| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113475714
Identifier: 113475714
GI number: 113475714
Start: 3214273
End: 3216798
Strand: Direct
Name: 113475714
Synonym: Tery_2061
Alternate gene names: NA
Gene position: 3214273-3216798 (Clockwise)
Preceding gene: 113475713
Following gene: 113475715
Centisome position: 41.47
GC content: 45.13
Gene sequence:
>2526_bases ATGGGTAAAAAGTCGCCAAAGTTAAGCCCAGGGTGGCTAGAACCAGAACAGTTGATGGAATTCATTGATCAGCTTCGTAG AGAATACAAATACAATATCGGTGTATCCCAATATATTGCAGCTCAAGAGTTGATACTTGCTTTGAGTGCAAAAGGAGAGC AGTTAGAAGAACCCCAGAGGCTTAAAAGTCTTCTCGGTCCCTTGTTATGCAGTTCCCCAGCAGAACAAGAAGATTTCCAA CTACGGTTTGACCAATGGATGGAACGTATGGGTTTTACCGTTCGCGAAGTTATTCATGCTGACGAAAATGCTGAGGCTCT TGAACAGGAGTTAAAAAAGATGCGGCAGGAATGGCGATGGCTACGGTGGGTACGTTTAGCGATCGCTGTTTTTCTTGTTA TTGTTCTAACCAATTTCCTGATACAGGATTTTTCGGCTTTAACTTCCCGGATGCAGCAGTTTCCCACTCCAACAGTAGAT CCCTTGAAACTATTTCCACCTCAAACTCTTCAAGAATGGCGGACTACATTTTTATGGTTAATACTCGTGCCCCCGGTTAC ATTCTTAGTTTGGAGACTATGGTGGCGTTGGCGTGTGGCTCTATACCTCAACCGTCGTCAGACCAGGCGGCCTCCTGAAA TTCAGCGAGTGTCTATATCAGGGCTAAATGAGGAACTATTTCCCAGAGTTTTGTTTTTGCGCATTGCTCAGGGTTTGAGG CGACGTATTCGGGTTCCATCCAATGAACTTGATATTGACAAGACCGTAGAAAAAACTGTCCGGGGAGGAGTTAGGTTTGC CCCAGTATACGGCTACTATAAGCTTCTTCCTGAATACCTGGTTCTGATCGACCGGGCAAACTACAGCGACCACCAGGCGA GACTTGTCAAGGAAATGATTGCTCAATTAACCGAGAACGAAGTCTTAATTATAGGTTACTATTTTGATGGCGACCCCAGG GTATGTTTTCCGGTTACAGGAAAAGGCTCTCCTTGTAAGTTACGGGAAATTTCTTTGAAGTACAGCCAGCATCGGCTCCT CATCTTCTCTGATGCAGAAGGTTTTTTTAATTCCCTGACTGGGGAACTTGAAGCCTGGCTTGATTTATTTTCAAGTTGGT CTCAGCGGGCTGTTTTCACTCCCAAACCTTCGGAACATTGGGGATATCAGGAACTGAAATTATCCCGAGAGTTTATTGTT CTACCTGCAACAAATGATGGGTTAATTGACTTGATACGGAGCATTGAACATGGAAAACTGCCTTATGTGTCTTCAGAAAA AGGTAGGGCACCTTATCCGGAAGCATTGAGAGTGCGGGGGCGGCGCTGGGTTGAGCAAGATCCACCTGAGCCATGGTTGC TGACTAATGTCCTAGGGTCTGTCCGAAACTATCTGGGGGAAGCTGGTTACTATTGGCTGAGTGCTTGTGCTGTATTTCCT GAGTTAAATTGGAATCTCACGGTTTACCTGGGGAATGCTCTTAGTGCTGGTGATGGTCGTTCTTTGCTTCAGGCTTGTCG GCTAACAGTTCTCGCTCGTTTGCCTTGGTTTCGATATGGTTATATGCCTGACTGGCTGCGCTTGTGGTTACTTTCTGAGT TACCTCGCCACCAGGAGGATGAGGTTCGTCAACTGCTTAGAAGTTTCTTGGTGGCAAAACCTGATGAGCAAGGCTCAGTT GGAAGATGGCAATTGGAAATTGCTCGGCAATACAGCAATGTTGTCTCTAGGTTGGTGCAACCACTTCTCCGCTTATTTTC TGGGGAAGCTCCTGAGGATAGTCCTCTGCGGGATTATATTTTTCAGGAGTTTATGGCAGGTCGTAAGGGACTCGCAGTGA GAATGCCGGAAGAGTTACGGGAGGAACTCCGTCGCAAATATTCACAACAAGTAGGATGGTGGTTTTGGTTTCAGTGGGTG TTGGCAAATAGTGTGGGTTTGTTTGTGGGTTTGTTTGTGGGTTTGTTTGTGGGTGGACGGGTTGACAATATTATGGTTAG TTTTCGTATTGCTGTTTTCGGTACTGTTTTCGGTGCTGTTGTGGGATCACTCCAGTGGTGGGTACTTAGAAAACGACTTT CCCAGGCTAGATGGTGGATACTGGCAACTGCCTTGGCATCAGCTATACTATTCTCTACAGCAGAAGTTATGTTGAATGCT GTAAGGGACGTTGTGAGCAATACTGTGATTCAGGTTGTTGTTATATCTTCTGTGGTGGGACTTGTTATCGGATCAGCTCA ATGGTTGGTTCTCAGAAAACAACTTTCTCAATCTCACTGGTGGATACTGGCAAGTGTTTTAGGAATAACTGCTACGCTCT TTGCTATTGTTTATTCTTCGCTCTTTGCTATTGTTTATTCTTCGCTCTTTGCTATTGTTTATTCTTCAAGGTTCGAGCTG GGTCTGCTTAAGACTTTTATATCCTTCCTGAGCATTTTCGGCATTATATACGGAGTAATCACTGGATTTGCCTTAGTTTG GCTGCTGCGACAACCGGGCAATTCTGTCATCAACAATAAAAAGTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CATACTTGCGCTGCAGGCTTTAAACATCTCACATCGACGCCTCACATCAGACTCCATTAATTAACCACAATACAAAAAGA CAGCACAGACAACCAAACTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 841; Mature: 840
Protein sequence:
>841_residues MGKKSPKLSPGWLEPEQLMEFIDQLRREYKYNIGVSQYIAAQELILALSAKGEQLEEPQRLKSLLGPLLCSSPAEQEDFQ LRFDQWMERMGFTVREVIHADENAEALEQELKKMRQEWRWLRWVRLAIAVFLVIVLTNFLIQDFSALTSRMQQFPTPTVD PLKLFPPQTLQEWRTTFLWLILVPPVTFLVWRLWWRWRVALYLNRRQTRRPPEIQRVSISGLNEELFPRVLFLRIAQGLR RRIRVPSNELDIDKTVEKTVRGGVRFAPVYGYYKLLPEYLVLIDRANYSDHQARLVKEMIAQLTENEVLIIGYYFDGDPR VCFPVTGKGSPCKLREISLKYSQHRLLIFSDAEGFFNSLTGELEAWLDLFSSWSQRAVFTPKPSEHWGYQELKLSREFIV LPATNDGLIDLIRSIEHGKLPYVSSEKGRAPYPEALRVRGRRWVEQDPPEPWLLTNVLGSVRNYLGEAGYYWLSACAVFP ELNWNLTVYLGNALSAGDGRSLLQACRLTVLARLPWFRYGYMPDWLRLWLLSELPRHQEDEVRQLLRSFLVAKPDEQGSV GRWQLEIARQYSNVVSRLVQPLLRLFSGEAPEDSPLRDYIFQEFMAGRKGLAVRMPEELREELRRKYSQQVGWWFWFQWV LANSVGLFVGLFVGLFVGGRVDNIMVSFRIAVFGTVFGAVVGSLQWWVLRKRLSQARWWILATALASAILFSTAEVMLNA VRDVVSNTVIQVVVISSVVGLVIGSAQWLVLRKQLSQSHWWILASVLGITATLFAIVYSSLFAIVYSSLFAIVYSSRFEL GLLKTFISFLSIFGIIYGVITGFALVWLLRQPGNSVINNKK
Sequences:
>Translated_841_residues MGKKSPKLSPGWLEPEQLMEFIDQLRREYKYNIGVSQYIAAQELILALSAKGEQLEEPQRLKSLLGPLLCSSPAEQEDFQ LRFDQWMERMGFTVREVIHADENAEALEQELKKMRQEWRWLRWVRLAIAVFLVIVLTNFLIQDFSALTSRMQQFPTPTVD PLKLFPPQTLQEWRTTFLWLILVPPVTFLVWRLWWRWRVALYLNRRQTRRPPEIQRVSISGLNEELFPRVLFLRIAQGLR RRIRVPSNELDIDKTVEKTVRGGVRFAPVYGYYKLLPEYLVLIDRANYSDHQARLVKEMIAQLTENEVLIIGYYFDGDPR VCFPVTGKGSPCKLREISLKYSQHRLLIFSDAEGFFNSLTGELEAWLDLFSSWSQRAVFTPKPSEHWGYQELKLSREFIV LPATNDGLIDLIRSIEHGKLPYVSSEKGRAPYPEALRVRGRRWVEQDPPEPWLLTNVLGSVRNYLGEAGYYWLSACAVFP ELNWNLTVYLGNALSAGDGRSLLQACRLTVLARLPWFRYGYMPDWLRLWLLSELPRHQEDEVRQLLRSFLVAKPDEQGSV GRWQLEIARQYSNVVSRLVQPLLRLFSGEAPEDSPLRDYIFQEFMAGRKGLAVRMPEELREELRRKYSQQVGWWFWFQWV LANSVGLFVGLFVGLFVGGRVDNIMVSFRIAVFGTVFGAVVGSLQWWVLRKRLSQARWWILATALASAILFSTAEVMLNA VRDVVSNTVIQVVVISSVVGLVIGSAQWLVLRKQLSQSHWWILASVLGITATLFAIVYSSLFAIVYSSLFAIVYSSRFEL GLLKTFISFLSIFGIIYGVITGFALVWLLRQPGNSVINNKK >Mature_840_residues GKKSPKLSPGWLEPEQLMEFIDQLRREYKYNIGVSQYIAAQELILALSAKGEQLEEPQRLKSLLGPLLCSSPAEQEDFQL RFDQWMERMGFTVREVIHADENAEALEQELKKMRQEWRWLRWVRLAIAVFLVIVLTNFLIQDFSALTSRMQQFPTPTVDP LKLFPPQTLQEWRTTFLWLILVPPVTFLVWRLWWRWRVALYLNRRQTRRPPEIQRVSISGLNEELFPRVLFLRIAQGLRR RIRVPSNELDIDKTVEKTVRGGVRFAPVYGYYKLLPEYLVLIDRANYSDHQARLVKEMIAQLTENEVLIIGYYFDGDPRV CFPVTGKGSPCKLREISLKYSQHRLLIFSDAEGFFNSLTGELEAWLDLFSSWSQRAVFTPKPSEHWGYQELKLSREFIVL PATNDGLIDLIRSIEHGKLPYVSSEKGRAPYPEALRVRGRRWVEQDPPEPWLLTNVLGSVRNYLGEAGYYWLSACAVFPE LNWNLTVYLGNALSAGDGRSLLQACRLTVLARLPWFRYGYMPDWLRLWLLSELPRHQEDEVRQLLRSFLVAKPDEQGSVG RWQLEIARQYSNVVSRLVQPLLRLFSGEAPEDSPLRDYIFQEFMAGRKGLAVRMPEELREELRRKYSQQVGWWFWFQWVL ANSVGLFVGLFVGLFVGGRVDNIMVSFRIAVFGTVFGAVVGSLQWWVLRKRLSQARWWILATALASAILFSTAEVMLNAV RDVVSNTVIQVVVISSVVGLVIGSAQWLVLRKQLSQSHWWILASVLGITATLFAIVYSSLFAIVYSSLFAIVYSSRFELG LLKTFISFLSIFGIIYGVITGFALVWLLRQPGNSVINNKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 97282; Mature: 97151
Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGKKSPKLSPGWLEPEQLMEFIDQLRREYKYNIGVSQYIAAQELILALSAKGEQLEEPQR CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH LKSLLGPLLCSSPAEQEDFQLRFDQWMERMGFTVREVIHADENAEALEQELKKMRQEWRW HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LRWVRLAIAVFLVIVLTNFLIQDFSALTSRMQQFPTPTVDPLKLFPPQTLQEWRTTFLWL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ILVPPVTFLVWRLWWRWRVALYLNRRQTRRPPEIQRVSISGLNEELFPRVLFLRIAQGLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH RRIRVPSNELDIDKTVEKTVRGGVRFAPVYGYYKLLPEYLVLIDRANYSDHQARLVKEMI HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH AQLTENEVLIIGYYFDGDPRVCFPVTGKGSPCKLREISLKYSQHRLLIFSDAEGFFNSLT HHHCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHH GELEAWLDLFSSWSQRAVFTPKPSEHWGYQELKLSREFIVLPATNDGLIDLIRSIEHGKL HHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCC PYVSSEKGRAPYPEALRVRGRRWVEQDPPEPWLLTNVLGSVRNYLGEAGYYWLSACAVFP CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC ELNWNLTVYLGNALSAGDGRSLLQACRLTVLARLPWFRYGYMPDWLRLWLLSELPRHQED CCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHH EVRQLLRSFLVAKPDEQGSVGRWQLEIARQYSNVVSRLVQPLLRLFSGEAPEDSPLRDYI HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH FQEFMAGRKGLAVRMPEELREELRRKYSQQVGWWFWFQWVLANSVGLFVGLFVGLFVGGR HHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC VDNIMVSFRIAVFGTVFGAVVGSLQWWVLRKRLSQARWWILATALASAILFSTAEVMLNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VRDVVSNTVIQVVVISSVVGLVIGSAQWLVLRKQLSQSHWWILASVLGITATLFAIVYSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFAIVYSSLFAIVYSSRFELGLLKTFISFLSIFGIIYGVITGFALVWLLRQPGNSVINNK HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC K C >Mature Secondary Structure GKKSPKLSPGWLEPEQLMEFIDQLRREYKYNIGVSQYIAAQELILALSAKGEQLEEPQR CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH LKSLLGPLLCSSPAEQEDFQLRFDQWMERMGFTVREVIHADENAEALEQELKKMRQEWRW HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LRWVRLAIAVFLVIVLTNFLIQDFSALTSRMQQFPTPTVDPLKLFPPQTLQEWRTTFLWL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ILVPPVTFLVWRLWWRWRVALYLNRRQTRRPPEIQRVSISGLNEELFPRVLFLRIAQGLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH RRIRVPSNELDIDKTVEKTVRGGVRFAPVYGYYKLLPEYLVLIDRANYSDHQARLVKEMI HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH AQLTENEVLIIGYYFDGDPRVCFPVTGKGSPCKLREISLKYSQHRLLIFSDAEGFFNSLT HHHCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHH GELEAWLDLFSSWSQRAVFTPKPSEHWGYQELKLSREFIVLPATNDGLIDLIRSIEHGKL HHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCC PYVSSEKGRAPYPEALRVRGRRWVEQDPPEPWLLTNVLGSVRNYLGEAGYYWLSACAVFP CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC ELNWNLTVYLGNALSAGDGRSLLQACRLTVLARLPWFRYGYMPDWLRLWLLSELPRHQED CCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHH EVRQLLRSFLVAKPDEQGSVGRWQLEIARQYSNVVSRLVQPLLRLFSGEAPEDSPLRDYI HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH FQEFMAGRKGLAVRMPEELREELRRKYSQQVGWWFWFQWVLANSVGLFVGLFVGLFVGGR HHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC VDNIMVSFRIAVFGTVFGAVVGSLQWWVLRKRLSQARWWILATALASAILFSTAEVMLNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VRDVVSNTVIQVVVISSVVGLVIGSAQWLVLRKQLSQSHWWILASVLGITATLFAIVYSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFAIVYSSLFAIVYSSRFELGLLKTFISFLSIFGIIYGVITGFALVWLLRQPGNSVINNK HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC K C
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA