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The map label for this gene is nhaD

Identifier: 89898077

GI number: 89898077

Start: 315407

End: 316669

Strand: Direct

Name: nhaD

Synonym: CF0270

Alternate gene names: NA

Gene position: 315407-316669 (Clockwise)

Preceding gene: 89898076

Following gene: 89898078

Centisome position: 27.04

GC content: 39.03

Gene sequence:

>1263_bases
ATGTTGAAATTCCAATTGTGCGCTCTGTTTTTATTTGGATACATCGCGATTGTTTTCGAGCATATTGTGCGAGTGAATAA
ATCTGCTGTAGCGCTTGCTATGGGAGGTTTGATGTGGCTAGTTTGTTTTTCTCATGTTCAACATGCTGATCATATGATTC
TAGCCGAAGAAATTGCTGATATGGCTCAAGTCATTTTTTTCTTGTTCTCAGCAATGGCCATTGTTGAACTTATAGATGCT
CATAAAGGGTTTTCTCTTATAGTACGGTGTTGTCAGATACAGTCTAGGACTTTACTACTTTGGGTGCTTATAGGACTTTC
CTTTTTCTTGTCTGCAGCCCTAGATAACCTAACATCTATTATTATCATCATATCCATTTTGAAGCGTTTGGTTAAATCAA
GAGAAGATCGTCTACTTTTAGGCGCTGTTTGTGTGATTAGTGTAAATGCTGGAGGAGCTTGGACGCCTTTAGGGGATGTT
ACAACGACCATGTTATGGATTAATAATAAAGTAACTTCTTGGGGAATTATTCGTGCTTTATTTATTCCCAGTTTGGTGTG
CGTTTTAATTGCTGGAATCTGTGCTCACTTCATGCTTAAAAAAAGAGCCTCAGGCGCGATTGCTAAGGAACTTGAGATAG
AATGTTCTCCTAAAAAAAGCGGTTTAATCATTTGCATTGGTTTAGGTTCTTTATTAATGGTCCCTGTGTGGAAAGCATGT
TTAGGAGTTCCTCCCTTTATGGGGGCTTTATTAGGTCTTGGACTTGTCTGGTTAGCCAGTGACTGGGTTCATTCTCCTCA
TGGTGAGGATCGCTATCACTTACGTGTTCCTCATATTTTAACAAAGATCGATATATCCTCGATCACCTTCTTTATAGGCA
TTTTACTGGCTGTTAATGCTTTAACTTTTTCTAATGTTCTCTCTGAACTTTCCATGAGTATGGATAGAATATTTTCCAGA
AACGTTGTGGCTATTTTTATTGGTCTTATTTCTAGCGTATTGGATAATGTTCCCCTTGTTGCAGCGACTATGGGCATGTA
TCAAGTCCCTACGGATGATACTTTGTGGAAATTAATTGCTTATGCTGCGGGCACGGGAGGAAGTATTTTAATCATTGGGT
CAGCTGCGGGAGTTGCCTTCATGGGTATCGAAAAGGTTGATTTCTTATGGTATTTTAAAAGGATTTCTTGGATTGCCTTG
GCCAGCTATTTTGGGGGTCTTATTTCATATTTTATGCTCGAACGCATCGCCCTATTTTTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAAGGATGTTTTCCCTAAAGATAGAAGGATTTTTCCTACTTTACCTAACCAGAAAATAGGAGTACACTAGTTCGTAG
AATTATTGTTTGAGGTCATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTGGTTTTTTTGGTTAAAAAAATTTTTTAAAAACTTTGTTTTAATAAAATCTTTGTACCTCTATCATACCACCTCCTTG
TAAACGTTCTCTATTTGGAA

Product: sodium/proton antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 420; Mature: 420

Protein sequence:

>420_residues
MLKFQLCALFLFGYIAIVFEHIVRVNKSAVALAMGGLMWLVCFSHVQHADHMILAEEIADMAQVIFFLFSAMAIVELIDA
HKGFSLIVRCCQIQSRTLLLWVLIGLSFFLSAALDNLTSIIIIISILKRLVKSREDRLLLGAVCVISVNAGGAWTPLGDV
TTTMLWINNKVTSWGIIRALFIPSLVCVLIAGICAHFMLKKRASGAIAKELEIECSPKKSGLIICIGLGSLLMVPVWKAC
LGVPPFMGALLGLGLVWLASDWVHSPHGEDRYHLRVPHILTKIDISSITFFIGILLAVNALTFSNVLSELSMSMDRIFSR
NVVAIFIGLISSVLDNVPLVAATMGMYQVPTDDTLWKLIAYAAGTGGSILIIGSAAGVAFMGIEKVDFLWYFKRISWIAL
ASYFGGLISYFMLERIALFF

Sequences:

>Translated_420_residues
MLKFQLCALFLFGYIAIVFEHIVRVNKSAVALAMGGLMWLVCFSHVQHADHMILAEEIADMAQVIFFLFSAMAIVELIDA
HKGFSLIVRCCQIQSRTLLLWVLIGLSFFLSAALDNLTSIIIIISILKRLVKSREDRLLLGAVCVISVNAGGAWTPLGDV
TTTMLWINNKVTSWGIIRALFIPSLVCVLIAGICAHFMLKKRASGAIAKELEIECSPKKSGLIICIGLGSLLMVPVWKAC
LGVPPFMGALLGLGLVWLASDWVHSPHGEDRYHLRVPHILTKIDISSITFFIGILLAVNALTFSNVLSELSMSMDRIFSR
NVVAIFIGLISSVLDNVPLVAATMGMYQVPTDDTLWKLIAYAAGTGGSILIIGSAAGVAFMGIEKVDFLWYFKRISWIAL
ASYFGGLISYFMLERIALFF
>Mature_420_residues
MLKFQLCALFLFGYIAIVFEHIVRVNKSAVALAMGGLMWLVCFSHVQHADHMILAEEIADMAQVIFFLFSAMAIVELIDA
HKGFSLIVRCCQIQSRTLLLWVLIGLSFFLSAALDNLTSIIIIISILKRLVKSREDRLLLGAVCVISVNAGGAWTPLGDV
TTTMLWINNKVTSWGIIRALFIPSLVCVLIAGICAHFMLKKRASGAIAKELEIECSPKKSGLIICIGLGSLLMVPVWKAC
LGVPPFMGALLGLGLVWLASDWVHSPHGEDRYHLRVPHILTKIDISSITFFIGILLAVNALTFSNVLSELSMSMDRIFSR
NVVAIFIGLISSVLDNVPLVAATMGMYQVPTDDTLWKLIAYAAGTGGSILIIGSAAGVAFMGIEKVDFLWYFKRISWIAL
ASYFGGLISYFMLERIALFF

Specific function: Unknown

COG id: COG1055

COG function: function code P; Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CitM (TC 2.A.11) transporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000802
- InterPro:   IPR004680 [H]

Pfam domain/function: PF03600 CitMHS [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46082; Mature: 46082

Theoretical pI: Translated: 8.27; Mature: 8.27

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
6.2 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
6.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKFQLCALFLFGYIAIVFEHIVRVNKSAVALAMGGLMWLVCFSHVQHADHMILAEEIAD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MAQVIFFLFSAMAIVELIDAHKGFSLIVRCCQIQSRTLLLWVLIGLSFFLSAALDNLTSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIIISILKRLVKSREDRLLLGAVCVISVNAGGAWTPLGDVTTTMLWINNKVTSWGIIRAL
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHH
FIPSLVCVLIAGICAHFMLKKRASGAIAKELEIECSPKKSGLIICIGLGSLLMVPVWKAC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCEEEECCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHH
LGVPPFMGALLGLGLVWLASDWVHSPHGEDRYHLRVPHILTKIDISSITFFIGILLAVNA
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTFSNVLSELSMSMDRIFSRNVVAIFIGLISSVLDNVPLVAATMGMYQVPTDDTLWKLIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHH
YAAGTGGSILIIGSAAGVAFMGIEKVDFLWYFKRISWIALASYFGGLISYFMLERIALFF
HHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MLKFQLCALFLFGYIAIVFEHIVRVNKSAVALAMGGLMWLVCFSHVQHADHMILAEEIAD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MAQVIFFLFSAMAIVELIDAHKGFSLIVRCCQIQSRTLLLWVLIGLSFFLSAALDNLTSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIIISILKRLVKSREDRLLLGAVCVISVNAGGAWTPLGDVTTTMLWINNKVTSWGIIRAL
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHH
FIPSLVCVLIAGICAHFMLKKRASGAIAKELEIECSPKKSGLIICIGLGSLLMVPVWKAC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCEEEECCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHH
LGVPPFMGALLGLGLVWLASDWVHSPHGEDRYHLRVPHILTKIDISSITFFIGILLAVNA
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTFSNVLSELSMSMDRIFSRNVVAIFIGLISSVLDNVPLVAATMGMYQVPTDDTLWKLIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHH
YAAGTGGSILIIGSAAGVAFMGIEKVDFLWYFKRISWIALASYFGGLISYFMLERIALFF
HHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]