| Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007795 |
| Length | 2,821,361 |
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The map label for this gene is ebh
Identifier: 88195168
GI number: 88195168
Start: 1376091
End: 1404698
Strand: Reverse
Name: ebh
Synonym: SAOUHSC_01447
Alternate gene names: 88195168
Gene position: 1404698-1376091 (Counterclockwise)
Preceding gene: 88195169
Following gene: 88195166
Centisome position: 49.79
GC content: 35.9
Gene sequence:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ECM-binding protein homolog
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Protein sequence:
>9535_residues MNYRDKIQKFSIRKYTVGTFSTVIATLVFLGFNTSQAHAAETNQPASVVKQKQQSNNEQTENRESQVQNSQNSQNGQSLS ATHENEQPNISQANLVDQKVAQSSTTNDEQPASQNVNTKKDSATAATTQPDKEQSKHKQNESQSANKNGNDNRAAHVENH EANVVTASDSSDNGNVQHDRNELQAFFDANYHDYRFIDRENADSGTFNYVKGIFDKINTLLGSNDPINNKDLQLAYKELE QAVALIRTMPQRQQTSRRSNRIQTRSVESRAAEPRSVSDYQNANSSYYVENANDGSGYPVGTYINASSKGAPYNLPTTPW NTLKASDSKEIALMTAKQTGDGYQWVIKFNKGHAPHQNMIFWFALPADQVPVGRTDFVTVNSDGTNVQWSHGAGAGANKP LQQMWEYGVNDPHRSHDFKIRNRSGQVIYDWPTVHIYSLEDLSRASDYFSEAGATPATKAFGRQNFEYINGQKPAESPGV PKVYTFIGQGDASYTISFKTQGPTVNKLYYAAGGRALEYNQLFMYSQLYVESTQDHQQRLNGLRQVVNRTYRIGTTKRVE VSQGNVQTKKVLESTNLNIDDFVDDPLSYVKTPSNKVLGFYSNNANTNAFRPGGAQQLNEYQLSQLFTDQKLQEAARTRN PIRLMIGFDYPDAYGNSETLVPVNLTVLPEIQHNIKFFKNDDTQNIAEKPFSKQAGHPVFYVYAGNQGNASVNLGGSVTS IQPLRINLTSNENFTDKDWQITGIPRTLHIENSTNRPNNARERNIELVGNLLPGDYFGTIRFGRKEQLFEIRVKPHTPTI TTTAEQLRGTALQKVPVNISGIPLDPSALVYLVAPTNQTTNGGSEADQIPSGYTILATGTPDGVHNTITIRPQDYVVFIP PVGKQIRAVVYYNKVVASNMSNAVTILPDDIPPTINNPVGINAKYYRGDEVNFTMGVSDRHSGIKNTTITTLPNGWTSNL 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Specific function: Promotes bacterial attachment to both soluble and immobilized forms of fibronectin (Fn), in a dose-dependent and saturable manner
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Single-pass membrane protein (Potential)
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 49 FIVAR domains
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): EBH_STAA8 (Q2FYJ6)
Other databases:
- EMBL: CP000253 - RefSeq: YP_499969.1 - ProteinModelPortal: Q2FYJ6 - STRING: Q2FYJ6 - EnsemblBacteria: EBSTAT00000028962 - GeneID: 3920225 - GenomeReviews: CP000253_GR - KEGG: sao:SAOUHSC_01447 - eggNOG: NOG147868 - GeneTree: EBGT00050000023685 - HOGENOM: HBG693128 - OMA: NQDSGDD - ProtClustDB: CLSK903880 - BioCyc: SAUR93061:SAOUHSC_01447-MONOMER - GO: GO:0009405 - InterPro: IPR011439 - InterPro: IPR011490 - InterPro: IPR020840 - InterPro: IPR002988 - InterPro: IPR005877 - InterPro: IPR009063 - SMART: SM00844 - TIGRFAMs: TIGR01168
Pfam domain/function: PF07564 DUF1542; PF07554 FIVAR; PF01468 GA; PF04650 YSIRK_signal; SSF46997 Bac_Ig/alb_bind
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 1029933; Mature: 1029933
Theoretical pI: Translated: 6.21; Mature: 6.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
HASH(0xc8f9304)-;
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNYRDKIQKFSIRKYTVGTFSTVIATLVFLGFNTSQAHAAETNQPASVVKQKQQSNNEQT CCHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHH ENRESQVQNSQNSQNGQSLSATHENEQPNISQANLVDQKVAQSSTTNDEQPASQNVNTKK HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC DSATAATTQPDKEQSKHKQNESQSANKNGNDNRAAHVENHEANVVTASDSSDNGNVQHDR CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCH NELQAFFDANYHDYRFIDRENADSGTFNYVKGIFDKINTLLGSNDPINNKDLQLAYKELE HHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH QAVALIRTMPQRQQTSRRSNRIQTRSVESRAAEPRSVSDYQNANSSYYVENANDGSGYPV HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCE GTYINASSKGAPYNLPTTPWNTLKASDSKEIALMTAKQTGDGYQWVIKFNKGHAPHQNMI EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEE FWFALPADQVPVGRTDFVTVNSDGTNVQWSHGAGAGANKPLQQMWEYGVNDPHRSHDFKI EEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEE RNRSGQVIYDWPTVHIYSLEDLSRASDYFSEAGATPATKAFGRQNFEYINGQKPAESPGV 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