| Definition | Burkholderia xenovorans LB400 chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_007951 |
| Length | 4,895,836 |
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The map label for this gene is 91781899
Identifier: 91781899
GI number: 91781899
Start: 580959
End: 583877
Strand: Reverse
Name: 91781899
Synonym: Bxe_A3946
Alternate gene names: NA
Gene position: 583877-580959 (Counterclockwise)
Preceding gene: 91781902
Following gene: 91781897
Centisome position: 11.93
GC content: 38.99
Gene sequence:
>2919_bases ATGATAAAAACAATAATAAATAAAAAGTCCTTGTTTGCATTCTCAATATTCATATTGACGATTTTTTGCTCAACAAGTGC ATTTGCTTTAGACCTAAACAACCTAACTGATTTGTTCACTGTTCCTTCAGGTGATGTATCAGCCAGTATCCTCAAATCCT TGTTTGGAGCACTTCCCAGCTTGGGTGGTGCTGGTACAGATGCCTTCCAACAGCCAATTGCAACTTTCAATCAGCTAGTG TTGATAGTAGGAGGCGTGTTAGCAGCTTACGGTATCTTAACTGGAACTGTGATGACTGCACATGAAGGCGAAGTAGCTGG GCGTTCAATTCATTCTGTTTGGTATCCCATTAGAACAGCCATTGGCTCAGCTTTAATACTTCCAGTATTTAATGGCTACT GCACTATTCAAGTGTTAGTCATGTGGTGTGTTCTACAAGGTGTAGGTTTAGCCGATGCAGTATGGGCTACTTTTACTAGT TCTTCTAATTTATCAAACATGGTATCAGTTAGCTACAATGGACCAGACGTTAATAAATTAGCACATGACATAGTAAAAGC TGAAATGTGCATGGCTGCAATCAATACTTTTTATAATAGCCCTGCTGAACAAGGTGGCAATCCAAACCTATTGCCACAAG CTGGAATCAACATGGCTGTAACCCCAGTAACTTCAACTGATTCGGCGCCTGCTGATATGTTTAATGGTGCTCCTGCCTCA TCAATTACATCAACTATTTATAAATTTGGTAACTCAACAGGTGCTGGTGGAATTTCAGTTGATTATTGTGGAACAGTGAC TGTCACACCAATGACTATAGCGAGTGCTACAGCCAACACAAGTTCAACTTCTCAAAGTTTGGCTTGGAGTATTGGTGCTA CTGGTCCTTACACTCAACAAAATATAAATAATATTAATCAGGCGCAATCACAAGCCATTCAAACGATGATTAGTGATGCA CAAAGCTTAGTGTCCACTACTGCCCAAACAATTTATTCAGATTCAAAAAACGGAATTTCTTTAACGGGTTCTGACATTCA AAGCTTTAATTCATCAATCGATACCATGATTGGCCACTACAATCAAACTGTTCATGCAGCAGCAGCAAATGCGATGAATA GTGCTGTGTCTTTTAGTGATATCTCTGCTGAAGCACAACAAGATGGTTGGGCACTAGCTGGTGCGTGGTTTATGAAATTT ATGTATTTACAAGATAGAACCCAACAAGCAATAGCAAACGTTCCTACTTCAAGCGCCATTAATAGTATTCCTTCCGACAT GATGGGGGATTTAGGTAGTATTTATATGAGTGGATTGAATATCTTAGCGTCTAATTCAAGCGTTTCAGGTGATTATGGCA TCACTGATGATGCTAACAAGCAATCATTCGTCAAAGATGGAGACATGGGTGCTGCTGTCACTCGTTTAGTTGGAAAAGCG CTTAATTTTTCAATTAATGATAACGATAATCCTGTCATGACTGTAAAGCGCTTGGGTGACTGGATGATTACAGTAGCTGG AGCACTAGCCACTGTAAAAATAGCCACTACAGCAGGTGTTGTAGGCAAGGTTTTATCTTTTGTGGGTATCAGCGATCTTA TTACCATAGTATTAAGCCCAATCATTATGTTTTTGATTTGCTTGGGTTTCATTTCTTCTTACATCATTCCTGTAATGCCA TTTATTATGTGGTTTGGCATCGTGACTGCTTATATCATTTTATGTGTTGAAGCAGTGATAGCAGCACCTTTATGGTGCGT GATGTTACTCAATCCACAAGCTAATGGCTTACTAGGCGAGCAAAAGCGTGGGCTTCAGATGGTTCTTAATTTAATGTTAA GACCAACCGTCATGATTTTTGGCTTAGCCGCATCAATTATTTTAATTCAAGTAATGGGCACATTACTTAATCATATTTTT AGTTCAGTTTGGGTAATGAGCCAAAGTAGTTCTAATATATTAGTAGCAATTTTGGGTGCTGGTGCTGGCGTACTTGTCTA TGATGTAATGGCATTTTTATTAATTAAAAAATTATTTGGAGCCATTACACAAATTCCAGATCAATTATTCAATTGGATTG GTGGAAGTCCAGTGGGTTTAGAATCTGCTTCTAGCAAATTGACTGCTGGCATGATGCAACTTAATACGCACATTGGTTCA GCAGCTAACCAATTAAGAAACATTGGTGGTGGTGCTATGGCTAGAGCAATACCTAACACAACACAAACTCCACCAAATTT ATTGTCAAGTTCTACAACTCAACAAAAAACAGAAGGAAGTTCTAATTCTGGCTCAACACTATCAGCGATGGAAAACAGTC AAAATGATTCAAAAACTGATGAAACATTAGGTGGTATGGCTGAACACTCACCTAATTTAGCAGAAGCTTTTTCTGAGTCT GGTGTTATGAGTAATATTGGAAATTCTCAAGAACGAAAAGATTCTGCTATTGGCTTTAATTCAATGGTTGACCAAGCGCA CTCAATGTTAGGTGGCTCACAATCACAAGCTTCTCAAGCATACAGTGAAAATTTAGCTGAAGCAATTAAAGCCAATCCTT TCATGAATAAAGGCCAAATGGCACATCAGTCAAATTCTGCACTTGTTAGCTCAATGGACCATGCATATGGAAGCGGCGCT ACAGCTATCACTAGTGCCATTGCTACAAAGCAAGATGGTTCTATTAGTAGAACCCAAGTTGGTAACACTGCTCAAACCTA CAAATCATTGATGGGCGCCATGAATAATGCTGGTGTAGATTCATCCTCACAGGCTGCAATGCTAGGAACCATGAATAGTA AAACATTGGAGGCTAGCCAAGTGGATACCAATACTTCAATGTCTCAACATCTACAAAATCATGCAACACAAGTAATTGCA GGATTAGGAACTTCTAACAGCGATGAAAATGTAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATATTAGGTTCAATTTTATAAAAGTCAAATACTTTTACTATTGACAAAGTACATTATGACAATAAAATAAAAAGACAA CAATTTAAAAGAGAGACTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases ACGACAAAATAAAAGGCACTCAGATGAGTGCCTTTTATTTAAATATTTTTAATTTGAACATTTGTTGGCTCAACCCCTTC AATGACTTGCTTTTTTGCCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Defect In Organelle Trafficking Protein DotA; TraY/DotA-Like Type IV Secretion System Protein; TraY Protein; DotA Protein; TraY Conjugal Transfer Protein; DotA/TraY Family Membrane Protein; Conjugative Transfer Protein; DotA/TraY-Family Integral Membrane Protein
Number of amino acids: Translated: 972; Mature: 972
Protein sequence:
>972_residues MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPSLGGAGTDAFQQPIATFNQLV LIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTAIGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTS SSNLSNMVSVSYNGPDVNKLAHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQNINNINQAQSQAIQTMISDA QSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHYNQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKF MYLQDRTQQAIANVPTSSAINSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSPIIMFLICLGFISSYIIPVMP FIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGEQKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIF SSVWVMSQSSSNILVAILGAGAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTDETLGGMAEHSPNLAEAFSES GVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQAYSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGA TAITSAIATKQDGSISRTQVGNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA GLGTSNSDENVE
Sequences:
>Translated_972_residues MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPSLGGAGTDAFQQPIATFNQLV LIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTAIGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTS SSNLSNMVSVSYNGPDVNKLAHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQNINNINQAQSQAIQTMISDA QSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHYNQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKF MYLQDRTQQAIANVPTSSAINSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSPIIMFLICLGFISSYIIPVMP FIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGEQKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIF SSVWVMSQSSSNILVAILGAGAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTDETLGGMAEHSPNLAEAFSES GVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQAYSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGA TAITSAIATKQDGSISRTQVGNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA GLGTSNSDENVE >Mature_972_residues MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPSLGGAGTDAFQQPIATFNQLV LIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTAIGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTS SSNLSNMVSVSYNGPDVNKLAHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQNINNINQAQSQAIQTMISDA QSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHYNQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKF MYLQDRTQQAIANVPTSSAINSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSPIIMFLICLGFISSYIIPVMP FIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGEQKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIF SSVWVMSQSSSNILVAILGAGAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTDETLGGMAEHSPNLAEAFSES GVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQAYSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGA TAITSAIATKQDGSISRTQVGNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA GLGTSNSDENVE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101619; Mature: 101619
Theoretical pI: Translated: 4.77; Mature: 4.77
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 4.7 %Met (Translated Protein) 5.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 4.7 %Met (Mature Protein) 5.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPS CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCC LGGAGTDAFQQPIATFNQLVLIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTA CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH IGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTSSSNLSNMVSVSYNGPDVNKL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHH AHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCHH SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQ HHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCEEECCEEEECCCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCHH NINNINQAQSQAIQTMISDAQSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH NQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKFMYLQDRTQQAIANVPTSSAI CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH NSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSP HCEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIMFLICLGFISSYIIPVMPFIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCH QKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIFSSVWVMSQSSSNILVAILGA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECC GAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTD HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHH ETLGGMAEHSPNLAEAFSESGVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQA HHHCCHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH YSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGATAITSAIATKQDGSISRTQV HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHC GNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH GLGTSNSDENVE HCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MIKTIINKKSLFAFSIFILTIFCSTSAFALDLNNLTDLFTVPSGDVSASILKSLFGALPS CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCC LGGAGTDAFQQPIATFNQLVLIVGGVLAAYGILTGTVMTAHEGEVAGRSIHSVWYPIRTA CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH IGSALILPVFNGYCTIQVLVMWCVLQGVGLADAVWATFTSSSNLSNMVSVSYNGPDVNKL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHH AHDIVKAEMCMAAINTFYNSPAEQGGNPNLLPQAGINMAVTPVTSTDSAPADMFNGAPAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCHH SITSTIYKFGNSTGAGGISVDYCGTVTVTPMTIASATANTSSTSQSLAWSIGATGPYTQQ HHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCEEECCEEEECCCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCHH NINNINQAQSQAIQTMISDAQSLVSTTAQTIYSDSKNGISLTGSDIQSFNSSIDTMIGHY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH NQTVHAAAANAMNSAVSFSDISAEAQQDGWALAGAWFMKFMYLQDRTQQAIANVPTSSAI CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH NSIPSDMMGDLGSIYMSGLNILASNSSVSGDYGITDDANKQSFVKDGDMGAAVTRLVGKA HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LNFSINDNDNPVMTVKRLGDWMITVAGALATVKIATTAGVVGKVLSFVGISDLITIVLSP HCEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIMFLICLGFISSYIIPVMPFIMWFGIVTAYIILCVEAVIAAPLWCVMLLNPQANGLLGE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCH QKRGLQMVLNLMLRPTVMIFGLAASIILIQVMGTLLNHIFSSVWVMSQSSSNILVAILGA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECC GAGVLVYDVMAFLLIKKLFGAITQIPDQLFNWIGGSPVGLESASSKLTAGMMQLNTHIGS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AANQLRNIGGGAMARAIPNTTQTPPNLLSSSTTQQKTEGSSNSGSTLSAMENSQNDSKTD HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHH ETLGGMAEHSPNLAEAFSESGVMSNIGNSQERKDSAIGFNSMVDQAHSMLGGSQSQASQA HHHCCHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH YSENLAEAIKANPFMNKGQMAHQSNSALVSSMDHAYGSGATAITSAIATKQDGSISRTQV HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHC GNTAQTYKSLMGAMNNAGVDSSSQAAMLGTMNSKTLEASQVDTNTSMSQHLQNHATQVIA CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH GLGTSNSDENVE HCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA