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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 82750046

GI number: 82750046

Start: 334767

End: 336122

Strand: Direct

Name: mepA [H]

Synonym: SAB0284

Alternate gene names: 82750046

Gene position: 334767-336122 (Clockwise)

Preceding gene: 82750045

Following gene: 82750047

Centisome position: 12.21

GC content: 32.45

Gene sequence:

>1356_bases
ATGAAAGACGAACAATTATATTATTTTGAGAAATCGCCAGTATTTAAAGCGATGATGCATTTCTCATTGCCAATGATGAT
AGGGACTTTATTAAGCGTTATTTATGGCATATTAAATATTTACTTTATAGGATTTTTAGAAGATAGTCACATGATTTCTG
CTATCTCACTAACACTGCCAGTATTTGCTATCTTAATGGGATTGGGGAATTTATTTGACGTTGGTGCAGGAACTTATATT
TCACGTTTATTAGGTGCGAAAGACTATAGTAAGAGTAAATTTGTAAGTAGTTTCTCTATTTATGGTGGTATTGCACTAGG
ACTTATTGTAATTTTAGTTGCTTTACCATTCAGTGATCAAATCGCAGCAATTTTAGGGGCGAGAGGTGAAACGTTAGCTT
TAACAAGTAATTATTTGAAAGTAATGTTTTTAAGTGCACCTTTTGTAATTTTGTTCTTCATATTAGAACAATTTGCACGT
GCAATTGGGGCACCAATGATTTCTATGATTGGTATGTTAGCTAGTGTAAGCTTAAATATTATTTTAGATCCAATTTTAAT
TTTTGGTTTTGATTTAAACGTTGTTGGTGCAGCTTTGGGTACTGCAATCAGTAATGTTGCTGCTGCTCTGTTCTTTATCA
TTTATTTTATGAAAAATAGTGACGTTGTGTCAGTTAATATTAAACTTGCGAAACCTAATAAAGAAATGCTTTCTGAAATC
TTTAAAATAGGTATTCCTGCATTTTTAATGAGTATCTTAATGGGATTCACAGGATTAGTTTTAAATTTATTTTTAGCACA
TTATGGAAACTTCGCGATTGCAAGTTATGGTATCTCATTTAGACTTGTGCAATTTCCAGAACTTATTATCATGGGATTAT
GTGAAGGTGTTGTACCATTAATTGCATATAACTTTATGTCAAATAAAGGTCGTATGAAAGACGTTATCAAAGCAGTTATC
ATGTCTATCGGCGTTATCTTTGTTGTATGTATGATTGCTGTATTTACAATTGGACATCATATGGTCGGACTATTTACTAC
TGATCAAGCCATTGTTGAGATGGCGACATTTATTTTGAAAGTAACAATGACATCATTGTTATTAAATGGTATAGGTTTCT
TGTTTACTGGTATGCTTCAAGCAACTGGTCAAGGTCGCGGTGCTACAATTATGGCCATTTTACAAGGTGTGGTTATCATT
CCAGTACTATTTATTATGAATGCTTTGTTTGGACTAACAGGTGTCATGTGGTCATTATTAATTGCTGAGTCACTTTGTGC
TTTAGCAGCAATGTTAATCGTTTATTTATTACGTGATCGTTTGACAGTTGATACATCTGAATTAATAGAAGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCGTGACTGGTAGAAATCAGTCACTTTATCTTTAATGCTATAGTTAGATATCTAATTGTTAGCAAGCTAATTATTGAAA
AAGAAAAGGAGTATTGAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTTCGTACACTTCTGGCTGAGTATATTTCGGTCGGAAGTGTATTTTTCGAATAAAAAATAAATATATGATATGATTA
TGAAAAAAATAAAGTGAGAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 451; Mature: 451

Protein sequence:

>451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFDVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVALPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMISMIGMLASVSLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMSNKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMTSLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGVVII
PVLFIMNALFGLTGVMWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG

Sequences:

>Translated_451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFDVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVALPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMISMIGMLASVSLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMSNKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMTSLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGVVII
PVLFIMNALFGLTGVMWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
>Mature_451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFDVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVALPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMISMIGMLASVSLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMSNKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMTSLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGVVII
PVLFIMNALFGLTGVMWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48953; Mature: 48953

Theoretical pI: Translated: 7.04; Mature: 7.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
6.2 %Met     (Translated Protein)
6.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
6.2 %Met     (Mature Protein)
6.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLP
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VFAILMGLGNLFDVGAGTYISRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVALPFSDQ
HHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
IAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFARAIGAPMISMIGMLASVSLNI
HHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHH
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAYNFMSNKGRMKDVIKAVIMSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILK
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHH
VTMTSLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGVVIIPVLFIMNALFGLTGVMWSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLP
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VFAILMGLGNLFDVGAGTYISRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVALPFSDQ
HHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
IAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFARAIGAPMISMIGMLASVSLNI
HHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHH
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAYNFMSNKGRMKDVIKAVIMSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILK
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHH
VTMTSLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGVVIIPVLFIMNALFGLTGVMWSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA