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Definition Burkholderia xenovorans LB400 chromosome 1, complete sequence.
Accession NC_007951
Length 4,895,836

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The map label for this gene is 91781899

Identifier: 91781899

GI number: 91781899

Start: 580959

End: 583877

Strand: Reverse

Name: 91781899

Synonym: Bxe_A3946

Alternate gene names: NA

Gene position: 583877-580959 (Counterclockwise)

Preceding gene: 91781902

Following gene: 91781897

Centisome position: 11.93

GC content: 38.99

Gene sequence:

>2919_bases
ATGATAAAAACAATAATAAATAAAAAGTCCTTGTTTGCATTCTCAATATTCATATTGACGATTTTTTGCTCAACAAGTGC
ATTTGCTTTAGACCTAAACAACCTAACTGATTTGTTCACTGTTCCTTCAGGTGATGTATCAGCCAGTATCCTCAAATCCT
TGTTTGGAGCACTTCCCAGCTTGGGTGGTGCTGGTACAGATGCCTTCCAACAGCCAATTGCAACTTTCAATCAGCTAGTG
TTGATAGTAGGAGGCGTGTTAGCAGCTTACGGTATCTTAACTGGAACTGTGATGACTGCACATGAAGGCGAAGTAGCTGG
GCGTTCAATTCATTCTGTTTGGTATCCCATTAGAACAGCCATTGGCTCAGCTTTAATACTTCCAGTATTTAATGGCTACT
GCACTATTCAAGTGTTAGTCATGTGGTGTGTTCTACAAGGTGTAGGTTTAGCCGATGCAGTATGGGCTACTTTTACTAGT
TCTTCTAATTTATCAAACATGGTATCAGTTAGCTACAATGGACCAGACGTTAATAAATTAGCACATGACATAGTAAAAGC
TGAAATGTGCATGGCTGCAATCAATACTTTTTATAATAGCCCTGCTGAACAAGGTGGCAATCCAAACCTATTGCCACAAG
CTGGAATCAACATGGCTGTAACCCCAGTAACTTCAACTGATTCGGCGCCTGCTGATATGTTTAATGGTGCTCCTGCCTCA
TCAATTACATCAACTATTTATAAATTTGGTAACTCAACAGGTGCTGGTGGAATTTCAGTTGATTATTGTGGAACAGTGAC
TGTCACACCAATGACTATAGCGAGTGCTACAGCCAACACAAGTTCAACTTCTCAAAGTTTGGCTTGGAGTATTGGTGCTA
CTGGTCCTTACACTCAACAAAATATAAATAATATTAATCAGGCGCAATCACAAGCCATTCAAACGATGATTAGTGATGCA
CAAAGCTTAGTGTCCACTACTGCCCAAACAATTTATTCAGATTCAAAAAACGGAATTTCTTTAACGGGTTCTGACATTCA
AAGCTTTAATTCATCAATCGATACCATGATTGGCCACTACAATCAAACTGTTCATGCAGCAGCAGCAAATGCGATGAATA
GTGCTGTGTCTTTTAGTGATATCTCTGCTGAAGCACAACAAGATGGTTGGGCACTAGCTGGTGCGTGGTTTATGAAATTT
ATGTATTTACAAGATAGAACCCAACAAGCAATAGCAAACGTTCCTACTTCAAGCGCCATTAATAGTATTCCTTCCGACAT
GATGGGGGATTTAGGTAGTATTTATATGAGTGGATTGAATATCTTAGCGTCTAATTCAAGCGTTTCAGGTGATTATGGCA
TCACTGATGATGCTAACAAGCAATCATTCGTCAAAGATGGAGACATGGGTGCTGCTGTCACTCGTTTAGTTGGAAAAGCG
CTTAATTTTTCAATTAATGATAACGATAATCCTGTCATGACTGTAAAGCGCTTGGGTGACTGGATGATTACAGTAGCTGG
AGCACTAGCCACTGTAAAAATAGCCACTACAGCAGGTGTTGTAGGCAAGGTTTTATCTTTTGTGGGTATCAGCGATCTTA
TTACCATAGTATTAAGCCCAATCATTATGTTTTTGATTTGCTTGGGTTTCATTTCTTCTTACATCATTCCTGTAATGCCA
TTTATTATGTGGTTTGGCATCGTGACTGCTTATATCATTTTATGTGTTGAAGCAGTGATAGCAGCACCTTTATGGTGCGT
GATGTTACTCAATCCACAAGCTAATGGCTTACTAGGCGAGCAAAAGCGTGGGCTTCAGATGGTTCTTAATTTAATGTTAA
GACCAACCGTCATGATTTTTGGCTTAGCCGCATCAATTATTTTAATTCAAGTAATGGGCACATTACTTAATCATATTTTT
AGTTCAGTTTGGGTAATGAGCCAAAGTAGTTCTAATATATTAGTAGCAATTTTGGGTGCTGGTGCTGGCGTACTTGTCTA
TGATGTAATGGCATTTTTATTAATTAAAAAATTATTTGGAGCCATTACACAAATTCCAGATCAATTATTCAATTGGATTG
GTGGAAGTCCAGTGGGTTTAGAATCTGCTTCTAGCAAATTGACTGCTGGCATGATGCAACTTAATACGCACATTGGTTCA
GCAGCTAACCAATTAAGAAACATTGGTGGTGGTGCTATGGCTAGAGCAATACCTAACACAACACAAACTCCACCAAATTT
ATTGTCAAGTTCTACAACTCAACAAAAAACAGAAGGAAGTTCTAATTCTGGCTCAACACTATCAGCGATGGAAAACAGTC
AAAATGATTCAAAAACTGATGAAACATTAGGTGGTATGGCTGAACACTCACCTAATTTAGCAGAAGCTTTTTCTGAGTCT
GGTGTTATGAGTAATATTGGAAATTCTCAAGAACGAAAAGATTCTGCTATTGGCTTTAATTCAATGGTTGACCAAGCGCA
CTCAATGTTAGGTGGCTCACAATCACAAGCTTCTCAAGCATACAGTGAAAATTTAGCTGAAGCAATTAAAGCCAATCCTT
TCATGAATAAAGGCCAAATGGCACATCAGTCAAATTCTGCACTTGTTAGCTCAATGGACCATGCATATGGAAGCGGCGCT
ACAGCTATCACTAGTGCCATTGCTACAAAGCAAGATGGTTCTATTAGTAGAACCCAAGTTGGTAACACTGCTCAAACCTA
CAAATCATTGATGGGCGCCATGAATAATGCTGGTGTAGATTCATCCTCACAGGCTGCAATGCTAGGAACCATGAATAGTA
AAACATTGGAGGCTAGCCAAGTGGATACCAATACTTCAATGTCTCAACATCTACAAAATCATGCAACACAAGTAATTGCA
GGATTAGGAACTTCTAACAGCGATGAAAATGTAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATATTAGGTTCAATTTTATAAAAGTCAAATACTTTTACTATTGACAAAGTACATTATGACAATAAAATAAAAAGACAA
CAATTTAAAAGAGAGACTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACGACAAAATAAAAGGCACTCAGATGAGTGCCTTTTATTTAAATATTTTTAATTTGAACATTTGTTGGCTCAACCCCTTC
AATGACTTGCTTTTTTGCCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Defect In Organelle Trafficking Protein DotA; TraY/DotA-Like Type IV Secretion System Protein; TraY Protein; DotA Protein; TraY Conjugal Transfer Protein; DotA/TraY Family Membrane Protein; Conjugative Transfer Protein; DotA/TraY-Family Integral Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 972; Mature: 972

Protein sequence:

>972_residues
MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPSLGGAGTDAFQQPIATFNQLV
LIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTAIGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTS
SSNLSNMVSVSYNGPDVNKLAHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS
SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQNINNINQAQSQAIQTMISDA
QSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHYNQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKF
MYLQDRTQQAIANVPTSSAINSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA
LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSPIIMFLICLGFISSYIIPVMP
FIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGEQKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIF
SSVWVMSQSSSNILVAILGAGAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS
AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTDETLGGMAEHSPNLAEAFSES
GVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQAYSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGA
TAITSAIATKQDGSISRTQVGNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA
GLGTSNSDENVE

Sequences:

>Translated_972_residues
MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPSLGGAGTDAFQQPIATFNQLV
LIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTAIGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTS
SSNLSNMVSVSYNGPDVNKLAHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS
SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQNINNINQAQSQAIQTMISDA
QSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHYNQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKF
MYLQDRTQQAIANVPTSSAINSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA
LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSPIIMFLICLGFISSYIIPVMP
FIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGEQKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIF
SSVWVMSQSSSNILVAILGAGAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS
AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTDETLGGMAEHSPNLAEAFSES
GVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQAYSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGA
TAITSAIATKQDGSISRTQVGNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA
GLGTSNSDENVE
>Mature_972_residues
MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPSLGGAGTDAFQQPIATFNQLV
LIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTAIGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTS
SSNLSNMVSVSYNGPDVNKLAHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS
SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQNINNINQAQSQAIQTMISDA
QSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHYNQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKF
MYLQDRTQQAIANVPTSSAINSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA
LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSPIIMFLICLGFISSYIIPVMP
FIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGEQKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIF
SSVWVMSQSSSNILVAILGAGAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS
AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTDETLGGMAEHSPNLAEAFSES
GVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQAYSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGA
TAITSAIATKQDGSISRTQVGNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA
GLGTSNSDENVE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101619; Mature: 101619

Theoretical pI: Translated: 4.77; Mature: 4.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
5.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPS
CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
LGGAGTDAFQQPIATFNQLVLIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTSSSNLSNMVSVSYNGPDVNKL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHH
AHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCHH
SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQ
HHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCEEECCEEEECCCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCHH
NINNINQAQSQAIQTMISDAQSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKFMYLQDRTQQAIANVPTSSAI
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
NSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSP
HCEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIMFLICLGFISSYIIPVMPFIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCH
QKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIFSSVWVMSQSSSNILVAILGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECC
GAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTD
HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHH
ETLGGMAEHSPNLAEAFSESGVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQA
HHHCCHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
YSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGATAITSAIATKQDGSISRTQV
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHC
GNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GLGTSNSDENVE
HCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPS
CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
LGGAGTDAFQQPIATFNQLVLIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTSSSNLSNMVSVSYNGPDVNKL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHH
AHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCHH
SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQ
HHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCEEECCEEEECCCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCHH
NINNINQAQSQAIQTMISDAQSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKFMYLQDRTQQAIANVPTSSAI
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
NSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSP
HCEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIMFLICLGFISSYIIPVMPFIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECC
GAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTD
HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHH
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HHHCCHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
YSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGATAITSAIATKQDGSISRTQV
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHC
GNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GLGTSNSDENVE
HCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA