| Definition | Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007880 |
| Length | 1,895,994 |
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The map label for this gene is 89255585
Identifier: 89255585
GI number: 89255585
Start: 154695
End: 156569
Strand: Direct
Name: 89255585
Synonym: FTL_0148
Alternate gene names: NA
Gene position: 154695-156569 (Clockwise)
Preceding gene: 89255584
Following gene: 89255586
Centisome position: 8.16
GC content: 32.59
Gene sequence:
>1875_bases ATGGAGCTATTTGTACATTCGTCTAATTATATTTTACTAGCATCTGGCTTAATATTGTTTTTTGCTATTGTTTCACAGTT TTTATCTTGGAGATTAAAGCTACCATCGATACTTTTTTTAATTTTAAGTGGAATTATCCTCGGACCTCTATCAGAAGCAA TATTCCAAACTGGCTTCAAGCTGGTTGATGGTAATGTTATATTTGGTGAGGCGTTGTCACCTTTTGTTTCAATCTGTGTG GCAATAATTCTTTTTGAGGGCAGCTTATCGCTAAATTTTAGTAAGATAAAAAGTGTAAGTAGTGTTGTTATACTTCTGAT TACTGTAGGTTTAGCAATTACTGTTGTACTTACAGCCTTGTTCTGTTATTACGTTGTTGGTTTGAATCTAGAACTATCTA TGCTTATCGGTGGTATTACCTGTGTGAGTGGGCCAACCGTTGTACCACCTTTTATGAGGACTGTTAGACCAAAAAAACAT ATTGCAAATATCCTAAAATGGGAGTCTATACTCGTAGATCCAATAGGAGCGTTAGTTGTAGTCTTTATGCTAGCATGGTT TGTTATTGGTGGCAATTTTGCTAATCAACCTAATGCAGTAAGTACATTTATAGCATATATGGTGTTTGTATGTATTTTAG GAATAACCTCAGGATTTATTTTTGGTTATTTAATTGGCTTAAGCTTTAGAAAACATTATATTCCAGAGTATCTAAAGAGT TTTTTCGTACTTGCGGTAATTGTGTTAGGTTTTATTATTTCTGATGCAATTATGCATGGTGCGGGACTATTAATGGTAAC AGTAGCAGGTCTGGTAATGGCAAATATGAAAGATATCAAAATGTCTGATATTGTTTCATTTAAAGAGAATCTAAGCATTG TGATTATCTCAGTTCTTTTTATTGTCTTAGGAGCTGAAATTGACTTTAGTTTATTTAAAGATTATTGGTTAGATTTGATT GAGGTTTTTTTATTTTTACAGTTTATATTACGACCAATAGTTGTTTTCTTGTGTTGCCTAGGATCTAAAACAACTTTTGC AGAAAGAGTTGTTTTGGGGATTATTTATCCTCGTGGGATTGTGGCAGCATCAGTAGCAGCATTAGTAGCGGTTAAGATTA TTAAATCACATCCTGAGCTATACAGTGAGGCAAATACTTTAGTATTCTTTGTCTTTATGATAATTGTTTTTACTGTTGTT TTTCAAAGTATCGTTACACCATATATTTCAAAAGCGCTTGGAGTTACTGAACCAGAGGGTAAAGGATTTTTGATAATTGG GGGTAATAGATTTGCACGTGAGTTAGCAGAAATTTTTGTCAAAAATGATATTGAAGTTGTAATTACAGACTCTTCTTGGG GTAATGTGCAAAAATGTCGACAGTTGGGTTTAAATACTTATTATGGTAGTCCTGTTTCAATTCATGCTGATTGGAGTATT AATTTAGTCGGCATCGGTGCGATGCTGGGATTATCAACAAGTGAGTATGTAAATGCAGTATCAGCGATGAAATATAAATA TGAATTTGGCTCAAATAATGTCTATGTACTACGTACAGCACAAAAAGAGAGTTACAAAGGTATTGGTGCTATAGAAACAA ATCTTGCTAATTTATTATTTGATGAGGGAGTTGATTTTAATATCTTGATAGAGATGCTTAATCAAGGAGCTACAATTAGA AGTACAAATATTACCCCTAACTATACTTTAGAGAAGTTTTTTAGTGATAATCCCAACGCTATTGGATTATTTATCATTGA TGATAATGGTTATGCACAACCTTTTAGTAAGAATAAAAAGATTAAATTTGAGAGTTATAATTTGATATCATTAAGGGATG ATAAAAGTAAGGATCAGCTATGTCTAGATGTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTTATCCTTGTAAGATTGATAAACAAATTAATATCATATAATATTTAGAATTCTTATGATGATATTTTTATATTCAGGG TATTTATTTTGAGTAATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GAAGCTTTAATGGTAAATATCCTAAAGTAGCTGATTCAGCTTATGTTGATGAGTCAGCAGCAGTAATTGGTGATGTTATC TTAAAAGAAGATTCATCTAT
Product: Sodium/hydrogen exchanger (antiporter) family protein
Products: NA
Alternate protein names: MjNhaP1 [H]
Number of amino acids: Translated: 624; Mature: 624
Protein sequence:
>624_residues MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFKLVDGNVIFGEALSPFVSICV AIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTALFCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKH IANILKWESILVDPIGALVVVFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLFIVLGAEIDFSLFKDYWLDLI EVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGIVAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVV FQSIVTPYISKALGVTEPEGKGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLFDEGVDFNILIEMLNQGATIR STNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKKIKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV
Sequences:
>Translated_624_residues MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFKLVDGNVIFGEALSPFVSICV AIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTALFCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKH IANILKWESILVDPIGALVVVFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLFIVLGAEIDFSLFKDYWLDLI EVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGIVAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVV FQSIVTPYISKALGVTEPEGKGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLFDEGVDFNILIEMLNQGATIR STNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKKIKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV >Mature_624_residues MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFKLVDGNVIFGEALSPFVSICV AIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTALFCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKH IANILKWESILVDPIGALVVVFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLFIVLGAEIDFSLFKDYWLDLI EVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGIVAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVV FQSIVTPYISKALGVTEPEGKGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLFDEGVDFNILIEMLNQGATIR STNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKKIKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV
Specific function: This is a Na(+)/H(+) antiporter. Can also transport lithium [H]
COG id: COG0025
COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR006153 [H]
Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 68773; Mature: 68773
Theoretical pI: Translated: 6.77; Mature: 6.77
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFK CEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE LVDGNVIFGEALSPFVSICVAIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTAL EECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKHIANILKWESILVDPIGALVV HHHHHHHCCEEEHHHHCCEEECCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH IVLGAEIDFSLFKDYWLDLIEVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGI HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH VAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVVFQSIVTPYISKALGVTEPEG HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI CEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCEE NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLF EEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH DEGVDFNILIEMLNQGATIRSTNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKK HCCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCC IKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV EEEECEEEEEECCCCCCCCEEECC >Mature Secondary Structure MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFK CEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE LVDGNVIFGEALSPFVSICVAIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTAL EECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKHIANILKWESILVDPIGALVV HHHHHHHCCEEEHHHHCCEEECCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH IVLGAEIDFSLFKDYWLDLIEVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGI HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH VAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVVFQSIVTPYISKALGVTEPEG HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI CEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCEE NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLF EEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH DEGVDFNILIEMLNQGATIRSTNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKK HCCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCC IKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV EEEECEEEEEECCCCCCCCEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]