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Definition Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome.
Accession NC_007969
Length 3,059,876

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The map label for this gene is 93006961

Identifier: 93006961

GI number: 93006961

Start: 2616051

End: 2618471

Strand: Reverse

Name: 93006961

Synonym: Pcryo_2137

Alternate gene names: NA

Gene position: 2618471-2616051 (Counterclockwise)

Preceding gene: 93006962

Following gene: 93006960

Centisome position: 85.57

GC content: 30.73

Gene sequence:

>2421_bases
ATGAAAAGCTTATACAATATTAAATTGGATGAAATAGCATCTATTAGCTCAGTTATTGAAAAATGTAATGCACTATTCTC
GTTGATACGCTCATTAACACAAGTTATAGCTCTCACAAGTCTGGATATATCCACATCTATATTAAGATTAGAGGAAGATG
AAAGACTTACCGACTTTATAGATAGGATTCAAAAACCATCCGATGGACTGCCTTATGAAATTTTGGATTACTTAGTTCCT
AAATTTAGAACTGATATTGATGAGAGGTTTATGGATGGATGGTTTGAAAAAAAAGATAATATAAGCTTAGCGGATGAATT
ACGCAATTTTATTGAGTTTAGAAACTCCTCTTCTGGACATGGGGTATTGGATTTAAAAAAGTCGGAAGAATGGGCACCTA
AGCTAATAAGTCTTTCATCTAGGATACTTGAGGTTTGCGAGAGGTTGATTCCATCAGTTGACAACAAATTAAAGGTAATT
GATGAACACAAGATATCGATTCCGTTACTATATCAAGAAGAGCCATTTGTGATTATCTCCATTAAACAAAGAAAAGGTTT
ATGGAGATTAAAGGGTCAAACACTGAATATAACTGATTCAGAAGAATTTAGCTTTGGTTTAAATAATTCACGAATTTTTA
ATATAGAACGTATAAATACTAATCGAGGTTATGACTTAGTAGAAATAAATAACGAAAGCAACGATATTCTATTTCATAAT
ATACCAGTCCGACAAACTGATTCATTTCATGGTAGAAATAAAGAGCTTAATACACTAACAGAATGGTACAGCGATGTAGA
CTCAAGAGTCTGTCTTATTTATGGTGATGGGGGATATGGTAAAACTACTTTTATATTAGAGTCTTTAAACCAATTTTTAG
ATGGTGATTTTGAAATAGAAAATAATAATCCATTATACATTTGTTATTACTCTGCAAAGAAAACTAAATGGACTGAAGAT
GGTTTAGTTTATTTTCAATCTGCACAGCCAATGGTTGATGACTGTATCCGAGAAATTGTAAAGACTCAGACGGATTTATC
TAAGGAATGGTACGGTATTGATGGTAGAGCATTAGTAGACAAAGCAAAAAATATTCTACAGAAAAATAAAATAAATAGAG
ATGATATTCTCCTAATTATTGATAATTCTGAAACTTTAGCTAATTCTCCAACTGAGGTTAAGGAGTTGTCTGAGAGGGTT
AAATATATATCAAAAAATATCGCAAGAGTTATTATAACTTCTAGAAGAAGAGAAATAATACAAGCCGAACCAATACTCAT
AGAAGGTTTAAATGAGTCTGAAAGCGTAGAGCTTATGAAAAATCTATCTGCGCGTTATAATGCAGAATCTCTTAATAAGG
CTGGAGAAAATAGATTAAGAAAAATTGTCAAAAAACTAATGTATAAACCCTTACTTATTGAAGCATATGTTAAATATATG
AAACACTCTCAATCTGGCATAGATGAAGGTTTGAATAAGTTTTACAAATTTTCAAACGAAGAGTTGTTAGAATTCTTATA
CGAAGATGCTTGGCTAAGGATGAATGAACTTCAAAGAAAGGTTTTCTTAGTAATTATTCATGTTGACCATGAAATTAATA
ATCGAGTTCTGGATAAGATTTATCAACTCGTTGAAATTAATAAGGAAGAGTTTACTCAAGCTTATGAGGAAACCTATTTC
GCTAATATAACTGATTTTGGTTCAGAGTTTATTTTCGAAATAGTAAGTTTGGCACAGATGTTCTTTAAAAAGCAATTCTC
AAGTTATACTAAATATGTACAAGACGATATTAAGAGTAAGGCACAAAAGGCTGAATTGTATGGAAAAAAGCTACAAGAAA
TGGAAAAAAGCTACAAAACTGATAGGGTTTCAGAAGCATTTAGGTCTGAATATGCTAGATTTGCTAAAAGTCACACAGAT
CGTGGAGAAATTGACAAAGCTATTGAGATGTACGAACTAGCTCTGGTTGATGATCCTATAAACTCATATTTATATGACCG
TTATGCTTGGCTTTTAATTAATAAAACAAATAATTTTGAAAAAGCATTATTATTATCCGAAAAAGCATTTGAGTTAGATC
AAAATAATATTGATGCTATGGTTAATGTAGCTTTATCTTATTACAAGCTAAAAAATATTAAAAAAGGTGATGAGTTTATA
GAGCTTTGTGTTAAGAAAGGTAGGTCTGAATCATTTGTTTTTCTTAGAAAAGGTATTGCAAGGTATCAGATTGCAAAAAA
TTCAAGTGATAATAAATATGCTGTTAGCCTATATAATGAAGCTATTAAATTTTTTAACAAGATTGGATATAACACCAAGA
GTGAAGCTATTACGGGCTATGAGGCTAAGATTAGAGATGATGCAGTACGATATCATAATTTATCTTTAAAGAGATTGAAC
GACATGAAGTTTAAAAACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTAGAATGGCAGTTAACGCCGTAGATGAAAGCTCTCAATAGTCACCTAAGAATTTATTACAATACTACCTACTTTTTAG
CTTCAGACTCGAGATAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGAAGCGCTTTAGTGCGCTATTATTTTTATAATTATCTTTATGAATGTAAGGAACACCATGAACCATCTCACCGTCGGA
CAACGCTCGCCTTTAAGCAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 806; Mature: 806

Protein sequence:

>806_residues
MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFIDRIQKPSDGLPYEILDYLVP
KFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGHGVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVI
DEHKISIPLLYQEEPFVIISIKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN
IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIENNNPLYICYYSAKKTKWTED
GLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVDKAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERV
KYISKNIARVIITSRRREIIQAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM
KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKIYQLVEINKEEFTQAYEETYF
ANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSKAQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTD
RGEIDKAIEMYELALVDDPINSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI
ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGYEAKIRDDAVRYHNLSLKRLN
DMKFKN

Sequences:

>Translated_806_residues
MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFIDRIQKPSDGLPYEILDYLVP
KFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGHGVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVI
DEHKISIPLLYQEEPFVIISIKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN
IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIENNNPLYICYYSAKKTKWTED
GLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVDKAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERV
KYISKNIARVIITSRRREIIQAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM
KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKIYQLVEINKEEFTQAYEETYF
ANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSKAQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTD
RGEIDKAIEMYELALVDDPINSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI
ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGYEAKIRDDAVRYHNLSLKRLN
DMKFKN
>Mature_806_residues
MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFIDRIQKPSDGLPYEILDYLVP
KFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGHGVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVI
DEHKISIPLLYQEEPFVIISIKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN
IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIENNNPLYICYYSAKKTKWTED
GLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVDKAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERV
KYISKNIARVIITSRRREIIQAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM
KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKIYQLVEINKEEFTQAYEETYF
ANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSKAQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTD
RGEIDKAIEMYELALVDDPINSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI
ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGYEAKIRDDAVRYHNLSLKRLN
DMKFKN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94146; Mature: 94146

Theoretical pI: Translated: 5.75; Mature: 5.75

Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFI
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEECCCHHHHHHH
DRIQKPSDGLPYEILDYLVPKFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGH
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC
GVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVIDEHKISIPLLYQEEPFVIIS
CEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEE
IKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN
ECCCCCCEEECCCEEECCCCCCCEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEC
IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIE
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
NNNPLYICYYSAKKTKWTEDGLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVD
CCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHH
KAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERVKYISKNIARVIITSRRREII
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM
CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKI
HHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHH
YQLVEINKEEFTQAYEETYFANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTDRGEIDKAIEMYELALVDDPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
NSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI
HHHHHHCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGY
HHHHHCCCCCCHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
EAKIRDDAVRYHNLSLKRLNDMKFKN
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKSLYNIKLDEIASISSVIEKCNALFSLIRSLTQVIALTSLDISTSILRLEEDERLTDFI
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEECCCHHHHHHH
DRIQKPSDGLPYEILDYLVPKFRTDIDERFMDGWFEKKDNISLADELRNFIEFRNSSSGH
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC
GVLDLKKSEEWAPKLISLSSRILEVCERLIPSVDNKLKVIDEHKISIPLLYQEEPFVIIS
CEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEE
IKQRKGLWRLKGQTLNITDSEEFSFGLNNSRIFNIERINTNRGYDLVEINNESNDILFHN
ECCCCCCEEECCCEEECCCCCCCEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEC
IPVRQTDSFHGRNKELNTLTEWYSDVDSRVCLIYGDGGYGKTTFILESLNQFLDGDFEIE
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
NNNPLYICYYSAKKTKWTEDGLVYFQSAQPMVDDCIREIVKTQTDLSKEWYGIDGRALVD
CCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHH
KAKNILQKNKINRDDILLIIDNSETLANSPTEVKELSERVKYISKNIARVIITSRRREII
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAEPILIEGLNESESVELMKNLSARYNAESLNKAGENRLRKIVKKLMYKPLLIEAYVKYM
CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
KHSQSGIDEGLNKFYKFSNEELLEFLYEDAWLRMNELQRKVFLVIIHVDHEINNRVLDKI
HHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHH
YQLVEINKEEFTQAYEETYFANITDFGSEFIFEIVSLAQMFFKKQFSSYTKYVQDDIKSK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQKAELYGKKLQEMEKSYKTDRVSEAFRSEYARFAKSHTDRGEIDKAIEMYELALVDDPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
NSYLYDRYAWLLINKTNNFEKALLLSEKAFELDQNNIDAMVNVALSYYKLKNIKKGDEFI
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ELCVKKGRSESFVFLRKGIARYQIAKNSSDNKYAVSLYNEAIKFFNKIGYNTKSEAITGY
HHHHHCCCCCCHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
EAKIRDDAVRYHNLSLKRLNDMKFKN
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA