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The map label for this gene is nuoL [H]

Identifier: 88657655

GI number: 88657655

Start: 554029

End: 555894

Strand: Direct

Name: nuoL [H]

Synonym: ECH_0554

Alternate gene names: 88657655

Gene position: 554029-555894 (Clockwise)

Preceding gene: 88658294

Following gene: 88658135

Centisome position: 47.1

GC content: 28.83

Gene sequence:

>1866_bases
ATGGTTAAAGTTGAACTATTATGTGTTTTTTTGCCTTTAATGGGTTCTATTTTTGCTAGTATGATGAATAATAGATTAAT
GTCTCAATTAGTTGCAACATCCTTAGTAGTTTGTGCATCATTATTGTCATGGTACTTATTTTTTAATTTTAAAGATAGTT
ATGTTATTACTTTATTTCCGTGGATTGAATTATATAAATTAAAAGTTAGTTGGTCATTGTATATAGATTCATTAAGTATG
ATTATGCTAATAATAGTTAATACAGTGTCAGCAGTAGTGCATATTTATTCAATGGGTTATATGTCTCATGATGTAGGTGT
ATCTAGATTCTTATCTTATGTGTCTCTATTTACATTTTTTATGTTGATTTTAATAACGAGTGATAATTTTGCTCAACTTT
TTTTAGGTTGGGAAGGTGTAGGTTTATGTTCTTATTTATTGATTGGTTTTTGGTTTGAGAAAGCTTCAGCTACTAAAGCA
GCAATGAAAGCTTTTATTATGAATAGGATAGGGGATTTTTTTTTCATATTAGGAATTGTAGCAGTATTTTGGGTATTTGG
ATCTTTAGAATTTAATAAGATATTTAACATGCTTGATTCAATATATGTTGAAGGTGTAGTTAATTTTTTTGGTTATCCGA
TACCTTATTTGGATATGATATGTTTATTGCTTTTTATTGGATGTATGGGTAAATCTGCACAAATTGGTTTGCATACATGG
TTACCTGATGCAATGGAAGGTCCAACTCCTGCTTCAGCGTTGATTCATGCTGCAACTATGGTAACAGCAGGGGTATTTCT
TGTTGCCAGATGTTCTCCATTATTTGAATTATCAGTTATGGCGCGCAACGTTATTTTGATTGTTGGTGCGTTTACCTGTT
TATTTGCTGCAACTGTTGCTATTGTACAGAGTGATGTAAAAAAGATAATAGCATATTCTACTTGTAGTCAGTTAGGATAT
ATGTTTATTGCATGTGGATTATCAGCATATAGTGTAGCCATATTTCATTTAATGACTCACGCTTTTTTTAAAGCTTTATT
ATTTTTGTGTGCAGGTAATATAATTCATGCTACACATGAACAAGATATCCATAAGGTGAATGCTTCTTGGCGTCAAATAC
CATTTACATATGTGTTAACTTGGATAGGGTCTTTAGCATTGGCAGGTATTTTTCCATTTGCTGGTTTCTATTCAAAGGAT
CTTATTATTGAAAGTAGCTATCATGTTAGTAAGATTGCCTTTATAATATGTAATTTGGTTGCCTTTTTAACAGCTTTTTA
TTCTTGGAGATTGATTATATTAGTTTTCCATAAAGTAAGATCAACAAGTCTTTCAATACATGAGTCAGGAAAAGTAATGC
TTGTACCTTTATTGATATTAGCTATAGGTTCTATATTTTCTGGTATGTGGGGACAAAATTTATTACTGATTAATGATGTT
GCATTTTGGAAAGGTAGTATAAAGATACATGAGCATGTAGAAGTGGGATTATTTGTAAAATTATTACCATTATTTTTAAG
TATACTTGGAATAGTGTGTGCTTATTTAAAATATTTTTACAATTGTTTTGGTAATTTTTATTGTAATCGATTATTCAAAT
TTCTATATAATAAGTGGTATTTTGATGAGTTATATAATCTTATCTTTATAATACCTGTTAGATATATAGCGAGTTTCTTT
TCTAAAGTAGTTGATAAAAAAATTATTGATTATTTTGGGTTAGGTGGTATTACTAAGATAGTAAATTGTTGCTCAAAGGG
TAGTGTTAAGATACAAACTGGTTTTATTTTTGATTATGCATTTATTATGCTATTGGGTTTGATAAGTATTATCATGTGGT
TAATTTATAATAATATAAGATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTGTGGAAATATTAATGTTGAAACAGCTAATAAGATGAAAGAGTAGAAAATTTTTTAGGTGCTTATTGACTAATCAT
AATTAATTAGGACAGGTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCATATGCTATTTTTGATGGTTTTATTACCAATATTGGGGTCATGTTTATTAGCAGTTAGTAATTTTAAGGCAAGTTCG
TTATCTATAAGAGTAATTTC

Product: NADH dehydrogenase I, L subunit

Products: NA

Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit L; NDH-1 subunit L [H]

Number of amino acids: Translated: 621; Mature: 621

Protein sequence:

>621_residues
MVKVELLCVFLPLMGSIFASMMNNRLMSQLVATSLVVCASLLSWYLFFNFKDSYVITLFPWIELYKLKVSWSLYIDSLSM
IMLIIVNTVSAVVHIYSMGYMSHDVGVSRFLSYVSLFTFFMLILITSDNFAQLFLGWEGVGLCSYLLIGFWFEKASATKA
AMKAFIMNRIGDFFFILGIVAVFWVFGSLEFNKIFNMLDSIYVEGVVNFFGYPIPYLDMICLLLFIGCMGKSAQIGLHTW
LPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGVFLVARCSPLFELSVMARNVILIVGAFTCLFAATVAIVQSDVKKIIAYSTCSQLGY
MFIACGLSAYSVAIFHLMTHAFFKALLFLCAGNIIHATHEQDIHKVNASWRQIPFTYVLTWIGSLALAGIFPFAGFYSKD
LIIESSYHVSKIAFIICNLVAFLTAFYSWRLIILVFHKVRSTSLSIHESGKVMLVPLLILAIGSIFSGMWGQNLLLINDV
AFWKGSIKIHEHVEVGLFVKLLPLFLSILGIVCAYLKYFYNCFGNFYCNRLFKFLYNKWYFDELYNLIFIIPVRYIASFF
SKVVDKKIIDYFGLGGITKIVNCCSKGSVKIQTGFIFDYAFIMLLGLISIIMWLIYNNIRF

Sequences:

>Translated_621_residues
MVKVELLCVFLPLMGSIFASMMNNRLMSQLVATSLVVCASLLSWYLFFNFKDSYVITLFPWIELYKLKVSWSLYIDSLSM
IMLIIVNTVSAVVHIYSMGYMSHDVGVSRFLSYVSLFTFFMLILITSDNFAQLFLGWEGVGLCSYLLIGFWFEKASATKA
AMKAFIMNRIGDFFFILGIVAVFWVFGSLEFNKIFNMLDSIYVEGVVNFFGYPIPYLDMICLLLFIGCMGKSAQIGLHTW
LPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGVFLVARCSPLFELSVMARNVILIVGAFTCLFAATVAIVQSDVKKIIAYSTCSQLGY
MFIACGLSAYSVAIFHLMTHAFFKALLFLCAGNIIHATHEQDIHKVNASWRQIPFTYVLTWIGSLALAGIFPFAGFYSKD
LIIESSYHVSKIAFIICNLVAFLTAFYSWRLIILVFHKVRSTSLSIHESGKVMLVPLLILAIGSIFSGMWGQNLLLINDV
AFWKGSIKIHEHVEVGLFVKLLPLFLSILGIVCAYLKYFYNCFGNFYCNRLFKFLYNKWYFDELYNLIFIIPVRYIASFF
SKVVDKKIIDYFGLGGITKIVNCCSKGSVKIQTGFIFDYAFIMLLGLISIIMWLIYNNIRF
>Mature_621_residues
MVKVELLCVFLPLMGSIFASMMNNRLMSQLVATSLVVCASLLSWYLFFNFKDSYVITLFPWIELYKLKVSWSLYIDSLSM
IMLIIVNTVSAVVHIYSMGYMSHDVGVSRFLSYVSLFTFFMLILITSDNFAQLFLGWEGVGLCSYLLIGFWFEKASATKA
AMKAFIMNRIGDFFFILGIVAVFWVFGSLEFNKIFNMLDSIYVEGVVNFFGYPIPYLDMICLLLFIGCMGKSAQIGLHTW
LPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGVFLVARCSPLFELSVMARNVILIVGAFTCLFAATVAIVQSDVKKIIAYSTCSQLGY
MFIACGLSAYSVAIFHLMTHAFFKALLFLCAGNIIHATHEQDIHKVNASWRQIPFTYVLTWIGSLALAGIFPFAGFYSKD
LIIESSYHVSKIAFIICNLVAFLTAFYSWRLIILVFHKVRSTSLSIHESGKVMLVPLLILAIGSIFSGMWGQNLLLINDV
AFWKGSIKIHEHVEVGLFVKLLPLFLSILGIVCAYLKYFYNCFGNFYCNRLFKFLYNKWYFDELYNLIFIIPVRYIASFF
SKVVDKKIIDYFGLGGITKIVNCCSKGSVKIQTGFIFDYAFIMLLGLISIIMWLIYNNIRF

Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cyto

COG id: COG1009

COG function: function code CP; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 5 family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=498, Percent_Identity=37.5502008032129, Blast_Score=293, Evalue=3e-79,
Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=578, Percent_Identity=37.3702422145329, Blast_Score=337, Evalue=2e-93,
Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=435, Percent_Identity=28.0459770114943, Blast_Score=142, Evalue=8e-35,
Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=351, Percent_Identity=29.6296296296296, Blast_Score=122, Evalue=7e-29,
Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=428, Percent_Identity=26.4018691588785, Blast_Score=112, Evalue=6e-26,
Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=404, Percent_Identity=24.7524752475248, Blast_Score=87, Evalue=2e-18,
Organism=Escherichia coli, GI2367154, Length=155, Percent_Identity=24.5161290322581, Blast_Score=69, Evalue=8e-13,
Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=208, Percent_Identity=26.9230769230769, Blast_Score=69, Evalue=1e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001750
- InterPro:   IPR001516
- InterPro:   IPR003945
- InterPro:   IPR018393 [H]

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1; PF00662 Oxidored_q1_N [H]

EC number: =1.6.99.5 [H]

Molecular weight: Translated: 70256; Mature: 70256

Theoretical pI: Translated: 8.57; Mature: 8.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.6 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
6.4 %Cys+Met (Translated Protein)
2.6 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
6.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA