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The map label for this gene is yabM [H]

Identifier: 116493279

GI number: 116493279

Start: 1517454

End: 1519037

Strand: Reverse

Name: yabM [H]

Synonym: PEPE_1551

Alternate gene names: 116493279

Gene position: 1519037-1517454 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116493280

Following gene: 116493278

Centisome position: 82.9

GC content: 39.08

Gene sequence:

>1584_bases
GTGAAAAATTCGAGTGCTAAAAAGGTTATGCGTGGGGCATTAATTTTATCCATCGCATCAATTGTGGCTAAAATTTTAAG
TGCAGTCTATCGAGTGCCCCTTCAAAATTTAGTTGGTAATACTGGTTTTTATGTATACCAACAAATCTATCCAATTTATG
GCATTGGAATGACCTTTGCATTAAATGGATTTCCGATTTTTATATCAAAAATTATTGCTGAGGAACCCGAAGAAGAAAAA
AGGTTACGTTTAAGTCGCTATGCGATGCTAATTTTGGCAGGGCTATCATTGTTAATATTTTTATTTTTAATGGTAGGTGC
TAGGTGGATTGCTGGTGCAATGGGGGATGTTAGTTTAACCCCACTATTGCGAATGGTTTCGACTATGTTCCTGTTTATGC
CATTATTGGCGACGGGGCGGGGTTACTACCAAGGAATTTATGATGTGGCGCCGACGGCTAAATCACAAGTGCTTGAACAA
GTAGTGCGGGTTTCAATCATTATTTTAGTTGCGGTATTGGCGGTTAAACTAAATTGGTCCGTGTATAAAATGGGGACTTG
GGCGATGGCTAGTTCAACTTTAGCTGCCGTTGCTTCAACGCTCTTTTTTATAAAGTTTGGGTCCAAGTTAATAAAAGCTA
AACGACATAAATTTAATTGGCAACTGTTTAAAATTTTAGTGAAACGCTTTGTGGTTGAAGGTGGCGTAATTTGCTTATTG
GCAGCCATGATTATTTTGCTACAGTTAGTAGATTCGTTCACGGTTAAAAATAGTTTGGTCAGTGGTGGGCTAACTCAATC
AATGGCTAAGTCGATGAAGGGGATTTATGATCGTGCACAGCCGTTAGTTCAATTAGGGACGGTGATTGCTACGGCTTTTG
CCACCACGTTGCTACCATCTCTTACGGAGGCTTTACAAAAAAGGGACACAAAAGCCTTTTATCGATCAGCAACCTCACTA
TTGCGGGTTTCACTAACCATATCGATGGCTGCCAGTATAGGAATGGTGGCTTTAATGCCTCAAATCAATCACCTGCTATT
TGGCAGTTCGGAAGGTTCCTTAGCTCTAGCTGTGTACAATTTAAGTGTGATTTTTGCTGCATTAATCTTTGTGTATAACA
GCATCTTGCAAAGTGCGGGGGCTGTTAAACCGACCTTGGTGGCCATTATCACAGGAATTATAATTAAAGTTGTTTTAAAT
AGTTGGGCTACTCAATGGTTGGGAATCTTAGGAGCTAGTCTCGTGACAGTATTAAGCTTAGCTGTGATTGCAGGTGTGAT
GAATTATGCATTACCGAGTCAGTTGTCGAAACGGGTTTACCGAGAACATCACTTTTTAAGGAAACTCATCTGGGGAAATT
TGTTAATGTTCATAGTAGTAAAATTACTCGTGATTGTTTTACAATTAACAGTAGTTTCTCCAGGACGCTTCGGCGCTACT
ATTATCACAGTAATGGGTGTAATCGTTGGAGCAGGTGTTTTTATTAGTTATATCTTTAAATTCAGGTTATTTAGTATTCG
GGAATGGTTGACTATTCCCTATGGTTCAAAAATTTTAAGAATGGTACAGAGGATTGTTAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTAAGCTGGTAATTCAACCACGAATGACACAAAAGGATTGGTTTACACAGCTGTTTAATTATATTGAGAAACTTAAAG
AATATGTGTGAGGACTGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTAGATAAATTTTTAAAGGTTTCAAGAATTATCAAACGGCGTGCTTTAGCTAAGGAAGTAGCTGATCAAGGACGAATT
TTGATCAATGATAAAGTGGC

Product: polysaccharide transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 527; Mature: 527

Protein sequence:

>527_residues
MKNSSAKKVMRGALILSIASIVAKILSAVYRVPLQNLVGNTGFYVYQQIYPIYGIGMTFALNGFPIFISKIIAEEPEEEK
RLRLSRYAMLILAGLSLLIFLFLMVGARWIAGAMGDVSLTPLLRMVSTMFLFMPLLATGRGYYQGIYDVAPTAKSQVLEQ
VVRVSIIILVAVLAVKLNWSVYKMGTWAMASSTLAAVASTLFFIKFGSKLIKAKRHKFNWQLFKILVKRFVVEGGVICLL
AAMIILLQLVDSFTVKNSLVSGGLTQSMAKSMKGIYDRAQPLVQLGTVIATAFATTLLPSLTEALQKRDTKAFYRSATSL
LRVSLTISMAASIGMVALMPQINHLLFGSSEGSLALAVYNLSVIFAALIFVYNSILQSAGAVKPTLVAIITGIIIKVVLN
SWATQWLGILGASLVTVLSLAVIAGVMNYALPSQLSKRVYREHHFLRKLIWGNLLMFIVVKLLVIVLQLTVVSPGRFGAT
IITVMGVIVGAGVFISYIFKFRLFSIREWLTIPYGSKILRMVQRIVK

Sequences:

>Translated_527_residues
MKNSSAKKVMRGALILSIASIVAKILSAVYRVPLQNLVGNTGFYVYQQIYPIYGIGMTFALNGFPIFISKIIAEEPEEEK
RLRLSRYAMLILAGLSLLIFLFLMVGARWIAGAMGDVSLTPLLRMVSTMFLFMPLLATGRGYYQGIYDVAPTAKSQVLEQ
VVRVSIIILVAVLAVKLNWSVYKMGTWAMASSTLAAVASTLFFIKFGSKLIKAKRHKFNWQLFKILVKRFVVEGGVICLL
AAMIILLQLVDSFTVKNSLVSGGLTQSMAKSMKGIYDRAQPLVQLGTVIATAFATTLLPSLTEALQKRDTKAFYRSATSL
LRVSLTISMAASIGMVALMPQINHLLFGSSEGSLALAVYNLSVIFAALIFVYNSILQSAGAVKPTLVAIITGIIIKVVLN
SWATQWLGILGASLVTVLSLAVIAGVMNYALPSQLSKRVYREHHFLRKLIWGNLLMFIVVKLLVIVLQLTVVSPGRFGAT
IITVMGVIVGAGVFISYIFKFRLFSIREWLTIPYGSKILRMVQRIVK
>Mature_527_residues
MKNSSAKKVMRGALILSIASIVAKILSAVYRVPLQNLVGNTGFYVYQQIYPIYGIGMTFALNGFPIFISKIIAEEPEEEK
RLRLSRYAMLILAGLSLLIFLFLMVGARWIAGAMGDVSLTPLLRMVSTMFLFMPLLATGRGYYQGIYDVAPTAKSQVLEQ
VVRVSIIILVAVLAVKLNWSVYKMGTWAMASSTLAAVASTLFFIKFGSKLIKAKRHKFNWQLFKILVKRFVVEGGVICLL
AAMIILLQLVDSFTVKNSLVSGGLTQSMAKSMKGIYDRAQPLVQLGTVIATAFATTLLPSLTEALQKRDTKAFYRSATSL
LRVSLTISMAASIGMVALMPQINHLLFGSSEGSLALAVYNLSVIFAALIFVYNSILQSAGAVKPTLVAIITGIIIKVVLN
SWATQWLGILGASLVTVLSLAVIAGVMNYALPSQLSKRVYREHHFLRKLIWGNLLMFIVVKLLVIVLQLTVVSPGRFGAT
IITVMGVIVGAGVFISYIFKFRLFSIREWLTIPYGSKILRMVQRIVK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57861; Mature: 57861

Theoretical pI: Translated: 10.98; Mature: 10.98

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]