| Definition | Nitrosomonas eutropha C91, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008344 |
| Length | 2,661,057 |
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The map label for this gene is 114332273
Identifier: 114332273
GI number: 114332273
Start: 2437871
End: 2440015
Strand: Reverse
Name: 114332273
Synonym: Neut_2313
Alternate gene names: NA
Gene position: 2440015-2437871 (Counterclockwise)
Preceding gene: 114332274
Following gene: 114332272
Centisome position: 91.69
GC content: 39.86
Gene sequence:
>2145_bases ATGGAAGTTGTTGCGATACTCGCTCGTTGGTCACAGCTTGTTGCTAATCTGGTATTGCTTGGCAGTTGTACTTATCTCGC GGTAGCGGGCGCAAGGAAGGAGTTATTTAGTAATAACTGGATCCTACGTTTAGAAAAATTATTTCCATTGTTGGCTTGTA TAATTTTAATTGGTCTCGTAGGGATTTTGGCAACTACTACGGGAAAAGCAACAGGGATTGAATCAAACGTATGGAAGCCT GATGCATGGATAAAAATTGTCCAACATACCAATATGGGGCACATGTGGGCAGTACGTGCGGTATCAGCTTTGCTTTTGCT GGGTGCTGCTACATTTGTCTCGCTAAAACGTGAGCGGGCCAGATGGCATTACGTCATGGTTGCAGGCTTGGCATCTCTGC CTTTGATAGCTTCTGCTATGGTAAGTCATGCTGGTTCAGACGAGAATTTCTTGTTTTATGCTCCTGTTTATGTCATGCAT ATTTTGATGGCTGGAGTGTGGTTTGGTGCGCTGCCGGCATTTTTGTTTATTATTTTTGATCGACGTAATTGTGAGGAAAA GGGTACTCAACTGGTTTTGAATGTAGAAAGCCTTAAGAAGTTTTCTTTCATTGCTTTGCCCGTTATGACTGTAATTATAT TAACAGGCCTGGTTCTGACAGATCGGATGGTTGAGAATTATTATCATGCACTGGTTGCGAGCACTTATGGCTGGGCATTG ATCATCAAAATTTCTTTATTGGTGGTTATTTTATTGATAGCTTTCCAGGCACGATCAAAGTGGCTTCCTTCATTTGAACG AGTTTGTGATTCGATTAATTTCTCCGAGCTTAAAAAGGAAAGTGAACGGAAGAATTTCCTATTTTCAAAAGTAATGCATA AAGCTGTTCAGGCAGAAAACTATGATTATGATGGGGATGCTGCCAATATTGGTGTGGAAAAATTAAGGAAATGGGTTCGG ATTGAATTTTTATTCGCATTGTTGCTTGTATTGTTTGCAACAATCCTCTCCAACTCTGTGCCCGCTAAACATGCAATAGT TGAAAATTGGCCTTATTCATTCCGCTTCACAATAGAGGGAACTTTGGGAGCGGGGACATGGAAAGATCCAAGTGTTCAGT TTTTTCTGGTATTGGGAGTCATTTTATTTGTTACAGCGATTGGTTCATTCTTGCTGGGGATAAAAAAAAACAGGAGTCCC AGAAAACATAATATGGTGACAATGGCGCTAATGTTAGGTTGCGCAGCTGTTACGTTACCCCAATTTGCTGTTGATGCGTT TCCTGAAACATATCGAAATACACCAATTCCATTTGATGCAATTTCAATTTCGAATGGAACAGCTCATTTTTCTGAATTTT GCTCCACTTGTCATGGGCCGCAAGGGATAGGTAATGGCATTCTTGCTAAAACCCTACCGAAGATGCCTACAGATTTACTC ACTGATTTATATACATCGAGACATCTTGCTGGCGATTTTTTTCATTGGATAAGTCATGGTATTAAAGAAGCAGGCATGCC TGGTTTTTCTGAAAAGCTAGAGGAAGAGGATCGATGGGATATTGTTAATTATATTCGAGCAATGTCGAGTGGCTATCAGC TAAGGTGGCTGGGTCCCATTGCTGCTTCGTATAAACTCTCAACGACACCACCTGATTTCCAGTTTACAACCTATACTGAC ACTACTGGTACTCTTAAAGAATATCGACAAAATAAAAATGTTTTGCTAGCATTTTTTAGCTGGCCCAGTTCTTTAGAAAG ATTGAAAGAGTTGAGCGAAAATTACGAAAAATTTAGAAACTTAAATACTGTTATACTCGCCATTCCTTTAGATGAATACA GTGAAACAGCAATAGCTGACTTTGCTGCCAATAACTCTATTGAAGTGGTAAGGGATGGATGGCTTGAAATAAAAGATAGT TACATTTTATATAGGCGAACCCTTAAATATCCTGATATTCTAGGAAAAGGTAATATACCTGATCACATGGAATTTCTTGT TGATCGGTTTGGCTTTTTGCGTGCACGATGGATACCCTCGATGGATCAATTTGGCTGGGATAACCTGGTGTTACTTACTG ATCAACTTCAGCAACTTAATCAGGAAAAGGAGATATTGCCACAGCTGCATAATCATGCACATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTCGGTATACAGTTAAGTTTCGGGTGTTGTCGGTAGATGGGCACGTACTGGATTCAGAATATAAATTTACGGTTAAGAAA AATAAAATTAAGTAAAAGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTCTATCAAGAGAAACTTCAGAAAGAAGAGTTTTAGTTGGCCTATTTAAGTAGGTTTAATAATAAAATTGTAGAGCTTGT AGAGCAATTTTTAACTGTGA
Product: copper resistance D domain-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: Cytochrome C Oxidase Mono-Heme Subunit/FixO; Cytochrome C Class ICCytochrome C Class I; Copper Resistance D Domain-Containing Protein
Number of amino acids: Translated: 714; Mature: 714
Protein sequence:
>714_residues MEVVAILARWSQLVANLVLLGSCTYLAVAGARKELFSNNWILRLEKLFPLLACIILIGLVGILATTTGKATGIESNVWKP DAWIKIVQHTNMGHMWAVRAVSALLLLGAATFVSLKRERARWHYVMVAGLASLPLIASAMVSHAGSDENFLFYAPVYVMH ILMAGVWFGALPAFLFIIFDRRNCEEKGTQLVLNVESLKKFSFIALPVMTVIILTGLVLTDRMVENYYHALVASTYGWAL IIKISLLVVILLIAFQARSKWLPSFERVCDSINFSELKKESERKNFLFSKVMHKAVQAENYDYDGDAANIGVEKLRKWVR IEFLFALLLVLFATILSNSVPAKHAIVENWPYSFRFTIEGTLGAGTWKDPSVQFFLVLGVILFVTAIGSFLLGIKKNRSP RKHNMVTMALMLGCAAVTLPQFAVDAFPETYRNTPIPFDAISISNGTAHFSEFCSTCHGPQGIGNGILAKTLPKMPTDLL TDLYTSRHLAGDFFHWISHGIKEAGMPGFSEKLEEEDRWDIVNYIRAMSSGYQLRWLGPIAASYKLSTTPPDFQFTTYTD TTGTLKEYRQNKNVLLAFFSWPSSLERLKELSENYEKFRNLNTVILAIPLDEYSETAIADFAANNSIEVVRDGWLEIKDS YILYRRTLKYPDILGKGNIPDHMEFLVDRFGFLRARWIPSMDQFGWDNLVLLTDQLQQLNQEKEILPQLHNHAH
Sequences:
>Translated_714_residues MEVVAILARWSQLVANLVLLGSCTYLAVAGARKELFSNNWILRLEKLFPLLACIILIGLVGILATTTGKATGIESNVWKP DAWIKIVQHTNMGHMWAVRAVSALLLLGAATFVSLKRERARWHYVMVAGLASLPLIASAMVSHAGSDENFLFYAPVYVMH ILMAGVWFGALPAFLFIIFDRRNCEEKGTQLVLNVESLKKFSFIALPVMTVIILTGLVLTDRMVENYYHALVASTYGWAL IIKISLLVVILLIAFQARSKWLPSFERVCDSINFSELKKESERKNFLFSKVMHKAVQAENYDYDGDAANIGVEKLRKWVR IEFLFALLLVLFATILSNSVPAKHAIVENWPYSFRFTIEGTLGAGTWKDPSVQFFLVLGVILFVTAIGSFLLGIKKNRSP RKHNMVTMALMLGCAAVTLPQFAVDAFPETYRNTPIPFDAISISNGTAHFSEFCSTCHGPQGIGNGILAKTLPKMPTDLL TDLYTSRHLAGDFFHWISHGIKEAGMPGFSEKLEEEDRWDIVNYIRAMSSGYQLRWLGPIAASYKLSTTPPDFQFTTYTD TTGTLKEYRQNKNVLLAFFSWPSSLERLKELSENYEKFRNLNTVILAIPLDEYSETAIADFAANNSIEVVRDGWLEIKDS YILYRRTLKYPDILGKGNIPDHMEFLVDRFGFLRARWIPSMDQFGWDNLVLLTDQLQQLNQEKEILPQLHNHAH >Mature_714_residues MEVVAILARWSQLVANLVLLGSCTYLAVAGARKELFSNNWILRLEKLFPLLACIILIGLVGILATTTGKATGIESNVWKP DAWIKIVQHTNMGHMWAVRAVSALLLLGAATFVSLKRERARWHYVMVAGLASLPLIASAMVSHAGSDENFLFYAPVYVMH ILMAGVWFGALPAFLFIIFDRRNCEEKGTQLVLNVESLKKFSFIALPVMTVIILTGLVLTDRMVENYYHALVASTYGWAL IIKISLLVVILLIAFQARSKWLPSFERVCDSINFSELKKESERKNFLFSKVMHKAVQAENYDYDGDAANIGVEKLRKWVR IEFLFALLLVLFATILSNSVPAKHAIVENWPYSFRFTIEGTLGAGTWKDPSVQFFLVLGVILFVTAIGSFLLGIKKNRSP RKHNMVTMALMLGCAAVTLPQFAVDAFPETYRNTPIPFDAISISNGTAHFSEFCSTCHGPQGIGNGILAKTLPKMPTDLL TDLYTSRHLAGDFFHWISHGIKEAGMPGFSEKLEEEDRWDIVNYIRAMSSGYQLRWLGPIAASYKLSTTPPDFQFTTYTD TTGTLKEYRQNKNVLLAFFSWPSSLERLKELSENYEKFRNLNTVILAIPLDEYSETAIADFAANNSIEVVRDGWLEIKDS YILYRRTLKYPDILGKGNIPDHMEFLVDRFGFLRARWIPSMDQFGWDNLVLLTDQLQQLNQEKEILPQLHNHAH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80639; Mature: 80639
Theoretical pI: Translated: 8.09; Mature: 8.09
Prosite motif: PS51007 CYTC
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEVVAILARWSQLVANLVLLGSCTYLAVAGARKELFSNNWILRLEKLFPLLACIILIGLV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH GILATTTGKATGIESNVWKPDAWIKIVQHTNMGHMWAVRAVSALLLLGAATFVSLKRERA HHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RWHYVMVAGLASLPLIASAMVSHAGSDENFLFYAPVYVMHILMAGVWFGALPAFLFIIFD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RRNCEEKGTQLVLNVESLKKFSFIALPVMTVIILTGLVLTDRMVENYYHALVASTYGWAL CCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH IIKISLLVVILLIAFQARSKWLPSFERVCDSINFSELKKESERKNFLFSKVMHKAVQAEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YDYDGDAANIGVEKLRKWVRIEFLFALLLVLFATILSNSVPAKHAIVENWPYSFRFTIEG CCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEEEEE TLGAGTWKDPSVQFFLVLGVILFVTAIGSFLLGIKKNRSPRKHNMVTMALMLGCAAVTLP EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFAVDAFPETYRNTPIPFDAISISNGTAHFSEFCSTCHGPQGIGNGILAKTLPKMPTDLL HHHHHHCHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHH TDLYTSRHLAGDFFHWISHGIKEAGMPGFSEKLEEEDRWDIVNYIRAMSSGYQLRWLGPI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCC AASYKLSTTPPDFQFTTYTDTTGTLKEYRQNKNVLLAFFSWPSSLERLKELSENYEKFRN CCCCEECCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC LNTVILAIPLDEYSETAIADFAANNSIEVVRDGWLEIKDSYILYRRTLKYPDILGKGNIP CCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCHHEEECCCHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCC DHMEFLVDRFGFLRARWIPSMDQFGWDNLVLLTDQLQQLNQEKEILPQLHNHAH HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCEEEEHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MEVVAILARWSQLVANLVLLGSCTYLAVAGARKELFSNNWILRLEKLFPLLACIILIGLV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH GILATTTGKATGIESNVWKPDAWIKIVQHTNMGHMWAVRAVSALLLLGAATFVSLKRERA HHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RWHYVMVAGLASLPLIASAMVSHAGSDENFLFYAPVYVMHILMAGVWFGALPAFLFIIFD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RRNCEEKGTQLVLNVESLKKFSFIALPVMTVIILTGLVLTDRMVENYYHALVASTYGWAL CCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH IIKISLLVVILLIAFQARSKWLPSFERVCDSINFSELKKESERKNFLFSKVMHKAVQAEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YDYDGDAANIGVEKLRKWVRIEFLFALLLVLFATILSNSVPAKHAIVENWPYSFRFTIEG CCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEEEEE TLGAGTWKDPSVQFFLVLGVILFVTAIGSFLLGIKKNRSPRKHNMVTMALMLGCAAVTLP EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFAVDAFPETYRNTPIPFDAISISNGTAHFSEFCSTCHGPQGIGNGILAKTLPKMPTDLL HHHHHHCHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHH TDLYTSRHLAGDFFHWISHGIKEAGMPGFSEKLEEEDRWDIVNYIRAMSSGYQLRWLGPI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCC AASYKLSTTPPDFQFTTYTDTTGTLKEYRQNKNVLLAFFSWPSSLERLKELSENYEKFRN CCCCEECCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC LNTVILAIPLDEYSETAIADFAANNSIEVVRDGWLEIKDSYILYRRTLKYPDILGKGNIP CCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCHHEEECCCHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCC DHMEFLVDRFGFLRARWIPSMDQFGWDNLVLLTDQLQQLNQEKEILPQLHNHAH HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCEEEEHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA