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The map label for this gene is 113474743

Identifier: 113474743

GI number: 113474743

Start: 1471755

End: 1473455

Strand: Reverse

Name: 113474743

Synonym: Tery_0937

Alternate gene names: NA

Gene position: 1473455-1471755 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113474744

Following gene: 113474742

Centisome position: 19.01

GC content: 34.27

Gene sequence:

>1701_bases
ATGATTTATCTGAGAAAGAGGGCCCGCCCTTGGGTAAGTTCAAAATATATCAAAATATTAAGTAAAATGAAAGTCGAAGA
AGCATTGGAAGTTCTGGAGACAGTTCTACCTCCAGGCTCCTTAAACGCTGTAAAAAAAATGGTATTTTCTCAAGCCTGGG
AAGATAAAGGATATTCTGAAATTGCCGAGCAAGCAGGTTATGATCCAGACTACATTAAAGGAGTAGCTGCTAACTTATGG
CAAAGTATTTCTAATGTCTTAGACGAAAAAGTAACCAAGAAAAATTTTCGCGCTCTGCTGAGACAAAAATTTGGCATTCA
GAAATCATTTATTGCCAAAACCGAGCTAAATACTCAACAGCATCTAACTTCCCTGTCTTCTTGTGAAACAAATAAAATAG
TATATAAATCAAAAGTAATTGATTGGGGAGAAGCTATAGATGTTTCTGTTTTTTACGGACGCTCTCAAGAACTCAATCAA
CTGCAAAAGTATATTATCGCAGATGGTTGTCGCTTGATAGCCCTACTTGGTATGGGTGGTATCGGTAAAACAGCGGTAGC
AGCAAAAGTTGCTACACAACTACAAAGTGAATTTGACTATATAATTTGGCGATCGCTGCGCCACTCTCCACCACTAAAAA
TAATGCTGAGAGAACTGATCTCGTTTTTCTCTCACCAAAAATGTACTCAAGGAGAACTAAGCAAACTTCTTGAATACTTA
CGCCAGTCACGCTGTCTAATAATTTTAGATAGTGTCGAAACTATTTTAAAAGCTGGATGTACAGGTTATTACCGCTCTGG
TTATGAAAACTATAGTCAATTATTTCAGTTAATCAGCGAAACATCTCACTCTAGCTGTCTTATTCTCACCAGTAGAGAAA
AACTCCCAGAAGTAGCAGCCCTTGAAAGTATAGATACAGCAGTACGATCTTTGCAACTATTTGGATCAAAAGAAATAGCT
AAAGCCTTACTAGAAACTAGAGAAATATCAGGTTCAGAAGCACAAAAACAACAACTTAGCGAATATTATGGCTATAGTCC
CCTAGCATTAAAAATAGTCACTACCTCTATCAAAGACTTATTCGATGGAGACCTAAAAGAATTTCTCCAACATAATACTA
CTACCTTCAATGGTATTCGCCGACTCCTCGACCAACACTTTCATCGTCTTTCAGAACTAGAAAAAAAAATTATGGTTTGG
TTAGCAGTTAACCAAGACTGGACTAGTGTACAAAAATTAGAAACTGATATTGTGCCAGCAATTTCTAAAGTTAATCTCCT
GGAAAGCTTAGAAGCTCTCATCTGGCGCTCCATAGTCAAGAAAAAATTAAGTATGTATACAGTTGAACCTCTAGTAATGG
AGTACATTCTTAACTACCTAATTGAAGAAGTTATTGGTGAATTAATTACTACTAACTTAAACTTATTTGTTACTCATTCC
TTAATCATAACTACTGAAAACTCCTCTATTAAAGAACGACAAAATAAGTTAATTATTGAACCAATTGCTAGACAACTAAG
TAAAATATTTAGTTCTGATAAAACCCTCAAAAAACAATTATTATTAATCCTAAATAAGCTAGAAAGTAACGAAATTTTAC
CATGTGGTTATGGCAAAGAAAATCTTATTAATCTTTCTATTAAACTAGAGATTGATTTAATGAATATTGATATTTATTCT
CATAAAATAGAATATAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTAAAATTACATCAATTTATATATAATTTAAAATATAAGGACTTGTGCAGGCGAAGCCAAAAACCAGATTTTTTTCGTA
GATATCTATTATTAAAAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTACTCATATATATACCTAAAGGCTATTTAAGTATTAAATAAAACTAACAATAAAAAATTCCTAGAGCTGTGATAGGCA
AAACTAAAAATCTGAAATCA

Product: WD repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 566; Mature: 566

Protein sequence:

>566_residues
MIYLRKRARPWVSSKYIKILSKMKVEEALEVLETVLPPGSLNAVKKMVFSQAWEDKGYSEIAEQAGYDPDYIKGVAANLW
QSISNVLDEKVTKKNFRALLRQKFGIQKSFIAKTELNTQQHLTSLSSCETNKIVYKSKVIDWGEAIDVSVFYGRSQELNQ
LQKYIIADGCRLIALLGMGGIGKTAVAAKVATQLQSEFDYIIWRSLRHSPPLKIMLRELISFFSHQKCTQGELSKLLEYL
RQSRCLIILDSVETILKAGCTGYYRSGYENYSQLFQLISETSHSSCLILTSREKLPEVAALESIDTAVRSLQLFGSKEIA
KALLETREISGSEAQKQQLSEYYGYSPLALKIVTTSIKDLFDGDLKEFLQHNTTTFNGIRRLLDQHFHRLSELEKKIMVW
LAVNQDWTSVQKLETDIVPAISKVNLLESLEALIWRSIVKKKLSMYTVEPLVMEYILNYLIEEVIGELITTNLNLFVTHS
LIITTENSSIKERQNKLIIEPIARQLSKIFSSDKTLKKQLLLILNKLESNEILPCGYGKENLINLSIKLEIDLMNIDIYS
HKIEYN

Sequences:

>Translated_566_residues
MIYLRKRARPWVSSKYIKILSKMKVEEALEVLETVLPPGSLNAVKKMVFSQAWEDKGYSEIAEQAGYDPDYIKGVAANLW
QSISNVLDEKVTKKNFRALLRQKFGIQKSFIAKTELNTQQHLTSLSSCETNKIVYKSKVIDWGEAIDVSVFYGRSQELNQ
LQKYIIADGCRLIALLGMGGIGKTAVAAKVATQLQSEFDYIIWRSLRHSPPLKIMLRELISFFSHQKCTQGELSKLLEYL
RQSRCLIILDSVETILKAGCTGYYRSGYENYSQLFQLISETSHSSCLILTSREKLPEVAALESIDTAVRSLQLFGSKEIA
KALLETREISGSEAQKQQLSEYYGYSPLALKIVTTSIKDLFDGDLKEFLQHNTTTFNGIRRLLDQHFHRLSELEKKIMVW
LAVNQDWTSVQKLETDIVPAISKVNLLESLEALIWRSIVKKKLSMYTVEPLVMEYILNYLIEEVIGELITTNLNLFVTHS
LIITTENSSIKERQNKLIIEPIARQLSKIFSSDKTLKKQLLLILNKLESNEILPCGYGKENLINLSIKLEIDLMNIDIYS
HKIEYN
>Mature_566_residues
MIYLRKRARPWVSSKYIKILSKMKVEEALEVLETVLPPGSLNAVKKMVFSQAWEDKGYSEIAEQAGYDPDYIKGVAANLW
QSISNVLDEKVTKKNFRALLRQKFGIQKSFIAKTELNTQQHLTSLSSCETNKIVYKSKVIDWGEAIDVSVFYGRSQELNQ
LQKYIIADGCRLIALLGMGGIGKTAVAAKVATQLQSEFDYIIWRSLRHSPPLKIMLRELISFFSHQKCTQGELSKLLEYL
RQSRCLIILDSVETILKAGCTGYYRSGYENYSQLFQLISETSHSSCLILTSREKLPEVAALESIDTAVRSLQLFGSKEIA
KALLETREISGSEAQKQQLSEYYGYSPLALKIVTTSIKDLFDGDLKEFLQHNTTTFNGIRRLLDQHFHRLSELEKKIMVW
LAVNQDWTSVQKLETDIVPAISKVNLLESLEALIWRSIVKKKLSMYTVEPLVMEYILNYLIEEVIGELITTNLNLFVTHS
LIITTENSSIKERQNKLIIEPIARQLSKIFSSDKTLKKQLLLILNKLESNEILPCGYGKENLINLSIKLEIDLMNIDIYS
HKIEYN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 15 WD repeats [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR002182
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00931 NB-ARC; PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64650; Mature: 64650

Theoretical pI: Translated: 8.69; Mature: 8.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIYLRKRARPWVSSKYIKILSKMKVEEALEVLETVLPPGSLNAVKKMVFSQAWEDKGYSE
CEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
IAEQAGYDPDYIKGVAANLWQSISNVLDEKVTKKNFRALLRQKFGIQKSFIAKTELNTQQ
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHH
HLTSLSSCETNKIVYKSKVIDWGEAIDVSVFYGRSQELNQLQKYIIADGCRLIALLGMGG
HHHHHHCCCCCCEEEHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCC
IGKTAVAAKVATQLQSEFDYIIWRSLRHSPPLKIMLRELISFFSHQKCTQGELSKLLEYL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
RQSRCLIILDSVETILKAGCTGYYRSGYENYSQLFQLISETSHSSCLILTSREKLPEVAA
HCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHCCCHHHH
LESIDTAVRSLQLFGSKEIAKALLETREISGSEAQKQQLSEYYGYSPLALKIVTTSIKDL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
FDGDLKEFLQHNTTTFNGIRRLLDQHFHRLSELEKKIMVWLAVNQDWTSVQKLETDIVPA
HCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
ISKVNLLESLEALIWRSIVKKKLSMYTVEPLVMEYILNYLIEEVIGELITTNLNLFVTHS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
LIITTENSSIKERQNKLIIEPIARQLSKIFSSDKTLKKQLLLILNKLESNEILPCGYGKE
EEEEECCCHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
NLINLSIKLEIDLMNIDIYSHKIEYN
CEEEEEEEEEEEEEEEEEEECEECCC
>Mature Secondary Structure
MIYLRKRARPWVSSKYIKILSKMKVEEALEVLETVLPPGSLNAVKKMVFSQAWEDKGYSE
CEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
IAEQAGYDPDYIKGVAANLWQSISNVLDEKVTKKNFRALLRQKFGIQKSFIAKTELNTQQ
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHH
HLTSLSSCETNKIVYKSKVIDWGEAIDVSVFYGRSQELNQLQKYIIADGCRLIALLGMGG
HHHHHHCCCCCCEEEHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCC
IGKTAVAAKVATQLQSEFDYIIWRSLRHSPPLKIMLRELISFFSHQKCTQGELSKLLEYL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
RQSRCLIILDSVETILKAGCTGYYRSGYENYSQLFQLISETSHSSCLILTSREKLPEVAA
HCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHCCCHHHH
LESIDTAVRSLQLFGSKEIAKALLETREISGSEAQKQQLSEYYGYSPLALKIVTTSIKDL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
FDGDLKEFLQHNTTTFNGIRRLLDQHFHRLSELEKKIMVWLAVNQDWTSVQKLETDIVPA
HCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
ISKVNLLESLEALIWRSIVKKKLSMYTVEPLVMEYILNYLIEEVIGELITTNLNLFVTHS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
LIITTENSSIKERQNKLIIEPIARQLSKIFSSDKTLKKQLLLILNKLESNEILPCGYGKE
EEEEECCCHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
NLINLSIKLEIDLMNIDIYSHKIEYN
CEEEEEEEEEEEEEEEEEEECEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11759840 [H]