| Definition | Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007514 |
| Length | 2,572,079 |
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The map label for this gene is 78189573
Identifier: 78189573
GI number: 78189573
Start: 2110253
End: 2114875
Strand: Reverse
Name: 78189573
Synonym: Cag_1615
Alternate gene names: NA
Gene position: 2114875-2110253 (Counterclockwise)
Preceding gene: 78189574
Following gene: 78189572
Centisome position: 82.22
GC content: 47.24
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ACCATGCCCTCTCCTCTTTACAACAAACGCATTCTCCTTGGCGTTAGTGGCGGCATTGCTGCTTATAAAATTCCCCATCT TGTACGGCTGCTGAAAAAAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1540; Mature: 1540
Protein sequence:
>1540_residues MQSFKHISLKALAGLLLSVLLVALMALVLLNSGSVDRAARALAMQLFQKELHGRLEIDELHLTFPNHVTLLHPRVYAPNE REPVVEAARMTARFHFLALLQPDIKKLAFQSLEAQRLKVRLVQNEQGSLNIERAFASRYPDTTKTGIEEYFCKQLSLKQA SFSYSFIKDGKEIPLARANNINAQLRSFTAGKALVKGEIQEFQSNIASHALVVQKMQGRFFFSDKRSEVLDLQTRIGNSH AILSATLEGVSLFKPSLLQQVAQSNAFVAIEEIDLHSNDVKRLFPSLPLLEGIYQVKATAKQQNGTLELREAQLVYRKSK LALQGTIQHPFESNKLQYNLQCDSSKVSSELLTALITNKEDQQLVTSLKSIGDITLAGKLSGNLSALQADVQSLTNVGMV GFKGAIERQPNNSFAAHGNVALNALKPHLILGMADVKSQLNATGTMELLVEPNALPEVALALQLQNSFWQHLNVTKGTLS FRHKKQLYEGALSLSNGSENLAVQGTVNLNSAQPTYDLTGTTYKLNVGQLLQSKNFSTDLNSRFTLQGEGFDLRQLNLQS SVVCAPSVINDVVLPNGTAATLSIAQQGTASRVKVTSDFFDVTAEGHYTFEDLTALGWMALSGISHEVARLNIWGETAQL NPPANMLTPQPFTVTYQLALHNIAPLLSIIAPLQQIAMQGTAQGKAEHNGGAYTIAGTIDLNNLIVEEEFAAKRIHLQGS LRGNSNGILEAQGRGAIAALRVGKQKVRNTNVTAAYVPTTLTSSIDVDVADVVQRVSTSFAMKQQGSGYLLDVQQLNVQD REGSWQANNNLPIVLDKEVLRFNNFTLMRGAQKAVLQGELSNNRASAFTCTLSSLQMNELQHFMLNAGLEKLQGIVSATL HISGVPGAKQSSISVRADNVAYDDLMIGIVQGSARHSNNLLHFELQSEAPAMVNGIQSAQRSNALLSTIEGSGTIPLELK YYPFKLRVNEQQNVHATFRSDNLSARFLEYLLPFFSAAEGTIPTLCTIEGSAAKPLISLHSRLQDTRITVKPTHVSYRLD GDIYATPQALELRNITLSDNNNGKGSIRGFVHLEKLQPSRLELAASCNNLLFYNKKDQQDDTSFGSIVGSTRNFTLTGSL RSPIVEGEVQIDRADYSLYSAGANESAQYVGIDNTISFVARNPKPKAPKAKELKSGGSKEFYYSLIDILTIHNLRISSPM PLKYTTIFDRIRGEELETTLSNLSLVVNKNSQRYRMFGSVQVTSGTYRFSNASFELQPGGSITWNNVDMRSGVLENLYGR KYINALNPQSGERDDVHLLLAMTGTLNEPQVAMGYYLNDQTQPYASSTTIGTETSKVDPNAELNVISMLLSRQWYSKPGD GGTQENVALTSASFSAGTGILSSRISRVIQTIGGLESFNVNVGMDKKGELSGLDLYFAVNVPGTDGKVRVSGSGSANDPR TANASTAYGSNQKVEYRVTPKVYLEASHSSGQNSGISSSSSTLQKPTDTWGVSLSYKERFHHWDQFWKKLLPFSSDKASD KTPNKVPDKASNKKENKPNE
Sequences:
>Translated_1540_residues MQSFKHISLKALAGLLLSVLLVALMALVLLNSGSVDRAARALAMQLFQKELHGRLEIDELHLTFPNHVTLLHPRVYAPNE REPVVEAARMTARFHFLALLQPDIKKLAFQSLEAQRLKVRLVQNEQGSLNIERAFASRYPDTTKTGIEEYFCKQLSLKQA SFSYSFIKDGKEIPLARANNINAQLRSFTAGKALVKGEIQEFQSNIASHALVVQKMQGRFFFSDKRSEVLDLQTRIGNSH AILSATLEGVSLFKPSLLQQVAQSNAFVAIEEIDLHSNDVKRLFPSLPLLEGIYQVKATAKQQNGTLELREAQLVYRKSK LALQGTIQHPFESNKLQYNLQCDSSKVSSELLTALITNKEDQQLVTSLKSIGDITLAGKLSGNLSALQADVQSLTNVGMV GFKGAIERQPNNSFAAHGNVALNALKPHLILGMADVKSQLNATGTMELLVEPNALPEVALALQLQNSFWQHLNVTKGTLS FRHKKQLYEGALSLSNGSENLAVQGTVNLNSAQPTYDLTGTTYKLNVGQLLQSKNFSTDLNSRFTLQGEGFDLRQLNLQS SVVCAPSVINDVVLPNGTAATLSIAQQGTASRVKVTSDFFDVTAEGHYTFEDLTALGWMALSGISHEVARLNIWGETAQL NPPANMLTPQPFTVTYQLALHNIAPLLSIIAPLQQIAMQGTAQGKAEHNGGAYTIAGTIDLNNLIVEEEFAAKRIHLQGS LRGNSNGILEAQGRGAIAALRVGKQKVRNTNVTAAYVPTTLTSSIDVDVADVVQRVSTSFAMKQQGSGYLLDVQQLNVQD REGSWQANNNLPIVLDKEVLRFNNFTLMRGAQKAVLQGELSNNRASAFTCTLSSLQMNELQHFMLNAGLEKLQGIVSATL HISGVPGAKQSSISVRADNVAYDDLMIGIVQGSARHSNNLLHFELQSEAPAMVNGIQSAQRSNALLSTIEGSGTIPLELK YYPFKLRVNEQQNVHATFRSDNLSARFLEYLLPFFSAAEGTIPTLCTIEGSAAKPLISLHSRLQDTRITVKPTHVSYRLD GDIYATPQALELRNITLSDNNNGKGSIRGFVHLEKLQPSRLELAASCNNLLFYNKKDQQDDTSFGSIVGSTRNFTLTGSL RSPIVEGEVQIDRADYSLYSAGANESAQYVGIDNTISFVARNPKPKAPKAKELKSGGSKEFYYSLIDILTIHNLRISSPM PLKYTTIFDRIRGEELETTLSNLSLVVNKNSQRYRMFGSVQVTSGTYRFSNASFELQPGGSITWNNVDMRSGVLENLYGR KYINALNPQSGERDDVHLLLAMTGTLNEPQVAMGYYLNDQTQPYASSTTIGTETSKVDPNAELNVISMLLSRQWYSKPGD GGTQENVALTSASFSAGTGILSSRISRVIQTIGGLESFNVNVGMDKKGELSGLDLYFAVNVPGTDGKVRVSGSGSANDPR TANASTAYGSNQKVEYRVTPKVYLEASHSSGQNSGISSSSSTLQKPTDTWGVSLSYKERFHHWDQFWKKLLPFSSDKASD KTPNKVPDKASNKKENKPNE >Mature_1540_residues MQSFKHISLKALAGLLLSVLLVALMALVLLNSGSVDRAARALAMQLFQKELHGRLEIDELHLTFPNHVTLLHPRVYAPNE REPVVEAARMTARFHFLALLQPDIKKLAFQSLEAQRLKVRLVQNEQGSLNIERAFASRYPDTTKTGIEEYFCKQLSLKQA SFSYSFIKDGKEIPLARANNINAQLRSFTAGKALVKGEIQEFQSNIASHALVVQKMQGRFFFSDKRSEVLDLQTRIGNSH AILSATLEGVSLFKPSLLQQVAQSNAFVAIEEIDLHSNDVKRLFPSLPLLEGIYQVKATAKQQNGTLELREAQLVYRKSK LALQGTIQHPFESNKLQYNLQCDSSKVSSELLTALITNKEDQQLVTSLKSIGDITLAGKLSGNLSALQADVQSLTNVGMV GFKGAIERQPNNSFAAHGNVALNALKPHLILGMADVKSQLNATGTMELLVEPNALPEVALALQLQNSFWQHLNVTKGTLS FRHKKQLYEGALSLSNGSENLAVQGTVNLNSAQPTYDLTGTTYKLNVGQLLQSKNFSTDLNSRFTLQGEGFDLRQLNLQS SVVCAPSVINDVVLPNGTAATLSIAQQGTASRVKVTSDFFDVTAEGHYTFEDLTALGWMALSGISHEVARLNIWGETAQL NPPANMLTPQPFTVTYQLALHNIAPLLSIIAPLQQIAMQGTAQGKAEHNGGAYTIAGTIDLNNLIVEEEFAAKRIHLQGS LRGNSNGILEAQGRGAIAALRVGKQKVRNTNVTAAYVPTTLTSSIDVDVADVVQRVSTSFAMKQQGSGYLLDVQQLNVQD REGSWQANNNLPIVLDKEVLRFNNFTLMRGAQKAVLQGELSNNRASAFTCTLSSLQMNELQHFMLNAGLEKLQGIVSATL HISGVPGAKQSSISVRADNVAYDDLMIGIVQGSARHSNNLLHFELQSEAPAMVNGIQSAQRSNALLSTIEGSGTIPLELK YYPFKLRVNEQQNVHATFRSDNLSARFLEYLLPFFSAAEGTIPTLCTIEGSAAKPLISLHSRLQDTRITVKPTHVSYRLD GDIYATPQALELRNITLSDNNNGKGSIRGFVHLEKLQPSRLELAASCNNLLFYNKKDQQDDTSFGSIVGSTRNFTLTGSL RSPIVEGEVQIDRADYSLYSAGANESAQYVGIDNTISFVARNPKPKAPKAKELKSGGSKEFYYSLIDILTIHNLRISSPM PLKYTTIFDRIRGEELETTLSNLSLVVNKNSQRYRMFGSVQVTSGTYRFSNASFELQPGGSITWNNVDMRSGVLENLYGR KYINALNPQSGERDDVHLLLAMTGTLNEPQVAMGYYLNDQTQPYASSTTIGTETSKVDPNAELNVISMLLSRQWYSKPGD GGTQENVALTSASFSAGTGILSSRISRVIQTIGGLESFNVNVGMDKKGELSGLDLYFAVNVPGTDGKVRVSGSGSANDPR TANASTAYGSNQKVEYRVTPKVYLEASHSSGQNSGISSSSSTLQKPTDTWGVSLSYKERFHHWDQFWKKLLPFSSDKASD KTPNKVPDKASNKKENKPNE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 168484; Mature: 168484
Theoretical pI: Translated: 8.96; Mature: 8.96
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
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PDB accession: NA
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Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
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Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA