| Definition | Saccharophagus degradans 2-40 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007912 |
| Length | 5,057,531 |
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Identifier: 90022889
GI number:
Start: 4139754
End: 4147295
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: Sde_3249
Alternate gene names: NA
Gene position: NA
Preceding gene: 90022890
Following gene: 90022888
Centisome position: NA
GC content: NA
Gene sequence:
>7542_bases ATGTTTAATCGGATAATTTATGTCGTGTTCTTCTGCTTGATAGCATTTTCAGGCGCTACTCAGGCGATCGAATTTAATAC AAGTAAATACGATATTTACATGGGCGATATAAATTATGATGGCAAAAATGATTATTACTTTCATGCTAAACCGCAATTTG TACTAATTTATTCAGATATATCTATTCCACTTATTATTCCGCCTCAAAGTAGCTATAAATTAGCTACAACTAGCGAAAAT GTGACTGTTTACCATACCGGAGGTGGAACGTCTACAGAGCTTCAGTGGGGCTTCTCTACCACCTTTGAGGAGGTGTCTCC AGCTTTAACTGAAGAGCAAATTGTAAACTTTGGTTTGGTACTGCTTAAAGCCGGTGACGGATATTTTGTTGCGGATTTCA ATGGGGATAGCAAATCAGACCTGCTTTTACCTGGAGTAAGTGATTCAGGAGCATTACTGTATGACGGCGCAGACCCGACA TCGCCGATGGTAGCCTACCCAACTGATTTATCTCGTTTAATTAAAAATGGTGGAGCAGATATCTCGCTCAAAGATGTTAA TGGGGATGGTTATCTCGATATCATTGTGCCTAACGAAAACCCAGAATTTGCTGCAATAAGTATATTGGGTGGGGGGGCGT ATACGAATATCGATTTTGTTCAAGATCCTCTTCCTGCTTATCCTTCATCCTTCTCTGGCTCTACGGGCGGTGAATTTCGT GTCTCAGAAACGGGGGCTGCGACTTATAACCTTCCCATTGCCTTGCCAAGCGGGGTCGCAGGTGTGCAGCCGAGTGTTTC ACTTTCTTATTCTTCTCAAGGGGGTAACGGGATAGTAGGTTTGGGGTGGTCCTTGTCTGCTGGTTCCGGAATATCTCGGT GTGCAAGTACGTTATATCAAGATGGGATTGCTAAGCCAATTAAGCTCAATGAGGAGGATCGACTGTGCCTAGATGGCCAG 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Downstream 100 bases:
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Product: Rhs family protein-like protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: NA
Protein sequence:
>2513_residues MFNRIIYVVFFCLIAFSGATQAIEFNTSKYDIYMGDINYDGKNDYYFHAKPQFVLIYSDISIPLIIPPQSSYKLATTSEN VTVYHTGGGTSTELQWGFSTTFEEVSPALTEEQIVNFGLVLLKAGDGYFVADFNGDSKSDLLLPGVSDSGALLYDGADPT SPMVAYPTDLSRLIKNGGADISLKDVNGDGYLDIIVPNENPEFAAISILGGGAYTNIDFVQDPLPAYPSSFSGSTGGEFR VSETGAATYNLPIALPSGVAGVQPSVSLSYSSQGGNGIVGLGWSLSAGSGISRCASTLYQDGIAKPIKLNEEDRLCLDGQ RLVLVDGEYGAANSTYKTEIDNYAIEIKAVGDAIGNPNYFTVIAKDGSLKRYGYTDDSKVKVSDKIVSWSLSDVQDNIGN AINYNYSSDFNNHRLTSISYAGGEAEVIFNYSDNRPDPIVSHLLGQKITTTKRLKGITVKNSGDVLRNYYLSYLKVKTDN TLSRMQRVQECAGSEANCLPALEFDWKTKSNWFSEGDFLEKEIARASNNLLMDQKQADINGDGCVDLVYGWLDLDNQFGD ENAEPSFRTVVMRSQPSGAGCSMFRKTDVITSKRYEEGDTGYSIGVLDYNADGRQDVAIRYNENSGWKLYLSVPQEDGGW VVSDRYESAGLPSTISGTFIDVNADGLVDLVGTSSIAIRGKSTTRSDTDNNIYTNKSSIAVGVKPIAYGDFNGDGQVDVV RYYNSQYPREPDDPRDTTNSAQRFSTTIAVSVKTESGYGSFHSWSDLKDCRNSFCLNEEPNIKKHVYTGDFNGDGLADII YTYSNSYKLYLNNGSGFDLGSEVPIQPSFLPKRVSLKPNSNGTVGKNTTELGVAPERFQVVDFNQDGYSDIFWQASTGLF VAYWQPSTETFTSPIKLPITTSNYDLYMAVDANSDGGVDIIKSKNAYNTEADAVRSIGVIFNANSGVKNLIVGVDNNFGS VTSINYESMNKSRHYDRLKVKSQLVNEHTHPCYSDDGTAMTTCTSREVSFSEFFRLLNNPFDLEHTDPEYLKPVYDMYSA MPIVTSVESSSPVASNPDATSQVDYLYSEAKLQGGGRGFLGFKTLSTIDKQTGVYTTTVYNQQFPFIGRPLQTTVYAPDG EMLSFSENNYEDKSVNENYFRPQLVSSVEKVYPSSTDIAEEESGVGDGLSVDTSLPLTVVTTDTQYDDFGNVTRTEVITE GNYPDIVNAGQIKTVTQSKVTINTYGNGEGITLHGESLSYAQLGRLAASQYTGVRDGITTEREVSFTYYTNGLLDEEQII SSDQSIARVTKHHYDAFGNKTIVEVTGWDGESIVTRKSESVYDANGRYLVSSKDHNGKIISEILSRDAFGRPTSIQSVSG AVSTIGYDLLGREVSKEDNTAQNRVTTEYLSCNQVSPACPAHAQYAMRVSQQHGATSITYFDRVGRPMRKAALDFENRWV FTDTQYDNLGRVIAVSAPYFSTSYAQYWTTTRYDILGRSRSITAPADNDDGFVTSSIAYNGASTITSNPAGQTKRETKNS FGELIQVEDNTHDTNNSYAFIRYVYNSEGKLTDTNVHTGEAANDVINTHIDYDDAGRKKAMQDVDKGNWTYTYNAFGELV SQTDGKNQKVVNRYDLLGRIASRTDYRDANATDVELHTTYYYDGKTDTNSAVLDNAYGQATAVILSTNASHTTCASATAK TCEYAEFDFYGRPFKNTKHIDTDDNNTTPLEVFTTSQTYDVAGRVDTTYDAMHNLITDGGVPVASGVKNNYTTTGFLEST TDLTTNQTLYQTVNTNARGQVIKATLGQGNTYTRVLNFSPATGRLQKQVAYYGHWFPSYGEEPSNNTTQHISYKWDDLGN LLSRQNQSAISNSQNRNLQESFCYDSLNRLVKTNIGTTSASNCAGLATEQQDVRYNSIGNITYKEGVGSYTYHTDRRHAV KTAGGATYYYDNNGNNTSGDGRSLTYSTFDKPLTISKGNHTSTFAYGADRGRYLQIDSNTADASKNKTTVYLGNIERIKQ GDTFEWRRTVAGGQQTVTTDTANAKLDDLVHRFIFNDHLGSLDVIALADGTVEQSLSFNPWGERRKESAGLPVLTVTELF NYNDSITSKGYTGHEMLDEVGLIHMNGRIYDAKLARFLQADPFVQAATDTGSYNRYSYIMNNPLNGVDPTGFNWISDEWS NAWNDAKPYVGTIVSLVLTAWQPWGAKFWSMASYGAIGGAAGAGATGGDVLKGAITAGVSAAAFYAVGKVFSDLGAAHLE DPFYSPYDANLVKFGGNTLTRGQVAAQITAHASVGGVLAKLQGGEFGHGFISAGITKGVTGASPGGTFIQRLALSSAVGG TVSKFTGGKFANGAKTAAFQFLFNEFTTAQIKKMSDQAQRRIARKESAYCKGLCHGYDGSYDIEHNFSSGAHVSAATINM LTSEGGGIYGFNGQKFLENGEVVGKYYTFTGSGDGIEYGAGMELVFALGTGAWSGDFNAAAFGVGYFSFSLFWSPWEGMK SSGGEGWIGITFGPSVGATPISASYQETFYVEQ
Sequences:
NA
Specific function: NA
COG id: COG3209
COG function: function code M; Rhs family protein
Gene ontology:
Cell location: NA
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General reaction: NA
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Structure determination priority: NA
TargetDB status: NA
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