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Definition Nitrosomonas eutropha C91, complete genome.
Accession NC_008344
Length 2,661,057

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The map label for this gene is cheA [H]

Identifier: 114331160

GI number: 114331160

Start: 1204410

End: 1209560

Strand: Direct

Name: cheA [H]

Synonym: Neut_1162

Alternate gene names: 114331160

Gene position: 1204410-1209560 (Clockwise)

Preceding gene: 114331159

Following gene: 114331161

Centisome position: 45.26

GC content: 50.07

Gene sequence:

>5151_bases
ATGAATACTGATACTAGGATAAATATCTCATCTGTTATGGGGATCAGAGAAGCCATTGAGCAGATTTTTACCTTGATCCA
CCGCCACTTTGATTCTTATGCCACGGATACGGATGACACCAGGCAGATTGAAGAATGCCGGTATTACATGCATCAACTGA
ATGGCATGCTTGAGATGCTGGAGCTGAGTGGGGTGGCGTTTGTCGGGATCAGTGTGGAAGAGCTGCTAGCAGCTTTACAG
GAACGGAGGATTGAACCGGACGCGCAGACTTTGGTTGTTGTCCGGCAGGCTATCCGCTCCATTTACCGTTACCTGGATGC
GCTGATAGATGGTGAGGTGGACAATCCGGTCAAGCTTTTTCCGGTCTACCGCAAGATCATGCAAGTGCAGGGGCTGGAAG
AAATCTCTGAAAGTGATTTGTTTTTCCCGGACATACGTGAATCGTTACCCCTACAACCTGTAGAGCTGGATCTGGATGAT
ACTTCCCGGCAAGAGACAGCCAAACAGGCGCGTGCGCAATTCCAGTCGGGATTGCTAAGCTGGCTGAAAAATGCTGATGA
CAAGCAGAGTCTGCAGAAAATGATTGAAGCGGTACGATCAATCGAGAAACTGCCGGCTGCTATTGAACAGCGGAAATTTT
GGTGGATCTCTTCCGGATTCCTGGATAGCCTGCTTCATCAGGAGCAGGTCGTTGACAAGTCGGTGCGCAGATTGTGCGGG
AAGATCGAGCAGGAAATCCGGCATCTGAACAAGGAATCACACGTTGTCGCTGCCCGGTTGACAAGAGAGTTGCTTTACCG
GATCGCACGCAGCCAGCCAGTGAGTGAACGCCTCCAGGAAATCAGTCGTGTCTATGACTGGCAGATTCCCTTGTCCACGA
TTGATAATCAGGAGCATCTTGACGAATCCATCATGGATGAAGAGGCAACTGCTTCGGATCTGCAGAGCATGCGTGTTCTG
CTGGAAGACATCAATGATCAGTGGCGCAAGTTCAATGCAGAAGATCAGGAAAATATTTCATCCTTGCTGGCGTTAACTGA
ACAGTTAAAAGTCCTGATTTCCAGGGTAAGTTGTCCTCCGCTGGAGAAACTGGCAGGCGTCATTCATGGTGTCTTGTCCT
ATTTGCGAATCCGCCCACAGAGCATGAATGAGGGAATTGCACTGGATATTGCCTCATCCCTGCTACTGACAGAAAATGCC
ATCGATAATTTTCATCGTTTGTCGCCGGAATTTCCGTCACAGGTCGATGCACTTGCCACCCGTATACGTGCAGTTACGAC
CGGCAAGGGAGAGGATATCGATTTACCTGATTTGCCCAATCCGGATCAGGCAGGCCATCTCACCCAGGAGAAAAAATTGT
TCAAACAGGTGGCGCAGGAAGTGCTCGCCAACCTGGCGCAAGTTGAAGATATCCTGGATCGTTTCTTTTTTGAACCGGAA
ATACGCAACGATCTGCCGCTTTTGCCTGAATTGTTCAACCAAATCAGCGGTGTATTGAATGTGCTTGAACTTGATCAAGC
CAGTACAGTGCTGGATTCATGTCGGGCTCTCACGGAAAAACTGACAGCATCTGATCACCTGATAGATCAAGCTGAGCAGA
TGTTGTTGGCCGATGCGCTGAGCAGTCTTGGTTTTTACATTGAAGCACTCAGGAATTCCCAGTCGGATGCTGAGGAAATT
CTTGCAACGATAATGCAACGGCTTGGCCAGAAGCCTGCCGGGCTAGGTTTATCAACAGATATTCGGGAAATCCCTATTGA
TTTCGCTGTGGCTGCTGATCGTTTATTTGAAAGTGATCCGGAGCAGCTGATTGATCCCGAGTTATTGGCAGTCTTTCTTG
ATGAATCCAGTGATGTACTGGCAAGCATTGCTGATCATTTAGAGTCGTGTTATGCCAATTACGCGAATCAGGACGCCCTG
ACAACTATCCGACGCGATTTCCATACGCTCAAAGGTAGTGGTCGCATGGTAAAGCTGGAAGCGCTGAGTGAAGTGGCATG
GCGTATTGAGCAGCTTATGAACCGCTGGCTGAGTGAGCAGAAACCGGCAACCAGCATACTTCTGGATTTGCTGGCAGAAA
GTCACAGGCAGTTTAGCAACTGGTGCGCCAGCCTGAGAAAGGATGGCGCGGTAGAGATCAAGGCTGAATACCTGCTTGAT
CAGATCAGAGCGCTGATGTATGGCACGGACGAACAGCCGGATATTGCGGCTACATCACTTGCACCCGAGGTGTTCGAGCA
GGCTCCGGAGATTGAACCACTGCCAACAATCACCGATGCACTATCTGACATAAAAACCGGAGCAGAAACGGCAATAAGAA
TTGGCGATAGCGAGGTGCCGGCAGATCTCTTCAGAATTTTCATCAATGAAGCCAGTACTCATGTTGCTACTCTCAAACAG
GCATTTAATCTGCCCGGGGATGATGCCATTTTATCGGTTACACATGAATCCATGCTGGCAGCTCATACGCTTGCCAGTAC
ATCACGCGCACTGGAATTGGGTTTCATCGCACAGATCGGACAAGCGCTGGAGCGCTGGTTTAACCGGCTGCTGACGACTT
CAAACATGCCCGGACAGCAAGCATTATCGTACATGACAACTGCGGTCAACTTGCTGGATGATATGCTGGCCACAATTCGG
GAACATCAATTTCCTTCGGCGGAAACTGTGCAGGCCAGCGCAGAAATCACACATGAATTGATGCGCCTTCTGGAAGAAGC
TCCTGCTATACAAGCAACAGAAACAGAGCAGATGGTGGAAATGGAGGAGATGGCGCCACTCGAATTGGCAGTGGACGAAG
TGCTGGAGGAAGATTCATCTGCTTCAATGTCAGAGACTGAGATTTCGTTGCCGGTTTCATCACTTCAGCAGGTGAAAGAT
GCGTTTGCCGACCTGGATCAGGAATTGCTGGAAGTATTTCTTGAAGAAGCACAAGAACTGCAATCCGAGATTGGCACAAA
TCTGCGGATATGGCGTAAACAACCTAATCAGATGAATGCACGCAAGGCAGTATTGCGTGCCTTGCATACCTTGAAGGGCA
GTGCCCGGATTGCTGATGCGCAGCAAGTGAGTGATCTGGCGCATCAGATGGAAAGTGATATTGAATCTCTGTATGATCAG
ACGGCCTCCGCAGCATTGCTTGATCAGCTGGAAACACAGTTCGATACCATTTCGGATAAGGTTGAGCAATTGCGATCCTC
TTTACAACCTGAATCGCAGCCTGCCCCGGTAACTGAAGAAGCCGAGGCACATCCGGAATTGCTTCCTCCCGCAGTGGAAA
CTGTTTCTGCCCTTCCTATATCCACAGCGGATACTGATCAACCTTTCCGCAAAACTACACTGCGTGTCGATGCAGAATTG
ATAGATCGCCTGATTAATGAATCAGGCGAGTCGAGTATCATTCGTTCCCGGGTTGAGGCGCAGCTATATGATCTGGAACA
GTATTTGCAGGATCTGGGTGAAAGTGTTGATCGCATGCGTGGCCAGTTGCGTGAAGTTGAATTGCTGGCTGAAACCCAAA
TGCCAGCCAGCTCGCTACCTTCCATAACTGGTCAGACAGATTTTGATCCGTTGGAACTGGATCGCTTTACTCGCTTTCAG
GAGTTGACCCGGCTGATGGCGGAAAGCATGGATGATGTAGTCACCATTCATAAAAGTTTGCGTGAAATACAGCGTGCCGC
CACGATGACGGTGGATCAGCAGGCACATCTGAATCGACAGTTACAGCAGGATCTGCTGCGTATTCGTACTATTCCTTTCA
GCCATTATTCCGAGCGCCTTTATCGCGCCGTCAGGCAGGTGACCAAAGATACCGGCAAGCAGGCTAACCTGATTATTCAG
GGAGATAGCATTGAGTTTGATCGGGGTGTGCTGGATAAAATCAGCTCTTCCCTGGAGCATCTGCTACGCAATGCGCTGGT
ACATGGCATAGAAACTCCGGAAGAACGTCTGAGCATCGGCAAGGCGGAAGCGGGCCAGATCACACTCGATCTGCACCGGG
ATGGCAACGAAATTGTCATGGTGCTGCAAGATGACGGGATTGGGTTGGATGCAGAACGCATTCGTGAAAAAGCGCGGCAG
CTTGGGTTGGGCAGCCCGGAAAATGAGCAGGACGATGAGCAGTGGTATCCGCTGATTTTTACGCATGGCTTTTCCACATT
GGATGGCGTGACGGATATCGCCGGGCGCGGGGTAGGACTGGATATTGTCAGGAACGAGTTGGGCGAACTGGGCGGGAACA
TCGCAGTCACATCCGAGAAAAACCGGGGAACCACATTCACCCTGCGTTTTCCAGTGACATTGGCCTTAACACAAGCGTTA
ATGGTCAAGGCAGGAGATAGCACTTATGCCATCCCGATAGCGATTGTGGCACATGTATTGGAAATGAATGCAGAAACACT
CGGGACGGCTTATCAGGAGCATCACCTGATATGGAACGGCAATCGCTTTCCACTGGGCTATCTGCCGCACCTGCTGGGGG
TGTCGCATACCTTTCCTGAAATCAGACGTAGTAACCGTATTGTGTTATTGCAAACGGAACATGAGCAGCTGGCCATTCAT
GCCGATGCACTGATCGGGCAATGTGAAGTGGTCATCAAGAATATCGGCCCGCAACTGTCTAATGCACCCGGCATTGAAGG
GGCAACGATCACAGGAGATGGCAGCATCGTATTGATCATTAATCCGATCAAGTTGCTGCAGCGCGAGCAGGTACGGGAGC
TGCTATCTGCAGGACCAATGACGCCAGTTGATGCTGCAGATATTCATCCTTCTGCCACCGCACCGGTTGTCATGATTGTG
GATGATTCGCTGACGGTACGTAAAGTCACCAGCCGACTACTGGAACGGCAGGGCTATGAAATCCTGATTGCCAAAGATGG
CGTGGGGGCACTTCAGCTGCTGCGCGAAACCATACCAGCCATCATGCTGGTTGATATCGAAATGCCGCACATGGATGGCT
TTGAACTGATCCGCGCTGTCCGTAACAACCCGGAGTTACAAAATATCCCGATCATCATCATCTCCTCCCGCACAGCAGAG
AAACACCGGAAAGTAGCAGAGGAACTTGGCGTAAATGAGTTTATGGGTAAACCCTACCAGGAAGATGAGTTGTTGCAGCA
TATTGAACGCCTGATTAAAGAAGGATGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAGTTGCCAATTTCAAGGTATGACAGCTCTGTGCAAAGCTGCCATCTGCAGCAAACCAAAGCCATCCACTATCAATTTT
GGGATTAATAGGGCCGCATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAGTAACCACTGCTCATCCGGTTCAGGCATCAACTTAGCGCAACTTCAAACCCTTGAATTTAAATAGCTATGATTTCAT
TAGAAGAACTTGGTCTTGCT

Product: CheA signal transduction histidine kinases

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1716; Mature: 1716

Protein sequence:

>1716_residues
MNTDTRINISSVMGIREAIEQIFTLIHRHFDSYATDTDDTRQIEECRYYMHQLNGMLEMLELSGVAFVGISVEELLAALQ
ERRIEPDAQTLVVVRQAIRSIYRYLDALIDGEVDNPVKLFPVYRKIMQVQGLEEISESDLFFPDIRESLPLQPVELDLDD
TSRQETAKQARAQFQSGLLSWLKNADDKQSLQKMIEAVRSIEKLPAAIEQRKFWWISSGFLDSLLHQEQVVDKSVRRLCG
KIEQEIRHLNKESHVVAARLTRELLYRIARSQPVSERLQEISRVYDWQIPLSTIDNQEHLDESIMDEEATASDLQSMRVL
LEDINDQWRKFNAEDQENISSLLALTEQLKVLISRVSCPPLEKLAGVIHGVLSYLRIRPQSMNEGIALDIASSLLLTENA
IDNFHRLSPEFPSQVDALATRIRAVTTGKGEDIDLPDLPNPDQAGHLTQEKKLFKQVAQEVLANLAQVEDILDRFFFEPE
IRNDLPLLPELFNQISGVLNVLELDQASTVLDSCRALTEKLTASDHLIDQAEQMLLADALSSLGFYIEALRNSQSDAEEI
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TTIRRDFHTLKGSGRMVKLEALSEVAWRIEQLMNRWLSEQKPATSILLDLLAESHRQFSNWCASLRKDGAVEIKAEYLLD
QIRALMYGTDEQPDIAATSLAPEVFEQAPEIEPLPTITDALSDIKTGAETAIRIGDSEVPADLFRIFINEASTHVATLKQ
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EHQFPSAETVQASAEITHELMRLLEEAPAIQATETEQMVEMEEMAPLELAVDEVLEEDSSASMSETEISLPVSSLQQVKD
AFADLDQELLEVFLEEAQELQSEIGTNLRIWRKQPNQMNARKAVLRALHTLKGSARIADAQQVSDLAHQMESDIESLYDQ
TASAALLDQLETQFDTISDKVEQLRSSLQPESQPAPVTEEAEAHPELLPPAVETVSALPISTADTDQPFRKTTLRVDAEL
IDRLINESGESSIIRSRVEAQLYDLEQYLQDLGESVDRMRGQLREVELLAETQMPASSLPSITGQTDFDPLELDRFTRFQ
ELTRLMAESMDDVVTIHKSLREIQRAATMTVDQQAHLNRQLQQDLLRIRTIPFSHYSERLYRAVRQVTKDTGKQANLIIQ
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ADALIGQCEVVIKNIGPQLSNAPGIEGATITGDGSIVLIINPIKLLQREQVRELLSAGPMTPVDAADIHPSATAPVVMIV
DDSLTVRKVTSRLLERQGYEILIAKDGVGALQLLRETIPAIMLVDIEMPHMDGFELIRAVRNNPELQNIPIIIISSRTAE
KHRKVAEELGVNEFMGKPYQEDELLQHIERLIKEGC

Sequences:

>Translated_1716_residues
MNTDTRINISSVMGIREAIEQIFTLIHRHFDSYATDTDDTRQIEECRYYMHQLNGMLEMLELSGVAFVGISVEELLAALQ
ERRIEPDAQTLVVVRQAIRSIYRYLDALIDGEVDNPVKLFPVYRKIMQVQGLEEISESDLFFPDIRESLPLQPVELDLDD
TSRQETAKQARAQFQSGLLSWLKNADDKQSLQKMIEAVRSIEKLPAAIEQRKFWWISSGFLDSLLHQEQVVDKSVRRLCG
KIEQEIRHLNKESHVVAARLTRELLYRIARSQPVSERLQEISRVYDWQIPLSTIDNQEHLDESIMDEEATASDLQSMRVL
LEDINDQWRKFNAEDQENISSLLALTEQLKVLISRVSCPPLEKLAGVIHGVLSYLRIRPQSMNEGIALDIASSLLLTENA
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AFADLDQELLEVFLEEAQELQSEIGTNLRIWRKQPNQMNARKAVLRALHTLKGSARIADAQQVSDLAHQMESDIESLYDQ
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GDSIEFDRGVLDKISSSLEHLLRNALVHGIETPEERLSIGKAEAGQITLDLHRDGNEIVMVLQDDGIGLDAERIREKARQ
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MVKAGDSTYAIPIAIVAHVLEMNAETLGTAYQEHHLIWNGNRFPLGYLPHLLGVSHTFPEIRRSNRIVLLQTEHEQLAIH
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DDSLTVRKVTSRLLERQGYEILIAKDGVGALQLLRETIPAIMLVDIEMPHMDGFELIRAVRNNPELQNIPIIIISSRTAE
KHRKVAEELGVNEFMGKPYQEDELLQHIERLIKEGC
>Mature_1716_residues
MNTDTRINISSVMGIREAIEQIFTLIHRHFDSYATDTDDTRQIEECRYYMHQLNGMLEMLELSGVAFVGISVEELLAALQ
ERRIEPDAQTLVVVRQAIRSIYRYLDALIDGEVDNPVKLFPVYRKIMQVQGLEEISESDLFFPDIRESLPLQPVELDLDD
TSRQETAKQARAQFQSGLLSWLKNADDKQSLQKMIEAVRSIEKLPAAIEQRKFWWISSGFLDSLLHQEQVVDKSVRRLCG
KIEQEIRHLNKESHVVAARLTRELLYRIARSQPVSERLQEISRVYDWQIPLSTIDNQEHLDESIMDEEATASDLQSMRVL
LEDINDQWRKFNAEDQENISSLLALTEQLKVLISRVSCPPLEKLAGVIHGVLSYLRIRPQSMNEGIALDIASSLLLTENA
IDNFHRLSPEFPSQVDALATRIRAVTTGKGEDIDLPDLPNPDQAGHLTQEKKLFKQVAQEVLANLAQVEDILDRFFFEPE
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QIRALMYGTDEQPDIAATSLAPEVFEQAPEIEPLPTITDALSDIKTGAETAIRIGDSEVPADLFRIFINEASTHVATLKQ
AFNLPGDDAILSVTHESMLAAHTLASTSRALELGFIAQIGQALERWFNRLLTTSNMPGQQALSYMTTAVNLLDDMLATIR
EHQFPSAETVQASAEITHELMRLLEEAPAIQATETEQMVEMEEMAPLELAVDEVLEEDSSASMSETEISLPVSSLQQVKD
AFADLDQELLEVFLEEAQELQSEIGTNLRIWRKQPNQMNARKAVLRALHTLKGSARIADAQQVSDLAHQMESDIESLYDQ
TASAALLDQLETQFDTISDKVEQLRSSLQPESQPAPVTEEAEAHPELLPPAVETVSALPISTADTDQPFRKTTLRVDAEL
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GDSIEFDRGVLDKISSSLEHLLRNALVHGIETPEERLSIGKAEAGQITLDLHRDGNEIVMVLQDDGIGLDAERIREKARQ
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DDSLTVRKVTSRLLERQGYEILIAKDGVGALQLLRETIPAIMLVDIEMPHMDGFELIRAVRNNPELQNIPIIIISSRTAE
KHRKVAEELGVNEFMGKPYQEDELLQHIERLIKEGC

Specific function: Involved in the transmission of sensory signals from the chemoreceptors to the flagellar motors. CheA is autophosphorylated; it can transfer its phosphate group to either CheB or CheY [H]

COG id: COG0643

COG function: function code NT; Chemotaxis protein histidine kinase and related kinases

Gene ontology:

Cell location: Membrane (Potential). Note=It is not known whether CheA is actually membrane bound although CheA has two regions at the C-terminal end with the potential to be transmembrane regions [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 HPt domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788197, Length=657, Percent_Identity=28.7671232876712, Blast_Score=218, Evalue=2e-57,
Organism=Escherichia coli, GI1788713, Length=186, Percent_Identity=30.1075268817204, Blast_Score=64, Evalue=6e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003594
- InterPro:   IPR002545
- InterPro:   IPR004358
- InterPro:   IPR008207
- InterPro:   IPR004105
- InterPro:   IPR005467
- InterPro:   IPR009082
- InterPro:   IPR010808 [H]

Pfam domain/function: PF01584 CheW; PF02895 H-kinase_dim; PF02518 HATPase_c; PF01627 Hpt; PF07194 P2 [H]

EC number: =2.7.13.3 [H]

Molecular weight: Translated: 192151; Mature: 192151

Theoretical pI: Translated: 4.39; Mature: 4.39

Prosite motif: PS50851 CHEW ; PS50894 HPT ; PS50110 RESPONSE_REGULATORY ; PS50109 HIS_KIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNTDTRINISSVMGIREAIEQIFTLIHRHFDSYATDTDDTRQIEECRYYMHQLNGMLEML
CCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELSGVAFVGISVEELLAALQERRIEPDAQTLVVVRQAIRSIYRYLDALIDGEVDNPVKLF
HHCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
PVYRKIMQVQGLEEISESDLFFPDIRESLPLQPVELDLDDTSRQETAKQARAQFQSGLLS
HHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLKNADDKQSLQKMIEAVRSIEKLPAAIEQRKFWWISSGFLDSLLHQEQVVDKSVRRLCG
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIEQEIRHLNKESHVVAARLTRELLYRIARSQPVSERLQEISRVYDWQIPLSTIDNQEHL
HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHH
DESIMDEEATASDLQSMRVLLEDINDQWRKFNAEDQENISSLLALTEQLKVLISRVSCPP
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LEKLAGVIHGVLSYLRIRPQSMNEGIALDIASSLLLTENAIDNFHRLSPEFPSQVDALAT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
RIRAVTTGKGEDIDLPDLPNPDQAGHLTQEKKLFKQVAQEVLANLAQVEDILDRFFFEPE
HHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IRNDLPLLPELFNQISGVLNVLELDQASTVLDSCRALTEKLTASDHLIDQAEQMLLADAL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSLGFYIEALRNSQSDAEEILATIMQRLGQKPAGLGLSTDIREIPIDFAVAADRLFESDP
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCC
EQLIDPELLAVFLDESSDVLASIADHLESCYANYANQDALTTIRRDFHTLKGSGRMVKLE
HHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHH
ALSEVAWRIEQLMNRWLSEQKPATSILLDLLAESHRQFSNWCASLRKDGAVEIKAEYLLD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHH
QIRALMYGTDEQPDIAATSLAPEVFEQAPEIEPLPTITDALSDIKTGAETAIRIGDSEVP
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHEEECCCCCC
ADLFRIFINEASTHVATLKQAFNLPGDDAILSVTHESMLAAHTLASTSRALELGFIAQIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QALERWFNRLLTTSNMPGQQALSYMTTAVNLLDDMLATIREHQFPSAETVQASAEITHEL
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
MRLLEEAPAIQATETEQMVEMEEMAPLELAVDEVLEEDSSASMSETEISLPVSSLQQVKD
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHH
AFADLDQELLEVFLEEAQELQSEIGTNLRIWRKQPNQMNARKAVLRALHTLKGSARIADA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
QQVSDLAHQMESDIESLYDQTASAALLDQLETQFDTISDKVEQLRSSLQPESQPAPVTEE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
AEAHPELLPPAVETVSALPISTADTDQPFRKTTLRVDAELIDRLINESGESSIIRSRVEA
CCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
QLYDLEQYLQDLGESVDRMRGQLREVELLAETQMPASSLPSITGQTDFDPLELDRFTRFQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
ELTRLMAESMDDVVTIHKSLREIQRAATMTVDQQAHLNRQLQQDLLRIRTIPFSHYSERL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
YRAVRQVTKDTGKQANLIIQGDSIEFDRGVLDKISSSLEHLLRNALVHGIETPEERLSIG
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCC
KAEAGQITLDLHRDGNEIVMVLQDDGIGLDAERIREKARQLGLGSPENEQDDEQWYPLIF
CCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEE
THGFSTLDGVTDIAGRGVGLDIVRNELGELGGNIAVTSEKNRGTTFTLRFPVTLALTQAL
ECCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCEEEEECHHHHHHHHHH
MVKAGDSTYAIPIAIVAHVLEMNAETLGTAYQEHHLIWNGNRFPLGYLPHLLGVSHTFPE
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHH
IRRSNRIVLLQTEHEQLAIHADALIGQCEVVIKNIGPQLSNAPGIEGATITGDGSIVLII
HHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEEEE
NPIKLLQREQVRELLSAGPMTPVDAADIHPSATAPVVMIVDDSLTVRKVTSRLLERQGYE
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCE
ILIAKDGVGALQLLRETIPAIMLVDIEMPHMDGFELIRAVRNNPELQNIPIIIISSRTAE
EEEECCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHH
KHRKVAEELGVNEFMGKPYQEDELLQHIERLIKEGC
HHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNTDTRINISSVMGIREAIEQIFTLIHRHFDSYATDTDDTRQIEECRYYMHQLNGMLEML
CCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELSGVAFVGISVEELLAALQERRIEPDAQTLVVVRQAIRSIYRYLDALIDGEVDNPVKLF
HHCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
PVYRKIMQVQGLEEISESDLFFPDIRESLPLQPVELDLDDTSRQETAKQARAQFQSGLLS
HHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLKNADDKQSLQKMIEAVRSIEKLPAAIEQRKFWWISSGFLDSLLHQEQVVDKSVRRLCG
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIEQEIRHLNKESHVVAARLTRELLYRIARSQPVSERLQEISRVYDWQIPLSTIDNQEHL
HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHH
DESIMDEEATASDLQSMRVLLEDINDQWRKFNAEDQENISSLLALTEQLKVLISRVSCPP
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LEKLAGVIHGVLSYLRIRPQSMNEGIALDIASSLLLTENAIDNFHRLSPEFPSQVDALAT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
RIRAVTTGKGEDIDLPDLPNPDQAGHLTQEKKLFKQVAQEVLANLAQVEDILDRFFFEPE
HHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
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