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The map label for this gene is flhA [H]

Identifier: 108562831

GI number: 108562831

Start: 416246

End: 418447

Strand: Reverse

Name: flhA [H]

Synonym: HPAG1_0406

Alternate gene names: 108562831

Gene position: 418447-416246 (Counterclockwise)

Preceding gene: 108562839

Following gene: 108562830

Centisome position: 26.21

GC content: 42.05

Gene sequence:

>2202_bases
ATGGCAAACGAACGCTCCAAATTAGCTTTTAAAAAGACTTTCCCTGTCTTTAAACGCTTTTTGCAATCCAAAGACTTAGC
CCTTGTGGTCTTTGTGATCGCTATTTTAGCGATCATTATCGTGCCGTTACCGCCTTTTGTGTTGGACTTTTTACTCACGA
TTTCTATCGCGCTATCGGTGTTGATTATTTTAATCGGGCTTTATATTGACAAGCCTACTGATTTTAGCGCTTTCCCCACT
TTATTGCTCATTGTAACCTTATACCGCTTGGCTTTAAATGTCGCCACCACTAGAATGATTTTAACCCAAGGCTATAAAGG
GCCTAGCGCGGTGAGCGATATTATCACGGCGTTTGGGGAATTTAGCGTGAGCGGGAATTATGTGATTGGGGCGATTATCT
TTAGTATTTTAGTGTTAGTGAATTTATTAGTGGTTACTAATGGCTCTACTAGGGTTACTGAAGTTAGGGCACGATTCGCT
CTAGACGCTATGCCAGGAAAGCAAATGGCGATTGATGCGGATTTAAACTCAGGGCTTATTGACGATAAGGAAGCTAAAAA
ACGGCGCGCCGCTCTAAGCCAAGAAGCGGATTTTTATGGCGCGATGGATGGCGCGTCTAAATTTGTCAAAGGCGATGCGA
TCGCTTCTATCATCATCACGCTTATCAATATCATTGGAGGGTTTTTAGTGGGCGTGTTTCAAAGGGATATGAGTTTGAGC
TTTAGCGCTAGCACTTTCACTATCCTAACCATTGGCGATGGGCTTGTAGGGCAAATCCCTGCCTTAATCATTGCGACAGC
GACCGGTATTGTCGCCACTCGCACCACGCAAAACGAAGAAGAAGATTTCGCTTCTAAACTCATCACACAGCTCACCAATA
AAAGCAAAACTTTAGTGATTGTGGGAGCGATTTTATTGCTTTTTGCAACCATTCCTGGACTCCCTACCTTTTCTTTAGCG
TTTGTAGGGGCTCTCTTTTTATTCATCGCATGGCTGATTAGCAGGGAGGGAAAGGACGGACTGCTCACTAAATTAGAAAA
TTATTTGAGTCAAAAATTCGGCTTGGATTTGAGCGAAAAACCCCACAGCTCCAAAATCAAACCCCACGCCCCCACTACAA
GGGCTAAAACCCAAGAAGAGCTTAAAAGAGAAGAAGAACAAGCCATTGATGAAGTGTTAAAAATTGAATTTTTAGAATTG
GCTTTAGGCTATCAGCTCATCAGCTTAGCGGACATGAAACAAGGGGGCGATTTGTTAGAAAGGATTAGGGGTATTAGAAA
AAAAATAGCGAGCGATTATGGTTTTTTGATGCCGCAAATTAGGATTAGGGATAATTTACAGCTCCCCCCAACGCATTATG
AAATCAAGCTTAAGGGCATTGTGATTGGTGAGGGCATGGTGATGCCAGACAAGTTTTTAGCCATGAATACCGGCTTTGTG
AATAAAGAAATTGAAGGCATTCCCACTAAAGAGCCGGCTTTTGGAATGGACGCTTTATGGATTGAAACTAAAAATAAAGA
AGAAGCCATCATTCAAGGCTATACCATTATTGATCCAAGCACCGTTATTGCGACACACACCAGCGAATTAGTGAAAAAAT
ACGCTGAAGATTTTATCACTAAAGATGAAGTGAAATCCCTTTTAGAGCGCTTGGCTAAAGACTATCCTACAATTGTAGAA
GAGAGTAAAAAAATCCCCACCGGTGCGATCCGCTCAGTCTTGCAAGCCTTGTTGCATGAAAAAATCCCCATTAAAGACAT
GCTCACTATTTTGGAAACGATTACCGATATTGCCCCATTGGTTCAAAACGATGTGAATATCTTAACCGAACAAGTGAGGG
CGAGGCTTTCTAGGGTGATCACTAACGCTTTTAAATCTGAAGACGGGCGTTTGAAATTTTTAACCTTTTCTACCGATAGC
GAACAATTTTTGCTGAATAAATTGCGAGAAAATGGCACTTCTAAGAGCTTGCTACTCAATGTGGGCGAATTGCAAAAACT
CATTGAAGGGGTCTCTGAAGAGGCCATGAAAGTCTTGCAAAAAGGGATCGCTCCGGTGATTTTGATCGTAGAGCCTAATT
TAAGAAAAGCCCTTTCCAATCAAATGGAGCAGGCCAGGATTGATGTGGTCGTGCTAAGCCATGCGGAATTAGATCCTAAC
TCTAATTTTGAAGCCTTAGGCACGATCCATATTAACTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTATAGCGTAAAATAAGCTTTTTTGCGCCATACTCTCAAACTTTATATTATAATAAGAGACAAACACACCTACCAAAAT
TAAGGCATTGATTTTAGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGATAAATAATTGATAAAAAAGGAGAATGATGCAAGTTTACCACCTTTCACACATTGATTTAGACGGCTATGCATGCCA
GCTTGTTTCAAAACAATTTT

Product: flagellar biosynthesis protein FlhA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 733; Mature: 732

Protein sequence:

>733_residues
MANERSKLAFKKTFPVFKRFLQSKDLALVVFVIAILAIIIVPLPPFVLDFLLTISIALSVLIILIGLYIDKPTDFSAFPT
LLLIVTLYRLALNVATTRMILTQGYKGPSAVSDIITAFGEFSVSGNYVIGAIIFSILVLVNLLVVTNGSTRVTEVRARFA
LDAMPGKQMAIDADLNSGLIDDKEAKKRRAALSQEADFYGAMDGASKFVKGDAIASIIITLINIIGGFLVGVFQRDMSLS
FSASTFTILTIGDGLVGQIPALIIATATGIVATRTTQNEEEDFASKLITQLTNKSKTLVIVGAILLLFATIPGLPTFSLA
FVGALFLFIAWLISREGKDGLLTKLENYLSQKFGLDLSEKPHSSKIKPHAPTTRAKTQEELKREEEQAIDEVLKIEFLEL
ALGYQLISLADMKQGGDLLERIRGIRKKIASDYGFLMPQIRIRDNLQLPPTHYEIKLKGIVIGEGMVMPDKFLAMNTGFV
NKEIEGIPTKEPAFGMDALWIETKNKEEAIIQGYTIIDPSTVIATHTSELVKKYAEDFITKDEVKSLLERLAKDYPTIVE
ESKKIPTGAIRSVLQALLHEKIPIKDMLTILETITDIAPLVQNDVNILTEQVRARLSRVITNAFKSEDGRLKFLTFSTDS
EQFLLNKLRENGTSKSLLLNVGELQKLIEGVSEEAMKVLQKGIAPVILIVEPNLRKALSNQMEQARIDVVVLSHAELDPN
SNFEALGTIHINF

Sequences:

>Translated_733_residues
MANERSKLAFKKTFPVFKRFLQSKDLALVVFVIAILAIIIVPLPPFVLDFLLTISIALSVLIILIGLYIDKPTDFSAFPT
LLLIVTLYRLALNVATTRMILTQGYKGPSAVSDIITAFGEFSVSGNYVIGAIIFSILVLVNLLVVTNGSTRVTEVRARFA
LDAMPGKQMAIDADLNSGLIDDKEAKKRRAALSQEADFYGAMDGASKFVKGDAIASIIITLINIIGGFLVGVFQRDMSLS
FSASTFTILTIGDGLVGQIPALIIATATGIVATRTTQNEEEDFASKLITQLTNKSKTLVIVGAILLLFATIPGLPTFSLA
FVGALFLFIAWLISREGKDGLLTKLENYLSQKFGLDLSEKPHSSKIKPHAPTTRAKTQEELKREEEQAIDEVLKIEFLEL
ALGYQLISLADMKQGGDLLERIRGIRKKIASDYGFLMPQIRIRDNLQLPPTHYEIKLKGIVIGEGMVMPDKFLAMNTGFV
NKEIEGIPTKEPAFGMDALWIETKNKEEAIIQGYTIIDPSTVIATHTSELVKKYAEDFITKDEVKSLLERLAKDYPTIVE
ESKKIPTGAIRSVLQALLHEKIPIKDMLTILETITDIAPLVQNDVNILTEQVRARLSRVITNAFKSEDGRLKFLTFSTDS
EQFLLNKLRENGTSKSLLLNVGELQKLIEGVSEEAMKVLQKGIAPVILIVEPNLRKALSNQMEQARIDVVVLSHAELDPN
SNFEALGTIHINF
>Mature_732_residues
ANERSKLAFKKTFPVFKRFLQSKDLALVVFVIAILAIIIVPLPPFVLDFLLTISIALSVLIILIGLYIDKPTDFSAFPTL
LLIVTLYRLALNVATTRMILTQGYKGPSAVSDIITAFGEFSVSGNYVIGAIIFSILVLVNLLVVTNGSTRVTEVRARFAL
DAMPGKQMAIDADLNSGLIDDKEAKKRRAALSQEADFYGAMDGASKFVKGDAIASIIITLINIIGGFLVGVFQRDMSLSF
SASTFTILTIGDGLVGQIPALIIATATGIVATRTTQNEEEDFASKLITQLTNKSKTLVIVGAILLLFATIPGLPTFSLAF
VGALFLFIAWLISREGKDGLLTKLENYLSQKFGLDLSEKPHSSKIKPHAPTTRAKTQEELKREEEQAIDEVLKIEFLELA
LGYQLISLADMKQGGDLLERIRGIRKKIASDYGFLMPQIRIRDNLQLPPTHYEIKLKGIVIGEGMVMPDKFLAMNTGFVN
KEIEGIPTKEPAFGMDALWIETKNKEEAIIQGYTIIDPSTVIATHTSELVKKYAEDFITKDEVKSLLERLAKDYPTIVEE
SKKIPTGAIRSVLQALLHEKIPIKDMLTILETITDIAPLVQNDVNILTEQVRARLSRVITNAFKSEDGRLKFLTFSTDSE
QFLLNKLRENGTSKSLLLNVGELQKLIEGVSEEAMKVLQKGIAPVILIVEPNLRKALSNQMEQARIDVVVLSHAELDPNS
NFEALGTIHINF

Specific function: Involved in the export of flagellum proteins [H]

COG id: COG1298

COG function: function code NU; Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the FHIPEP (flagella/HR/invasion proteins export pore) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788187, Length=727, Percent_Identity=40.990371389271, Blast_Score=527, Evalue=1e-150,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 (rich media) [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006301
- InterPro:   IPR001712 [H]

Pfam domain/function: PF00771 FHIPEP [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80794; Mature: 80663

Theoretical pI: Translated: 6.45; Mature: 6.45

Prosite motif: PS00994 FHIPEP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MANERSKLAFKKTFPVFKRFLQSKDLALVVFVIAILAIIIVPLPPFVLDFLLTISIALSV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LIILIGLYIDKPTDFSAFPTLLLIVTLYRLALNVATTRMILTQGYKGPSAVSDIITAFGE
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHC
FSVSGNYVIGAIIFSILVLVNLLVVTNGSTRVTEVRARFALDAMPGKQMAIDADLNSGLI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCC
DDKEAKKRRAALSQEADFYGAMDGASKFVKGDAIASIIITLINIIGGFLVGVFQRDMSLS
CCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE
FSASTFTILTIGDGLVGQIPALIIATATGIVATRTTQNEEEDFASKLITQLTNKSKTLVI
ECCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHH
VGAILLLFATIPGLPTFSLAFVGALFLFIAWLISREGKDGLLTKLENYLSQKFGLDLSEK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PHSSKIKPHAPTTRAKTQEELKREEEQAIDEVLKIEFLELALGYQLISLADMKQGGDLLE
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
RIRGIRKKIASDYGFLMPQIRIRDNLQLPPTHYEIKLKGIVIGEGMVMPDKFLAMNTGFV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCHHHEECCCCC
NKEIEGIPTKEPAFGMDALWIETKNKEEAIIQGYTIIDPSTVIATHTSELVKKYAEDFIT
CCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KDEVKSLLERLAKDYPTIVEESKKIPTGAIRSVLQALLHEKIPIKDMLTILETITDIAPL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VQNDVNILTEQVRARLSRVITNAFKSEDGRLKFLTFSTDSEQFLLNKLRENGTSKSLLLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHEE
VGELQKLIEGVSEEAMKVLQKGIAPVILIVEPNLRKALSNQMEQARIDVVVLSHAELDPN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCC
SNFEALGTIHINF
CCCEEEEEEEEEC
>Mature Secondary Structure 
ANERSKLAFKKTFPVFKRFLQSKDLALVVFVIAILAIIIVPLPPFVLDFLLTISIALSV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LIILIGLYIDKPTDFSAFPTLLLIVTLYRLALNVATTRMILTQGYKGPSAVSDIITAFGE
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHC
FSVSGNYVIGAIIFSILVLVNLLVVTNGSTRVTEVRARFALDAMPGKQMAIDADLNSGLI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCC
DDKEAKKRRAALSQEADFYGAMDGASKFVKGDAIASIIITLINIIGGFLVGVFQRDMSLS
CCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE
FSASTFTILTIGDGLVGQIPALIIATATGIVATRTTQNEEEDFASKLITQLTNKSKTLVI
ECCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHH
VGAILLLFATIPGLPTFSLAFVGALFLFIAWLISREGKDGLLTKLENYLSQKFGLDLSEK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PHSSKIKPHAPTTRAKTQEELKREEEQAIDEVLKIEFLELALGYQLISLADMKQGGDLLE
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
RIRGIRKKIASDYGFLMPQIRIRDNLQLPPTHYEIKLKGIVIGEGMVMPDKFLAMNTGFV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCHHHEECCCCC
NKEIEGIPTKEPAFGMDALWIETKNKEEAIIQGYTIIDPSTVIATHTSELVKKYAEDFIT
CCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KDEVKSLLERLAKDYPTIVEESKKIPTGAIRSVLQALLHEKIPIKDMLTILETITDIAPL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VQNDVNILTEQVRARLSRVITNAFKSEDGRLKFLTFSTDSEQFLLNKLRENGTSKSLLLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHEE
VGELQKLIEGVSEEAMKVLQKGIAPVILIVEPNLRKALSNQMEQARIDVVVLSHAELDPN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCC
SNFEALGTIHINF
CCCEEEEEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9923682 [H]