCGC
CATTTACAGCAAAGCCCTGCGAGTGTGACTGAGCCTGAAGACAAACTCAGAAAATTACTCAGTGGCGGCACAGATAACCA
GTTTTTATTGGTGCGCGCCCCCAGCGAAGAAGCCTTACTGCAACGGCTCGAAGCCCTCAGTCCGCAGCTCGATGCCGCCA
TTAAACAGCAAGAGCTGGGCAACTATATCAGCCTCAGCCGTTATCTGCCGAGCAAGCAAAAGCAGGATGCGGCGTATCAA
TTACAGAGCAAGATTTACCAGTCGCAATTAACCACAGTGCTAAACAGCATTGGCCTAGATGACGGCCTAGCACCTGAGCT
TTCTGCCACCTACCTTGCCGCCAAGGATAGCTATATCACCCCGACGGATTTTTTCGAACTGGGCCTAGGCAAACAGCTAG
CCCCACTCTGGCTTGCACCACAGGGATTCGCGCCGCTTGGGCACTCAACAGAGTCAGCAACCAGCCCCGATAATGCCAAC
CTAGGGAACGATAGCCACGGCACCATAGTGCTGCTCGGCGGTATTGAAGATATTGCGGCCCTCAAGGCACGCTTTGTCGA
GGATCCGCTGGTGCAGCTTATTGATAAAGTCGCGGATATCTCCACTGTGATGGGGCATTATCGCCTGCTTACGCTCAAGT
TATTGGGGCTGGCGCTCGTTATCGCCCTCTTGCTATTTAGCCTGAGTTTTGGCGTTAAAAGAGCCGCCCTAGTGGTCGCC
GTACCCGCGCTGGCGGCCTTACTCACCTTGGCCATTTTAGGCTTAGCCGGCTCGCCCTTAAGCTTGTTTCATGCGCTGGC
GCTGATTTTAGTCTTCGGGATTGGGATAGATTACAGTTTGTTCTTTGCCTCTGCAGCGCAACATGGCAAGGCAGTGATGA
TGGCGGTGTTTATGTCCGCCTGCTCGACCCTATTGGCCTTTGGCTTACTCGCCTTTAGCCAAACCCAAGCTATTCATTAT
TTTGGATTGACCCTATCCCTCGGCATAGGGTTTACCTTTGTACTTTCGCCATTGATTTTGACCACCAGTCAGGTTTTAAC
CACCAACAAGGTCTCGATACCTACAAGGAATGTTATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGAGCTGCGCCAAGGTCCACTGAGTGAGGCTGAGTTAGCCCAATATGCCATCAGCCAGACAACGCCTAAAGACACTGGTC
CAAGAGAGTAAGGCAGAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTCCACATCTACCGCTGCAAGCTCCACACAGTCTCACTCCCTTTCCGTCGATGTGGCCATTATTGGCGCAGGCCCCTC
GGGCTCGATTGCCGCTAGTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 839; Mature: 838

Protein sequence:

>839_residues
MAPKIATRIGHSLMQTSTKWRFAIWLCLMLAASLWTLQLWQNGAKVQSDILAMLPHLQQDALTARALEQVESTLADQVYL
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FCASGLLGAYLTLVLAYPLLAGSKLPSGERPLNLAQAYLAKLTGFSNKLISPWGLSLFALVLAGVCLLGISKLNVDDDIR
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VPALAALLTLAILGLAGSPLSLFHALALILVFGIGIDYSLFFASAAQHGKAVMMAVFMSACSTLLAFGLLAFSQTQAIHY
FGLTLSLGIGFTFVLSPLILTTSQVLTTNKVSIPTRNVI

Sequences:

>Translated_839_residues
MAPKIATRIGHSLMQTSTKWRFAIWLCLMLAASLWTLQLWQNGAKVQSDILAMLPHLQQDALTARALEQVESTLADQVYL
ALIAKDEPQAIAAATLLMEQLKTQNTAFTDIRSADLQMGEALGQFYLPYRFKLLTPEQTEALSHNGLEHLIASATQQLYN
AFSYANSQLLTQDPLLLFPDNLLALAPSSKLSANQGILLAHPQSVDTKQGVNSSEGVAAIVMAKGTESAFNPNAQLRQQA
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TLSVFGELHLLTLVFGTSLIGIAIDYSFHFYCERLSDHQRSAQATVAYIFPTVSLAFITSALAYVGIGLAPFPGMQQVAI
FCASGLLGAYLTLVLAYPLLAGSKLPSGERPLNLAQAYLAKLTGFSNKLISPWGLSLFALVLAGVCLLGISKLNVDDDIR
HLQQSPASVTEPEDKLRKLLSGGTDNQFLLVRAPSEEALLQRLEALSPQLDAAIKQQELGNYISLSRYLPSKQKQDAAYQ
LQSKIYQSQLTTVLNSIGLDDGLAPELSATYLAAKDSYITPTDFFELGLGKQLAPLWLAPQGFAPLGHSTESATSPDNAN
LGNDSHGTIVLLGGIEDIAALKARFVEDPLVQLIDKVADISTVMGHYRLLTLKLLGLALVIALLLFSLSFGVKRAALVVA
VPALAALLTLAILGLAGSPLSLFHALALILVFGIGIDYSLFFASAAQHGKAVMMAVFMSACSTLLAFGLLAFSQTQAIHY
FGLTLSLGIGFTFVLSPLILTTSQVLTTNKVSIPTRNVI
>Mature_838_residues
APKIATRIGHSLMQTSTKWRFAIWLCLMLAASLWTLQLWQNGAKVQSDILAMLPHLQQDALTARALEQVESTLADQVYLA
LIAKDEPQAIAAATLLMEQLKTQNTAFTDIRSADLQMGEALGQFYLPYRFKLLTPEQTEALSHNGLEHLIASATQQLYNA
FSYANSQLLTQDPLLLFPDNLLALAPSSKLSANQGILLAHPQSVDTKQGVNSSEGVAAIVMAKGTESAFNPNAQLRQQAA
LTQALNAVSAQYPSIKVLQAGALFHAIEATNTAKSEISVLGLASLLGVVLLVWLAFRSVMPLLLAMVTIGSGLLLAVTFT
LSVFGELHLLTLVFGTSLIGIAIDYSFHFYCERLSDHQRSAQATVAYIFPTVSLAFITSALAYVGIGLAPFPGMQQVAIF
CASGLLGAYLTLVLAYPLLAGSKLPSGERPLNLAQAYLAKLTGFSNKLISPWGLSLFALVLAGVCLLGISKLNVDDDIRH
LQQSPASVTEPEDKLRKLLSGGTDNQFLLVRAPSEEALLQRLEALSPQLDAAIKQQELGNYISLSRYLPSKQKQDAAYQL
QSKIYQSQLTTVLNSIGLDDGLAPELSATYLAAKDSYITPTDFFELGLGKQLAPLWLAPQGFAPLGHSTESATSPDNANL
GNDSHGTIVLLGGIEDIAALKARFVEDPLVQLIDKVADISTVMGHYRLLTLKLLGLALVIALLLFSLSFGVKRAALVVAV
PALAALLTLAILGLAGSPLSLFHALALILVFGIGIDYSLFFASAAQHGKAVMMAVFMSACSTLLAFGLLAFSQTQAIHYF
GLTLSLGIGFTFVLSPLILTTSQVLTTNKVSIPTRNVI

Specific function: Unknown

COG id: COG4258

COG function: function code R; Predicted exporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89801; Mature: 89670

Theoretical pI: Translated: 6.62; Mature: 6.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAPKIATRIGHSLMQTSTKWRFAIWLCLMLAASLWTLQLWQNGAKVQSDILAMLPHLQQD
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ALTARALEQVESTLADQVYLALIAKDEPQAIAAATLLMEQLKTQNTAFTDIRSADLQMGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
ALGQFYLPYRFKLLTPEQTEALSHNGLEHLIASATQQLYNAFSYANSQLLTQDPLLLFPD
HHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCC
NLLALAPSSKLSANQGILLAHPQSVDTKQGVNSSEGVAAIVMAKGTESAFNPNAQLRQQA
CCEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHH
ALTQALNAVSAQYPSIKVLQAGALFHAIEATNTAKSEISVLGLASLLGVVLLVWLAFRSV
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MPLLLAMVTIGSGLLLAVTFTLSVFGELHLLTLVFGTSLIGIAIDYSFHFYCERLSDHQR
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHH
SAQATVAYIFPTVSLAFITSALAYVGIGLAPFPGMQQVAIFCASGLLGAYLTLVLAYPLL
HHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGSKLPSGERPLNLAQAYLAKLTGFSNKLISPWGLSLFALVLAGVCLLGISKLNVDDDIR
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
HLQQSPASVTEPEDKLRKLLSGGTDNQFLLVRAPSEEALLQRLEALSPQLDAAIKQQELG
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCC
NYISLSRYLPSKQKQDAAYQLQSKIYQSQLTTVLNSIGLDDGLAPELSATYLAAKDSYIT
CHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHEECCCCCCC
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LKARFVEDPLVQLIDKVADISTVMGHYRLLTLKLLGLALVIALLLFSLSFGVKRAALVVA
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VPALAALLTLAILGLAGSPLSLFHALALILVFGIGIDYSLFFASAAQHGKAVMMAVFMSA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
CSTLLAFGLLAFSQTQAIHYFGLTLSLGIGFTFVLSPLILTTSQVLTTNKVSIPTRNVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
APKIATRIGHSLMQTSTKWRFAIWLCLMLAASLWTLQLWQNGAKVQSDILAMLPHLQQD
CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ALTARALEQVESTLADQVYLALIAKDEPQAIAAATLLMEQLKTQNTAFTDIRSADLQMGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
ALGQFYLPYRFKLLTPEQTEALSHNGLEHLIASATQQLYNAFSYANSQLLTQDPLLLFPD
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NLLALAPSSKLSANQGILLAHPQSVDTKQGVNSSEGVAAIVMAKGTESAFNPNAQLRQQA
CCEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHH
ALTQALNAVSAQYPSIKVLQAGALFHAIEATNTAKSEISVLGLASLLGVVLLVWLAFRSV
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MPLLLAMVTIGSGLLLAVTFTLSVFGELHLLTLVFGTSLIGIAIDYSFHFYCERLSDHQR
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SAQATVAYIFPTVSLAFITSALAYVGIGLAPFPGMQQVAIFCASGLLGAYLTLVLAYPLL
HHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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PTDFFELGLGKQLAPLWLAPQGFAPLGHSTESATSPDNANLGNDSHGTIVLLGGIEDIAA
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CSTLLAFGLLAFSQTQAIHYFGLTLSLGIGFTFVLSPLILTTSQVLTTNKVSIPTRNVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA