| Definition | Shewanella sp. MR-4 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008321 |
| Length | 4,706,287 |
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The map label for this gene is 113968982
Identifier: 113968982
GI number: 113968982
Start: 740646
End: 744317
Strand: Direct
Name: 113968982
Synonym: Shewmr4_0638
Alternate gene names: NA
Gene position: 740646-744317 (Clockwise)
Preceding gene: 113968981
Following gene: 113968983
Centisome position: 15.74
GC content: 52.1
Gene sequence:
>3672_bases ATGCCAAGCTTGATTCGTATTGTGCTGATTGATACGCACCTTCCGGGCGTTGTGGAACTCGCCCTCAATGGCCATACCAA TATTTGTGGTACTAACGCCTCGGGCAAAACCACTCTGCAACGCTTAGTGCCGGTATTTTATGGCGAATATCCTAGCCGCG TGGTGCCTTCAACCCGTGACAGTTTCGAGCGTTGGTACTTGCCACACGATTCAAGCTACATCATTTACGAATACCAAAAG GCCGATGGCTTGCTCTATCAAGCTGTGCTGGCGTCGGCGGGCGATGGCAAAGGGGTGAATTACCGCTTTATCGCTAAAGG TTTTGAGTTAAGCGATTATATTAAATCGCAAAATGGTGACACTATTCTTTGCCACACCATGGCGGAACTGGGCCGCGATT TAAAACGCCAAGGTATTGCCACCACTAACTTGCTTAACACCCGCGAATACCGCGCGATTATTCAAAACGATCGCACTTTG TTAAGTACGGGCAGCAACCGCAGTGAACTGCGAGCCTATGCGCACCAATTCGCCCTGTGTGAAGGTGAGCATTCACTGCG CCATATCGAAAAACTCGCCAAGGCGGTGCACTCGAAAGAAGGCAAAATGGAAACGGTCAAATCCATGATCGCCGCCATTT TGGAAGAAGACGGGGTGAATCCACCTAGCTCACGCCTCAATCCGCAACGTGTCGAGGCGTGGATCCGCGAGAGTCAGCTT ATCCAAGGCTTTGAAGTGATCCGCCCCGAGTTTGAAAAGCTCGAGCAGGAATTTAACCAATTACTCAGCGCCGAGATGCG TCTCTCGAGCCTGTCCCGTGGTTATCGCAACGACGAAAGCCTAGAAGCCGATCGTTTAGAGATCCAACAAACCCTGTCTA AGGAGCTGAATCTAAAGCTTCGAATGTTGGACGACGAATGGAAAGAAGTGCGTGACGAGCTAAACCTCGACCTATCCGCC GCCAAGGGCGACGTGGCCAAGTGCGAGTACGAACTCGATGCGATTGAAGATCAGCACGGCGCCTTTTTAGATGCCAATAT CGAGCAAGCTAAGGCCGACTTGGACATGCTGCCAAACTGGCGCGCTGATATGGAAAACTTAAGCGAGCGCCATAAATTAC AAACCGAAAAGCACCAAGATATTGAAGCGGCTTACAATGCCCGCCGCAGTAAAATTGGCGAGCAGTTAAACCGCGAGCTT GAAGGCTTACACGCGGATCAAGACAAGCAACGCGAAGCGCGCGATAAGCAGCGTGAAGTGGCAAGAGCCGATCTCGATGC CCTCGAAGCCCAATGGCGCAGCCAAATGGATGCGGGCAAGGCAAGCTTTAGCGAGCAGGAATATCAATTCAAACTCAATG CCGCCGAGCTTAAATTACGTGTCGATGGTGTGACCTACACCGAGGAAGAAAAGTTAAGCCTAGCGATTTTTGACGAGCGG ATTCACCGCGCCGACGAAGAGCAAGAAAGCTGTAACGCTAAGGTGGAACGTTTAAGTAGCGATGAGCGTAAGCTGCGCGC CAAACGCGACCAAGCCAACGAAGCGCTGCGTATCGCCAGCCTGCGGGTTAACGAACGCCAAACCGCGCTCGATGAACTGC ACCATATGCTGTTCCCGCAGTCCCATACCTTGCTCGAGTTTCTGCGCAAGGAAGCCCAAGGTTGGGAGCAGAGTCTGGGT AAAGTGATTGCCCCCGAGTTGCTACATCGCACCGATTTACATCCGAGCGTGACCGGAACGAGCGACACCCTGTTTGGGGT GCATTTGGATCTTAAAGCCATCGATGTGCCTGAATATGCCGCCTCCGAGCAGGAACTGCGTATTCGTTTAAGCAAGGCCG AAGAGGCGCTGCAAAGCGCGCAGGAATTACAGGCCGAGGCCGAATCACAGCTGGTGGCGATTAACGGTGAGCTGGATAAA CTCAGCCGTGAACTCACCTTTGCCCGCACGGCTTACAAAAATAGCCGCGATGATTTACGTCGTCTGTTCGATGAAAAACG CAGTGAGCAGGACAAGATCAACAAGGCGCTGGCCGAGCGTAAAGCCTTTGCCCAGCAGCGCTTAACTCAACTCGATGGCG AGCTAAAGCAGCTTAAGCATCAACATCAGCTCTGGCTCGAAGAGCAAAAAGAGCAGGCGCTCGAAGCGCGGATGGAAAAA CAAGCCTACTGGCAGGAAGTGATTGGTGCGCTCGACAATCAACTCGGGCAAATCAAGGCGACTATTGATGCTCGCCGCGA AAGCGCTAAGGCTGAGCAGAAAGCCTGCGAAACCTGGTACAAAAACGAGCTTAAGTCCCGCGGTGTGGATGAGGACAATA TCCTTAAACTCAAGCAACAAATCCGTGAGCTTGAAACCAAAATCAGCCGCGCCGAGCAGCGCCGCAGTGAAGTATTGCGC TTCGACGATTGGTATCAACATACTTGGTTGCTGCGTAAGCCTAAGTTGCAGACCCAATTGAGCGACGTAAAACGTGCCGC CTCGGAAATCGATCAGCAGCTTAAAGCCAAGACTCAAGAAGTGAAGACTCGCCGCCAACAACTCGAGACCGACCGTAAGG CCTCGGATGCGGCGCAAATTGAAGCTTCTGAAAACTTAACCAAACTGCGCGCCGTGATGCGTAAGTTGGCCGAGTTGAAA CTGCCCGCCAACAATGAAGAAGCCCAGGGTAGCCTAGGTGAGCGTTTGCGTCAGGGTGAAGATTTACTGCTAAAACGCGA TTATTTGATGGGCTCGGTTAAGCAATATGTGGAGCATTTTGACTCTGTAATTGCCAGCAAGTCAGGCTCAGGTTTAGCCG AGACTTGGGAGCGCGCTCGCGAAGAATCGAGCTTTATCAATGACAAAGGTATTCGCCTGCTGGATTACCGCAAGCTAGTG CCACAGCTTGAACAGTTACTCAATGTGATTGTGCCGCAATCGATTATGGCGCTGCGTGAACAGGGGCGGATCTTCGGGGT CGACTTAACTGCCTTCTACGATGTACTTGCCGATATCGACCGTCGCATCGCCTCCCAGAGTGCGCGCATTACCCGCGAAG TGGGCGAGGAGTTATTCCTCGATGGCGTATCCGAGTCAGCGGTTCGTATTCGCTCTAAGATCAGTGAATTAGAGTTTTGG CCTGAGCTTGAGCAGTTCGTTAAAGCCTTCAAACAGTGGAAGGCCGACGGCTTTAATGGTCTGCCCGATGAGGAATACAC CAACAGTATGCGCCGCGCCTTGGATATTATTGGCCGCGCGGCCTTAACTGGCGGCATTTCTAAGTTGCTTGAAATCGAGC TGCGCCTCAAAGAGGGCAATAGCGACCTGATTATCCGCACCGACAGACAGCTGAACGAATCCTCGAGCCACGGTATGGCT TATTTGATCCTGTGTAAGTTCCTGTTGGCATTCACGCGCTTGTTACGTGGCCGTGCCGACGTCACCATTCACTGGCCGAT CGACGAGCTGGGCACGCTGCACCACACCAACGTGAAGAAGATTTTCGATGCCTGTGGTAACAACAATATCAGCGTGTTAG GCGCCTTCCCGAACCCAGAGTCAGAAGTGCTGAACCTGTTCGAGAACCGTTACATTATTAATAAACAAACCAAGAAGTTG CAGGTGGTGAAGCCCAAAGCCAATCCGATTGCCGATATGTTGAGTAAACGCCTGAGCAAGGAGGCCATCTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1223; Mature: 1222
Protein sequence:
>1223_residues MPSLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYQK ADGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELSDYIKSQNGDTILCHTMAELGRDLKRQGIATTNLLNTREYRAIIQNDRTL LSTGSNRSELRAYAHQFALCEGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL IQGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAEMRLSSLSRGYRNDESLEADRLEIQQTLSKELNLKLRMLDDEWKEVRDELNLDLSA AKGDVAKCEYELDAIEDQHGAFLDANIEQAKADLDMLPNWRADMENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNREL EGLHADQDKQREARDKQREVARADLDALEAQWRSQMDAGKASFSEQEYQFKLNAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDER IHRADEEQESCNAKVERLSSDERKLRAKRDQANEALRIASLRVNERQTALDELHHMLFPQSHTLLEFLRKEAQGWEQSLG KVIAPELLHRTDLHPSVTGTSDTLFGVHLDLKAIDVPEYAASEQELRIRLSKAEEALQSAQELQAEAESQLVAINGELDK LSRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDEKRSEQDKINKALAERKAFAQQRLTQLDGELKQLKHQHQLWLEEQKEQALEARMEK QAYWQEVIGALDNQLGQIKATIDARRESAKAEQKACETWYKNELKSRGVDEDNILKLKQQIRELETKISRAEQRRSEVLR FDDWYQHTWLLRKPKLQTQLSDVKRAASEIDQQLKAKTQEVKTRRQQLETDRKASDAAQIEASENLTKLRAVMRKLAELK LPANNEEAQGSLGERLRQGEDLLLKRDYLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLAETWERAREESSFINDKGIRLLDYRKLV PQLEQLLNVIVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVRIRSKISELEFW PELEQFVKAFKQWKADGFNGLPDEEYTNSMRRALDIIGRAALTGGISKLLEIELRLKEGNSDLIIRTDRQLNESSSHGMA YLILCKFLLAFTRLLRGRADVTIHWPIDELGTLHHTNVKKIFDACGNNNISVLGAFPNPESEVLNLFENRYIINKQTKKL QVVKPKANPIADMLSKRLSKEAI
Sequences:
>Translated_1223_residues MPSLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYQK ADGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELSDYIKSQNGDTILCHTMAELGRDLKRQGIATTNLLNTREYRAIIQNDRTL LSTGSNRSELRAYAHQFALCEGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL IQGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAEMRLSSLSRGYRNDESLEADRLEIQQTLSKELNLKLRMLDDEWKEVRDELNLDLSA AKGDVAKCEYELDAIEDQHGAFLDANIEQAKADLDMLPNWRADMENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNREL EGLHADQDKQREARDKQREVARADLDALEAQWRSQMDAGKASFSEQEYQFKLNAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDER IHRADEEQESCNAKVERLSSDERKLRAKRDQANEALRIASLRVNERQTALDELHHMLFPQSHTLLEFLRKEAQGWEQSLG KVIAPELLHRTDLHPSVTGTSDTLFGVHLDLKAIDVPEYAASEQELRIRLSKAEEALQSAQELQAEAESQLVAINGELDK LSRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDEKRSEQDKINKALAERKAFAQQRLTQLDGELKQLKHQHQLWLEEQKEQALEARMEK QAYWQEVIGALDNQLGQIKATIDARRESAKAEQKACETWYKNELKSRGVDEDNILKLKQQIRELETKISRAEQRRSEVLR FDDWYQHTWLLRKPKLQTQLSDVKRAASEIDQQLKAKTQEVKTRRQQLETDRKASDAAQIEASENLTKLRAVMRKLAELK LPANNEEAQGSLGERLRQGEDLLLKRDYLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLAETWERAREESSFINDKGIRLLDYRKLV PQLEQLLNVIVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVRIRSKISELEFW PELEQFVKAFKQWKADGFNGLPDEEYTNSMRRALDIIGRAALTGGISKLLEIELRLKEGNSDLIIRTDRQLNESSSHGMA YLILCKFLLAFTRLLRGRADVTIHWPIDELGTLHHTNVKKIFDACGNNNISVLGAFPNPESEVLNLFENRYIINKQTKKL QVVKPKANPIADMLSKRLSKEAI >Mature_1222_residues PSLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYQKA DGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELSDYIKSQNGDTILCHTMAELGRDLKRQGIATTNLLNTREYRAIIQNDRTLL STGSNRSELRAYAHQFALCEGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQLI QGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAEMRLSSLSRGYRNDESLEADRLEIQQTLSKELNLKLRMLDDEWKEVRDELNLDLSAA KGDVAKCEYELDAIEDQHGAFLDANIEQAKADLDMLPNWRADMENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNRELE GLHADQDKQREARDKQREVARADLDALEAQWRSQMDAGKASFSEQEYQFKLNAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDERI HRADEEQESCNAKVERLSSDERKLRAKRDQANEALRIASLRVNERQTALDELHHMLFPQSHTLLEFLRKEAQGWEQSLGK VIAPELLHRTDLHPSVTGTSDTLFGVHLDLKAIDVPEYAASEQELRIRLSKAEEALQSAQELQAEAESQLVAINGELDKL SRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDEKRSEQDKINKALAERKAFAQQRLTQLDGELKQLKHQHQLWLEEQKEQALEARMEKQ AYWQEVIGALDNQLGQIKATIDARRESAKAEQKACETWYKNELKSRGVDEDNILKLKQQIRELETKISRAEQRRSEVLRF DDWYQHTWLLRKPKLQTQLSDVKRAASEIDQQLKAKTQEVKTRRQQLETDRKASDAAQIEASENLTKLRAVMRKLAELKL PANNEEAQGSLGERLRQGEDLLLKRDYLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLAETWERAREESSFINDKGIRLLDYRKLVP QLEQLLNVIVPQSIMALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLDGVSESAVRIRSKISELEFWP ELEQFVKAFKQWKADGFNGLPDEEYTNSMRRALDIIGRAALTGGISKLLEIELRLKEGNSDLIIRTDRQLNESSSHGMAY LILCKFLLAFTRLLRGRADVTIHWPIDELGTLHHTNVKKIFDACGNNNISVLGAFPNPESEVLNLFENRYIINKQTKKLQ VVKPKANPIADMLSKRLSKEAI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 140197; Mature: 140066
Theoretical pI: Translated: 6.04; Mature: 6.04
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPSLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRD CCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH SFERWYLPHDSSYIIYEYQKADGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELSDYIKSQNGD HHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCC TILCHTMAELGRDLKRQGIATTNLLNTREYRAIIQNDRTLLSTGSNRSELRAYAHQFALC EEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH EGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH IQGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAEMRLSSLSRGYRNDESLEADRLEIQQTLSKELNLKL HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCEEE RMLDDEWKEVRDELNLDLSAAKGDVAKCEYELDAIEDQHGAFLDANIEQAKADLDMLPNW EECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHCCCCC RADMENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNRELEGLHADQDKQREARDKQREV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ARADLDALEAQWRSQMDAGKASFSEQEYQFKLNAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDER 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA