| Definition | Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007969 |
| Length | 3,059,876 |
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The map label for this gene is 93006961
Identifier: 93006961
GI number: 93006961
Start: 2616051
End: 2618471
Strand: Reverse
Name: 93006961
Synonym: Pcryo_2137
Alternate gene names: NA
Gene position: 2618471-2616051 (Counterclockwise)
Preceding gene: 93006962
Following gene: 93006960
Centisome position: 85.57
GC content: 30.73
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TAGAAGCGCTTTAGTGCGCTATTATTTTTATAATTATCTTTATGAATGTAAGGAACACCATGAACCATCTCACCGTCGGA CAACGCTCGCCTTTAAGCAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 806; Mature: 806
Protein sequence:
>806_residues MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFIDRIQKPSDGLPYEILDYLVP KFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGHGVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVI DEHKISIPLLYQEEPFVIISIKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIENNNPLYICYYSAKKTKWTED GLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVDKAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERV KYISKNIARVIITSRRREIIQAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKIYQLVEINKEEFTQAYEETYF ANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSKAQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTD RGEIDKAIEMYELALVDDPINSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGYEAKIRDDAVRYHNLSLKRLN DMKFKN
Sequences:
>Translated_806_residues MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFIDRIQKPSDGLPYEILDYLVP KFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGHGVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVI DEHKISIPLLYQEEPFVIISIKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIENNNPLYICYYSAKKTKWTED GLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVDKAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERV KYISKNIARVIITSRRREIIQAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKIYQLVEINKEEFTQAYEETYF ANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSKAQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTD RGEIDKAIEMYELALVDDPINSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGYEAKIRDDAVRYHNLSLKRLN DMKFKN >Mature_806_residues MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFIDRIQKPSDGLPYEILDYLVP KFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGHGVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVI DEHKISIPLLYQEEPFVIISIKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIENNNPLYICYYSAKKTKWTED GLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVDKAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERV KYISKNIARVIITSRRREIIQAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKIYQLVEINKEEFTQAYEETYF ANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSKAQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTD RGEIDKAIEMYELALVDDPINSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGYEAKIRDDAVRYHNLSLKRLN DMKFKN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 94146; Mature: 94146
Theoretical pI: Translated: 5.75; Mature: 5.75
Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFI CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEECCCHHHHHHH DRIQKPSDGLPYEILDYLVPKFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGH HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC GVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVIDEHKISIPLLYQEEPFVIIS CEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEE IKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN ECCCCCCEEECCCEEECCCCCCCEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEC IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIE CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE NNNPLYICYYSAKKTKWTEDGLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVD CCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHH KAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERVKYISKNIARVIITSRRREII HHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKI HHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHH YQLVEINKEEFTQAYEETYFANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSK HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTDRGEIDKAIEMYELALVDDPI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH NSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI HHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGY HHHHHCCCCCCHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC EAKIRDDAVRYHNLSLKRLNDMKFKN HHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFI CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEECCCHHHHHHH DRIQKPSDGLPYEILDYLVPKFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGH HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC GVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVIDEHKISIPLLYQEEPFVIIS CEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEE IKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN ECCCCCCEEECCCEEECCCCCCCEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEC IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIE CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE NNNPLYICYYSAKKTKWTEDGLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVD CCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHH KAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERVKYISKNIARVIITSRRREII HHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKI HHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHH YQLVEINKEEFTQAYEETYFANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSK HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTDRGEIDKAIEMYELALVDDPI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH NSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI HHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGY HHHHHCCCCCCHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC EAKIRDDAVRYHNLSLKRLNDMKFKN HHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA