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Definition Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome, complete genome.
Accession NC_007514
Length 2,572,079

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The map label for this gene is 78189813

Identifier: 78189813

GI number: 78189813

Start: 2365057

End: 2367453

Strand: Reverse

Name: 78189813

Synonym: Cag_1857

Alternate gene names: NA

Gene position: 2367453-2365057 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78189814

Following gene: 78189812

Centisome position: 92.04

GC content: 46.35

Gene sequence:

>2397_bases
ATGAAAAAACAGATTTTGTTGTTCTCAGCCATTTTTAGCGGCTATACCTTCTTGCTCCTTTTGCTTTACTTTCCGTTAGT
CTTTCAATCGCAAGTGCTTACAGCCCCCGATTCGCTTATCCCACAAGCCTCATCCATGGCGCTTGATAAACTCCAAGCTG
AAAGCGGAAGCTATCCGTTGTGGCAGCCGTGGATTTTTTCAGGAATGCCAACCGTTGAAGCCTTTAGCTATCTCAGCGGG
CTTTACTATCCCAATTTGTTGTTCAATCTTTTCCATACTGATGGTGTGCTTCTCCAGCTTCTTCATCTTGCTTTTGCGGG
TGCAGGTACCTTCCTTTTGTTGCGCGATTTACGTCTCTCCTTGCTTGCCTCCATTGCTGGGGGATTGATCTTTCTCTGTA
ATCCCTTTTTTAGCGCCATGCTTGTGCATGGGCATGGTAGTCAGCTTATGACCACTGCATATATGCCGTGGATGCTATGG
GCAGCAATGCGCTTTATGGATCGTGGTGGCGTTGCTGAAGCGGGCATTTTTGCACTGATTGCAGGCTTGCAATTGCAGCG
AGCGCATGTGCAAATGGCTTACTATTCGTGGCTTATGATGCTGCTTTTGGTGGTTGTGTTGTTTGCAACACGTCGTTGGG
TTGTGCCACAAGCTGTGCAACGGGGTGGGCTTTTCGTAATTGCTTCAGTAACGGCAATTGCTATGGCTGCCGCAATTTAT
TTACCAGCCTCGCACTATGCTGAAGCCTCCGTGCGTGGTGCGGCAGTAGGTGGTGGTGGCGCTGCGTGGGAATATGCAAC
GCTTTGGTCGCTTCATCCACTTGAAGCAATAACCTTCCTTTTCCCGGGATTTTTTGGTTTTGGTGGTGTTACCTATTGGG
GCTTTATGCCCTTTACCGACTTTCCACATTACGCAGGTCTTGTGGTGTTACTGCTTGCTCTCATGGGGCTAATTATGCGC
CGTCGTGAACCTATGACGTGGCTTTTTGCGGGCGTTGGCTTCCTTGCTCTTTTGCTTGCTTTCGGACGATTTTTTAGCCC
AATCTTCGACCTCTTTTATTCGTTTGCACCGCTTTTTAGCCGCTTTCGTGTTCCTTCAATGGCGCTCATTATGCTCTATT
TTGCGCTTGCTGCACTTGCGGCTATTGGTTTGCATGAATTGCTTGAGCGTAAACCACAGCGCTTGCTCAAAGTGCTTCGA
CTTAGCAGTATAGTTGTAGCGCTTCTATTGTTGATTTTTTTAGCCTTAGAAGAGGTTGCTGAACATGCAGCACGTTCACT
TTTTCCGCTCCCGCAAGTTGATAGCTTTGAGTTAGTCTCTGCCATTAATTCTATACGATGGGAACAACTTTCAAGCAGTG
TTATTGTAACTCTTACTCTTTTACTGCTTGTAGCAGGTGTTTTGTGGCTTTTACTGAGTGGCAAAATTTCTTCAAAATAT
TCGGCATCGCTCCTTGTGTTGCTTGCTGTGGGTGATCTGCTGTGGGTTACGGTTCAAGTTATTTATCCATCAGCTCACTC
ACTTCGTACTCCGCTTTTTGCCGATAAGCAACAAGTTGCACCAGCATTTCAGCATGATGATGTTACCCGTTTTCTTGCAA
GTCAGCCCAAACCCTTTCGTATCTATCCTGCGGGTAACTTCTTTACAGAAAATAAGTTTGCCCTTTTTGGAATTGAATCG
GTGGGTGGTTACCATCCTGCCAAGCTAAAAAGCTACGATGATCTATTGCAGGTGAGCGATAATCTTGCAAGTATTGCCCT
CTTGCGTATGCTTAATGTTCACTACATCGTTAGCCCCGCACCAATTGAGCATCCCACACTTACATTGGCAACAAGCGGTA
CCTTGCAGCGTGCGAATGGTTCAGCTCAAGCCTTTGTTTATCGCTTGCAAGAGCCAGCACCACGCGCATGGTTTGTCAGC
CGTGTTGTGCCATTTTCCAACAAGCAAGAGCTATACAGCCATTTGCTTGATGATACTGCTTCGCTTTCAGTGGCTTACGT
TGAAGCGCAGCAATGGCAAGGCGCACAACGTTTTTCAGAAGGCACCATTCAATCCGTTACCACACAACCCGAATCCATTA
AGCTTAATGTTAACGCACCAAATAGTTCCTTTTTAGTGCTCAGTGAAATCTACTATCCCAACGGTTGGCAGGTAATGCTT
GATGGTAAAGCAACTTCCATGCTTCGGGTTAATGGCGTGTTGCGAGGGGTTAACGTACCGGCAGGTAACCATGCTATCCA
CTTCAGTTACAATCGCCATTTATTTGAGCAAAGCCAATGGATTGCTCTTGCGGGATTTATTATTGCACTGCTGATGATTG
CGGGTGGCTTGCTTTGGAAGCATCTTCTTCTTTCAGGTGAAAAACGGGTTGTAAGAGGTTTTCATACAATAAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTCTGCCTTGTTAAATCCCCCAACTATGCAAAACCGTAAAATGTTGCTCTTCATAACTCAACCTGTTCCACTACTTTA
AAGCAGCAATCAATCACACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCCTCATACTTTTTTCTCATGCTTGCTACAACGTGCGAGTGGTGCAAACAAAGGAGAGGAGAAAAAAATTGTTTCAAAAA
ATAAAAACTCATCAATAGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 798; Mature: 798

Protein sequence:

>798_residues
MKKQILLFSAIFSGYTFLLLLLYFPLVFQSQVLTAPDSLIPQASSMALDKLQAESGSYPLWQPWIFSGMPTVEAFSYLSG
LYYPNLLFNLFHTDGVLLQLLHLAFAGAGTFLLLRDLRLSLLASIAGGLIFLCNPFFSAMLVHGHGSQLMTTAYMPWMLW
AAMRFMDRGGVAEAGIFALIAGLQLQRAHVQMAYYSWLMMLLLVVVLFATRRWVVPQAVQRGGLFVIASVTAIAMAAAIY
LPASHYAEASVRGAAVGGGGAAWEYATLWSLHPLEAITFLFPGFFGFGGVTYWGFMPFTDFPHYAGLVVLLLALMGLIMR
RREPMTWLFAGVGFLALLLAFGRFFSPIFDLFYSFAPLFSRFRVPSMALIMLYFALAALAAIGLHELLERKPQRLLKVLR
LSSIVVALLLLIFLALEEVAEHAARSLFPLPQVDSFELVSAINSIRWEQLSSSVIVTLTLLLLVAGVLWLLLSGKISSKY
SASLLVLLAVGDLLWVTVQVIYPSAHSLRTPLFADKQQVAPAFQHDDVTRFLASQPKPFRIYPAGNFFTENKFALFGIES
VGGYHPAKLKSYDDLLQVSDNLASIALLRMLNVHYIVSPAPIEHPTLTLATSGTLQRANGSAQAFVYRLQEPAPRAWFVS
RVVPFSNKQELYSHLLDDTASLSVAYVEAQQWQGAQRFSEGTIQSVTTQPESIKLNVNAPNSSFLVLSEIYYPNGWQVML
DGKATSMLRVNGVLRGVNVPAGNHAIHFSYNRHLFEQSQWIALAGFIIALLMIAGGLLWKHLLLSGEKRVVRGFHTIR

Sequences:

>Translated_798_residues
MKKQILLFSAIFSGYTFLLLLLYFPLVFQSQVLTAPDSLIPQASSMALDKLQAESGSYPLWQPWIFSGMPTVEAFSYLSG
LYYPNLLFNLFHTDGVLLQLLHLAFAGAGTFLLLRDLRLSLLASIAGGLIFLCNPFFSAMLVHGHGSQLMTTAYMPWMLW
AAMRFMDRGGVAEAGIFALIAGLQLQRAHVQMAYYSWLMMLLLVVVLFATRRWVVPQAVQRGGLFVIASVTAIAMAAAIY
LPASHYAEASVRGAAVGGGGAAWEYATLWSLHPLEAITFLFPGFFGFGGVTYWGFMPFTDFPHYAGLVVLLLALMGLIMR
RREPMTWLFAGVGFLALLLAFGRFFSPIFDLFYSFAPLFSRFRVPSMALIMLYFALAALAAIGLHELLERKPQRLLKVLR
LSSIVVALLLLIFLALEEVAEHAARSLFPLPQVDSFELVSAINSIRWEQLSSSVIVTLTLLLLVAGVLWLLLSGKISSKY
SASLLVLLAVGDLLWVTVQVIYPSAHSLRTPLFADKQQVAPAFQHDDVTRFLASQPKPFRIYPAGNFFTENKFALFGIES
VGGYHPAKLKSYDDLLQVSDNLASIALLRMLNVHYIVSPAPIEHPTLTLATSGTLQRANGSAQAFVYRLQEPAPRAWFVS
RVVPFSNKQELYSHLLDDTASLSVAYVEAQQWQGAQRFSEGTIQSVTTQPESIKLNVNAPNSSFLVLSEIYYPNGWQVML
DGKATSMLRVNGVLRGVNVPAGNHAIHFSYNRHLFEQSQWIALAGFIIALLMIAGGLLWKHLLLSGEKRVVRGFHTIR
>Mature_798_residues
MKKQILLFSAIFSGYTFLLLLLYFPLVFQSQVLTAPDSLIPQASSMALDKLQAESGSYPLWQPWIFSGMPTVEAFSYLSG
LYYPNLLFNLFHTDGVLLQLLHLAFAGAGTFLLLRDLRLSLLASIAGGLIFLCNPFFSAMLVHGHGSQLMTTAYMPWMLW
AAMRFMDRGGVAEAGIFALIAGLQLQRAHVQMAYYSWLMMLLLVVVLFATRRWVVPQAVQRGGLFVIASVTAIAMAAAIY
LPASHYAEASVRGAAVGGGGAAWEYATLWSLHPLEAITFLFPGFFGFGGVTYWGFMPFTDFPHYAGLVVLLLALMGLIMR
RREPMTWLFAGVGFLALLLAFGRFFSPIFDLFYSFAPLFSRFRVPSMALIMLYFALAALAAIGLHELLERKPQRLLKVLR
LSSIVVALLLLIFLALEEVAEHAARSLFPLPQVDSFELVSAINSIRWEQLSSSVIVTLTLLLLVAGVLWLLLSGKISSKY
SASLLVLLAVGDLLWVTVQVIYPSAHSLRTPLFADKQQVAPAFQHDDVTRFLASQPKPFRIYPAGNFFTENKFALFGIES
VGGYHPAKLKSYDDLLQVSDNLASIALLRMLNVHYIVSPAPIEHPTLTLATSGTLQRANGSAQAFVYRLQEPAPRAWFVS
RVVPFSNKQELYSHLLDDTASLSVAYVEAQQWQGAQRFSEGTIQSVTTQPESIKLNVNAPNSSFLVLSEIYYPNGWQVML
DGKATSMLRVNGVLRGVNVPAGNHAIHFSYNRHLFEQSQWIALAGFIIALLMIAGGLLWKHLLLSGEKRVVRGFHTIR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88428; Mature: 88428

Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHCCCHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHCCCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA