Definition Staphylococcus aureus RF122, complete genome.
Accession NC_007622
Length 2,742,531

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is vraE

Identifier: 82752281

GI number: 82752281

Start: 2731794

End: 2733674

Strand: Direct

Name: vraE

Synonym: SAB2579

Alternate gene names: 82752281

Gene position: 2731794-2733674 (Clockwise)

Preceding gene: 82752280

Following gene: 82752282

Centisome position: 99.61

GC content: 31.47

Gene sequence:

>1881_bases
ATGACATTTAACCATATCGTTTTCAAAAACTTACGCCAAAACTTAAAACATTATGCAATGTATTTATTTTCATTATTTTT
TAGTATCGTCTTATATTTCAGTTTTACAACCTTACAGTTTACTAAAGGTGTAAATAATGACGACTCGATGGCCATCATTA
AGAAAGGTGCTTTAGTCGGATCAATATTTTTATTTATCATTATTGTCATCTTTTTAATGTATGCCAATCATTTATTCGTG
AAACGTCGTACACGTGAATTTGCGCTATTTCAGTTGATTGGTTTAACACGACAAAACATTTTGAAAATGTTAGCACTTGA
ACAAATGATTGTATTTTTAATCACAGGTGTTGTCGGTGTATTATGTGGCATTGCAGGTGCACAATTATTGCTTTCCATTG
TATCTAAATTGATGTCGTTATCGATTAACTTATCGATACATTTCGAACCTATGGCCCTTGTTTTAACTATTTTAATGCTA
ATTATTGCGTATATACTGATTTTATTTCAAAGTAGTTTGTTTTTAAAAAGACGCAGTATCTTATCAATGATGAAAGACTC
AATTAAAACTGATGTTACAACTGCTAAAGTAACGACTGCAGAGGTTATTTCAGGCGTATTAGGTATTGCTATGATCGCAC
TAGGCTATTATATGGCGACAGAAATGTTTGGTACGTTCAAAGCACTAACTATGGCTATGACATCACCGTTTATCATTTTA
TTTTTAACGGTTGTAGGCGCCTATTTATTCTTCAGAAGTTCCGTGTCACTGATTTTTAAAACTTTGAAAAAATCTAAAAA
TGGACGCGTATCTATTACAGATGTTGTATTTACATCGTCTATTATGTACCGAATGAAGAAAAATGCCATGTCTTTAACTA
TCATTGCAATTATTTCTGCAGTTACAGTAACTGTATTGTGTTTTGCGGCATTATCTAAATCAAATACAGATCAAACCCTT
ACATCAATGGCACCAAATGAATTTAACGTGGTCGCCTCTCAAGATGCGCAACAATTTGAATCTAAACTAAGCCAACAACA
TATTACATTTACTAAAAATTATTATGAAACTATCACTGTAAATAATGTTAAAGATCAGGTTATTACTTTGGAAAATGGTA
GTGATTCAGGTCGCACGAATTCTATTTTAAGTGCAAATACAAAGTTAACTGGTAACAATGCCATCATTACAAATACAAAG
TCGCTGCCTAACGTGATTAATATCCTTTTAAACAAAGATTTAGTAGTAAAAGGAACTAAGAATGAAACTTTCCGTGTTAC
ACAAGAAGACAAAGGTAAGGTTTATCCTTTAAATCTAAGCTTCAACTCACCTGTCGTCGAAGTAAGTCCTGAAAAGTATC
AGCAGTTGAAAACACAAAATAATGTTCATACTTTTTATGGGTATGATATTAAACAAACATCACAAAAGGAAAAAGCTCAA
GCAATTGCAAAACAGTTTGGAGACAAAGTAATCACGTATGATGACATGAAAAAAGAGGTCGATGCTACTAACGGTATTCT
AATATTTGTTACATCATTTTTAGGATTAGCATTTTTAGTAGCAGCTGGATGTATTATTTATATTAAACAAATGGATGAAA
CTGAGGATGAACTAAGTAACTTCAGAATATTAAAACGCATAGGCTTTACGCATACAGATATGCTTAAGGGATTATTATTA
AAAATTACTTTCAACTTCGGTTTACCATTATTGATTGCTATATTACATGCAGTATTCGCCGCAATAGCATTTATGAAATT
GATGGGTAATATTTCCTTCATGCCGGTTATTATAGTAATTGTTGTATACACACTCATTTACATTGCTTTTGCTTTAATCG
CTTTTGTACATTCAAACAAATTGATTAAGAAAACCATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATGGCCAAATTCATACACAACTTTATCAGGAAGGACGTTCTAAACAGGCCTTTTATGAAGACATTGTACATCTTCAATC
AGTATTAGGTGGTGTCTCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACTTGTGATTAAAAGATGCTTCATTGAGATTTTGATTTTAAGCAATGCAGTATAACTATTAATTGATTTATAAAAAAGG
AGAGATTGAATCATGAAATT

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 626; Mature: 625

Protein sequence:

>626_residues
MTFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFV
KRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILML
IIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIIL
FLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTL
TSMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTK
SLPNVINILLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQ
AIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLL
KITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIVVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI

Sequences:

>Translated_626_residues
MTFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFV
KRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILML
IIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIIL
FLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTL
TSMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTK
SLPNVINILLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQ
AIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLL
KITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIVVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI
>Mature_625_residues
TFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFVK
RRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLI
IAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIILF
LTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTLT
SMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKS
LPNVINILLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQA
IAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLLK
ITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIVVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI

Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70023; Mature: 69892

Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH
SIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIIL
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
VTVTVLCFAALSKSNTDQTLTSMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITV
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEECCCEEEEEE
NNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNVINILLNKDLVVKGTK
CCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEECCCEECCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCEEEECCC
NETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQ
CCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHH
AIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSN
HHHHHHCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHH
FRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
VVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH
SIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIIL
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
VTVTVLCFAALSKSNTDQTLTSMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITV
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEECCCEEEEEE
NNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNVINILLNKDLVVKGTK
CCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEECCCEECCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCEEEECCC
NETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQ
CCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHH
AIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSN
HHHHHHCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHH
FRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
VVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]