| Definition | Staphylococcus aureus RF122, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007622 |
| Length | 2,742,531 |
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The map label for this gene is 82749911
Identifier: 82749911
GI number: 82749911
Start: 174453
End: 176138
Strand: Direct
Name: 82749911
Synonym: SAB0141
Alternate gene names: NA
Gene position: 174453-176138 (Clockwise)
Preceding gene: 82749910
Following gene: 82749912
Centisome position: 6.36
GC content: 23.31
Gene sequence:
>1686_bases ATGAATAATTCAATATTTTATACCTATTTAAAATTTAATCTTAGATATTTTATCCGTAGAAAATTTGAAATTGTAAAAAG GTCGCGACTTAATGTTACTACAAAAATACTGTTTTTAATTAAATTGATTTTTTCGTCACTATTATTATTTATTTCAACTA TTATGTTAGCTGACTATTTCAGTGATTATATTGATTTTATAGAATATTATTTCTATGCGAGTATGTTTATTTACATTGTA TTTATACCATTAATACCTAGAACTAAATTATTGATCAATCCAATGGATAAACAGCTGTTATATAGATCTAGTTTGAGAGA AGTTGACATTTTTAACTTGATATATGCTTCAGACGTTTTAAAAAAGTTTGTTGGATATTTTAATTTGTTGATAGTTGGTA TGGCTATTAGTTTATATCATATTAGTCCTTTTATATTTAAACTCAAGGTTTTTTGTGCACTAATACACTTTTCAACAATC TCTTATGTAATTCAAATTATTTTTATAAATATTAAAGTCATAAGCACAAAAAAATTATTTTCTTATCACTATTGTGTTTT TAATTTTATGATGGGAAGCATTGTTTCTGTTATTGGATTTGTCGTCTCATTTCTTTTAGTAAATTTATTAATAAAGCCCT TTTTAGTTTTTTCGACATATGTAATAAAAAGTAAGAAAACTTTTGAATGGTATAGTTATTTTCAGGATATAAAGAGCGAA GTCATTATTATTAATGAAAAAGTTATGCAATTATTAGATTATATATCACCTCACACTATTTTTATGAGATTAAACTTTGT GAATATATCATTTGTGATTATTACAATAGCTTTATTTATAACGTTATATTATTTTAATAAAATAGGGTTTTGGTATAGAA AAGAAGATATCTATCTATCTTTAACAAATATTAATTTTTCGTTGCCAATTTCAATAAAAGCTATAACAACGATACAGCTA AAACACTGGATAAGTAACAAAGAAGAAGTTAATTTACATAAACCTTTCTTCTATATTAGTTATTCAATATGGTTCTTTTT AGGGTGTTTAATCTATTTTTCACAGATGGCATATAATCAGTTAGCTAATGCAGTTATTTTTATTTTGATATTAAACACTA TAACTCGTGATAGTTTTTCTGCGGGGACGGATTTTTTTACTAAATCATTACGTTTTGATTCAGATAGAAAAAGTATCGGT TTGTATAGGATGTCAAACACTGATTTTAAACAAATTTACGATTCTAAATTATCTCTAATTCGCTTTATTGGTTTTAAAGA AACAATACTTGCTATTATTTTATTAGCAATATTTTTAAATCAAGACATATATTTATATATAATTGGATTTGAAATAATAA TCATCAATACAGTAATAATTCCTAATTTATCATTATTACCTTCGTATTTATCTCCACATTTCAATCATCAACATTACAGT GAATTAGAGTCTTTTGAAGAACAAATTTTTCTTGAAGATACTGTTTTTGATAAAGTTAAGAATTTTTTATCATCATCATA TTTTTTAATTCTATTTGTAGGTTACTTATCTCAACGTAATTATATTGACATAATGATTTTTATAATTATTTTCAACATTT TAGCCTTAATACTTGTTTCGTTGTTTATTAGGTTTTCTAAACAAAAAATAACAAAGTCTTGGAGAAAGAGGGATTTATAT TTATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGGGGCGTACGAAAAACAGCTGCTTGGTAAAAGATAATCTAATTCTTTATAAGAGAGGCTTTCTTTTTTTGGAAAGCCTC TTTTTAAAAAAGGAGATTCA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTAAATACAAAAAAAATTTATTTTTAATATATTGGTGTTAATAATAGGGGGATTATTGGGATGCTTGGTTTATTACTT ATTAAATATTGATTTAGGTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 561; Mature: 561
Protein sequence:
>561_residues MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYFSDYIDFIEYYFYASMFIYIV FIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVLKKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFKLKVFCALIHFSTI SYVIQIIFINIKVISTKKLFSYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKSE VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFITLYYFNKIGFWYRKEDIYLSLTNINFSLPISIKAITTIQL KHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQLANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIG LYRMSNTDFKQIYDSKLSLIRFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVSLFIRFSKQKITKSWRKRDLY L
Sequences:
>Translated_561_residues MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYFSDYIDFIEYYFYASMFIYIV FIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVLKKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFKLKVFCALIHFSTI SYVIQIIFINIKVISTKKLFSYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKSE VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFITLYYFNKIGFWYRKEDIYLSLTNINFSLPISIKAITTIQL KHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQLANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIG LYRMSNTDFKQIYDSKLSLIRFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVSLFIRFSKQKITKSWRKRDLY L >Mature_561_residues MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYFSDYIDFIEYYFYASMFIYIV FIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVLKKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFKLKVFCALIHFSTI SYVIQIIFINIKVISTKKLFSYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKSE VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFITLYYFNKIGFWYRKEDIYLSLTNINFSLPISIKAITTIQL KHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQLANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIG LYRMSNTDFKQIYDSKLSLIRFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVSLFIRFSKQKITKSWRKRDLY L
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 66732; Mature: 66732
Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYF CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SDYIDFIEYYFYASMFIYIVFIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH KKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFKLKVFCALIHFSTISYVIQIIFINIKVISTKKLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEHHHHH SYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFITLYYFNKIGFWYRKEDIYLS EEEECHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEE LTNINFSLPISIKAITTIQLKHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQ EEECEEECCEEEEEEEEEEHHHHHCCCCCCEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIGLYRMSNTDFKQIYDSKLSLI HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH RFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS HHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHEEHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHH ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFIRFSKQKITKSWRKRDLYL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYF CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SDYIDFIEYYFYASMFIYIVFIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH KKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFKLKVFCALIHFSTISYVIQIIFINIKVISTKKLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEHHHHH SYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFITLYYFNKIGFWYRKEDIYLS EEEECHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEE LTNINFSLPISIKAITTIQLKHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQ EEECEEECCEEEEEEEEEEHHHHHCCCCCCEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIGLYRMSNTDFKQIYDSKLSLI HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH RFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS HHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHEEHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHH ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFIRFSKQKITKSWRKRDLYL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA