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The map label for this gene is 78779680

Identifier: 78779680

GI number: 78779680

Start: 1203744

End: 1205078

Strand: Direct

Name: 78779680

Synonym: PMT9312_1297

Alternate gene names: NA

Gene position: 1203744-1205078 (Clockwise)

Preceding gene: 78779678

Following gene: 78779681

Centisome position: 70.43

GC content: 25.02

Gene sequence:

>1335_bases
GTGTTAAAAGATTTTGACTATAGAAATAAAATGTTAACTAATAATTTTCTTAAATATGCAAAAAAAAATTATCTGAATAT
TGGTAAATATTCTTTTCTTATAGGAGTATTCCTTTTACCCACTGCATTCGTAATATCTGCGTTATTTTTACTATTTTCTT
TAGTTTTATCTTTTTCCAAAAGTAAACTTTGTTTTTTAAAAGATAAATTGAATTTATTAGTAATCATTGCGATAGGAATG
ATCCTATTTAGTTCACTTATAAATAATACAATTTTAATTCCTAGGGTGCTTCCAAATTTAGATAATTCATTTGTATTGCT
AAATTTATTCAATTGGATTCCTCCTTTATTAGGCTTTATTGGATTCCAAAGCTATGTAAAAACTGAAGATGATAGATTAA
TTTTTTCTAAATATTTATTATCTGGAACAGTTCCATTTATAGTAAGTTGTCTTTTTCAACTATTCTTTGACTTACATGGA
CCTTTTCAAATTTTTAATGGTTTAATTATATGGTTTCAAAAGCCTCTCGAAGTTACTGGAGGGGTTTCAGGATTATTTAG
TAATAGAAATTATGCAGGTATTTGGCTTTCAATAAATCTTCCATTTGGAATATACCTCATAAAGAAAAATATAAAATATA
AAATTAAAAGTCTTTCCATTCTATTCATCACTTTTCTGATTAGCTATTTAATAATCAATACAAATTCTAAAAATGCTCTG
CTCAGTATGATTTCAACCATAATAGTTTTCTTTGGAATAAAGACTTTTTTTATATTTTCAATTGGTATAATTTTCTTTTT
TGTCATTCTTAACTTACTGCCAACACTAAATATATTAGAGTTCATACCTGAAACATTTTTAAGAATTAAAAGATTCACAT
TCTTCATTAATACACCAAGATTAGTAATTTTCAGATCAGCTTTGAATTTTATATTTCAAAGACCTTTTTTAGGTTGGGGA
TCAGGAACATTCGCTTTAATTTATCTAGCAAAAGACAATATGTGGAATCCACCTTTTGTATTTCATAAATTTCAACATAC
TCATAATTTATTTTTGGAGATGGCTTTTAATTTTGGCATCCCAATTTCAATATTATTAACTTCAATAGCTTTTTATATTT
TTTATAAATCTCTTAAAGTGTTTTACTCTAATGATAAAAAAGATGATTATCAAAATCTAAATAAAGCATGGATTTCAGCA
GGTATAGTTATTTTCTTAATCCATTTAAGTGATATGACTTTTTATGATGGTAGAGTCAGTATGTTGATTTGCATCTTATT
CTCTGGCTTAAGGTGTATTTCATTAACAAAAAATAATCTGAAAATTTGTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTAACAAGCCCAAAAACCTCTAGCTTCCTTAGCTCAGCTGGATAGAGCAACTGCCTTCTAAGCAGTGGGCCGCAGGTTCG
AATCCTGCAGGAAGCGTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAACTGGTGCATTTTTATGCTTAATAATTTCTGGAGGAATCATAAAAAGAATATTCATCCAAGTGTAATAATAGAAGAA
TCAGCAATAATAGACAAAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 444; Mature: 444

Protein sequence:

>444_residues
MLKDFDYRNKMLTNNFLKYAKKNYLNIGKYSFLIGVFLLPTAFVISALFLLFSLVLSFSKSKLCFLKDKLNLLVIIAIGM
ILFSSLINNTILIPRVLPNLDNSFVLLNLFNWIPPLLGFIGFQSYVKTEDDRLIFSKYLLSGTVPFIVSCLFQLFFDLHG
PFQIFNGLIIWFQKPLEVTGGVSGLFSNRNYAGIWLSINLPFGIYLIKKNIKYKIKSLSILFITFLISYLIINTNSKNAL
LSMISTIIVFFGIKTFFIFSIGIIFFFVILNLLPTLNILEFIPETFLRIKRFTFFINTPRLVIFRSALNFIFQRPFLGWG
SGTFALIYLAKDNMWNPPFVFHKFQHTHNLFLEMAFNFGIPISILLTSIAFYIFYKSLKVFYSNDKKDDYQNLNKAWISA
GIVIFLIHLSDMTFYDGRVSMLICILFSGLRCISLTKNNLKICN

Sequences:

>Translated_444_residues
MLKDFDYRNKMLTNNFLKYAKKNYLNIGKYSFLIGVFLLPTAFVISALFLLFSLVLSFSKSKLCFLKDKLNLLVIIAIGM
ILFSSLINNTILIPRVLPNLDNSFVLLNLFNWIPPLLGFIGFQSYVKTEDDRLIFSKYLLSGTVPFIVSCLFQLFFDLHG
PFQIFNGLIIWFQKPLEVTGGVSGLFSNRNYAGIWLSINLPFGIYLIKKNIKYKIKSLSILFITFLISYLIINTNSKNAL
LSMISTIIVFFGIKTFFIFSIGIIFFFVILNLLPTLNILEFIPETFLRIKRFTFFINTPRLVIFRSALNFIFQRPFLGWG
SGTFALIYLAKDNMWNPPFVFHKFQHTHNLFLEMAFNFGIPISILLTSIAFYIFYKSLKVFYSNDKKDDYQNLNKAWISA
GIVIFLIHLSDMTFYDGRVSMLICILFSGLRCISLTKNNLKICN
>Mature_444_residues
MLKDFDYRNKMLTNNFLKYAKKNYLNIGKYSFLIGVFLLPTAFVISALFLLFSLVLSFSKSKLCFLKDKLNLLVIIAIGM
ILFSSLINNTILIPRVLPNLDNSFVLLNLFNWIPPLLGFIGFQSYVKTEDDRLIFSKYLLSGTVPFIVSCLFQLFFDLHG
PFQIFNGLIIWFQKPLEVTGGVSGLFSNRNYAGIWLSINLPFGIYLIKKNIKYKIKSLSILFITFLISYLIINTNSKNAL
LSMISTIIVFFGIKTFFIFSIGIIFFFVILNLLPTLNILEFIPETFLRIKRFTFFINTPRLVIFRSALNFIFQRPFLGWG
SGTFALIYLAKDNMWNPPFVFHKFQHTHNLFLEMAFNFGIPISILLTSIAFYIFYKSLKVFYSNDKKDDYQNLNKAWISA
GIVIFLIHLSDMTFYDGRVSMLICILFSGLRCISLTKNNLKICN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51378; Mature: 51378

Theoretical pI: Translated: 10.30; Mature: 10.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKDFDYRNKMLTNNFLKYAKKNYLNIGKYSFLIGVFLLPTAFVISALFLLFSLVLSFSK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SKLCFLKDKLNLLVIIAIGMILFSSLINNTILIPRVLPNLDNSFVLLNLFNWIPPLLGFI
CCEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHH
GFQSYVKTEDDRLIFSKYLLSGTVPFIVSCLFQLFFDLHGPFQIFNGLIIWFQKPLEVTG
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEEEECCHHHCC
GVSGLFSNRNYAGIWLSINLPFGIYLIKKNIKYKIKSLSILFITFLISYLIINTNSKNAL
CCHHHHCCCCEEEEEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LSMISTIIVFFGIKTFFIFSIGIIFFFVILNLLPTLNILEFIPETFLRIKRFTFFINTPR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCH
LVIFRSALNFIFQRPFLGWGSGTFALIYLAKDNMWNPPFVFHKFQHTHNLFLEMAFNFGI
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PISILLTSIAFYIFYKSLKVFYSNDKKDDYQNLNKAWISAGIVIFLIHLSDMTFYDGRVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEECCHHH
MLICILFSGLRCISLTKNNLKICN
HHHHHHHCCCCEEEECCCCCEECC
>Mature Secondary Structure
MLKDFDYRNKMLTNNFLKYAKKNYLNIGKYSFLIGVFLLPTAFVISALFLLFSLVLSFSK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SKLCFLKDKLNLLVIIAIGMILFSSLINNTILIPRVLPNLDNSFVLLNLFNWIPPLLGFI
CCEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHH
GFQSYVKTEDDRLIFSKYLLSGTVPFIVSCLFQLFFDLHGPFQIFNGLIIWFQKPLEVTG
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEEEECCHHHCC
GVSGLFSNRNYAGIWLSINLPFGIYLIKKNIKYKIKSLSILFITFLISYLIINTNSKNAL
CCHHHHCCCCEEEEEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LSMISTIIVFFGIKTFFIFSIGIIFFFVILNLLPTLNILEFIPETFLRIKRFTFFINTPR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCH
LVIFRSALNFIFQRPFLGWGSGTFALIYLAKDNMWNPPFVFHKFQHTHNLFLEMAFNFGI
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PISILLTSIAFYIFYKSLKVFYSNDKKDDYQNLNKAWISAGIVIFLIHLSDMTFYDGRVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEECCHHH
MLICILFSGLRCISLTKNNLKICN
HHHHHHHCCCCEEEECCCCCEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA