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The map label for this gene is 88608575

Identifier: 88608575

GI number: 88608575

Start: 452751

End: 455075

Strand: Direct

Name: 88608575

Synonym: NSE_0526

Alternate gene names: NA

Gene position: 452751-455075 (Clockwise)

Preceding gene: 88608173

Following gene: 88608782

Centisome position: 52.71

GC content: 42.37

Gene sequence:

>2325_bases
TTGCTTTCTAGTAAAAGAGATGTAATACTAGAAAGTGTATTCTCTATATTCCGTGCCAATGATATTTGGCTTAGGTCTTT
GTTGTGTACGCATATATCTATTTATGTATATTTAGTTGTCGTGCCTAGTTCCTATAATGAGCTTAATGCTTCTCCTTTCC
CAACCAGACAAGTATCCAACAGTGATGCTTCTGAACTTGAAGTGGTGCTAAATCCTCAAGAGAATCCTGACCTTGGGAGC
CGAAGCATTTTTGTGCCAGATTGCCCTTATTCTCCAACATTCTTCTATACTTTCGGCTCAAGTGAAGATGAAAATATTTC
CGATATGAAATCGGTAGAATCGTTGTTTTCAATCTCCTCTTCTCTTTGGGATCTTCGGGAAGAACTGTCAGGTAGTCTTT
ACCAAGAACAGCTTGACTGTCCCTCTGGCGATTCCCACTTCAGACAAATCCCCTCTGATGCGGAATCGGTCTATTCAAGC
ATCACCCCTACTGCTGAAGAGGATTCCAGTATACATGAACCTGAGATACTTATTGAAGTTGATAAAGTTGGCACTGTTCC
AACTTTGGAATGTCAGCACTCGCCTTCTTATGCGAGTCATGTTTCCAAAAGTATAAAACAGGGTGCTTTCGCTGGACTGC
ATGCAGCAACAGGCTACGTACAATTCCTTTCCTCTAACTTAGGCGGTGCTCTCGGTAGCTTAATGCAAAGCACTTCAAAC
GCTTTATATAGTGCAGGAAGCTATGCTTACAATAGTGTGGTTCCTATTTCTTCAGGTACCACTTCCACTGAAGAAGATTC
TGATAAGCATGGTGAAACAACAGGCTACGTACAATTCCTTTCCTCTAACTTAGGCGGTGCTCTCGGTAGCTTAATGCAAA
GCACTTCAAACGCTTTATATAGTGCAGGAAGCTATGTTTACAATAGTGTGGTTCCTATTTCTTCAGGTACCACTTCCACT
GAAGAAGATTCTGATAAGCATGGTGAAACAACAGGCTACGTACAATTCCTTTCCTCTAACTTAGGCGGTGCTCTCGGTAG
CTTAATGCAAAGCACTTCAAACGCTTTATATAGTGCAGGAAGCTATGTTTACAATAGCAGCTCTTACACCCGGTTTCGGA
ACTACCTTGGCAATGGTATTAACAATATGAAAAATGGGTTCAGTAGCGTTGGAAAAGAGATGTTGTCGTCGGCTGTACAG
ACCGCCGTAAATAGCACTTTTCCAGAATCTACGGAAACATTACAGAACCTTAATCGAGCAATATCAGGCATCAATAACGC
TGTCACACATCTGCAGAGTACAAGTAAAGATGTCTCAGCTGCTGCGGCTGCAGTCTCTGAAACATTCAATGGAACTTCCC
TCCACTTAAGTCGCTTATTCAGTATATTTATGGAGTTTAACAGTGCTATTTCGCTTCATGATAGTGATGGTATTCTTGAG
GCCCTTGAGAACATGTCAAAGCAGATAGAAAAACTTCAAGCTTTGTGTCTTTTAAAGAGTGATACTCAAGATAATTATAA
CGATAAACTCCTGTGTTTAGATCATCTTGCTAAAAAAATTGTGGAACTTTCGTCCGTAGCTAAGCAAGGTGATACTTTAT
ACTCGTGGGATCGTAACAGACTATACGATTTCCTTGAATTAGACAAATTAAAGAAATATTTTCTTCGTTCCAGTAATATC
CAAGATACGATTGGGCATATGCATGGTGTAATCCCTCGCGTTAGGAGGGCTTGTGTTGATACATCCAACTCTGCGAATTC
GATCTCTGTTATCTCGGAGAATATAAAGCTTTTCAGCCTGATCGGTAGTGTTCAGGTTTTACCACTTGCAGCGTTTGTGC
TTCGGTGTTCGGTCAATCAGGATAACAGTGTGGTTTGTGCGGTACTGCAGGCTCTCGCTGTTACAGTAATATTCGCGCTC
ATGGGTAGATATTTTCAAGAAGCGAGGCTTTTGAGAAAATCCGACAACAACGACATTGCAAGCGATCATGCCTCAGTTGT
AAAAGTCTGTAATGCGCGCACGATCATGATTGCTGGACTCTCAGCTTTACCTATAGCATTGATAACACTTGGTATTTATA
CGGCAGATACTGCAACCGCAGCAAAGACCCACATAGCGTTGTTGTCTACACTCTTCGTCCTTTCGTTAGCTCTGAGCATT
GTCTTGCCCATAGTGTATAAGATATACCCACAACGTCAGGGAGAAGCAGGTCCGTACACATCTAATCCCCATTCCGGGGA
TCCGGACAACGAAACTCCTAGCACCAGTCTTCCATCTAGCGACGTCACCACCCCTGGCCATAGAATGAGGCTAGCACCTA
TCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCTTTTAGCTCTCTTTAGTTTAACTTTTATATTATTTTAGATTTTTCATATCTATGTAATATATCTTTTATAAAATTGT
CTTAATAAATATGCTGCCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCTTTAGCTTTATTATCGATCTAAGGATTTTTTCCATATCCAGTGCGGAGCGCGTAGTCTCAAACGTTCCGCCTGGTGGA
AGTATCTCACTACTGATGCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 774; Mature: 774

Protein sequence:

>774_residues
MLSSKRDVILESVFSIFRANDIWLRSLLCTHISIYVYLVVVPSSYNELNASPFPTRQVSNSDASELEVVLNPQENPDLGS
RSIFVPDCPYSPTFFYTFGSSEDENISDMKSVESLFSISSSLWDLREELSGSLYQEQLDCPSGDSHFRQIPSDAESVYSS
ITPTAEEDSSIHEPEILIEVDKVGTVPTLECQHSPSYASHVSKSIKQGAFAGLHAATGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSN
ALYSAGSYAYNSVVPISSGTTSTEEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALYSAGSYVYNSVVPISSGTTST
EEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALYSAGSYVYNSSSYTRFRNYLGNGINNMKNGFSSVGKEMLSSAVQ
TAVNSTFPESTETLQNLNRAISGINNAVTHLQSTSKDVSAAAAAVSETFNGTSLHLSRLFSIFMEFNSAISLHDSDGILE
ALENMSKQIEKLQALCLLKSDTQDNYNDKLLCLDHLAKKIVELSSVAKQGDTLYSWDRNRLYDFLELDKLKKYFLRSSNI
QDTIGHMHGVIPRVRRACVDTSNSANSISVISENIKLFSLIGSVQVLPLAAFVLRCSVNQDNSVVCAVLQALAVTVIFAL
MGRYFQEARLLRKSDNNDIASDHASVVKVCNARTIMIAGLSALPIALITLGIYTADTATAAKTHIALLSTLFVLSLALSI
VLPIVYKIYPQRQGEAGPYTSNPHSGDPDNETPSTSLPSSDVTTPGHRMRLAPI

Sequences:

>Translated_774_residues
MLSSKRDVILESVFSIFRANDIWLRSLLCTHISIYVYLVVVPSSYNELNASPFPTRQVSNSDASELEVVLNPQENPDLGS
RSIFVPDCPYSPTFFYTFGSSEDENISDMKSVESLFSISSSLWDLREELSGSLYQEQLDCPSGDSHFRQIPSDAESVYSS
ITPTAEEDSSIHEPEILIEVDKVGTVPTLECQHSPSYASHVSKSIKQGAFAGLHAATGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSN
ALYSAGSYAYNSVVPISSGTTSTEEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALYSAGSYVYNSVVPISSGTTST
EEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALYSAGSYVYNSSSYTRFRNYLGNGINNMKNGFSSVGKEMLSSAVQ
TAVNSTFPESTETLQNLNRAISGINNAVTHLQSTSKDVSAAAAAVSETFNGTSLHLSRLFSIFMEFNSAISLHDSDGILE
ALENMSKQIEKLQALCLLKSDTQDNYNDKLLCLDHLAKKIVELSSVAKQGDTLYSWDRNRLYDFLELDKLKKYFLRSSNI
QDTIGHMHGVIPRVRRACVDTSNSANSISVISENIKLFSLIGSVQVLPLAAFVLRCSVNQDNSVVCAVLQALAVTVIFAL
MGRYFQEARLLRKSDNNDIASDHASVVKVCNARTIMIAGLSALPIALITLGIYTADTATAAKTHIALLSTLFVLSLALSI
VLPIVYKIYPQRQGEAGPYTSNPHSGDPDNETPSTSLPSSDVTTPGHRMRLAPI
>Mature_774_residues
MLSSKRDVILESVFSIFRANDIWLRSLLCTHISIYVYLVVVPSSYNELNASPFPTRQVSNSDASELEVVLNPQENPDLGS
RSIFVPDCPYSPTFFYTFGSSEDENISDMKSVESLFSISSSLWDLREELSGSLYQEQLDCPSGDSHFRQIPSDAESVYSS
ITPTAEEDSSIHEPEILIEVDKVGTVPTLECQHSPSYASHVSKSIKQGAFAGLHAATGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSN
ALYSAGSYAYNSVVPISSGTTSTEEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALYSAGSYVYNSVVPISSGTTST
EEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALYSAGSYVYNSSSYTRFRNYLGNGINNMKNGFSSVGKEMLSSAVQ
TAVNSTFPESTETLQNLNRAISGINNAVTHLQSTSKDVSAAAAAVSETFNGTSLHLSRLFSIFMEFNSAISLHDSDGILE
ALENMSKQIEKLQALCLLKSDTQDNYNDKLLCLDHLAKKIVELSSVAKQGDTLYSWDRNRLYDFLELDKLKKYFLRSSNI
QDTIGHMHGVIPRVRRACVDTSNSANSISVISENIKLFSLIGSVQVLPLAAFVLRCSVNQDNSVVCAVLQALAVTVIFAL
MGRYFQEARLLRKSDNNDIASDHASVVKVCNARTIMIAGLSALPIALITLGIYTADTATAAKTHIALLSTLFVLSLALSI
VLPIVYKIYPQRQGEAGPYTSNPHSGDPDNETPSTSLPSSDVTTPGHRMRLAPI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83675; Mature: 83675

Theoretical pI: Translated: 4.91; Mature: 4.91

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLSSKRDVILESVFSIFRANDIWLRSLLCTHISIYVYLVVVPSSYNELNASPFPTRQVSN
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCC
SDASELEVVLNPQENPDLGSRSIFVPDCPYSPTFFYTFGSSEDENISDMKSVESLFSISS
CCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SLWDLREELSGSLYQEQLDCPSGDSHFRQIPSDAESVYSSITPTAEEDSSIHEPEILIEV
HHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE
DKVGTVPTLECQHSPSYASHVSKSIKQGAFAGLHAATGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSN
CCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALYSAGSYAYNSVVPISSGTTSTEEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALY
HHHHCCCHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAGSYVYNSVVPISSGTTSTEEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALYSAG
HCCHHHHHCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SYVYNSSSYTRFRNYLGNGINNMKNGFSSVGKEMLSSAVQTAVNSTFPESTETLQNLNRA
CEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
ISGINNAVTHLQSTSKDVSAAAAAVSETFNGTSLHLSRLFSIFMEFNSAISLHDSDGILE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHH
ALENMSKQIEKLQALCLLKSDTQDNYNDKLLCLDHLAKKIVELSSVAKQGDTLYSWDRNR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHH
LYDFLELDKLKKYFLRSSNIQDTIGHMHGVIPRVRRACVDTSNSANSISVISENIKLFSL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
IGSVQVLPLAAFVLRCSVNQDNSVVCAVLQALAVTVIFALMGRYFQEARLLRKSDNNDIA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
SDHASVVKVCNARTIMIAGLSALPIALITLGIYTADTATAAKTHIALLSTLFVLSLALSI
HHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLPIVYKIYPQRQGEAGPYTSNPHSGDPDNETPSTSLPSSDVTTPGHRMRLAPI
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCC
>Mature Secondary Structure
MLSSKRDVILESVFSIFRANDIWLRSLLCTHISIYVYLVVVPSSYNELNASPFPTRQVSN
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCC
SDASELEVVLNPQENPDLGSRSIFVPDCPYSPTFFYTFGSSEDENISDMKSVESLFSISS
CCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE
DKVGTVPTLECQHSPSYASHVSKSIKQGAFAGLHAATGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSN
CCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALYSAGSYAYNSVVPISSGTTSTEEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALY
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SAGSYVYNSVVPISSGTTSTEEDSDKHGETTGYVQFLSSNLGGALGSLMQSTSNALYSAG
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SYVYNSSSYTRFRNYLGNGINNMKNGFSSVGKEMLSSAVQTAVNSTFPESTETLQNLNRA
CEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
ISGINNAVTHLQSTSKDVSAAAAAVSETFNGTSLHLSRLFSIFMEFNSAISLHDSDGILE
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SDHASVVKVCNARTIMIAGLSALPIALITLGIYTADTATAAKTHIALLSTLFVLSLALSI
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VLPIVYKIYPQRQGEAGPYTSNPHSGDPDNETPSTSLPSSDVTTPGHRMRLAPI
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA