| Definition | Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008508 |
| Length | 3,614,446 |
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The map label for this gene is pknB [H]
Identifier: 116328762
GI number: 116328762
Start: 2502348
End: 2507720
Strand: Reverse
Name: pknB [H]
Synonym: LBL_2136
Alternate gene names: 116328762
Gene position: 2507720-2502348 (Counterclockwise)
Preceding gene: 116328763
Following gene: 116328761
Centisome position: 69.38
GC content: 40.33
Gene sequence:
>5373_bases ATGTCAATTCGAACGGATCTGGCCGCCTTTCAAACGAACGAAATTCTACTGCAAGATCACGTCTCGACGGTTTACAGAGG GATCTTAAAGGGGGAATCCGAAACAAAAATCCTTAGGATTCAGAAAGAAAAAACTAAAGAAGAGGATTCTTTTTACTTTT TGAACGAATACGAGATCGGAAAATTGATTTCCGACGATCATATCTTAAAGCCCGAACATATATTAAGGATTCAGGATAAA TACTGCCTCGTCTATGAAAATCTGAAAAGTGTTCTTCTGTCGGATTATATGTCCGAGGTCGGTCCGTTAGCCGTGGAGGA ATACCTTCAAATTGCGCTTTCGGTTACTGAAAATGTGGTTCACCTACATTCGCAGGGGGTTCTTCACAATCAGATTGGTC CTAATTCCTTTTTTTACGACGCCGGTACAAAAACCTCCGTTCTTGCTTGGCTCGGCTCCTCTTCTTTACTCATAGGAGAA AAAGGAAATCCCGCTCCTTTACAGATTTCGTCTACGTTACTCGCTTATTGTTCCCCGGAACGGACTGGAAAGCTCAATCG CTCCGTGGATTTTCGATCGGACGGTTATTCTATCGGCGCTTTGTTCTATTGGCTTTTAACGGGTAAACCTCCTTTCGAAT CCGACGACCCGTTGGAAATCATACATTCTCACATAGCCCGCGTTCCCATTCCGGTATCTGAAAAAAGAAAAGAGATTCCG GTTCCGATTTCGAATCTCGTAATGAAATTACTTTCCAAAATGCCGGAGGAAAGATATTTCTCGTTGGAAACGTTACTCTA CGATTTGCGGATTCTTTACGATTCCGTTCGGTCTCAAAGAAGCATTTTGGAGTTTATTCCCGGTTTTACCGAAAAAAAGG ATAAGTTTCGAATCTCCCAAAAGTTATACGGAAGAGACAAGGAAAAGGAAATCATAGAGGAAGCGATTTCTTCCGTTTAT 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Upstream 100 bases:
>100_bases TCTATTTCCCGAAGGAATATTTCGTTTTATGTTTGGGTGTATTGGTTTTTATAGCGGATGCATATTACGTCTATTTATTT GCAAAGACTAGAAAATAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ACTACAAGCTTGAATTTGAAAAATTTTGAGATGGTGGCAAGTTTTTTTGGAGATTTGTCGTATAATACAAACCTTTTGCG GATGAGATCGAACTTCTGAA
Product: ATPase/protein kinase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1790; Mature: 1789
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_1790_residues MSIRTDLAAFQTNEILLQDHVSTVYRGILKGESETKILRIQKEKTKEEDSFYFLNEYEIGKLISDDHILKPEHILRIQDK YCLVYENLKSVLLSDYMSEVGPLAVEEYLQIALSVTENVVHLHSQGVLHNQIGPNSFFYDAGTKTSVLAWLGSSSLLIGE KGNPAPLQISSTLLAYCSPERTGKLNRSVDFRSDGYSIGALFYWLLTGKPPFESDDPLEIIHSHIARVPIPVSEKRKEIP VPISNLVMKLLSKMPEERYFSLETLLYDLRILYDSVRSQRSILEFIPGFTEKKDKFRISQKLYGRDKEKEIIEEAISSVY SGVKASILIKGKSGTGKTSLIQDTILSKELNTLRSFKGKFEEDKKGIPYFALRQVLVELSNYLLTQSEYEIQSFRKKIQE KLRGNIQLLAQLIPEIENLTGIFPVSSEHQSQKDDQFLFIVILRFLSVCFNRRSPALLILDDIQWADPASLALIEFISRL TEWEGMLFVFISRNEEEYSDFLNSFRERILNSEILLQEISLNPLDQTMIRSYVTDSLDLKEEDSEKLTEILYQKTNGNPF FLNQFFNTLYTESFIRYQKSSGIWSLDWDQIIKKTVTENVLDLLTEEITRLPEDTQEFLKVAACVGNLFDLGILYRYFQD IPEIVETGIRECIKQGIIIYQESQVSLYPILQILKKKNVEELDKNRVFEGITFRFSHDKINQVIGESIALDQRAEIHKNL AWFLIESDRLTSKQERIPEIANHLIKSQKILSSKEEVEIFNHYIILAGNSAKLAAAFNTAYNLFTLLKKKITEESWKDRK EQCVQIYKSFAESAYFLSKTLEAEDAVQVLLSRLQDRIEIVDVYLMQLEVMNAKNDLEGAYKVGLKALQSLDVGFPEKPG ITVLIFEFLKMIYYQRGRSPERLREAKKNQDPYKIETINILTNMLNYGKHSDGKLFVFLFLKLMNITLKEGNSPVSFFGY AGFGSLLFVVTGNFKTTLRYWDLGEYIIRIFNADRIRGRYLFGKNMLLDFYRQPFSKLVLLADEAYEKCIQYGDYLWAAF SLISHSIYHLYSSDTSESYYEVLIKDAKRGEQLGYETVYIVVASSDFLIRSIGNTSKQNVIYRDREMSAEIFEREVLVPN ANGTANAWYAVLRGKETYLSGEWKEGLRVFDKFANDLERSRTIFIYSEYRFYKSLHLIRSNESKRRLSWSNLFFIKRSIS LFKVWSKTFPDNFQSYFYILKAEYNRYKKDFAKTDMFYESALSSLRENEGNLRKTIVHEHAGVWEFERGRKHYANYLLKV SERQYRTWGATAKANQIQAMRQHEEDVGILLRMREEALWDTILKSAEKLDFRSVLKSSQSISEIIEQDELLRKLMRTIME NAGATRGFLILPRKDGLYVETGQDIEREDILTRSLILDYATELLPIEIVYYCYRSGQRILLNNTSSKDSPHSLNSYIGAK RPKSLLCLPITKQGRILSVLYLENGLTYDVFDEHKLEILEILSSQAAISLENAKLYEDITSLNAELEKKVELRTQELMQS LEIIRKDLLYSKKIQRSILPEHPVLPGIVYSVSYQPMDEVGGDFYDLFEIRPGVYRFFVADATGHGVQAALITMAIKSEY EHLKKIQKNPSSLLGELNAVILEKFKTLYLTCVVADINVKNHTLEYSSAGHPPQILLREGKTDLFHKTGAILGLKKDFVY YTEKVKLKSGDRIYLFTDGIYEQFNATKTEFGEARFSNSIVLSSSLSPEDQISTVQKDLNLFLQGEPIQDDLTLIIIEVV FSRSQKKLIYKSWFLRSEVRKIFVPQKFRA >Mature_1789_residues SIRTDLAAFQTNEILLQDHVSTVYRGILKGESETKILRIQKEKTKEEDSFYFLNEYEIGKLISDDHILKPEHILRIQDKY CLVYENLKSVLLSDYMSEVGPLAVEEYLQIALSVTENVVHLHSQGVLHNQIGPNSFFYDAGTKTSVLAWLGSSSLLIGEK GNPAPLQISSTLLAYCSPERTGKLNRSVDFRSDGYSIGALFYWLLTGKPPFESDDPLEIIHSHIARVPIPVSEKRKEIPV PISNLVMKLLSKMPEERYFSLETLLYDLRILYDSVRSQRSILEFIPGFTEKKDKFRISQKLYGRDKEKEIIEEAISSVYS GVKASILIKGKSGTGKTSLIQDTILSKELNTLRSFKGKFEEDKKGIPYFALRQVLVELSNYLLTQSEYEIQSFRKKIQEK LRGNIQLLAQLIPEIENLTGIFPVSSEHQSQKDDQFLFIVILRFLSVCFNRRSPALLILDDIQWADPASLALIEFISRLT EWEGMLFVFISRNEEEYSDFLNSFRERILNSEILLQEISLNPLDQTMIRSYVTDSLDLKEEDSEKLTEILYQKTNGNPFF LNQFFNTLYTESFIRYQKSSGIWSLDWDQIIKKTVTENVLDLLTEEITRLPEDTQEFLKVAACVGNLFDLGILYRYFQDI PEIVETGIRECIKQGIIIYQESQVSLYPILQILKKKNVEELDKNRVFEGITFRFSHDKINQVIGESIALDQRAEIHKNLA WFLIESDRLTSKQERIPEIANHLIKSQKILSSKEEVEIFNHYIILAGNSAKLAAAFNTAYNLFTLLKKKITEESWKDRKE QCVQIYKSFAESAYFLSKTLEAEDAVQVLLSRLQDRIEIVDVYLMQLEVMNAKNDLEGAYKVGLKALQSLDVGFPEKPGI TVLIFEFLKMIYYQRGRSPERLREAKKNQDPYKIETINILTNMLNYGKHSDGKLFVFLFLKLMNITLKEGNSPVSFFGYA GFGSLLFVVTGNFKTTLRYWDLGEYIIRIFNADRIRGRYLFGKNMLLDFYRQPFSKLVLLADEAYEKCIQYGDYLWAAFS LISHSIYHLYSSDTSESYYEVLIKDAKRGEQLGYETVYIVVASSDFLIRSIGNTSKQNVIYRDREMSAEIFEREVLVPNA NGTANAWYAVLRGKETYLSGEWKEGLRVFDKFANDLERSRTIFIYSEYRFYKSLHLIRSNESKRRLSWSNLFFIKRSISL FKVWSKTFPDNFQSYFYILKAEYNRYKKDFAKTDMFYESALSSLRENEGNLRKTIVHEHAGVWEFERGRKHYANYLLKVS ERQYRTWGATAKANQIQAMRQHEEDVGILLRMREEALWDTILKSAEKLDFRSVLKSSQSISEIIEQDELLRKLMRTIMEN AGATRGFLILPRKDGLYVETGQDIEREDILTRSLILDYATELLPIEIVYYCYRSGQRILLNNTSSKDSPHSLNSYIGAKR PKSLLCLPITKQGRILSVLYLENGLTYDVFDEHKLEILEILSSQAAISLENAKLYEDITSLNAELEKKVELRTQELMQSL EIIRKDLLYSKKIQRSILPEHPVLPGIVYSVSYQPMDEVGGDFYDLFEIRPGVYRFFVADATGHGVQAALITMAIKSEYE HLKKIQKNPSSLLGELNAVILEKFKTLYLTCVVADINVKNHTLEYSSAGHPPQILLREGKTDLFHKTGAILGLKKDFVYY TEKVKLKSGDRIYLFTDGIYEQFNATKTEFGEARFSNSIVLSSSLSPEDQISTVQKDLNLFLQGEPIQDDLTLIIIEVVF SRSQKKLIYKSWFLRSEVRKIFVPQKFRA
Specific function: Unknown
COG id: COG3899
COG function: function code R; Predicted ATPase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 protein kinase domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011009 - InterPro: IPR005543 - InterPro: IPR000719 - InterPro: IPR017441 - InterPro: IPR017442 - InterPro: IPR008271 - InterPro: IPR002290 [H]
Pfam domain/function: PF03793 PASTA; PF00069 Pkinase [H]
EC number: =2.7.11.1 [H]
Molecular weight: Translated: 207146; Mature: 207015
Theoretical pI: Translated: 6.73; Mature: 6.73
Prosite motif: PS50011 PROTEIN_KINASE_DOM
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSIRTDLAAFQTNEILLQDHVSTVYRGILKGESETKILRIQKEKTKEEDSFYFLNEYEIG CCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCEEEECCCCCC KLISDDHILKPEHILRIQDKYCLVYENLKSVLLSDYMSEVGPLAVEEYLQIALSVTENVV CCCCCCCCCCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLHSQGVLHNQIGPNSFFYDAGTKTSVLAWLGSSSLLIGEKGNPAPLQISSTLLAYCSPE HHHCCCCEECCCCCCCEEECCCCCHHHHEEECCCCEEEECCCCCCCEEEHHHHHHHCCCC RTGKLNRSVDFRSDGYSIGALFYWLLTGKPPFESDDPLEIIHSHIARVPIPVSEKRKEIP CCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC VPISNLVMKLLSKMPEERYFSLETLLYDLRILYDSVRSQRSILEFIPGFTEKKDKFRISQ CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH KLYGRDKEKEIIEEAISSVYSGVKASILIKGKSGTGKTSLIQDTILSKELNTLRSFKGKF HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC EEDKKGIPYFALRQVLVELSNYLLTQSEYEIQSFRKKIQEKLRGNIQLLAQLIPEIENLT CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC GIFPVSSEHQSQKDDQFLFIVILRFLSVCFNRRSPALLILDDIQWADPASLALIEFISRL 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