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The map label for this gene is dinF [H]

Identifier: 113475386

GI number: 113475386

Start: 2601980

End: 2603347

Strand: Direct

Name: dinF [H]

Synonym: Tery_1710

Alternate gene names: 113475386

Gene position: 2601980-2603347 (Clockwise)

Preceding gene: 113475373

Following gene: 113475387

Centisome position: 33.57

GC content: 29.39

Gene sequence:

>1368_bases
ATGAAATCTATAATTAAAAATAGCTTTATTCGATTAACTTTAGTCAACATTTTATCTAATTTAATGGTACCTTTAGCAAG
TCTAATAGACTTAGCTTTTTTAGGTTATTTAGATGAAATTCGTCATTTAGCAGGAGTTTCCATTGCCACAGTTTTATTTA
ACTATATTTACTGGACTTTTGGATTTTTACGCATGAGTACAACTGGTACAACTGCTCAAGCTAATGGCAGTAGAAATTAC
CACGAAGTAAAACAAATTTGTCTACGTAATTGCTTAATTGCTTTAACCATTGCCACAATAATTATAATTTTCCAATATCC
TTTACGAGAAATTGGCTTTAATTTACTTAGTGCAACTCCAGAAGTAAAAGCTAGTGGTATTAACTACTATAAAAGTTTAA
TTTGGGGTGCCCCTGCTACCTTATTAAACTTCGTATTAATAGGTTGGTTTTTAGGACTCGAACAAGGAGGAAAAGTTTTA
CTATTATCAATAGTTAATAAAGGAACAAATATTATCCTAGACTATATTTTTATTGTTCGTTGGGGATGGGAAAGTAGCGG
AGCTGGTAGTGCTACAGCAATAAGTCAATATATAACTTTAGTTATCGGTATGATTTGTGTTTTTAAATTCATATATTTAG
CAGAAATTCCTCAGTTAATCAAAAATATTTGGCAACCTCAAGTAATTAAAAAAACTTTTATTCTCAATCGAGATATTCTG
ATTCGTACTTTTGCTATAATTTCTACTTTTGCTGTATTTACTAATTTAAGCTCATACATAAATACTCTAGTTTTAGTAAC
TAATACTCTGTTATTACAGGTAGTTACATTAGCCGCTTATTTTATTGACGGTCTAGCTTTTGCCACAGAAAGCTTAGCAG
GAAAAAGTTATGGTAAAAGAAATCAAAAAGAATTAAAAGCATTGGTAAAATTATCAGGGATAATTGGTATAAGTATCGGA
TTAATTTTTGCCTTTATTTTCTGTTTATTCCCGACTACTTTATTTAGTTTGTTGACTAATCATACTCAGGTTATTAACAA
TATTAGTAGTTATGTTTTATGGTTAATACCTATCTTGGGTTTTGGAGGCATAGCTTATATTTTAGATGGTTATTTTCTAG
GTTTAACTCAAGGAAATTTGTTGCGCAATTCTACTTTAGTTGCTAGTTTAATAGGATTTTTACCCTTTGCTATAGTCGGT
TTATTGTTAAAAAATAATCATATATTATGGTTATCTTTGGCAATGTTTATGGCAACTAGAGCTATTACTCTAGGTAAGGC
TATTCCTAATATAATTGTTGAAAAATTTTCGGCTTCAATAGAACTCATCAAAGACAAGAATAATAAAAAACATATTACTC
CTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCAGTATCTAAAACGGCAAATAATTTTGCTTATGCTTTACATAAAATCAGCATAAAATTTGTATGAGCAAACTATAAAAA
ATTATGAAAAATTTGGGAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTCTTTTTATTCCATAATTTACCACTAAATTAGGTTGGAATTCTACCCTTTAAAGGTGATAACAAAAAGCGTAAGTAGGT
GGGTTTAATTATTCCTACAA

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 455; Mature: 455

Protein sequence:

>455_residues
MKSIIKNSFIRLTLVNILSNLMVPLASLIDLAFLGYLDEIRHLAGVSIATVLFNYIYWTFGFLRMSTTGTTAQANGSRNY
HEVKQICLRNCLIALTIATIIIIFQYPLREIGFNLLSATPEVKASGINYYKSLIWGAPATLLNFVLIGWFLGLEQGGKVL
LLSIVNKGTNIILDYIFIVRWGWESSGAGSATAISQYITLVIGMICVFKFIYLAEIPQLIKNIWQPQVIKKTFILNRDIL
IRTFAIISTFAVFTNLSSYINTLVLVTNTLLLQVVTLAAYFIDGLAFATESLAGKSYGKRNQKELKALVKLSGIIGISIG
LIFAFIFCLFPTTLFSLLTNHTQVINNISSYVLWLIPILGFGGIAYILDGYFLGLTQGNLLRNSTLVASLIGFLPFAIVG
LLLKNNHILWLSLAMFMATRAITLGKAIPNIIVEKFSASIELIKDKNNKKHITPK

Sequences:

>Translated_455_residues
MKSIIKNSFIRLTLVNILSNLMVPLASLIDLAFLGYLDEIRHLAGVSIATVLFNYIYWTFGFLRMSTTGTTAQANGSRNY
HEVKQICLRNCLIALTIATIIIIFQYPLREIGFNLLSATPEVKASGINYYKSLIWGAPATLLNFVLIGWFLGLEQGGKVL
LLSIVNKGTNIILDYIFIVRWGWESSGAGSATAISQYITLVIGMICVFKFIYLAEIPQLIKNIWQPQVIKKTFILNRDIL
IRTFAIISTFAVFTNLSSYINTLVLVTNTLLLQVVTLAAYFIDGLAFATESLAGKSYGKRNQKELKALVKLSGIIGISIG
LIFAFIFCLFPTTLFSLLTNHTQVINNISSYVLWLIPILGFGGIAYILDGYFLGLTQGNLLRNSTLVASLIGFLPFAIVG
LLLKNNHILWLSLAMFMATRAITLGKAIPNIIVEKFSASIELIKDKNNKKHITPK
>Mature_455_residues
MKSIIKNSFIRLTLVNILSNLMVPLASLIDLAFLGYLDEIRHLAGVSIATVLFNYIYWTFGFLRMSTTGTTAQANGSRNY
HEVKQICLRNCLIALTIATIIIIFQYPLREIGFNLLSATPEVKASGINYYKSLIWGAPATLLNFVLIGWFLGLEQGGKVL
LLSIVNKGTNIILDYIFIVRWGWESSGAGSATAISQYITLVIGMICVFKFIYLAEIPQLIKNIWQPQVIKKTFILNRDIL
IRTFAIISTFAVFTNLSSYINTLVLVTNTLLLQVVTLAAYFIDGLAFATESLAGKSYGKRNQKELKALVKLSGIIGISIG
LIFAFIFCLFPTTLFSLLTNHTQVINNISSYVLWLIPILGFGGIAYILDGYFLGLTQGNLLRNSTLVASLIGFLPFAIVG
LLLKNNHILWLSLAMFMATRAITLGKAIPNIIVEKFSASIELIKDKNNKKHITPK

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790477, Length=427, Percent_Identity=31.615925058548, Blast_Score=181, Evalue=8e-47,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50472; Mature: 50472

Theoretical pI: Translated: 10.16; Mature: 10.16

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSIIKNSFIRLTLVNILSNLMVPLASLIDLAFLGYLDEIRHLAGVSIATVLFNYIYWTF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFLRMSTTGTTAQANGSRNYHEVKQICLRNCLIALTIATIIIIFQYPLREIGFNLLSATP
HHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCC
EVKASGINYYKSLIWGAPATLLNFVLIGWFLGLEQGGKVLLLSIVNKGTNIILDYIFIVR
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHE
WGWESSGAGSATAISQYITLVIGMICVFKFIYLAEIPQLIKNIWQPQVIKKTFILNRDIL
ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHH
IRTFAIISTFAVFTNLSSYINTLVLVTNTLLLQVVTLAAYFIDGLAFATESLAGKSYGKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
NQKELKALVKLSGIIGISIGLIFAFIFCLFPTTLFSLLTNHTQVINNISSYVLWLIPILG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FGGIAYILDGYFLGLTQGNLLRNSTLVASLIGFLPFAIVGLLLKNNHILWLSLAMFMATR
CCHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
AITLGKAIPNIIVEKFSASIELIKDKNNKKHITPK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKSIIKNSFIRLTLVNILSNLMVPLASLIDLAFLGYLDEIRHLAGVSIATVLFNYIYWTF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFLRMSTTGTTAQANGSRNYHEVKQICLRNCLIALTIATIIIIFQYPLREIGFNLLSATP
HHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCC
EVKASGINYYKSLIWGAPATLLNFVLIGWFLGLEQGGKVLLLSIVNKGTNIILDYIFIVR
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHE
WGWESSGAGSATAISQYITLVIGMICVFKFIYLAEIPQLIKNIWQPQVIKKTFILNRDIL
ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHH
IRTFAIISTFAVFTNLSSYINTLVLVTNTLLLQVVTLAAYFIDGLAFATESLAGKSYGKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
NQKELKALVKLSGIIGISIGLIFAFIFCLFPTTLFSLLTNHTQVINNISSYVLWLIPILG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FGGIAYILDGYFLGLTQGNLLRNSTLVASLIGFLPFAIVGLLLKNNHILWLSLAMFMATR
CCHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
AITLGKAIPNIIVEKFSASIELIKDKNNKKHITPK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8265357; 9278503 [H]