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The map label for this gene is comEC [H]

Identifier: 116492910

GI number: 116492910

Start: 1148492

End: 1150597

Strand: Reverse

Name: comEC [H]

Synonym: PEPE_1149

Alternate gene names: 116492910

Gene position: 1150597-1148492 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116492911

Following gene: 116492909

Centisome position: 62.79

GC content: 32.53

Gene sequence:

>2106_bases
TTGATTAGTGTCTGTTTTTTTATTCACTTTAGTCATAAAGCAAATTCAATTAATACTTATAACCAAAGTAGAAGTGATAT
TGAAATTGATTTGAGAGTTTATCCCGATGAAATTAAGCCAATGGAAGACGGCGTTTCAATTCGAGCATATACTAACAATG
TTAACCGTAAAGGCTTGCAAGTTTTTATTCCAGTTAAAACGGTGGACGATTTAAAAAAAATTAGTAAAACTCAAAAAGTA
GTTGAATTTAAAATTAAGGGGAATATTGAACCGCTTGAACGACCAACGAATATAAATCAATTTGATTTTCGACGGATTAT
GTACGGTAAGGCAGTTTATTTTAAAGTAAGTAAAGCTAGTCTAATAGAATATAATATTTTAACTAAAAATAGTTTGATTG
CTAAGATACATAGCTGGCGTAAAAAGTTATTAGAAAGATGTATAAAGTTAGAGGAACCACTACAGAGTTATTGTATGGGG
ATTATCCTTGGGGAACAGACGGATTATCTAAAAGAAAATAGCACTAAGTTACGTAATATGGGTATTATTCATTTGTTTTG
TATTTCAGGATTACATGTGTTTTATTTCATCAAGTTAATTGAAATTGTTTTTACTAGATTTAAAATTAAAAGGGAAACGA
TGGAGATAACCCAAATAGGAGTTTTACCCCTCTATTTTATTTTGGGTGGGGGAAGTACTAGTCTATTTCGCGCGGTGGTA
TTAGTTTTAGTTCAGTTGATAACTAAAAAAATAGCTATAAAAATTAGCACACTTGATAGCTGGTGCTTAGTTTTATTAGT
CAATTTATGGCTTAATCCGTTTGTCTTACTTCAGATGGGTGGGCAACTTAGTTATTTATTATCTTTTGTCTTAATTATGC
AACAAATGGAAAATGGCTGGACAACAGGAATAAAATTATTTTTGGTAGAATTACCAATTATTTTATTTTCAACATACAAA
ATCCACTTACTAACGATGGTTTTTAATTTAATTATTGTTCCGATTTTTTCGAGTGTAATCGTTCCAATCGTAATTGTAGC
TTTTGCACTTCCTCAATTAATGGCATTATTAAATCCGATTATTATGATGTTTGAAGTGACTTTGAAATATTTGGATAAAT
TACCGGGGTTAATTCAAGTTGGTAAACCTTCGCGACTGATCACTTTATTCATGGTGATATTAGCGCTAAAAATTATTTCA
ACAAAGCAAAGTAAATTTAAGAAAAGAGCGCTAACGTTCTATAGTCTGATTTGGCTGGGGTTGTGGAGCTGGTTTAAATT
GAATCCGTATGGTGAAATTACCTTTTTTGATGTAGGTCAAGGCGATAGCATTTTAATTCGTGAACCGTTTAATCGAACAG
TAACGTTAATTGATACCGGCGGTAAAATGCAATTTGGCAAAAAGCCGGTTGCAATGAAGCATACCATCGCTAAGAATAGT
TCAATTAATTATTTACAAAGTATAGGAGTATCTAAGTTAAATAATTTATGTTTGACGCATCAAGATATTGATCATATTGG
AGAAGCCAGTGAAATTTTAAACAATTTTAAAGTGAAAAATTTGGTTTTTCCGGTGGGGGTTGATACAACTCAAAATTATC
AACGAAAAATATTGCCATTTATCCGACGCAATACAAAGGTGATTGCGTGCTTAGCGGGGACGAAAATTGATCACTTACCA
ATGGAAATTAAGTATCCGTTTCAAGCTGGAAAGGGTGAAAATGGTGATTCTTTAGTTTTAGCTGGTAATGTGGGTGGTAA
AAATTTACTACTAACAGGTGATCTAGACCTAGCTGGTGAACGTAAATTGTTAGAAAGTGGTGTATTAAATCAACGGGTGG
ATATTTTTAAATTAGGGCACCATGGGAGTAAGACGGCTAATTCTGAAGAAATTCTAAAAGCAATTATGCCTAAATTAGCT
ATTGTTTCAGCTGGGCGTCATAATCGGTATGGACATCCAAATCTAGAAGTTATAAATCGCTTGAATTCAATGGGGATTCC
TTACGCTTCGACACAGGATGAAGGAATGATTTCTTATAGATATTTTTTGAATGGTATGGGAAGATGGAAGACAGGAATAG
ATGAAAAGGAAAGTATTATTCAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTAATCTTTACCAGAGCTAAAATATTTTTATTATTATTAATAATTTGGTTAATTAGAACTATATGTTTAAAAAAACTTA
CAGTGGTAATGCAGGCATTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTAACTGATTTAAGAAAAAAACTTAAACAAGGGCAATTGAAGTCAATCTATTTGGTTGAAGGTCCTGATAACTATATC
CAGAAAGCGGTCAAAAAAGA

Product: metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 701

Protein sequence:

>701_residues
MISVCFFIHFSHKANSINTYNQSRSDIEIDLRVYPDEIKPMEDGVSIRAYTNNVNRKGLQVFIPVKTVDDLKKISKTQKV
VEFKIKGNIEPLERPTNINQFDFRRIMYGKAVYFKVSKASLIEYNILTKNSLIAKIHSWRKKLLERCIKLEEPLQSYCMG
IILGEQTDYLKENSTKLRNMGIIHLFCISGLHVFYFIKLIEIVFTRFKIKRETMEITQIGVLPLYFILGGGSTSLFRAVV
LVLVQLITKKIAIKISTLDSWCLVLLVNLWLNPFVLLQMGGQLSYLLSFVLIMQQMENGWTTGIKLFLVELPIILFSTYK
IHLLTMVFNLIIVPIFSSVIVPIVIVAFALPQLMALLNPIIMMFEVTLKYLDKLPGLIQVGKPSRLITLFMVILALKIIS
TKQSKFKKRALTFYSLIWLGLWSWFKLNPYGEITFFDVGQGDSILIREPFNRTVTLIDTGGKMQFGKKPVAMKHTIAKNS
SINYLQSIGVSKLNNLCLTHQDIDHIGEASEILNNFKVKNLVFPVGVDTTQNYQRKILPFIRRNTKVIACLAGTKIDHLP
MEIKYPFQAGKGENGDSLVLAGNVGGKNLLLTGDLDLAGERKLLESGVLNQRVDIFKLGHHGSKTANSEEILKAIMPKLA
IVSAGRHNRYGHPNLEVINRLNSMGIPYASTQDEGMISYRYFLNGMGRWKTGIDEKESIIQ

Sequences:

>Translated_701_residues
MISVCFFIHFSHKANSINTYNQSRSDIEIDLRVYPDEIKPMEDGVSIRAYTNNVNRKGLQVFIPVKTVDDLKKISKTQKV
VEFKIKGNIEPLERPTNINQFDFRRIMYGKAVYFKVSKASLIEYNILTKNSLIAKIHSWRKKLLERCIKLEEPLQSYCMG
IILGEQTDYLKENSTKLRNMGIIHLFCISGLHVFYFIKLIEIVFTRFKIKRETMEITQIGVLPLYFILGGGSTSLFRAVV
LVLVQLITKKIAIKISTLDSWCLVLLVNLWLNPFVLLQMGGQLSYLLSFVLIMQQMENGWTTGIKLFLVELPIILFSTYK
IHLLTMVFNLIIVPIFSSVIVPIVIVAFALPQLMALLNPIIMMFEVTLKYLDKLPGLIQVGKPSRLITLFMVILALKIIS
TKQSKFKKRALTFYSLIWLGLWSWFKLNPYGEITFFDVGQGDSILIREPFNRTVTLIDTGGKMQFGKKPVAMKHTIAKNS
SINYLQSIGVSKLNNLCLTHQDIDHIGEASEILNNFKVKNLVFPVGVDTTQNYQRKILPFIRRNTKVIACLAGTKIDHLP
MEIKYPFQAGKGENGDSLVLAGNVGGKNLLLTGDLDLAGERKLLESGVLNQRVDIFKLGHHGSKTANSEEILKAIMPKLA
IVSAGRHNRYGHPNLEVINRLNSMGIPYASTQDEGMISYRYFLNGMGRWKTGIDEKESIIQ
>Mature_701_residues
MISVCFFIHFSHKANSINTYNQSRSDIEIDLRVYPDEIKPMEDGVSIRAYTNNVNRKGLQVFIPVKTVDDLKKISKTQKV
VEFKIKGNIEPLERPTNINQFDFRRIMYGKAVYFKVSKASLIEYNILTKNSLIAKIHSWRKKLLERCIKLEEPLQSYCMG
IILGEQTDYLKENSTKLRNMGIIHLFCISGLHVFYFIKLIEIVFTRFKIKRETMEITQIGVLPLYFILGGGSTSLFRAVV
LVLVQLITKKIAIKISTLDSWCLVLLVNLWLNPFVLLQMGGQLSYLLSFVLIMQQMENGWTTGIKLFLVELPIILFSTYK
IHLLTMVFNLIIVPIFSSVIVPIVIVAFALPQLMALLNPIIMMFEVTLKYLDKLPGLIQVGKPSRLITLFMVILALKIIS
TKQSKFKKRALTFYSLIWLGLWSWFKLNPYGEITFFDVGQGDSILIREPFNRTVTLIDTGGKMQFGKKPVAMKHTIAKNS
SINYLQSIGVSKLNNLCLTHQDIDHIGEASEILNNFKVKNLVFPVGVDTTQNYQRKILPFIRRNTKVIACLAGTKIDHLP
MEIKYPFQAGKGENGDSLVLAGNVGGKNLLLTGDLDLAGERKLLESGVLNQRVDIFKLGHHGSKTANSEEILKAIMPKLA
IVSAGRHNRYGHPNLEVINRLNSMGIPYASTQDEGMISYRYFLNGMGRWKTGIDEKESIIQ

Specific function: The comE operon is required for the binding and uptake of transforming DNA. ComEC is required for internalization but is dispensable for DNA binding [H]

COG id: COG2333

COG function: function code R; Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To H.influenzae REC2, N.gonorrhoeae ComA and E.coli YcaI [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081801, Length=654, Percent_Identity=21.7125382262997, Blast_Score=100, Evalue=5e-22,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001279
- InterPro:   IPR004477
- InterPro:   IPR004797 [H]

Pfam domain/function: PF03772 Competence; PF00753 Lactamase_B [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 79626; Mature: 79626

Theoretical pI: Translated: 10.14; Mature: 10.14

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MISVCFFIHFSHKANSINTYNQSRSDIEIDLRVYPDEIKPMEDGVSIRAYTNNVNRKGLQ
CEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEE
VFIPVKTVDDLKKISKTQKVVEFKIKGNIEPLERPTNINQFDFRRIMYGKAVYFKVSKAS
EEEECCCHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEEECCCC
LIEYNILTKNSLIAKIHSWRKKLLERCIKLEEPLQSYCMGIILGEQTDYLKENSTKLRNM
EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHCCCCHHHHC
GIIHLFCISGLHVFYFIKLIEIVFTRFKIKRETMEITQIGVLPLYFILGGGSTSLFRAVV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHH
LVLVQLITKKIAIKISTLDSWCLVLLVNLWLNPFVLLQMGGQLSYLLSFVLIMQQMENGW
HHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TTGIKLFLVELPIILFSTYKIHLLTMVFNLIIVPIFSSVIVPIVIVAFALPQLMALLNPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMMFEVTLKYLDKLPGLIQVGKPSRLITLFMVILALKIISTKQSKFKKRALTFYSLIWLG
HHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LWSWFKLNPYGEITFFDVGQGDSILIREPFNRTVTLIDTGGKMQFGKKPVAMKHTIAKNS
HHHHEEECCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCC
SINYLQSIGVSKLNNLCLTHQDIDHIGEASEILNNFKVKNLVFPVGVDTTQNYQRKILPF
CHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHCCHHHHHHHCCCHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHH
IRRNTKVIACLAGTKIDHLPMEIKYPFQAGKGENGDSLVLAGNVGGKNLLLTGDLDLAGE
HHCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCC
RKLLESGVLNQRVDIFKLGHHGSKTANSEEILKAIMPKLAIVSAGRHNRYGHPNLEVINR
HHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCHHHHHH
LNSMGIPYASTQDEGMISYRYFLNGMGRWKTGIDEKESIIQ
HHHCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MISVCFFIHFSHKANSINTYNQSRSDIEIDLRVYPDEIKPMEDGVSIRAYTNNVNRKGLQ
CEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEE
VFIPVKTVDDLKKISKTQKVVEFKIKGNIEPLERPTNINQFDFRRIMYGKAVYFKVSKAS
EEEECCCHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEEECCCC
LIEYNILTKNSLIAKIHSWRKKLLERCIKLEEPLQSYCMGIILGEQTDYLKENSTKLRNM
EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHCCCCHHHHC
GIIHLFCISGLHVFYFIKLIEIVFTRFKIKRETMEITQIGVLPLYFILGGGSTSLFRAVV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHH
LVLVQLITKKIAIKISTLDSWCLVLLVNLWLNPFVLLQMGGQLSYLLSFVLIMQQMENGW
HHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TTGIKLFLVELPIILFSTYKIHLLTMVFNLIIVPIFSSVIVPIVIVAFALPQLMALLNPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMMFEVTLKYLDKLPGLIQVGKPSRLITLFMVILALKIISTKQSKFKKRALTFYSLIWLG
HHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LWSWFKLNPYGEITFFDVGQGDSILIREPFNRTVTLIDTGGKMQFGKKPVAMKHTIAKNS
HHHHEEECCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCC
SINYLQSIGVSKLNNLCLTHQDIDHIGEASEILNNFKVKNLVFPVGVDTTQNYQRKILPF
CHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHCCHHHHHHHCCCHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHH
IRRNTKVIACLAGTKIDHLPMEIKYPFQAGKGENGDSLVLAGNVGGKNLLLTGDLDLAGE
HHCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCC
RKLLESGVLNQRVDIFKLGHHGSKTANSEEILKAIMPKLAIVSAGRHNRYGHPNLEVINR
HHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCHHHHHH
LNSMGIPYASTQDEGMISYRYFLNGMGRWKTGIDEKESIIQ
HHHCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7968523; 8969508; 9384377 [H]