| Definition | Saccharophagus degradans 2-40 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007912 |
| Length | 5,057,531 |
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Identifier: 90022662
GI number:
Start: 3846071
End: 3854359
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: Sde_3020
Alternate gene names: NA
Gene position: NA
Preceding gene: 90022663
Following gene: 90022661
Centisome position: NA
GC content: NA
Gene sequence:
>8289_bases ATGATTGCATTCACTAAAAAGCAATTGGGCGCTTTTGTGCGCATTACTGTTTTAACTGCGCTTTGCGCTATTTGTACTCC TGTGTTTGCAGGGTATTTAAGTAGTGATGAGACCCATAGCTATGACGGAAGCTTTAACCTAGTGATTGATCCGGCTGCTT GGGTAGAAAATGAAGATACCGATGAAAAGAAAACGCTTAGCCTCTACGAGGCCAGGGCCGATTTGGTTGCAAATGATCCA GTCTTCAGCGAAGAGATACTAATTGTTCCTGAATTATCAAAAGGCACGCTTAATTACTCAATATTTAAAAGTGAGAACGG AACATACAAGTACATTTTAAAAGTCTGCTCAGATTATATGGAGACAACCAGTGGTGGGCTCTCATATCCCAGAACGATTT GTTCCGCAACCGATTCAAATGCTCAAAACGATTTTCAATCCACTGTCGTAAAGGTAGATATTCCGCTAGATGATAGCCCA GACGAAAGATTAGACCTCTCAGACTACGATATTTATTACGGAGATTTTAATGGCGATGGGGTAAGCGGAGACATTTACTT TTACGGTAGGGATGTATTTGTTCTTATTGCAGGTGATATATCAATTCCGCTCAATATCCAAGGTCCCCCAAGTTTTGTTC TAAATCGTTTGCCATCTAACTTTGGTTACTCCCAGCCGGAACTTCTAGATTTAGATGAAGGGTATTTGGGTAGTTTTACT CGGGCAACATTGAACGCAGATTACTTCTCTGGCGATATGAATGGAGATCGAGAGGAAGACTACTTTATCCGTGGTTATCA AGCAGGTGAGCCTGCGTTAACTGCACTGCAGACAGAAATCGGGTTCCCTCAGTTTATTGTAGCTAACATCGATACAGAAA CACGCTTCGATCCTTCTGATAGAAGAAACACAATTGCGTTACAGGACTACAACCTTGATGGCCGCATGGATTTGGTGTTG 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Upstream 100 bases:
>100_bases GCGCTGGGACGCATGCATATTGCAAAGGAATTCGCACTTCTATTTTCCGCTTGTCTCCGTGATTAACCTCTAAATTCGCT TCTACCCGTAAAGGCCAAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATTTTATATGAAAAGTTTCATTTTAATATTATCGTTTTTTTTTATTGTGGGGTGTCATTACGAAAGTAATGATGGTCG AGAGTTCGAAGCCTATATTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: NA
Protein sequence:
>2762_residues MIAFTKKQLGAFVRITVLTALCAICTPVFAGYLSSDETHSYDGSFNLVIDPAAWVENEDTDEKKTLSLYEARADLVANDP VFSEEILIVPELSKGTLNYSIFKSENGTYKYILKVCSDYMETTSGGLSYPRTICSATDSNAQNDFQSTVVKVDIPLDDSP DERLDLSDYDIYYGDFNGDGVSGDIYFYGRDVFVLIAGDISIPLNIQGPPSFVLNRLPSNFGYSQPELLDLDEGYLGSFT RATLNADYFSGDMNGDREEDYFIRGYQAGEPALTALQTEIGFPQFIVANIDTETRFDPSDRRNTIALQDYNLDGRMDLVL LSGVGGYVVDVIYSNSGGVVDEGYYTANSIDEMLSVNTRTANAFGTLGGEFKVSETGAATYTISVFTPAGTAGVTPSVSF SYSSQAANGIMGTGWSLNASSAITRCRQTKFIDGVSRPLTFTNEDRFCFDGMRLLKISGVYGESGSKYRTEIDSQVVVTL HGNASSSGSYFTAVKKDGTIQYFGRVPNEFIDSQASQIFPGGKVLTWGLSRSEDSIGNAIKYYYIQENGNNFRVDRIEYA FGSGGAANTVISFGYEGRPDVQKGYLAGIYTERSVRLSSVNVDNNVTSNKNVRNYHIYYNRDTSPVAEKDRSLVTAIQEC VGTSCKEATKFSWGVVDGDLLAQAGGSPDIDLRLGSSISPTTQFQPIDINGDGELDVAWLVLTNNSSDVIGKNYDHELHY AISVFGTLTKQGFVDENGDLDGMVVEFDENERSFVGLQSLDYNADGHADVAIYRSRGAKGWNIHLAKPSKNGNWRLSSNS IHTGILDKEAIFIDVNGDGLTDALTESRVYLMEQNPEEEITSDRYYRFKPNGEELVYSGVERLERRDDMPLVCWSCPYGA SYLTDDQEFRFHGFGDFNGDGRLDLLVGDYIERQERRESNGKILDVSYMREKLQIVVATDSGFESWLDLGVRVSGDYDHE DSDYFPESGISVGDINADGLTDVLYHNNGQVEVYLSRGVGFNSDPDSILALPEDKVIRLLDVNGDGLLDLVSESKSDSTT KFNVYHWDRTADQFVSESKQKVIWKGGANYVFSDVNGDSHTDLITFYDERLSIHYFESSHESFESIKSIDNAGAVTNVTY EPISTSGNYSALNLKTAVEEEEFLSCVVDSWQTGTYRVCNTFDVDEVEDFYRAVNEGLNIETQNKIQTAAPILQYAAPYY VVTQVSSPAPSVQITNDPLSPSGNKGIRSIDQYSRAAVSYFYGEAKMQAGGRGFLGFHRLVTKDEQTGIETATTYRQDFP YIGSPLSTIVYAPDGGVLSEAYNVYSSKKFSAGAGAAKISKTSVGVSAKTSGTQVLGPIVPYLSATYQLTYETQSGPNQN LSVVSLSEGVNALYECTSNTQGDCPQFTAASSLQKIANQTVTLNDVDINNNPTSSVQHLIGEDVHITTTTLNEYGTGRTF NLHGETFSFGDLGRLTKSTVTHDRNGETKTEFVEFDYYTSSDGLGHPGLLKSETSLPYQEGEEALISEILTTTYEYDGLG NVSTKAVSGWNGFSDELEVRETVTRFDSTGRFVESVRDPLGHEFDIVESRNEYGAPKSIKGINGVNTLKYYDVWGRETRE EIVSLGRWTATQYKNCNSSPIACPSSAKTVVLNYDNGAGYSKVKAASFMDIAGREVRTTTLGLNGYVNVDKQYDVLGRLV RVSNPYFADEGPGYWTRTYFDLMGRATLVLEPGGATTRLSYSGNTTTYINALNQHKIEVKNAAGELKSIQDTIGSTLIYE YGVKGELLSTELLSAGQGPNNAGDIEISYGTIEGLCRQPTSDFQVVICYDGLGRKTAMWDPNKGFWQYAYNAFGELIRQT SANNTYVSNQYDLLGRPVSRVDYFADSTIEGNTRWYYDEYDNLGMQKVDNALLKPTAVVYTKGRLYEPGDPTDYLVKTLY DEFGQQVSTTQQIGDGDIYETRTKYDYTNGRVLAQYNALGDFVLRNGEAIESGVRNEYNEDGFLTQIYNIEDNALLYEVT QMDARGQLEQAKLANLVTINKSYNVASGLLNSQSANSGMYAQSITYKWDDVGNLIRRYNTSGALGTESHWRESYCYDRLN RLVKTDLLQNTDYQYGIHHAPDYTCPSSDRTHDVKYDFRGNITYKQDVGTYKYDLLSGGMRAGPNAVTSTIESNGTINYR YDANGNMLGDGARVFDYTTYDMVSKITKGQTEINFSYGPDRKRYYRKDEKKSAGGAVLSTEETWYLGNVEKVKLANGNIK WRRHLMGGTLHTYYTDADGNEITSDGQSSLVSTVDVHYILKDHLGSTDIILDASGTATSLMSFDAWGFRRSADSLENLSL SAAALFNSSITPKGFTGHEMLDSVGVIHMNGRIYYPRLGRFLQADPHVQAPDNTQSLNRYSYVMNNPLNATDPSGYFAVT LAAIVMTAMEVHIAIQIAVVAVMTTLQAYAAGASPGDAIGAGIVSAWSSIAFHAVGNHFNALGRTNEALNDMSITMFGRA NSAFHSFGGNLLRGSQIAKQITAHAVIGGVTADLQGGKFGHGFISAGLTKGVMGSIGPNFGNVFARTSIAALVGGTTSRI SGGKFANGAITAALGHLFNAEGGAGRTAKRAYYRVAMNVGGWFNDYPNARKAFNHYLDGNGAAVVYSGESELWTEFGVLR GIDHNIDVFYYEVENIINSLAPGDSASYAGVYSSHIDGASVSEDWYYTAGTTTLQTQVNLTIDLDSGGIPKVSGSVTHLW WDIYDWDRGKSTVVPTGKRLEDTTFQGLGDTFTQYSVKYEQW
Sequences:
NA
Specific function: NA
COG id: COG3209
COG function: function code M; Rhs family protein
Gene ontology:
Cell location: NA
Metaboloic importance: NA
Operon status: NA
Operon components: NA
Similarity: NA
Homologues:
NA
Paralogues:
NA
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: NA
Theoretical pI: NA
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
NA
Transmembrane regions:
NA
Cys/Met content:
NA
Secondary structure: NA
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: NA
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: NA
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA