| Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007795 |
| Length | 2,821,361 |
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The map label for this gene is 88195856
Identifier: 88195856
GI number: 88195856
Start: 2038746
End: 2042531
Strand: Reverse
Name: 88195856
Synonym: SAOUHSC_02180
Alternate gene names: NA
Gene position: 2042531-2038746 (Counterclockwise)
Preceding gene: 88195857
Following gene: 88195855
Centisome position: 72.4
GC content: 35.29
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CAAACAAGGATTACAAGCTAATCCTGAATATACAATTCATTATTTATCACAGGAAATTATGAGGTTAACACAAGAAAACG CGATGTTAAAAGCGTATATA
Product: phage minor structural protein
Products: NA
Alternate protein names: Minor Protein; Phage Related Protein; Phage-Related Protein; Phage Endopeptidase
Number of amino acids: Translated: 1261; Mature: 1261
Protein sequence:
>1261_residues MIHVLDFNDKIIDFLSTDDPSLVRAIHKRNVNDNSEMLELLISSERAEKFRERHRVIIRDSNKQWREFIINWVQDTMDGY TEIECIASYLADITTAKPYAPGKFEKKTTSEALKDVLSDTGWEVSEQTEYDGLRTTSWTSYQTRYEVLKQLCTTYKMALD FYIELSSNTVKGRYVVLKKKNSLFKGKEIEYGKDLVGLTRKIDMSEIKTALIAVGPENDKGKRLELVVTDDEAQSQFNLP TRYIWGIYEPQSDDQNMNETRLRSLAKTELNKRKSAVMSYEITSTDLEVTYPHEIISIGDTVRVKHRDFNPPLYVEAEVI AEEYNIISENSTYTFGQPKEFKESELREEFNKRLNIIHQKLNDNISNINTIVKDVVDGELEYFERKIHKNDTPPENPVND MLWYDTSNPDVAVLRRYWNGRWIEATPNDVEKLGGITREKALFSELNNIFINLSIQHASLLSEATELLNSEYLVDNDLKA DLQASLDAVIDVYNQIKNNLESMTPETATIGRLVDTQALFLEYRKKLQDVYTDVEDVKIAISDRFKLLQSQYTDEKYKEA LEIIATKFGLTVNEDLQLVGEPNVVKSAIEAARESTKEQLRDYVKTSDYKTDKDGIVERLDTAEAERTTLKGEIKDKVTL NEYRNGLEEQKQYTDDQLSDLSNNPEIKASIEQANQEAQEALKSYIDAQDNLKEKESQAYADGKISEEEQRAIQDAQAKL EEAKQNAELKARNAEKKANAYTDNKVKESTDAQRRTLTRYGSQIIQNGKEIKLRTTKEEFNATNRTLSNILNEIVQNVTD GTTIRYDDNGVAQALNVGPRGIRLNADKIDINGNREINLLIQNMRDKVDKTDIVNSLNLSREGLDINVNRIGIKGGNNNR YVQIQNDSIELGGIVQRTWKGKRSTDDIFTRLKDGHLRFRNNTAGGSLYMSHFGISTYIDGEGEDGGSSGTIQWWDKTYS DSGMNGITINSYGGVVALTSDNNRVVLESYASSNIKSKQAPVYLYPNTDKVPGLNRFAFTLSNADNAYSSDGYIMFGSDE NYDYGAGIRFSKERNKGLVQIVNGRYATGGDTTIEAGYGKFNMLKRRDGNRYIHIQSTDLLSVGSDDAGDRIASNSIYRR TYSAAANLHITSAGTIGRSTSARKYKLSIENQYNDRDEQLEHSKAILNLPIRTWFDKAESEILARELREDRKLSEDTYKL DRYVGLIAEEVENLGLKEFVTYDDKGEIEGIAYDRLWIHLIPVIKEQQLRIKKLEESKNAG
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 143745; Mature: 143745
Theoretical pI: Translated: 4.89; Mature: 4.89
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIHVLDFNDKIIDFLSTDDPSLVRAIHKRNVNDNSEMLELLISSERAEKFRERHRVIIRD CEEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEC SNKQWREFIINWVQDTMDGYTEIECIASYLADITTAKPYAPGKFEKKTTSEALKDVLSDT CCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC GWEVSEQTEYDGLRTTSWTSYQTRYEVLKQLCTTYKMALDFYIELSSNTVKGRYVVLKKK CCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEECCEEEEEECC NSLFKGKEIEYGKDLVGLTRKIDMSEIKTALIAVGPENDKGKRLELVVTDDEAQSQFNLP CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHCCCC TRYIWGIYEPQSDDQNMNETRLRSLAKTELNKRKSAVMSYEITSTDLEVTYPHEIISIGD HHEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCEEEECCHHHEECCC TVRVKHRDFNPPLYVEAEVIAEEYNIISENSTYTFGQPKEFKESELREEFNKRLNIIHQK EEEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHCEECCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNDNISNINTIVKDVVDGELEYFERKIHKNDTPPENPVNDMLWYDTSNPDVAVLRRYWNG HCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCC RWIEATPNDVEKLGGITREKALFSELNNIFINLSIQHASLLSEATELLNSEYLVDNDLKA 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA