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Definition Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome, complete genome.
Accession NC_007795
Length 2,821,361

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The map label for this gene is yebA [C]

Identifier: 88195239

GI number: 88195239

Start: 1473307

End: 1479507

Strand: Reverse

Name: yebA [C]

Synonym: SAOUHSC_01525

Alternate gene names: 88195239

Gene position: 1479507-1473307 (Counterclockwise)

Preceding gene: 88195240

Following gene: 88195238

Centisome position: 52.44

GC content: 36.28

Gene sequence:

>6201_bases
ATGAATGAAAAAGTAGAAGGCATGACCTTGGAGCTGAAATTAGACCATTTAGGTGTCCAAGAAGGCATGAAAGGTTTAAA
GCGACAATTAGGTGTTGTTAATAGTGAAATGAAAGCTAATCTGTCAGCATTTGATAAGTCTGAAAAATCAATGGAAAAAT
ATCAGGCGAGAATTAAGGGGTTAAATGATAGGCTTAAAGTTCAAAAAAAGATGTATTCTCAAGTAGAAGATGAGCTTAAA
CAAGTTAACGCTAATTACCAAAAAGCTAAATCCAGTGTAAAAGATGTTGAGAAAGCATATTTAAAGTTAGTAGAAGCCAA
TAAAAAAGAAAAATTAGCTCTTGATAAATCTAAAGAAGCCTTAAAATCATCGAATACAGAACTTAAAAAAGCTGAAAATC
AATATAAACGTACAAATCAACGTAAACAAGATGCGTATCAAAAACTTAAACAGTTGAGAGATGCAGAACAAAAGCTTAAG
AATAGTAACCAAGCTACTACTGCACAACTAAAAAGAGCAAGTGACGCAGTACAGAAGCAGTCCGCTAAGCATAAAGCACT
TGTTGAACAATATAAACAAGAAGGCAATCAAGTTCAAAAACTAAAAGTGCAAAATGACAATCTTTCAAAATCAAATGATA
AAATTGAAAGTTCTTACGCTAAAACTAATACTAAATTAAAGCAAACAGAAAAAGAATTTAATGATTTAAACAATACTATT
AAGAATCATAGCGCTAATGTCGCAAAAGCTGAAACAGCTGTTAATAAAGAAAAAGCTGCTTTAAATAATTTGGAGCGTTC
AATAGATAAAGCTTCATCCGAAATGAAGACTTTTAACAAAGAACAAATGATAGCTCAAAGTCATTTCGGTAAACTTGCAA
GTCAAGCGGATGTCATGTCAAAGAAATTTAGTTCTATTGGAGACAAAATGACTTCCCTGGGACGTACAATGACGATGGGC
GTATCTACACCGATTACTTTAGGTTTAGGTGCAGCATTAAAAACGAGTGCAGACTTTGAAGGGCAAATGTCTCGAGTTGG
AGCGATTGCACAAGCAAGCAGTAAAGACTTAAAAAGCATGTCTAATCAAGCGGTTGACTTAGGAGCTAAAACAAGTAAAA
GTGCTAACGAAGTTGCTAAAGGTATGGAAGAATTGGCAGCTTTAGGCTTTAATGCCAAACAAACAATGGAGGCTATGCCA
GGTGTTATCAGCGCAGCAGAAGCAAGTGGTGCAGAAATGGCTACAACTGCAACTGTAATGGCTTCAGCGATTAACTCTTT
CGGTTTAAAAGCATCTGATGCAAATCATGTTGCTGATTTACTTGCGAGATCAGCAAATGATAGTGCTGCAGATATTCAAT
ATATGGGAGATGCATTAAAATATGCAGGTACTCCAGCAAAAGCATTAGGAGTTTCAATAGAGGACACTTCTGCAGCAATT
GAAGTTTTATCTAACTCAGGTTTAGAGGGGTCTCAAGCAGGTACTGCATTAAGAGCTTCGTTTATTAGGCTAGCTAATCC
AAGTAAAAGTACAGCTAAGGAAATGAAAAAATTAGGTATTCATTTGTCTGATGCTAAAGGTGAGTTTGTTGGAATGGGCG
AATTGATTAGACAGTTCCAAGATAACATGAAAGGCATGACGAGAGAACAAAAATTAGCAACAGTGGCTACAATAGTTGGC
ACTGAAGCAGCAAGTGGATTTTTAGCCTTGATTGAAGCGGGTCCAGATAAAATTAATAGCTATAGCAAATCATTGAAGAA
CTCTAATGGTGAAAGTAAAAAAGCAGCTGATTTGATGAAAGATAACCTCAAAGGTGCTCTGGAACAATTAGGTGGCGCTT
TTGAATCGTTAGCAATTGAAGTTGGTAAAGATTTAACGCCTATGATTAGAGCAGGTGCGGAAGGATTAACAAAATTAGTT
GATGGATTTACACATCTTCCTGGTTGGGTTAGAAAGGCTTCGGTAGGCTTAGCAATTTTTGGTGCATCTATTGGTCCTGC
TGTTCTTGCTGGTGGCTTATTAATACGTGCAGTTGGGAGCGCGGCTAAAGGCTATGCATCATTAAATAGACGCATTGCTG
AAAATACAATTCTTTCTAATACCAATTCAAAAGCAATGAAATCTTTAGGTCTTCAAACATTATTTCTTGGTTCTACAACA
GGAAAAACGTCAAAAGGCTTTAAAGGATTAGCCGGAGCTATGTTGTTTAATTTAAAACCTATAAATGTTTTGAAAAATTC
TGCAAAGCTAGCAATTTTACCGTTCAAACTTTTGAAAAACGGTTTAGGATTAGCCGCAAAATCCTTATTTGCAGTAAGTG
GAGGCGCAAGATTTGCTGGTGTAGCCTTAAAGTTTTTAACAGGACCTATAGGTGCTACAATAACTGCTATTACAATTGCA
TATAAAGTTTTTAAAACCGCATATGATCGTGTGGAATGGTTCAGAAACGGTATTAACGGTTTAGGAGAAACTATAAAGTT
TTTTGGTGGCAAAATTATTGGCGGTGCTGTTAGGAAGCTAGGAGAGTTTAAAAATTATCTTGGAAGTATAGGCAAAAGCT
TCAAAGAAAAGTTTTCAAAGGATATGAAAGATGGTTATAAATCTTTGAGTGACGATGACCTTCTGAAAGTAGGAGTCAAC
AAGTTTAAAGGATTTATGCAAACCATGGGCACAGCTTCTAAAAAAGCATCTGATACTGTAAAAGTGTTGGGGAAAGGTGT
TTCAAAAGAAACAGAAAAAGCTTTAGAAAAATACGTACACTATTCTGAAGAGAACAACAGAATCATGGAAAAAGTACGTT
TAAACTCGGGTCAAATAACAGAAGACAAAGCAAAAAAACTTTTGAAAATTGAAGCGGATTTATCTAATAACCTTATAGCT
GAAATAGAAAAAAGAAATAAAAAGGAACTCGAAAAAACTCAAGAACTTATTGATAAGTATAGTGCATTCGATGAACAAGA
AAAGCAAAACATTTTAACTAGAACTAAAGAAAAAAATGACTTGCGAATTAAAAAAGAGCAAGAACTCAATCAGAAAATCA
AAGAATTGAAAGAAAAAGCTTTAAGTGATGGTCAGATTTCAGAAAATGAAAGAAAAGAAATTGAAAAGCTTGAAAATCAA
AGACGTGACATCACTGTTAAAGAATTGAGTAAGACTGAAAAAGAGCAAGAGCGTATTTTAGTAAGAATGCAAAGAAACAG
AAATGCTTATTCAATAGACGAAGCGAGCAAAGCAATTAAAGAAGCAGAAAAAGCAAGAAAAGCAAGAAAAAAAGAAGTGG
ATAAGCAGTATGAAGATGATGTCATTGCTATAAAAAATAACGTCAACCTTTCTAAGTCTGAAAAAGATAAATTGTTAGCT
ATTGCTGATCAAAGACATAAGGATGAAGTAAGAAAGGCAAAATCTAAAAAAGATGCTGTAGTAGACGTTGTTAAAAAGCA
AAATAAAGATATTGATAAAGAAATGGATTTATCCAGTGGACGTGTATATAAAAATACTGAAAAGTGGTGGAATGGTCTTA
AAAGTTGGTGGTCTAACTTTAGAGAAGACCAAAAGAAGAAAAGTGATAAATACGCTAAAGAACAAGAAGAAACAGCTCGT
AGAAACAGAGAAAATATAAAGAAATGGTTTGGAAATGCTTGGGACGGCGTAAAAACTAAAACTGGTGAAGCCTTTAGTAA
AATGGGCAGAAATGCTAATCATTTTGGCGGCGAAATGAAAAAAATGTGGAGTGGAATCAAAGGAATTCCAAGCAAATTAA
GTTCAAGTTGGAGCTCAGCCAAAAGTTCTGTAGGATATCACACTAAGGCTATAGCTAATAGTACTGGTAAATGGTTTGGA
AAAGCTTGGCAATCTGTTAAATCGACTACAGGAAGTATTTACAATCAAACTAAGCAAAAGTATTCAGATGCCTCAGATAA
AGCTTGGGCGCATTCAAAATCTATTTGGAGAGGCACATCAAAATGGTTTAGCAACGCATATAAAAGTGCAAAGGGTTGGC
TAATAGATATGGCTAATAAATCGCGCTCGAAATGGGATAATATTTCTAGTACAGCATGGTCGAATGCAAAATCCGTTTGG
AAAGGAACATCGAAATGGTTTAGTAACTCATACAAATCTTTAAAAGGTTGGACTGGGGATATGTATTCAAGAGCCCACGA
TCGTTTTGATGCAATTTCAAGTTCGGCATGGTCTAACGCTAAATCAGTATTTAATGGTTTTAGAAAATGGCTATCAAAAA
CATATGATTGGATTAGAGATATTGGTAAAGACATGGGAAGAGCTGCGGCTGATTTAGGTAAAAATGTTGCTAATAAAGCT
ATTGGCGGTTTGAATAGCATGATTGGCGGTATTAATAAAATATCTAAAGCCATTACTGATAAAAATCTCATCAAGCCAAT
ACCTACATTGTCTACTGGTACTTTAGCAGGAAAGGGTGTAGCTACCGATAATTCAGGAGCATTAACGCAACCGACATTTG
CTGTATTAAATGATAGAGGTTCTGGAAACGCCCCAGGTGGTGGAGTTCAAGAAATAATTCACAGGGCTGACGGAACATTC
CATGCACCCCAAGGACGAGATGTGGTTGTTCCACTAGGAGTTGGAGATAGTGTAATAAATGCCAATGACACTCTGAAGTT
ACAGCGGATGGGTGTTTTGCCAAAATTCCATGGTGGTACGAAAAAGAAAAAATGGATGGAACAAGTTACTGAAAATCTTG
GTAAAAAAGCAGGGGACTTCGGTTCTAAAGCTAAAAACACAGCTCATAATATCAAAAAAGGTGCAGAAGAAATGGTTGAA
GCGGCAGGCGATAAAATCAAAGATGGTGCATCTTGGTTAGGCGATAAAATCGGCGATGTGTGGGATTATGTACAACATCC
AGGGAAACTAGTAAATAAAGTAATGTCAGGTTTAAATATTAATTTTGGAGGCGGAGCTAACGCTACAGTAAAAATTGCTA
AAGGCGCGTACTCATTGCTCAAAAAGAAATTAGTAGACAAAGTAAAATCGTGGTTTGAAGATTTTGGTGGCGGAGGCGAT
GGAAGCTATCTATTTGACCATCCAATTTGGCAAAGGTTTGGGAGTTACACAGGTGGACTTAACTTTAATGGCGGTCGTCA
CTATGGTATCGACTTTGGTATGCCTACAGGAACGAACATTTATGCTGTTAAAGGCGGTATAGCTGATAAAGTATGGACTG
ATTACGGTGGCGGTAATTCTATACAAATTAAGACCGGTGCTAACGAATGGAACTGGTATATGCATTTATCTAAGCAATTA
GCAAGACAAGGCCAACGTATTAAAGCTGGTCAACTGATAGGGAAATCAGGTGCTACAGGTAATTTCGTTAGAGGAGCACA
CTTACATTTCCAATTGATGCAAGGGTCGCATCCAGGGAATGATACAGCTAAAGATCCAGAAAAATGGTTGAAGTCACTTA
AAGGTAGTGGCGTTCGAAGTGGTTCAGGTGTTAATAAGGCTGCATCTGCTTGGGCAGGCGATATACGTCGTGCAGCAAAA
CGAATGGGTGTTAATGTTACTTCGGCTGACGTAGGAAATATCATTAGCTTGATTCAACACGAATCAGGAGGAAATGCAGG
TATAACTCAATCTAGTTCGCTTAGAGACATCAACGTTTTACAGGGCAATCCAGCAAAAGGATTGCTTCAATATATCCCAC
AAACATTTAGACATTATGCTGTTAGAGGTCACAACAATATATATAGTGGTTACGATCAGTTATTAGCGTTCTTTAACAAC
AGATATTGGCGCTCACAGTTTAACCCAAGAGGTGGTTGGTCTCCAAGTGGTCCAAGAAGATATGCGAATGGTGGTTTGAT
TACAAAGCATCAACTTGCTGAAGTGGGTGAAGGAGATAAACAGGAGATGGTTATCCCTTTAACTAGACGTAAACGAGCAA
TTCAATTAACTGAACAGGTTATGCGCATCATCGGTATGGATGGCAAGCCAAATAACATCACTGTAAATAATGATACTTCT
ACAGTTGAAAAATTGTTGAAACAAATTGTTATGTTAAGTGATAAAGGAAATAAATTAACAGATGCGTTGATTCAAACTGT
TTCTTCTCAGGATAATAACTTAGGTTCTAATGATGCAATTAGAGGTTTAGAAAAAATATTGTCAAAACAAAGTGGGCATA
GAGCAAATGCAAATAATTATATGGGAGGTTTGACTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAGAGAATAAAGAAGAGACTGAAGAAAAACAAAGTGAACAAAAAGTCATTACAGGTACGGATTTAAGAAAACTTTTTGG
AAGCTAGAAAGGAGGTTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCAATCTTTTGTAAAAATCATAGATGGTTACAAGGAAGAAGTAATAACAGATTTTAATCAGCTTATATTTTTAGATGCA
AGGGCTGAAAGTCCAAACAC

Product: phage tail tape meausure protein

Products: NA

Alternate protein names: Staphylolytic enzyme ALE-1 [H]

Number of amino acids: Translated: 2066; Mature: 2066

Protein sequence:

>2066_residues
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Sequences:

>Translated_2066_residues
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TVEKLLKQIVMLSDKGNKLTDALIQTVSSQDNNLGSNDAIRGLEKILSKQSGHRANANNYMGGLTN

Specific function: Lyses staphylococcal cells by hydrolyzing the polyglycine interpeptide bridges of the peptidoglycan [H]

COG id: COG5283

COG function: function code S; Phage-related tail protein

Gene ontology:

Cell location: Secreted [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M23B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011055
- InterPro:   IPR016047
- InterPro:   IPR002886
- InterPro:   IPR003646
- InterPro:   IPR013667 [H]

Pfam domain/function: PF01551 Peptidase_M23; PF08460 SH3_5 [H]

EC number: =3.4.24.75 [H]

Molecular weight: Translated: 226067; Mature: 226067

Theoretical pI: Translated: 10.50; Mature: 10.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNEKVEGMTLELKLDHLGVQEGMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSMEKYQARIKG
CCCCCCCCEEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LNDRLKVQKKMYSQVEDELKQVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKLALDKSKEA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLKNSNQATTAQLKRASDAVQKQ
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SAKHKALVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNDKIESSYAKTNTKLKQTEKEFNDLNNTI
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKLASQADVMS
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKFSSIGDKMTSLGRTMTMGVSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQASSKDLKSM
HHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMPGVISAAEASGAEMATTATVM
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVSIEDTSAAI
HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHH
EVLSNSGLEGSQAGTALRASFIRLANPSKSTAKEMKKLGIHLSDAKGEFVGMGELIRQFQ
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCEEECCCCCEECHHHHHHHHH
DNMKGMTREQKLATVATIVGTEAASGFLALIEAGPDKINSYSKSLKNSNGESKKAADLMK
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
DNLKGALEQLGGAFESLAIEVGKDLTPMIRAGAEGLTKLVDGFTHLPGWVRKASVGLAIF
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCEEE
GASIGPAVLAGGLLIRAVGSAAKGYASLNRRIAENTILSNTNSKAMKSLGLQTLFLGSTT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHEEECCCC
GKTSKGFKGLAGAMLFNLKPINVLKNSAKLAILPFKLLKNGLGLAAKSLFAVSGGARFAG
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHH
VALKFLTGPIGATITAITIAYKVFKTAYDRVEWFRNGINGLGETIKFFGGKIIGGAVRKL
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
GEFKNYLGSIGKSFKEKFSKDMKDGYKSLSDDDLLKVGVNKFKGFMQTMGTASKKASDTV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
KVLGKGVSKETEKALEKYVHYSEENNRIMEKVRLNSGQITEDKAKKLLKIEADLSNNLIA
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
EIEKRNKKELEKTQELIDKYSAFDEQEKQNILTRTKEKNDLRIKKEQELNQKIKELKEKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LSDGQISENERKEIEKLENQRRDITVKELSKTEKEQERILVRMQRNRNAYSIDEASKAIK
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
EAEKARKARKKEVDKQYEDDVIAIKNNVNLSKSEKDKLLAIADQRHKDEVRKAKSKKDAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VDVVKKQNKDIDKEMDLSSGRVYKNTEKWWNGLKSWWSNFREDQKKKSDKYAKEQEETAR
HHHHHHHCCCCCHHCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RNRENIKKWFGNAWDGVKTKTGEAFSKMGRNANHFGGEMKKMWSGIKGIPSKLSSSWSSA
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
KSSVGYHTKAIANSTGKWFGKAWQSVKSTTGSIYNQTKQKYSDASDKAWAHSKSIWRGTS
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>Mature Secondary Structure
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