Definition Pediococcus pentosaceus ATCC 25745, complete genome.
Accession NC_008525
Length 1,832,387

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The map label for this gene is bceB [H]

Identifier: 116493472

GI number: 116493472

Start: 1719498

End: 1721309

Strand: Direct

Name: bceB [H]

Synonym: PEPE_1744

Alternate gene names: 116493472

Gene position: 1719498-1721309 (Clockwise)

Preceding gene: 116493471

Following gene: 116493475

Centisome position: 93.84

GC content: 34.99

Gene sequence:

>1812_bases
ATGTTATCTAGACTCGCACTCTCAAATATCAAAAATCGATTACGAGACTACATCGTCCTCTTGACCGGCCTTGTAATGTC
TTCCGCTATCTTTTATATGTTTGCCAACTTGGCAACCAACGAAAGCTTTATTAAAAGTAATACTACTTTTAGATTCGCTG
TTCCTGTTTTTTATTTTGGTGAGGTACTACTCGTAATTATCACTTTAGTTTACGTCATGTACGCTAATTCATTCTTATTA
AACATGAGACTTCACGATTATGGTTTATTTATGATGTTAGGAGCCAAAAAACGTCGTGTAGGAACATTGATGGTTTTCGA
AACTTTAGTCGTTGGTGCCATTGCTACCGCAATCGGTTTACTGCTGGGAATTGGTTTAACAGGGGGACTTTCTAAGTTAC
TATTCTCACACCTTGGAATTGCGCTTCATCATTTTAACCCATTCTATTTTAAAGCAGTACTGACAACCATTGTTTTATAC
TTAGTACTTTTTATCATTGCCGCAATTTTTAATCTTCAATCATTAATTCGTACTCCGGTACTCAAATTGCTTAAACAAAA
TGATACAGTTAACAAAATTAAGGCTCATGGAATTGGGCTTTACTTTGCGGGAATATTTGGAGTAATTTTAATTGGAATTG
GTTACTATGCTCTAGCTCAAATTGCTACCTTCAAATTAACTTCTATTCCAATTGCCCTAGTTACTATCGTGCTAGGGAGT
TATTTAATTTTCCACTCAAGCATGATTCTTATTATTGAACGTCTTAAGAAATCTAATTGGGCACGTCGTAAATTAAACAA
TTTTACTTTATCTCAAATTATGTTCCGCGTTCAGGATTACACTAAGATTTTAACAATTACGTCCCTCTTGTTCGCCTTAG
CATTAGGGGCCATTACCGTGGGCTCTGCGTTCAACCGTCAAATCGATTCAATGGCTAAAAGTAATAGTTCCTATACTATT
GCTATTAACAATCCAACAGCTAAAGAGCAAGGTTTGATCGAACAATTATCTGATCGTACAGTCGTTAAATATGACCAAAA
GTTTAGTGGTAACCACGTTATTTATAATGAAGATCAATTTGCTCAACATCCATATAAGATTGTTGAAACAACTCAAAGTA
AGTCTGGTACTATGAATACGTATAAAAACATTCCAGTTTCTGTCAGCAAGCTTAAAAAAGAAGTTAGCAGCCAATTTGAT
TTTGTAAGTTTAGGTGGTTCTGTTTTAGACACGGCTCCTAAATTCTATGCCACAAACGATTTTAATAAAATTAACGCCAA
AAAAGGTTCTGTTAGTTTAATTACGGTTAAAAGTATTGCTGAGAACCGTACTGTTTTAGAGAAGTTAAACCATCTCCAAC
TTAAAGCTTATCCAACAATGGATGAAACTGGCATTGGTGCTGGTACCTTCCCTGCCTTCTTAATGATTAGTGGGATCTAT
GGTGGACTAGAATTTATCGGCTACTTCTTAGGAATTGCATTCCTAGCAATGCTAGCAAGTTGCTTGATGTTCAAGATTCT
TTCTGGAACTCAACAAGACCGGATTCGTTATAACTTGCTAACTAAGGTTGGTACTCGTCGCTCTCTACTAAACCAAAGTA
TCAATCGTGAAATCTTTGTGCTATTTGCACTTCCAGGTATCCTAGGAATTATTGATGTACTCTTTGGACTCCAAATGTTT
AAGAGCTTCTTCAATAATAATCCTTATCAAAACATCCAATATCCAATCATAATTTTTGTTGTACTATATCTGTTGTATTA
CTTCCTAACAACTTGGTTATATAAATTAATCGTATTGCCTAAAAAGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTGGTCAAGAAATACGTCGTAACGGAGTTTCACGGACTGAGTTTTACCAAGATATTCTTGAAAAACTCGGAACTTTT
GAACAATAGGAGGCGAACAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAAGGTGAACCCATAGAGGTTCACCTTTTTTTATATCCTAGTATTCAATTATTTAACTTGATGTCCTTCAGCCACA
TACTGGTCCATATCATTCTT

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 603; Mature: 603

Protein sequence:

>603_residues
MLSRLALSNIKNRLRDYIVLLTGLVMSSAIFYMFANLATNESFIKSNTTFRFAVPVFYFGEVLLVIITLVYVMYANSFLL
NMRLHDYGLFMMLGAKKRRVGTLMVFETLVVGAIATAIGLLLGIGLTGGLSKLLFSHLGIALHHFNPFYFKAVLTTIVLY
LVLFIIAAIFNLQSLIRTPVLKLLKQNDTVNKIKAHGIGLYFAGIFGVILIGIGYYALAQIATFKLTSIPIALVTIVLGS
YLIFHSSMILIIERLKKSNWARRKLNNFTLSQIMFRVQDYTKILTITSLLFALALGAITVGSAFNRQIDSMAKSNSSYTI
AINNPTAKEQGLIEQLSDRTVVKYDQKFSGNHVIYNEDQFAQHPYKIVETTQSKSGTMNTYKNIPVSVSKLKKEVSSQFD
FVSLGGSVLDTAPKFYATNDFNKINAKKGSVSLITVKSIAENRTVLEKLNHLQLKAYPTMDETGIGAGTFPAFLMISGIY
GGLEFIGYFLGIAFLAMLASCLMFKILSGTQQDRIRYNLLTKVGTRRSLLNQSINREIFVLFALPGILGIIDVLFGLQMF
KSFFNNNPYQNIQYPIIIFVVLYLLYYFLTTWLYKLIVLPKKK

Sequences:

>Translated_603_residues
MLSRLALSNIKNRLRDYIVLLTGLVMSSAIFYMFANLATNESFIKSNTTFRFAVPVFYFGEVLLVIITLVYVMYANSFLL
NMRLHDYGLFMMLGAKKRRVGTLMVFETLVVGAIATAIGLLLGIGLTGGLSKLLFSHLGIALHHFNPFYFKAVLTTIVLY
LVLFIIAAIFNLQSLIRTPVLKLLKQNDTVNKIKAHGIGLYFAGIFGVILIGIGYYALAQIATFKLTSIPIALVTIVLGS
YLIFHSSMILIIERLKKSNWARRKLNNFTLSQIMFRVQDYTKILTITSLLFALALGAITVGSAFNRQIDSMAKSNSSYTI
AINNPTAKEQGLIEQLSDRTVVKYDQKFSGNHVIYNEDQFAQHPYKIVETTQSKSGTMNTYKNIPVSVSKLKKEVSSQFD
FVSLGGSVLDTAPKFYATNDFNKINAKKGSVSLITVKSIAENRTVLEKLNHLQLKAYPTMDETGIGAGTFPAFLMISGIY
GGLEFIGYFLGIAFLAMLASCLMFKILSGTQQDRIRYNLLTKVGTRRSLLNQSINREIFVLFALPGILGIIDVLFGLQMF
KSFFNNNPYQNIQYPIIIFVVLYLLYYFLTTWLYKLIVLPKKK
>Mature_603_residues
MLSRLALSNIKNRLRDYIVLLTGLVMSSAIFYMFANLATNESFIKSNTTFRFAVPVFYFGEVLLVIITLVYVMYANSFLL
NMRLHDYGLFMMLGAKKRRVGTLMVFETLVVGAIATAIGLLLGIGLTGGLSKLLFSHLGIALHHFNPFYFKAVLTTIVLY
LVLFIIAAIFNLQSLIRTPVLKLLKQNDTVNKIKAHGIGLYFAGIFGVILIGIGYYALAQIATFKLTSIPIALVTIVLGS
YLIFHSSMILIIERLKKSNWARRKLNNFTLSQIMFRVQDYTKILTITSLLFALALGAITVGSAFNRQIDSMAKSNSSYTI
AINNPTAKEQGLIEQLSDRTVVKYDQKFSGNHVIYNEDQFAQHPYKIVETTQSKSGTMNTYKNIPVSVSKLKKEVSSQFD
FVSLGGSVLDTAPKFYATNDFNKINAKKGSVSLITVKSIAENRTVLEKLNHLQLKAYPTMDETGIGAGTFPAFLMISGIY
GGLEFIGYFLGIAFLAMLASCLMFKILSGTQQDRIRYNLLTKVGTRRSLLNQSINREIFVLFALPGILGIIDVLFGLQMF
KSFFNNNPYQNIQYPIIIFVVLYLLYYFLTTWLYKLIVLPKKK

Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67623; Mature: 67623

Theoretical pI: Translated: 10.35; Mature: 10.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLSRLALSNIKNRLRDYIVLLTGLVMSSAIFYMFANLATNESFIKSNTTFRFAVPVFYFG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEEEHHHHHHH
EVLLVIITLVYVMYANSFLLNMRLHDYGLFMMLGAKKRRVGTLMVFETLVVGAIATAIGL
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGIGLTGGLSKLLFSHLGIALHHFNPFYFKAVLTTIVLYLVLFIIAAIFNLQSLIRTPV
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKLLKQNDTVNKIKAHGIGLYFAGIFGVILIGIGYYALAQIATFKLTSIPIALVTIVLGS
HHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLIFHSSMILIIERLKKSNWARRKLNNFTLSQIMFRVQDYTKILTITSLLFALALGAITV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GSAFNRQIDSMAKSNSSYTIAINNPTAKEQGLIEQLSDRTVVKYDQKFSGNHVIYNEDQF
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEEECCHHH
AQHPYKIVETTQSKSGTMNTYKNIPVSVSKLKKEVSSQFDFVSLGGSVLDTAPKFYATND
HHCCHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHCCCCCEECCC
FNKINAKKGSVSLITVKSIAENRTVLEKLNHLQLKAYPTMDETGIGAGTFPAFLMISGIY
CCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
GGLEFIGYFLGIAFLAMLASCLMFKILSGTQQDRIRYNLLTKVGTRRSLLNQSINREIFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
LFALPGILGIIDVLFGLQMFKSFFNNNPYQNIQYPIIIFVVLYLLYYFLTTWLYKLIVLP
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KKK
CCC
>Mature Secondary Structure
MLSRLALSNIKNRLRDYIVLLTGLVMSSAIFYMFANLATNESFIKSNTTFRFAVPVFYFG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEEEHHHHHHH
EVLLVIITLVYVMYANSFLLNMRLHDYGLFMMLGAKKRRVGTLMVFETLVVGAIATAIGL
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGIGLTGGLSKLLFSHLGIALHHFNPFYFKAVLTTIVLYLVLFIIAAIFNLQSLIRTPV
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKLLKQNDTVNKIKAHGIGLYFAGIFGVILIGIGYYALAQIATFKLTSIPIALVTIVLGS
HHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLIFHSSMILIIERLKKSNWARRKLNNFTLSQIMFRVQDYTKILTITSLLFALALGAITV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GSAFNRQIDSMAKSNSSYTIAINNPTAKEQGLIEQLSDRTVVKYDQKFSGNHVIYNEDQF
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEEECCHHH
AQHPYKIVETTQSKSGTMNTYKNIPVSVSKLKKEVSSQFDFVSLGGSVLDTAPKFYATND
HHCCHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHCCCCCEECCC
FNKINAKKGSVSLITVKSIAENRTVLEKLNHLQLKAYPTMDETGIGAGTFPAFLMISGIY
CCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
GGLEFIGYFLGIAFLAMLASCLMFKILSGTQQDRIRYNLLTKVGTRRSLLNQSINREIFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
LFALPGILGIIDVLFGLQMFKSFFNNNPYQNIQYPIIIFVVLYLLYYFLTTWLYKLIVLP
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KKK
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]