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Definition Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome.
Accession NC_007799
Length 1,176,248

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The map label for this gene is 88657793

Identifier: 88657793

GI number: 88657793

Start: 832802

End: 835546

Strand: Reverse

Name: 88657793

Synonym: ECH_0820

Alternate gene names: NA

Gene position: 835546-832802 (Counterclockwise)

Preceding gene: 88658114

Following gene: 88658247

Centisome position: 71.03

GC content: 27.98

Gene sequence:

>2745_bases
ATGGGAAAAATTTTTTCAGTTTATTGTCCAGAATCATTTTTAGCTGTAGTTGCAAAATTTGCATTTGATATCTTTAATGA
TAATTCTGGAAATTCTTCTAGTGTAATAATTATAGTACCAAATCAAGAAGATGTTAAGTTGCTATATGGTCAATTGAAAC
TTTATTTTCATGCTACTGTTCTCGCTCAAGTGAAAGTTATGTCACTATCAGATATAGACCAAGATCTACTAGCTAATGAA
CACAGTTTTGTCAGAATTATGACTCCAATAAGGAAGCTTTTGTTGTTAATGGAGTTTATAAAGTTGTGGAATTCTGAAAA
TGGTGATAATTATCCACTGTCTTTAGGTTATGAATTATCTTCATTGTTGAATGAAATGCATGTACATTGTATACCAATAT
CTAATTTAGAATGTTTGTTTGATTATGATTTACCAGCACATTGTCAAAAGGCAGCTAGATTCCTTTCTGAATTATCTAAA
AAGTGGAAAGAAGTTTTAAATAAAGATGAAGTATTAGATATATTAGAGCATAGAAGTTTATATATAGGCAACTTAATTAA
GTATTTACAAGATGAAGTATTAAATTGTACTGTGATTTTTGCTGGTATGGTGTTTGACAATTTTTTTGTTAACTTTATTC
AGGAATTGTATAAATTACCTAATAGTAGAATAATATTTCCATATGTAGATATAAGTATTGATGAAAAGGATTGGCAGCTA
TTAGAAGAATGTCATTATCAGTATTATGTGAAGAGTTTATTAGATATTTTGAAGGTTAATAGAAATGATATTGTTTTTCT
AGGAGAGCCAAATCATTCTGTATTTGTAAGCAGTGTGTTTAATTTTAATTTATTTTTAGAGAAATATCATCAACATGAGA
TTCAGAACTATAGTGATTATAGTCGTGTTAAATTAATTACTTGTATTTCAGATGAAGAGGAAGCTCAAGTTGTATCTATG
CTTATAAAAGAAAATGTCAACAGCAGCCCTATTGTGTTTACAAATAATTTGTTGTTGACTAAAAGAATAAATTCTATTGT
AAATGCAGAAAGATTGTTAGATAAACCTAATGTTGGTTATCTGATATTATCCTTTATATTACATACATTAGAAGTTGTAA
TGAGTAAATGGAATCCTATCCCGTTATTATCATTACTTAAACATCCTTTTGTGACTTTGGGATATGTTAAAGAAGATTAT
GATGCTTTAATATCAAGTTTTGAACTAAAAGTTATCAGATCTTATTCTGGTTATGATTTTTTTAGCATGGAAAATAATGT
AAAGGAGAAGGTGCCAGATTTGCTACCTTTTTGGGAAAAAATAACAAGTGTTATACTTCCTTTAGTTAAAGTAAAACATG
ATGTTATATCTTCTATAGTGAAAGCTCATATTGTATGTATACAGAATTTATTAGAAGGTAATCTTGTAATTGATTCTAAT
GGTTATAGTAAAATTCAAGAATTTTTTGACGACTTACAAAACTCATGTAACGGAATAAAAGTATATGGCATGGATGTATA
TTATGAAATTTTAACATCAGTTTTGTATAGTAGCTTTTCTTTAGAAAATTATAAATTATCCACTGTTAACTTGTTTAAGA
GAGGAATAGTAATCTTTGCTGGGTTTAATGAAATAAATTATGGTGTTAATTCATGTGGAACATTGTTAAACAGGTGGATA
CGTACAAAATTAGGATTGCCTTCCATTCAAAGAGAAAAGGGTTATTTTGCATATTTGTTACATAGTTTTTTTTATGCAGA
TAAGATTTATATTACACAATCTTTAAAAAGTTTTGGGAAAATAAATGAAGAATCTATTTGGATTAGGCGATTAGGAATTT
TAGCAAAACTTTATGATATAGAAAATTTGAAATGTGAAATTTATTCAAAAATCAGTGATAGATTTTCATGTGATGATACT
AAGAGTTTGGCATACTTAAGGCCTCAACCTAATCCAGATATTAATAACAGGGTTATTGCATTCAATGTTTTGTCTACAAC
TTCTTTAGAGACTTTGGTAAAGAATCCTTATGTCTTTTATCTAAGTAACATTTTAAATATTTTACCATGTAAGAGTATTA
ATGAAAAATTTTCTATGCGGGATTTTGGGATTGTTGTTCATAATGTTCTACATAAATATTTATTATGCAATAATAATCAA
CATAGATATGAAGATTTGGTAGAAATTGCTGCGTCAGAATTGTTGGATAAATATAAAGATTTTCCACAAGTTGAAACTAT
TTTATGGCCTAAGTTCCAAAAGATAGCTGAGCAATTTTTTGAAATTAATTTAGAAAGAGCTCATTATGTTGATGAAATTA
TTACAGAACGTTTTTTTTCTTGGGAGATCAATAGTAATATCGAAGTAATATCTAGGTGTGATAGGGTAGAATGTTTAAAA
GATGGTAGTGTGATAATCATTGATTATAAGACAGGTGCAATTCCTTCACAATCAGATATTAATTATGGAGTTGCATTGCA
AATGATAATACAGGCGTTAACAGTAAAGCAGAGCTTAAAAAAGGAGATCTCAGGGTTAATGTATTGGAAGATAAGTTCAG
AAGACATGAGAATAGTCCCTATAGATAATTATACTGAGTTAATCAAAAAATTGGAAGTTGCTTTAAAACAGTTAATATTA
GATTATGTGGAGTTTATGAAGCCATTTACTGCATCTTGTGATATGTCTAAATACGCTGATTATGATCTTATAACACGTGT
AAAGGAGTGGGGATATTTTATATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTCAGAAAAGCTGTAACTATAAATGTTGTAAAAACTAACCTAATTTGTTAAGCATACTATTAGCATTATACTTTAATAA
TTTTTGGTCTAGCGTGCTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTCAATTTGCTATTCCTAAGATGGAATTATAGATTTTATAAAATTGTGTATAATGTAAAACTTATCAAAATTTTTGAT
GCGTATTATGTGTGTTTTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 914; Mature: 913

Protein sequence:

>914_residues
MGKIFSVYCPESFLAVVAKFAFDIFNDNSGNSSSVIIIVPNQEDVKLLYGQLKLYFHATVLAQVKVMSLSDIDQDLLANE
HSFVRIMTPIRKLLLLMEFIKLWNSENGDNYPLSLGYELSSLLNEMHVHCIPISNLECLFDYDLPAHCQKAARFLSELSK
KWKEVLNKDEVLDILEHRSLYIGNLIKYLQDEVLNCTVIFAGMVFDNFFVNFIQELYKLPNSRIIFPYVDISIDEKDWQL
LEECHYQYYVKSLLDILKVNRNDIVFLGEPNHSVFVSSVFNFNLFLEKYHQHEIQNYSDYSRVKLITCISDEEEAQVVSM
LIKENVNSSPIVFTNNLLLTKRINSIVNAERLLDKPNVGYLILSFILHTLEVVMSKWNPIPLLSLLKHPFVTLGYVKEDY
DALISSFELKVIRSYSGYDFFSMENNVKEKVPDLLPFWEKITSVILPLVKVKHDVISSIVKAHIVCIQNLLEGNLVIDSN
GYSKIQEFFDDLQNSCNGIKVYGMDVYYEILTSVLYSSFSLENYKLSTVNLFKRGIVIFAGFNEINYGVNSCGTLLNRWI
RTKLGLPSIQREKGYFAYLLHSFFYADKIYITQSLKSFGKINEESIWIRRLGILAKLYDIENLKCEIYSKISDRFSCDDT
KSLAYLRPQPNPDINNRVIAFNVLSTTSLETLVKNPYVFYLSNILNILPCKSINEKFSMRDFGIVVHNVLHKYLLCNNNQ
HRYEDLVEIAASELLDKYKDFPQVETILWPKFQKIAEQFFEINLERAHYVDEIITERFFSWEINSNIEVISRCDRVECLK
DGSVIIIDYKTGAIPSQSDINYGVALQMIIQALTVKQSLKKEISGLMYWKISSEDMRIVPIDNYTELIKKLEVALKQLIL
DYVEFMKPFTASCDMSKYADYDLITRVKEWGYFI

Sequences:

>Translated_914_residues
MGKIFSVYCPESFLAVVAKFAFDIFNDNSGNSSSVIIIVPNQEDVKLLYGQLKLYFHATVLAQVKVMSLSDIDQDLLANE
HSFVRIMTPIRKLLLLMEFIKLWNSENGDNYPLSLGYELSSLLNEMHVHCIPISNLECLFDYDLPAHCQKAARFLSELSK
KWKEVLNKDEVLDILEHRSLYIGNLIKYLQDEVLNCTVIFAGMVFDNFFVNFIQELYKLPNSRIIFPYVDISIDEKDWQL
LEECHYQYYVKSLLDILKVNRNDIVFLGEPNHSVFVSSVFNFNLFLEKYHQHEIQNYSDYSRVKLITCISDEEEAQVVSM
LIKENVNSSPIVFTNNLLLTKRINSIVNAERLLDKPNVGYLILSFILHTLEVVMSKWNPIPLLSLLKHPFVTLGYVKEDY
DALISSFELKVIRSYSGYDFFSMENNVKEKVPDLLPFWEKITSVILPLVKVKHDVISSIVKAHIVCIQNLLEGNLVIDSN
GYSKIQEFFDDLQNSCNGIKVYGMDVYYEILTSVLYSSFSLENYKLSTVNLFKRGIVIFAGFNEINYGVNSCGTLLNRWI
RTKLGLPSIQREKGYFAYLLHSFFYADKIYITQSLKSFGKINEESIWIRRLGILAKLYDIENLKCEIYSKISDRFSCDDT
KSLAYLRPQPNPDINNRVIAFNVLSTTSLETLVKNPYVFYLSNILNILPCKSINEKFSMRDFGIVVHNVLHKYLLCNNNQ
HRYEDLVEIAASELLDKYKDFPQVETILWPKFQKIAEQFFEINLERAHYVDEIITERFFSWEINSNIEVISRCDRVECLK
DGSVIIIDYKTGAIPSQSDINYGVALQMIIQALTVKQSLKKEISGLMYWKISSEDMRIVPIDNYTELIKKLEVALKQLIL
DYVEFMKPFTASCDMSKYADYDLITRVKEWGYFI
>Mature_913_residues
GKIFSVYCPESFLAVVAKFAFDIFNDNSGNSSSVIIIVPNQEDVKLLYGQLKLYFHATVLAQVKVMSLSDIDQDLLANEH
SFVRIMTPIRKLLLLMEFIKLWNSENGDNYPLSLGYELSSLLNEMHVHCIPISNLECLFDYDLPAHCQKAARFLSELSKK
WKEVLNKDEVLDILEHRSLYIGNLIKYLQDEVLNCTVIFAGMVFDNFFVNFIQELYKLPNSRIIFPYVDISIDEKDWQLL
EECHYQYYVKSLLDILKVNRNDIVFLGEPNHSVFVSSVFNFNLFLEKYHQHEIQNYSDYSRVKLITCISDEEEAQVVSML
IKENVNSSPIVFTNNLLLTKRINSIVNAERLLDKPNVGYLILSFILHTLEVVMSKWNPIPLLSLLKHPFVTLGYVKEDYD
ALISSFELKVIRSYSGYDFFSMENNVKEKVPDLLPFWEKITSVILPLVKVKHDVISSIVKAHIVCIQNLLEGNLVIDSNG
YSKIQEFFDDLQNSCNGIKVYGMDVYYEILTSVLYSSFSLENYKLSTVNLFKRGIVIFAGFNEINYGVNSCGTLLNRWIR
TKLGLPSIQREKGYFAYLLHSFFYADKIYITQSLKSFGKINEESIWIRRLGILAKLYDIENLKCEIYSKISDRFSCDDTK
SLAYLRPQPNPDINNRVIAFNVLSTTSLETLVKNPYVFYLSNILNILPCKSINEKFSMRDFGIVVHNVLHKYLLCNNNQH
RYEDLVEIAASELLDKYKDFPQVETILWPKFQKIAEQFFEINLERAHYVDEIITERFFSWEINSNIEVISRCDRVECLKD
GSVIIIDYKTGAIPSQSDINYGVALQMIIQALTVKQSLKKEISGLMYWKISSEDMRIVPIDNYTELIKKLEVALKQLILD
YVEFMKPFTASCDMSKYADYDLITRVKEWGYFI

Specific function: Unknown

COG id: COG3893

COG function: function code L; Inactivated superfamily I helicase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106086; Mature: 105955

Theoretical pI: Translated: 5.58; Mature: 5.58

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGKIFSVYCPESFLAVVAKFAFDIFNDNSGNSSSVIIIVPNQEDVKLLYGQLKLYFHATV
CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LAQVKVMSLSDIDQDLLANEHSFVRIMTPIRKLLLLMEFIKLWNSENGDNYPLSLGYELS
HHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECHHHH
SLLNEMHVHCIPISNLECLFDYDLPAHCQKAARFLSELSKKWKEVLNKDEVLDILEHRSL
HHHHHCCEEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
YIGNLIKYLQDEVLNCTVIFAGMVFDNFFVNFIQELYKLPNSRIIFPYVDISIDEKDWQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHH
LEECHYQYYVKSLLDILKVNRNDIVFLGEPNHSVFVSSVFNFNLFLEKYHQHEIQNYSDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SRVKLITCISDEEEAQVVSMLIKENVNSSPIVFTNNLLLTKRINSIVNAERLLDKPNVGY
CCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
LILSFILHTLEVVMSKWNPIPLLSLLKHPFVTLGYVKEDYDALISSFELKVIRSYSGYDF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEE
FSMENNVKEKVPDLLPFWEKITSVILPLVKVKHDVISSIVKAHIVCIQNLLEGNLVIDSN
ECCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECC
GYSKIQEFFDDLQNSCNGIKVYGMDVYYEILTSVLYSSFSLENYKLSTVNLFKRGIVIFA
CHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHCCEEEEE
GFNEINYGVNSCGTLLNRWIRTKLGLPSIQREKGYFAYLLHSFFYADKIYITQSLKSFGK
CCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
INEESIWIRRLGILAKLYDIENLKCEIYSKISDRFSCDDTKSLAYLRPQPNPDINNRVIA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEE
FNVLSTTSLETLVKNPYVFYLSNILNILPCKSINEKFSMRDFGIVVHNVLHKYLLCNNNQ
EEEECHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
HRYEDLVEIAASELLDKYKDFPQVETILWPKFQKIAEQFFEINLERAHYVDEIITERFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHEE
WEINSNIEVISRCDRVECLKDGSVIIIDYKTGAIPSQSDINYGVALQMIIQALTVKQSLK
EEECCCHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEISGLMYWKISSEDMRIVPIDNYTELIKKLEVALKQLILDYVEFMKPFTASCDMSKYAD
HHHCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCC
YDLITRVKEWGYFI
HHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GKIFSVYCPESFLAVVAKFAFDIFNDNSGNSSSVIIIVPNQEDVKLLYGQLKLYFHATV
CCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LAQVKVMSLSDIDQDLLANEHSFVRIMTPIRKLLLLMEFIKLWNSENGDNYPLSLGYELS
HHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECHHHH
SLLNEMHVHCIPISNLECLFDYDLPAHCQKAARFLSELSKKWKEVLNKDEVLDILEHRSL
HHHHHCCEEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
YIGNLIKYLQDEVLNCTVIFAGMVFDNFFVNFIQELYKLPNSRIIFPYVDISIDEKDWQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHH
LEECHYQYYVKSLLDILKVNRNDIVFLGEPNHSVFVSSVFNFNLFLEKYHQHEIQNYSDY
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SRVKLITCISDEEEAQVVSMLIKENVNSSPIVFTNNLLLTKRINSIVNAERLLDKPNVGY
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LILSFILHTLEVVMSKWNPIPLLSLLKHPFVTLGYVKEDYDALISSFELKVIRSYSGYDF
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GFNEINYGVNSCGTLLNRWIRTKLGLPSIQREKGYFAYLLHSFFYADKIYITQSLKSFGK
CCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
INEESIWIRRLGILAKLYDIENLKCEIYSKISDRFSCDDTKSLAYLRPQPNPDINNRVIA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEE
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HRYEDLVEIAASELLDKYKDFPQVETILWPKFQKIAEQFFEINLERAHYVDEIITERFFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHEE
WEINSNIEVISRCDRVECLKDGSVIIIDYKTGAIPSQSDINYGVALQMIIQALTVKQSLK
EEECCCHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEISGLMYWKISSEDMRIVPIDNYTELIKKLEVALKQLILDYVEFMKPFTASCDMSKYAD
HHHCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCC
YDLITRVKEWGYFI
HHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA