Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 93005741

Identifier: 93005741

GI number: 93005741

Start: 1082635

End: 1085019

Strand: Reverse

Name: 93005741

Synonym: Pcryo_0913

Alternate gene names: NA

Gene position: 1085019-1082635 (Counterclockwise)

Preceding gene: 93005742

Following gene: 93005740

Centisome position: 35.46

GC content: 36.27

Gene sequence:

>2385_bases
ATGCCTGATGATGGTAATCAAATTGTTCTTTTGACGGATAGCCAGCTTATTGAGCAAGTTGATTTTTTAAGTGTTGAAGA
TGAATATAACTACACTGAGAACTGGATAGCCTCACTAAAGGAAATTGCCACTTTAATTAATTTAAGCGTTCAACAACGAT
CGCCACCTTTAATAGAGCAGTTGATAGCTATAAAAAACGGTTTGCTTTTTCAAGAAGAAGTCAGTAAAAAGACACTTAAT
GCATTACCTCCGATTCTACAACCACTTTTCTTGGTAGCTAACTTAACCCGTGATGAGCACAAAGAAATAATATGGTTATG
CATATCCATTCACACGTATTTGTTATTATCACATCACAAAAAAGCAAAGAGGCATTTAACGAATATAATTAACCGATTCA
AATTACCCGTATTTTTTAAATCTAACAACAACAGATGGATTTGGGAGATATTACCAAAACTTGACGATATTGAAGGCTTA
TCAGATACAGTAGACTTTCTCCATAGATTTTTTATAGCCCAATTAAGAAAAATAGCGTACGAACAAGAAGTGCGAAACGA
GCTACTAACTAGAACTGTGGAAAGTGACGCAACCATCAAATTACGCAGTAAAAAAATCAATCAGCTTGATGCGATTGTTA
AATGCTTTGAACAAGCCTACTATCCACATAAAAAAATCACTCGGCAAGGTAAAAATGAAGATGCTGAAGAAAAATATTTA
AATACTTTTAAAAGCGAGATTACCGAACAGTTAGCTAGTTTTGTAGACGGTTCAACCTGGATAGAGAATAGTTATTGGAA
TCTGAGTAGATACGATATTGAAAACGATGCTCCACATTTATACTATCAACATCCTGCAATACCAAATTTTGATTATGAAC
TGTACTCACCAAACTCAACAAAACCTAGAAATATTGAAGAATATATTGATACTTTAGAACGTCCACTAATTGTCAGTTTA
GATTTGCCTGATAAGAAAATTCGTTACATGCAACCGTTACATAGGATAGAAAAAAACGTTCATCATAGTTATATTAGTCA
GAGAGAATTAGAGCTTAACTCTAATGTCCGAACGCTTTCTGTCGCAGGCTTAAAACAGGTTTTTGGCAGATTAGCGATAG
ATTCACATCGATACGACTATAAACACAATAAAGCCTCTTTAATCTTACTCCTATCAATGATGACAGCCGTTCCTGTAGAG
TTTTTAATGACAACTGGTTTCATTTCAGGTTCTGGGTTATTCACCGTTTTGGAAGATACTGCATATTTGCAGTATCAGCT
GCAAATCACTGATCGCAAGCAGGAGTATGATGCAAGTATCCACGAAAACCAAGAAAGTATCATCCGTCTGCCCATGCCAA
TGGGATTAATAAAACTCCTTTCTAATGAAAGAAATTTATCAAGCAAGGAGGATATCTTAGACTATATTCGGGCTATAAAG
GAAGAGATAAACTTACCCTATCTATCAATAGTACGGATTGAAACCGCTTTACATATCATCTTACACAGATACATTCAGGG
TAGTAATCAACATATTGCTGATCTGATTTGTCGAATACCAGCATCTCTTGCGCCCTCTACCTACTACAGCAGCCATAGTA
ACGATTTTCTTGTTAATCGTTATCGTCAAGCGATAGAGCTGCTTAACTATGATAATCAATTAGACGATAGTTTTATTAGC
CAGCCGAGCACCAGAACAGATTTTACTACAGGCTCTGGATTTGCTTTGACATTAGAGTACGTCAATATTTTTTTACAGAA
CCTATGGGTATGGGTTGGTAATAGCGGTGATAAGGAGGAGCGCTTTAATAGGTATAGTGCTCTTGTTTGGATCCAGTTTT
GTTTGTTGACCGGCACTCGCCCAAATAATGGACTGACTAATGTTAAAGATATTGACTTAGAGACAGGCTGGTATGAAGTT
GCTGACAAACCTAACAAGGTTGTCAAAAACCATCGGCTAATTCCACTGTGCCCTACTCTTTTGGCGATTTTAAAAAAGTA
CCAATTATTTCTTGTCGATTATCAGCCTTATGCGACTGCCAAGGTCGATAAAATGATTCATCAGATCAAACAAGAGCAAG
ATGAGTTAACCCTCCTAAATATACTATCAGATAATTACGATAAACTTATTAAAATCAAGCGAAGCCATATCTCAAAACTG
TTAGCAGATTACATGCCTTTTGAGGATTCTTATTGGACACGGCACTTCTTACGTACCCAACTTGAAAAGCTTGGCGTTTC
AATGATCTTGATTAACACAGTGATTGGTCACGAAAAAAACCGACAAGAAGCATTGGGACAATTCTCATCAGTAAACAAGC
AACAAATTTGGCAAGTGCGTGATACCTTTGAGGAAATCGCACAACAAATGAATTTAAGAATGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATAGTTATACTATCCTGCTGTTTTGCAGACACATGAACATCCATAAAAATACATACGATAACGCACGAAATGAGTCA
AAAAAATAGCGAGGAATATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGCAAATGAAACCATTAAAAAATAAATCAAATAACGATAGCCACAAGCCGCGCAAAGAATTAGCAAAGCCGCAGCAAAC
TCAGAAATCTAAACGCAAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 794; Mature: 793

Protein sequence:

>794_residues
MPDDGNQIVLLTDSQLIEQVDFLSVEDEYNYTENWIASLKEIATLINLSVQQRSPPLIEQLIAIKNGLLFQEEVSKKTLN
ALPPILQPLFLVANLTRDEHKEIIWLCISIHTYLLLSHHKKAKRHLTNIINRFKLPVFFKSNNNRWIWEILPKLDDIEGL
SDTVDFLHRFFIAQLRKIAYEQEVRNELLTRTVESDATIKLRSKKINQLDAIVKCFEQAYYPHKKITRQGKNEDAEEKYL
NTFKSEITEQLASFVDGSTWIENSYWNLSRYDIENDAPHLYYQHPAIPNFDYELYSPNSTKPRNIEEYIDTLERPLIVSL
DLPDKKIRYMQPLHRIEKNVHHSYISQRELELNSNVRTLSVAGLKQVFGRLAIDSHRYDYKHNKASLILLLSMMTAVPVE
FLMTTGFISGSGLFTVLEDTAYLQYQLQITDRKQEYDASIHENQESIIRLPMPMGLIKLLSNERNLSSKEDILDYIRAIK
EEINLPYLSIVRIETALHIILHRYIQGSNQHIADLICRIPASLAPSTYYSSHSNDFLVNRYRQAIELLNYDNQLDDSFIS
QPSTRTDFTTGSGFALTLEYVNIFLQNLWVWVGNSGDKEERFNRYSALVWIQFCLLTGTRPNNGLTNVKDIDLETGWYEV
ADKPNKVVKNHRLIPLCPTLLAILKKYQLFLVDYQPYATAKVDKMIHQIKQEQDELTLLNILSDNYDKLIKIKRSHISKL
LADYMPFEDSYWTRHFLRTQLEKLGVSMILINTVIGHEKNRQEALGQFSSVNKQQIWQVRDTFEEIAQQMNLRM

Sequences:

>Translated_794_residues
MPDDGNQIVLLTDSQLIEQVDFLSVEDEYNYTENWIASLKEIATLINLSVQQRSPPLIEQLIAIKNGLLFQEEVSKKTLN
ALPPILQPLFLVANLTRDEHKEIIWLCISIHTYLLLSHHKKAKRHLTNIINRFKLPVFFKSNNNRWIWEILPKLDDIEGL
SDTVDFLHRFFIAQLRKIAYEQEVRNELLTRTVESDATIKLRSKKINQLDAIVKCFEQAYYPHKKITRQGKNEDAEEKYL
NTFKSEITEQLASFVDGSTWIENSYWNLSRYDIENDAPHLYYQHPAIPNFDYELYSPNSTKPRNIEEYIDTLERPLIVSL
DLPDKKIRYMQPLHRIEKNVHHSYISQRELELNSNVRTLSVAGLKQVFGRLAIDSHRYDYKHNKASLILLLSMMTAVPVE
FLMTTGFISGSGLFTVLEDTAYLQYQLQITDRKQEYDASIHENQESIIRLPMPMGLIKLLSNERNLSSKEDILDYIRAIK
EEINLPYLSIVRIETALHIILHRYIQGSNQHIADLICRIPASLAPSTYYSSHSNDFLVNRYRQAIELLNYDNQLDDSFIS
QPSTRTDFTTGSGFALTLEYVNIFLQNLWVWVGNSGDKEERFNRYSALVWIQFCLLTGTRPNNGLTNVKDIDLETGWYEV
ADKPNKVVKNHRLIPLCPTLLAILKKYQLFLVDYQPYATAKVDKMIHQIKQEQDELTLLNILSDNYDKLIKIKRSHISKL
LADYMPFEDSYWTRHFLRTQLEKLGVSMILINTVIGHEKNRQEALGQFSSVNKQQIWQVRDTFEEIAQQMNLRM
>Mature_793_residues
PDDGNQIVLLTDSQLIEQVDFLSVEDEYNYTENWIASLKEIATLINLSVQQRSPPLIEQLIAIKNGLLFQEEVSKKTLNA
LPPILQPLFLVANLTRDEHKEIIWLCISIHTYLLLSHHKKAKRHLTNIINRFKLPVFFKSNNNRWIWEILPKLDDIEGLS
DTVDFLHRFFIAQLRKIAYEQEVRNELLTRTVESDATIKLRSKKINQLDAIVKCFEQAYYPHKKITRQGKNEDAEEKYLN
TFKSEITEQLASFVDGSTWIENSYWNLSRYDIENDAPHLYYQHPAIPNFDYELYSPNSTKPRNIEEYIDTLERPLIVSLD
LPDKKIRYMQPLHRIEKNVHHSYISQRELELNSNVRTLSVAGLKQVFGRLAIDSHRYDYKHNKASLILLLSMMTAVPVEF
LMTTGFISGSGLFTVLEDTAYLQYQLQITDRKQEYDASIHENQESIIRLPMPMGLIKLLSNERNLSSKEDILDYIRAIKE
EINLPYLSIVRIETALHIILHRYIQGSNQHIADLICRIPASLAPSTYYSSHSNDFLVNRYRQAIELLNYDNQLDDSFISQ
PSTRTDFTTGSGFALTLEYVNIFLQNLWVWVGNSGDKEERFNRYSALVWIQFCLLTGTRPNNGLTNVKDIDLETGWYEVA
DKPNKVVKNHRLIPLCPTLLAILKKYQLFLVDYQPYATAKVDKMIHQIKQEQDELTLLNILSDNYDKLIKIKRSHISKLL
ADYMPFEDSYWTRHFLRTQLEKLGVSMILINTVIGHEKNRQEALGQFSSVNKQQIWQVRDTFEEIAQQMNLRM

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 92785; Mature: 92654

Theoretical pI: Translated: 6.59; Mature: 6.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPDDGNQIVLLTDSQLIEQVDFLSVEDEYNYTENWIASLKEIATLINLSVQQRSPPLIEQ
CCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
LIAIKNGLLFQEEVSKKTLNALPPILQPLFLVANLTRDEHKEIIWLCISIHTYLLLSHHK
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KAKRHLTNIINRFKLPVFFKSNNNRWIWEILPKLDDIEGLSDTVDFLHRFFIAQLRKIAY
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EQEVRNELLTRTVESDATIKLRSKKINQLDAIVKCFEQAYYPHKKITRQGKNEDAEEKYL
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHH
NTFKSEITEQLASFVDGSTWIENSYWNLSRYDIENDAPHLYYQHPAIPNFDYELYSPNST
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEECCCCC
KPRNIEEYIDTLERPLIVSLDLPDKKIRYMQPLHRIEKNVHHSYISQRELELNSNVRTLS
CCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
VAGLKQVFGRLAIDSHRYDYKHNKASLILLLSMMTAVPVEFLMTTGFISGSGLFTVLEDT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECC
AYLQYQLQITDRKQEYDASIHENQESIIRLPMPMGLIKLLSNERNLSSKEDILDYIRAIK
EEEEEEEEEECCHHHHCCHHHCCCHHEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
EEINLPYLSIVRIETALHIILHRYIQGSNQHIADLICRIPASLAPSTYYSSHSNDFLVNR
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
YRQAIELLNYDNQLDDSFISQPSTRTDFTTGSGFALTLEYVNIFLQNLWVWVGNSGDKEE
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHH
RFNRYSALVWIQFCLLTGTRPNNGLTNVKDIDLETGWYEVADKPNKVVKNHRLIPLCPTL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHH
LAILKKYQLFLVDYQPYATAKVDKMIHQIKQEQDELTLLNILSDNYDKLIKIKRSHISKL
HHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
LADYMPFEDSYWTRHFLRTQLEKLGVSMILINTVIGHEKNRQEALGQFSSVNKQQIWQVR
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
DTFEEIAQQMNLRM
HHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
PDDGNQIVLLTDSQLIEQVDFLSVEDEYNYTENWIASLKEIATLINLSVQQRSPPLIEQ
CCCCCEEEEEECHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
LIAIKNGLLFQEEVSKKTLNALPPILQPLFLVANLTRDEHKEIIWLCISIHTYLLLSHHK
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KAKRHLTNIINRFKLPVFFKSNNNRWIWEILPKLDDIEGLSDTVDFLHRFFIAQLRKIAY
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EQEVRNELLTRTVESDATIKLRSKKINQLDAIVKCFEQAYYPHKKITRQGKNEDAEEKYL
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHH
NTFKSEITEQLASFVDGSTWIENSYWNLSRYDIENDAPHLYYQHPAIPNFDYELYSPNST
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEECCCCC
KPRNIEEYIDTLERPLIVSLDLPDKKIRYMQPLHRIEKNVHHSYISQRELELNSNVRTLS
CCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
VAGLKQVFGRLAIDSHRYDYKHNKASLILLLSMMTAVPVEFLMTTGFISGSGLFTVLEDT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECC
AYLQYQLQITDRKQEYDASIHENQESIIRLPMPMGLIKLLSNERNLSSKEDILDYIRAIK
EEEEEEEEEECCHHHHCCHHHCCCHHEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
EEINLPYLSIVRIETALHIILHRYIQGSNQHIADLICRIPASLAPSTYYSSHSNDFLVNR
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
YRQAIELLNYDNQLDDSFISQPSTRTDFTTGSGFALTLEYVNIFLQNLWVWVGNSGDKEE
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHH
RFNRYSALVWIQFCLLTGTRPNNGLTNVKDIDLETGWYEVADKPNKVVKNHRLIPLCPTL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHH
LAILKKYQLFLVDYQPYATAKVDKMIHQIKQEQDELTLLNILSDNYDKLIKIKRSHISKL
HHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
LADYMPFEDSYWTRHFLRTQLEKLGVSMILINTVIGHEKNRQEALGQFSSVNKQQIWQVR
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
DTFEEIAQQMNLRM
HHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA