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The map label for this gene is 82543888

Identifier: 82543888

GI number: 82543888

Start: 1360604

End: 1363723

Strand: Reverse

Name: 82543888

Synonym: SBO_1384

Alternate gene names: NA

Gene position: 1363723-1360604 (Counterclockwise)

Preceding gene: 82543889

Following gene: 82543877

Centisome position: 30.17

GC content: 32.79

Gene sequence:

>3120_bases
ATGATTGGACAATTTTTAAGTGCAACAGAGATTTTAGCAAAGAACTATGTTCGTAATAAAATGGTTAAAAATCCATTTTA
TTCGAATTTAAAATGGAATTTTATTGAAAAAAACATCATAAGATTAACATCCTCACCGGTTAAATCAGTACTTTGCATAT
CAGCTTTTTCATTTGTACTACTTTATGTTGGATATTTAAACGAATTATTTATAAAAAATAATCTTTTACATTATTTCCCG
TTTAGGCATTCATTAACCGAATGGCAAACAACCATTTTAAGTGGCCAATTGACAATTATTGGTATTGTATACCCCCTTGT
TATAGGTTTAGTAAGTGTCTTATTCCAAAAAAAGGCAGATAGAAAAATAGCCCAAACTGCTTATCAGCGTTACTCAGGAT
TCATGCTTGCTGGACTCAGCGGGCTTTTCTTATCAGGATTTATACTTCTCAGTGTACTAATTAAAACTGTCTTTGGAAGT
TATCTTTATGGTATAGCTTGTCTAATCAGCATATTATGGCTTTTGATAAACATAGTTCTTTCTATTTGGTTCTTTATCGT
GAGTCTTGAAATTCTTGATGATGTAAAACGGCAAATAATTATAAAGCGATACATTGCCTTCGAAATAGTAATGCCCCATA
TTTGTAACAAAATCTCAGCCAAGCTTAGGTTATACCCTATCTATCAAAAACATAACTATTCAAATTTAGAAATCACGCAA
GCCGATTACAAAGGAGAATACATATCTGTGGCTAGCAGTTATTCTAAGGAAGATGAGTTAAGTTTATATCACCGTCCTTT
TCAACTTACTCTTAATCTTATTAATTACCAACTAAAAAAGAAGAATCATTTTGCGTCATTTGTCATTGGTGATAATCGTA
CAAAAGAAACAGAATCCACGGGTAAGATACTTTTTAGCGTTAAAAATATCAAACCAGACAGCTTATTAATAAAAATACTT
AAGCAATGTTTTTATAGGGCTCCGATTAAAGGAGGAGATTTTTCCGTAAGTCTTACAATGCAGGCTATAACAGCAGATAC
GTATATGTATCTGCGGGATTCTGATCTCATTAGTTTTGACAATGCTATCTCTGCATTAATTAATAACTTTAATAATCTCT
GCGATTTGTATTTTTTTCAAGATGATAATACCAACAATAACTTCTTACTGATCACTACAGAATTATTTGAACGGAGTTTT
CAATATGAGTTTTCAGATGAAGTTTATAAAATATCAAATAATTCCATGGATAAAATTAATCTTTCTGAAAGATTTTTTGA
ATTATGTCTTTGGAGCGGAGTGCGTATTATCAATAATAGAAAACATCTTATCAGCAATGAACTTTGTATCTATATGGGAA
TTACTCGTTCACAATGGTCAATATTAACAGAATGGTTCCGAAACAACCAATCACTCTTAAATGCCTCGCTTCGTTCACGT
TATAATCGTATATTAAGAACCTATATCACTGTTTGGGAGCAATATCAAGAAAGCATAAACTTTCGTTTCTGCAATACAGA
GAATTCAGATTTATTTGAATTATTTTGCAAAACGCAACTACAAGAACTTCCATCGATGATTATTGATGCAACACAGACTC
GCGATCCTTCTACTATTGATACAGCCGTCGATCTTATTAACCGATGGCAGCACTCAATGAATATTGACAGCCATTCGGTA
GAAAAATACAGTTACAAAGGCCAGCTTTTTAACCCGGGTTTTTTCATATCCAAAAAACTAAACTTCAATTCAGACAGAGA
GTGGTTCAATATTGCCATCATAAATGCGTTGACTGACATGCGTATATGCACATGTCTTTATCTGACATCAAGAATCAATA
CTTCTGACAAACTAATGACACATTACATTAAACTTATTTTAGAGGGTAAACTTATTGACCAAACCGGTGGATATGAAACT
CCCACTGAAGAAATTGATAATGCAAGCCAACTAATCAAGATATTAATTAGAATCTGCCTGTGGACATGGTCTGAAAATAT
GGAGCACAATGGGTGGATGAATAGTTTAGCAAGGCGTTTACGTGACTATGATAAAACAGACATGGTGATGGGCAGAGTTT
ACAGTAATGTTTTTGACTGTGGATTTATTGATATGGAACAATCATGGGTTCAGCTATTATTAATTTTTTCTAAAAAGAAC
GATAGCGTATCAAAAGAAATAAAAGAAGCAATAGAAAACAACTATATAACATATCGTGAGAAGCAACGACTCATTGGAGT
ATTATCAAAAATTTGTAACTCCATCGAATACACTAAAATCAAGCTGACTTTAACATTGGACGATCTCCAAACAAAAAAAG
AAAACTTAAGAAAGTTGCTTCAAGAGCATATTAACATGCTAAAGAAAGATCTTGATATGAGACTTCAGGATGCTGCCATA
GATGTACATCGACTAGATAGCACTGCACGTAAAACATCAGAACATCTTCGTAAACGCATCAAGAAAACGCTCCCTCTTTC
ACTTTTCAAATCTATTGATTTTAAGCAGGCTAGCGATTGTTTCACAAAACATAAGATATCTATTAAGATAGATAAAGAAC
CGTATGCCGAAGGAATAGAATCCATCCCTTATATCAATGAAGGTGATATTCAAGCAGACTTAATTCTCAAGGACATCCAG
AGAATAATACTTTCAAATTTATTTAGCACTGGCTGTTCGCAACATACCGTAATAGAAGATTTCAATATGTTGATTGATCA
CATAAAATCATCTGCTGACTTGGCTGGCAAACTGGTTCTTGTGATGAGTAAAGAGATCTTTCAGCAATATAATCGTATGC
TTTTCGATAATCCCAACCTCAGAGAACTAATGAGAAAAAATGATGATGGCTCTATGAACATAACTACTGAATCCGGTACC
CGTAAGGTTTACTTCTTACCATTTGTTAATCAACCATTTTCTCTTGTGGTAAAGGATAACTACTTCACTAAATTAATTAT
TAGAGAATATGATAATAATAAGTTAGTAAATGTCACTTCAGAGAATATCAAAAGTGACTCAGATAAATTCAAGCTAACTC
TTAACTATGAGTTGAATATAGTATTTGAAGGAAACGCTGATTTAAAAATAGCTCACTCGCAAAGAGTGACATCAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAGTATAATCTTCACAGTCCATCCCGTCCAAGGGAATATGACTCAATAGTAAAAGTTCCAGTTTAGTTAGTAGACCCAC
ACTTTATAGAAGAGTAATTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATCTTTGACGGCGCTCCTTAGAGTGCCGTTCGTTTATTAACTAATGCTAAAAATCATTATATAGAGAAAGTCATGTTTA
AATCTTAGAGAATACAACCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1039; Mature: 1039

Protein sequence:

>1039_residues
MIGQFLSATEILAKNYVRNKMVKNPFYSNLKWNFIEKNIIRLTSSPVKSVLCISAFSFVLLYVGYLNELFIKNNLLHYFP
FRHSLTEWQTTILSGQLTIIGIVYPLVIGLVSVLFQKKADRKIAQTAYQRYSGFMLAGLSGLFLSGFILLSVLIKTVFGS
YLYGIACLISILWLLINIVLSIWFFIVSLEILDDVKRQIIIKRYIAFEIVMPHICNKISAKLRLYPIYQKHNYSNLEITQ
ADYKGEYISVASSYSKEDELSLYHRPFQLTLNLINYQLKKKNHFASFVIGDNRTKETESTGKILFSVKNIKPDSLLIKIL
KQCFYRAPIKGGDFSVSLTMQAITADTYMYLRDSDLISFDNAISALINNFNNLCDLYFFQDDNTNNNFLLITTELFERSF
QYEFSDEVYKISNNSMDKINLSERFFELCLWSGVRIINNRKHLISNELCIYMGITRSQWSILTEWFRNNQSLLNASLRSR
YNRILRTYITVWEQYQESINFRFCNTENSDLFELFCKTQLQELPSMIIDATQTRDPSTIDTAVDLINRWQHSMNIDSHSV
EKYSYKGQLFNPGFFISKKLNFNSDREWFNIAIINALTDMRICTCLYLTSRINTSDKLMTHYIKLILEGKLIDQTGGYET
PTEEIDNASQLIKILIRICLWTWSENMEHNGWMNSLARRLRDYDKTDMVMGRVYSNVFDCGFIDMEQSWVQLLLIFSKKN
DSVSKEIKEAIENNYITYREKQRLIGVLSKICNSIEYTKIKLTLTLDDLQTKKENLRKLLQEHINMLKKDLDMRLQDAAI
DVHRLDSTARKTSEHLRKRIKKTLPLSLFKSIDFKQASDCFTKHKISIKIDKEPYAEGIESIPYINEGDIQADLILKDIQ
RIILSNLFSTGCSQHTVIEDFNMLIDHIKSSADLAGKLVLVMSKEIFQQYNRMLFDNPNLRELMRKNDDGSMNITTESGT
RKVYFLPFVNQPFSLVVKDNYFTKLIIREYDNNKLVNVTSENIKSDSDKFKLTLNYELNIVFEGNADLKIAHSQRVTSE

Sequences:

>Translated_1039_residues
MIGQFLSATEILAKNYVRNKMVKNPFYSNLKWNFIEKNIIRLTSSPVKSVLCISAFSFVLLYVGYLNELFIKNNLLHYFP
FRHSLTEWQTTILSGQLTIIGIVYPLVIGLVSVLFQKKADRKIAQTAYQRYSGFMLAGLSGLFLSGFILLSVLIKTVFGS
YLYGIACLISILWLLINIVLSIWFFIVSLEILDDVKRQIIIKRYIAFEIVMPHICNKISAKLRLYPIYQKHNYSNLEITQ
ADYKGEYISVASSYSKEDELSLYHRPFQLTLNLINYQLKKKNHFASFVIGDNRTKETESTGKILFSVKNIKPDSLLIKIL
KQCFYRAPIKGGDFSVSLTMQAITADTYMYLRDSDLISFDNAISALINNFNNLCDLYFFQDDNTNNNFLLITTELFERSF
QYEFSDEVYKISNNSMDKINLSERFFELCLWSGVRIINNRKHLISNELCIYMGITRSQWSILTEWFRNNQSLLNASLRSR
YNRILRTYITVWEQYQESINFRFCNTENSDLFELFCKTQLQELPSMIIDATQTRDPSTIDTAVDLINRWQHSMNIDSHSV
EKYSYKGQLFNPGFFISKKLNFNSDREWFNIAIINALTDMRICTCLYLTSRINTSDKLMTHYIKLILEGKLIDQTGGYET
PTEEIDNASQLIKILIRICLWTWSENMEHNGWMNSLARRLRDYDKTDMVMGRVYSNVFDCGFIDMEQSWVQLLLIFSKKN
DSVSKEIKEAIENNYITYREKQRLIGVLSKICNSIEYTKIKLTLTLDDLQTKKENLRKLLQEHINMLKKDLDMRLQDAAI
DVHRLDSTARKTSEHLRKRIKKTLPLSLFKSIDFKQASDCFTKHKISIKIDKEPYAEGIESIPYINEGDIQADLILKDIQ
RIILSNLFSTGCSQHTVIEDFNMLIDHIKSSADLAGKLVLVMSKEIFQQYNRMLFDNPNLRELMRKNDDGSMNITTESGT
RKVYFLPFVNQPFSLVVKDNYFTKLIIREYDNNKLVNVTSENIKSDSDKFKLTLNYELNIVFEGNADLKIAHSQRVTSE
>Mature_1039_residues
MIGQFLSATEILAKNYVRNKMVKNPFYSNLKWNFIEKNIIRLTSSPVKSVLCISAFSFVLLYVGYLNELFIKNNLLHYFP
FRHSLTEWQTTILSGQLTIIGIVYPLVIGLVSVLFQKKADRKIAQTAYQRYSGFMLAGLSGLFLSGFILLSVLIKTVFGS
YLYGIACLISILWLLINIVLSIWFFIVSLEILDDVKRQIIIKRYIAFEIVMPHICNKISAKLRLYPIYQKHNYSNLEITQ
ADYKGEYISVASSYSKEDELSLYHRPFQLTLNLINYQLKKKNHFASFVIGDNRTKETESTGKILFSVKNIKPDSLLIKIL
KQCFYRAPIKGGDFSVSLTMQAITADTYMYLRDSDLISFDNAISALINNFNNLCDLYFFQDDNTNNNFLLITTELFERSF
QYEFSDEVYKISNNSMDKINLSERFFELCLWSGVRIINNRKHLISNELCIYMGITRSQWSILTEWFRNNQSLLNASLRSR
YNRILRTYITVWEQYQESINFRFCNTENSDLFELFCKTQLQELPSMIIDATQTRDPSTIDTAVDLINRWQHSMNIDSHSV
EKYSYKGQLFNPGFFISKKLNFNSDREWFNIAIINALTDMRICTCLYLTSRINTSDKLMTHYIKLILEGKLIDQTGGYET
PTEEIDNASQLIKILIRICLWTWSENMEHNGWMNSLARRLRDYDKTDMVMGRVYSNVFDCGFIDMEQSWVQLLLIFSKKN
DSVSKEIKEAIENNYITYREKQRLIGVLSKICNSIEYTKIKLTLTLDDLQTKKENLRKLLQEHINMLKKDLDMRLQDAAI
DVHRLDSTARKTSEHLRKRIKKTLPLSLFKSIDFKQASDCFTKHKISIKIDKEPYAEGIESIPYINEGDIQADLILKDIQ
RIILSNLFSTGCSQHTVIEDFNMLIDHIKSSADLAGKLVLVMSKEIFQQYNRMLFDNPNLRELMRKNDDGSMNITTESGT
RKVYFLPFVNQPFSLVVKDNYFTKLIIREYDNNKLVNVTSENIKSDSDKFKLTLNYELNIVFEGNADLKIAHSQRVTSE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 121136; Mature: 121136

Theoretical pI: Translated: 8.66; Mature: 8.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIGQFLSATEILAKNYVRNKMVKNPFYSNLKWNFIEKNIIRLTSSPVKSVLCISAFSFVL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LYVGYLNELFIKNNLLHYFPFRHSLTEWQTTILSGQLTIIGIVYPLVIGLVSVLFQKKAD
HHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKIAQTAYQRYSGFMLAGLSGLFLSGFILLSVLIKTVFGSYLYGIACLISILWLLINIVL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIWFFIVSLEILDDVKRQIIIKRYIAFEIVMPHICNKISAKLRLYPIYQKHNYSNLEITQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEE
ADYKGEYISVASSYSKEDELSLYHRPFQLTLNLINYQLKKKNHFASFVIGDNRTKETEST
CCCCCCEEEEHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCC
GKILFSVKNIKPDSLLIKILKQCFYRAPIKGGDFSVSLTMQAITADTYMYLRDSDLISFD
CEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCHHH
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HHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCC
LSERFFELCLWSGVRIINNRKHLISNELCIYMGITRSQWSILTEWFRNNQSLLNASLRSR
HHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
YNRILRTYITVWEQYQESINFRFCNTENSDLFELFCKTQLQELPSMIIDATQTRDPSTID
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
TAVDLINRWQHSMNIDSHSVEKYSYKGQLFNPGFFISKKLNFNSDREWFNIAIINALTDM
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCEECCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEHHHHHHH
RICTCLYLTSRINTSDKLMTHYIKLILEGKLIDQTGGYETPTEEIDNASQLIKILIRICL
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WTWSENMEHNGWMNSLARRLRDYDKTDMVMGRVYSNVFDCGFIDMEQSWVQLLLIFSKKN
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
DSVSKEIKEAIENNYITYREKQRLIGVLSKICNSIEYTKIKLTLTLDDLQTKKENLRKLL
CHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
QEHINMLKKDLDMRLQDAAIDVHRLDSTARKTSEHLRKRIKKTLPLSLFKSIDFKQASDC
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHH
FTKHKISIKIDKEPYAEGIESIPYINEGDIQADLILKDIQRIILSNLFSTGCSQHTVIED
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FNMLIDHIKSSADLAGKLVLVMSKEIFQQYNRMLFDNPNLRELMRKNDDGSMNITTESGT
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EEEEEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEEEECCCCEEEEEEHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEE
VFEGNADLKIAHSQRVTSE
EEECCCCEEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIGQFLSATEILAKNYVRNKMVKNPFYSNLKWNFIEKNIIRLTSSPVKSVLCISAFSFVL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LYVGYLNELFIKNNLLHYFPFRHSLTEWQTTILSGQLTIIGIVYPLVIGLVSVLFQKKAD
HHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKIAQTAYQRYSGFMLAGLSGLFLSGFILLSVLIKTVFGSYLYGIACLISILWLLINIVL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIWFFIVSLEILDDVKRQIIIKRYIAFEIVMPHICNKISAKLRLYPIYQKHNYSNLEITQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEE
ADYKGEYISVASSYSKEDELSLYHRPFQLTLNLINYQLKKKNHFASFVIGDNRTKETEST
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GKILFSVKNIKPDSLLIKILKQCFYRAPIKGGDFSVSLTMQAITADTYMYLRDSDLISFD
CEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCHHH
NAISALINNFNNLCDLYFFQDDNTNNNFLLITTELFERSFQYEFSDEVYKISNNSMDKIN
HHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCC
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HHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
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TAVDLINRWQHSMNIDSHSVEKYSYKGQLFNPGFFISKKLNFNSDREWFNIAIINALTDM
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCEECCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEHHHHHHH
RICTCLYLTSRINTSDKLMTHYIKLILEGKLIDQTGGYETPTEEIDNASQLIKILIRICL
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
WTWSENMEHNGWMNSLARRLRDYDKTDMVMGRVYSNVFDCGFIDMEQSWVQLLLIFSKKN
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
DSVSKEIKEAIENNYITYREKQRLIGVLSKICNSIEYTKIKLTLTLDDLQTKKENLRKLL
CHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
QEHINMLKKDLDMRLQDAAIDVHRLDSTARKTSEHLRKRIKKTLPLSLFKSIDFKQASDC
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHH
FTKHKISIKIDKEPYAEGIESIPYINEGDIQADLILKDIQRIILSNLFSTGCSQHTVIED
HHHEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
FNMLIDHIKSSADLAGKLVLVMSKEIFQQYNRMLFDNPNLRELMRKNDDGSMNITTESGT
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEECCCC
RKVYFLPFVNQPFSLVVKDNYFTKLIIREYDNNKLVNVTSENIKSDSDKFKLTLNYELNI
EEEEEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEEEECCCCEEEEEEHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEE
VFEGNADLKIAHSQRVTSE
EEECCCCEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA