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The map label for this gene is 113968765

Identifier: 113968765

GI number: 113968765

Start: 466963

End: 468294

Strand: Direct

Name: 113968765

Synonym: Shewmr4_0421

Alternate gene names: NA

Gene position: 466963-468294 (Clockwise)

Preceding gene: 113968756

Following gene: 113968769

Centisome position: 9.92

GC content: 39.64

Gene sequence:

>1332_bases
GTGTTAGTTGGGCTAATTAGTTTTTTTTTGTTAGGGACTACCTTCGCTCTTGATGTTAATCATGTGTTTTCAATTAATAA
TGAATATGATTTAAAGCGAATTTTGGCAATTGCTTTTATTTGGCTTATGGTGTTAATGCTCAGCTTTAAAAGGGAGCATT
ATCTGTTGCGACTAAAAAAACAATCTATTGCTTTTTTAGTCTTTTTTTTTGGACTGGGGAGTATTTCAGCTTTATACAGT
CAACATTCGTTTTGGAGTTGGATTGAGTTAGGCAATATCTTATTGTGCCTGATTGGCTTATATTGTTTTAGTAGCGTTTT
AAGAAGTTTGTCTACCTCACAGGTTTATCGTTTTTGTTATTTTTTTTCGCTCGTCATTTCAATTGCTACGTTACTTAAAT
ATCTGCTTTTTTTAGTTTTTCACTATATTGAACTACAGCCATTTAATATTCACGGGCTTATTTATGGCTATGTGAATGTT
AGATTTTTTAATCAGTTGCAGGTGATGATGGTTCCATTGCTGCTTTTGCCTTTTTTTTCTTCAGAATTGAAGCGGTTCTC
TGTGATGTCGTTAATTTTAATCTCATTGCACTGGATGGTATTACTGCAAACAGAGGCGAGGGGCGCCATGGTTTCACTCA
TTAGTGCGATGGTTTTGATATCGTTTTTTTTGGGAGCAGATATTCGAAAGTCGTTAATCGCGGTTGTTTGTCGAGCGATT
TTATTAGGTATTTCCCTCTGGTTACTTTTTATTGTCATCATCCCCATTCTCATCATGGGGGATAACTTTGCCCATCTTCG
TGGGGGCAGTTCAGGCCGTTTAGACTTGTGGATGTATGTTGTTAATAATATATCTGAGCATCTTCTATTGGGTCATGGCC
CAATGGCATTTGCTTGGGCCGAGAATAAGCCGCTGCCCCATGCTCATCCCCATAATTCTGTTATGCAATTACTATACGAG
TACGGCGTCGTGGTTTGTATGGGGACCATCTTATGGGTTGGGAGCTATTTAGCTAACTTACTGGCGAGTTTGAAGCAAGA
AACGAATGTTAATCAGTTGCCTATCATAATGTCGTTGCTTACGGCATTAATTTATTCACTGTTTAGTGGCGTGGTGGTGA
TGCCCTTTGCGCAACTACTGTTGGTGTTTGTGGTATCGGTGACGGCTCTGCCATTACCAGCAGTGTGTTATCCGGTGAGT
GCACTGGTGCGGGGGATAGCAGTGATGGGCGTTTCATTACTAAGCTGGGCATTATTGGCGAGTTATCATCATTCGCAGTT
ATTATCTGCCTTATTTCCGCGATTTTGGGTCAATGGGTTACTGAGTTACTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATGCTACATTAACAAGGTGTTGGTCGCGGATCTACAAGTCATGCGGATAAAAAGTCATCGTTAAATGGGGAATGTAAT
TGAAGGCTTATGCTTATCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAAAAAGGCCGCAGTAGCGGCCCTTTAACACATTGATGCTAGCTATTGATTAAGAGCCAGCTGAACAGGTTGCAGTACC
CCAATCACAAGTAATTGTTG

Product: O-antigen polymerase

Products: NA

Alternate protein names: Pilus Biosynthesis-Like Protein; Pilus Biogenesis Protein; Pilin Glycosylation

Number of amino acids: Translated: 443; Mature: 443

Protein sequence:

>443_residues
MLVGLISFFLLGTTFALDVNHVFSINNEYDLKRILAIAFIWLMVLMLSFKREHYLLRLKKQSIAFLVFFFGLGSISALYS
QHSFWSWIELGNILLCLIGLYCFSSVLRSLSTSQVYRFCYFFSLVISIATLLKYLLFLVFHYIELQPFNIHGLIYGYVNV
RFFNQLQVMMVPLLLLPFFSSELKRFSVMSLILISLHWMVLLQTEARGAMVSLISAMVLISFFLGADIRKSLIAVVCRAI
LLGISLWLLFIVIIPILIMGDNFAHLRGGSSGRLDLWMYVVNNISEHLLLGHGPMAFAWAENKPLPHAHPHNSVMQLLYE
YGVVVCMGTILWVGSYLANLLASLKQETNVNQLPIIMSLLTALIYSLFSGVVVMPFAQLLLVFVVSVTALPLPAVCYPVS
ALVRGIAVMGVSLLSWALLASYHHSQLLSALFPRFWVNGLLSY

Sequences:

>Translated_443_residues
MLVGLISFFLLGTTFALDVNHVFSINNEYDLKRILAIAFIWLMVLMLSFKREHYLLRLKKQSIAFLVFFFGLGSISALYS
QHSFWSWIELGNILLCLIGLYCFSSVLRSLSTSQVYRFCYFFSLVISIATLLKYLLFLVFHYIELQPFNIHGLIYGYVNV
RFFNQLQVMMVPLLLLPFFSSELKRFSVMSLILISLHWMVLLQTEARGAMVSLISAMVLISFFLGADIRKSLIAVVCRAI
LLGISLWLLFIVIIPILIMGDNFAHLRGGSSGRLDLWMYVVNNISEHLLLGHGPMAFAWAENKPLPHAHPHNSVMQLLYE
YGVVVCMGTILWVGSYLANLLASLKQETNVNQLPIIMSLLTALIYSLFSGVVVMPFAQLLLVFVVSVTALPLPAVCYPVS
ALVRGIAVMGVSLLSWALLASYHHSQLLSALFPRFWVNGLLSY
>Mature_443_residues
MLVGLISFFLLGTTFALDVNHVFSINNEYDLKRILAIAFIWLMVLMLSFKREHYLLRLKKQSIAFLVFFFGLGSISALYS
QHSFWSWIELGNILLCLIGLYCFSSVLRSLSTSQVYRFCYFFSLVISIATLLKYLLFLVFHYIELQPFNIHGLIYGYVNV
RFFNQLQVMMVPLLLLPFFSSELKRFSVMSLILISLHWMVLLQTEARGAMVSLISAMVLISFFLGADIRKSLIAVVCRAI
LLGISLWLLFIVIIPILIMGDNFAHLRGGSSGRLDLWMYVVNNISEHLLLGHGPMAFAWAENKPLPHAHPHNSVMQLLYE
YGVVVCMGTILWVGSYLANLLASLKQETNVNQLPIIMSLLTALIYSLFSGVVVMPFAQLLLVFVVSVTALPLPAVCYPVS
ALVRGIAVMGVSLLSWALLASYHHSQLLSALFPRFWVNGLLSY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50031; Mature: 50031

Theoretical pI: Translated: 9.20; Mature: 9.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLVGLISFFLLGTTFALDVNHVFSINNEYDLKRILAIAFIWLMVLMLSFKREHYLLRLKK
CHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSIAFLVFFFGLGSISALYSQHSFWSWIELGNILLCLIGLYCFSSVLRSLSTSQVYRFCY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFSLVISIATLLKYLLFLVFHYIELQPFNIHGLIYGYVNVRFFNQLQVMMVPLLLLPFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SELKRFSVMSLILISLHWMVLLQTEARGAMVSLISAMVLISFFLGADIRKSLIAVVCRAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
LLGISLWLLFIVIIPILIMGDNFAHLRGGSSGRLDLWMYVVNNISEHLLLGHGPMAFAWA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEC
ENKPLPHAHPHNSVMQLLYEYGVVVCMGTILWVGSYLANLLASLKQETNVNQLPIIMSLL
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
TALIYSLFSGVVVMPFAQLLLVFVVSVTALPLPAVCYPVSALVRGIAVMGVSLLSWALLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYHHSQLLSALFPRFWVNGLLSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLVGLISFFLLGTTFALDVNHVFSINNEYDLKRILAIAFIWLMVLMLSFKREHYLLRLKK
CHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSIAFLVFFFGLGSISALYSQHSFWSWIELGNILLCLIGLYCFSSVLRSLSTSQVYRFCY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFSLVISIATLLKYLLFLVFHYIELQPFNIHGLIYGYVNVRFFNQLQVMMVPLLLLPFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SELKRFSVMSLILISLHWMVLLQTEARGAMVSLISAMVLISFFLGADIRKSLIAVVCRAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
LLGISLWLLFIVIIPILIMGDNFAHLRGGSSGRLDLWMYVVNNISEHLLLGHGPMAFAWA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEC
ENKPLPHAHPHNSVMQLLYEYGVVVCMGTILWVGSYLANLLASLKQETNVNQLPIIMSLL
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
TALIYSLFSGVVVMPFAQLLLVFVVSVTALPLPAVCYPVSALVRGIAVMGVSLLSWALLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYHHSQLLSALFPRFWVNGLLSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA