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The map label for this gene is 78189191

Identifier: 78189191

GI number: 78189191

Start: 1624902

End: 1627139

Strand: Reverse

Name: 78189191

Synonym: Cag_1224

Alternate gene names: NA

Gene position: 1627139-1624902 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78189194

Following gene: 78189188

Centisome position: 63.26

GC content: 41.24

Gene sequence:

>2238_bases
ATGACAACTCCCGACCCACAAGTGAAACCAAGCACTTTACCCAATGACCCGCTCACGCTGCTTGAGGTAGCCAACCACTC
TTCGGAGCGTTTAGCGGTGCAACACACAGCGTTTATTGCGGCATGTGTGTATGTGCTGATTATTGTGTTTGGTACGACTG
ACCTTGATTTGCTGATTGGTAAAGGTGTACGCTTGCCTTTTGTAGATGTTGAAGTGCCGATTGTTGGTTTTTTTGCTTTT
GTGCCATTTATCCTTGTGCTGGTGCATTTTAACCTGCTTTTACAGCTTCAACTGCTTTCGCGTAAATTGTTTGCTTTTGA
TGCAACGGTACCTCAGGATGATGGCATTGGCGGGTTGCGCGATCGCTTGCACATTTTTGCCTTTACCTATTACCTTGCTG
GTAATCCAAGCCGTTTGGTAAAGCCATTTCTTGCGATAATGGTTTCTATTACCTTGGTGTTGCTGCCATTGTTTGTGCTC
TTTGCTATGCAACTACAGTTTTTAGCATATCAAGATGAAGTGATTACGTGGATGCAACGTTTTGCGCTATGGTTGGATAT
TGCTTTAATCAATATTTTTTTGCCAACCATGTTGCATCCAAAGGATGATTGGAAAAGCTATTGGCGTAATGTGATTGCTT
GCTATGTTCCTCACCGAAGAGTATGGCTTTCGTTTCTGCTATTATATGTTGGAACTAACATTTGTTTATTTGCTTCTAAA
AAAGAAATCCTTTTGATAGGGATAGCCCTTCTTGTTCTCTCGTTGCTGTTACTACCAATACTTCGCGGATGGAAAGCAAC
GCACAAGGTTCAAAAAATAATTATACCAATACTCATTATTGTTACTTTTGCAATTATAGCGCTTTTGTTTTTAGTGGAAG
TTAGAGATTGGATAGAAATTACAATAACATCATTTATAAGTACAGAAACTATTCGTGAAAAGGTATTTCCGTTAAGCTTC
ATTCTTTATGCTCTCATTATCGTATTAACAGTTTTATGGCAACAGAGCGCACCACGTGGTAGCTTTGCTTTAGTAGTAAC
ATTGTTTCTTGGAACACTATTTCCATTAGCGTTTATGGTTGATGGAGAACATCTTGAAAAAATTATTGCAAAAGGTGAAA
ATGCAACGTTTTTGTCTAATGTACTTCAGGATAAACGTCGCCTTAACTTGAGCGAACAACATCTGTTTGCAAAAGCACTA
AAGCCAGAAATTATTACGTTAATTAGTGATGGCAAATGGAAAGAGGCATTACCTCAAATTGAACCTATTAACTTACAAGG
GCGTCATTTACGCCATGCAGAATTAAACCAAGCAATGTTACTTGGCGCTGATTTACGATTCGCTGACTTGCAAGGCGCTT
ACTTATCCGACGCTGACCTGCAAGGCGCTTACTTATCCGACGCTGACCTGCAAGGAGCTCACTTACGACAAGCTGAGCTG
CAGGGTGCTCACTTACGACAAGCTAACCTGCAGGGTGCTTACTTACGACAAGCTGACCTGCAAGACGCTAACTTATCATA
CACTAACCTGCAAGGCGCTGACTTCATCGGCGCTGACCTGCAAGGCGCTGATTTACGATTCGCTCACTTGCAAGGCGCTA
ACTTATTCGGCGCTCACCTGCAAGGCGCTTACTTATTCGTCGCTCACTTGCAAGGCGCTTATTTATCTGGTGCTCACTTG
CAAGGCGCTGACTTATCTGCTGCTCACTTGCAAGGCGCTGACTTATTTGGCGCTAATCTTTATGCTGCAGATATTCGTAG
AGCAAACACCACGCTTGTTGATGCACAAAACATACGCTTAGAACCTCTTAGCGAAAAAGAAGCAACTGAATTACGTACAA
CACTTAAGCCATTAATAAAAGATAATGAGGACTATAACGAGGTTGCTGAACGTATAAAAAAAGCAACAGCGCCACATGGT
GAAATTCCATATTTTGAATCTATTCTTGCAGAAAAGAATACGCCACTTCGCTATAAAAAATGCTATAATGCAGAAAACTC
TGCTGAACGTCGTGCATTTACAAAACAACTGCATCCATATCTTGTATCACTTGCATCTCAATCTCCTGAAATAGCACGAG
GTATTATTCAGCAAATTCCAATTAGTGAGCCAAACACATCTTCACGCAAAGGATTAGCCGCAGAACTTGCAAAGCATCTG
AACGATCCAAAGTGCAAAGGGTTATATGAATTACGTGATGATGAAAAAGAAGAGCTACGAAATTGGAAGGAGGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAGGAGGGGATTCTTTACCAAACGTTAGTAACAAGCATTTTGCATAAGTATGTTACCGGTAAAATGGTTGAATTGCACT
GAAGTAAACCTTGCACTCAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGGTGAAGAAATTAGTCGTTGGGTAATGGAGTTTCAACAGCAAAAAAGCATCAGCGTGCCGTAGTAGTGTTGTGTCAAG
TTCTTTCTGTCATGTTGCAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 745; Mature: 744

Protein sequence:

>745_residues
MTTPDPQVKPSTLPNDPLTLLEVANHSSERLAVQHTAFIAACVYVLIIVFGTTDLDLLIGKGVRLPFVDVEVPIVGFFAF
VPFILVLVHFNLLLQLQLLSRKLFAFDATVPQDDGIGGLRDRLHIFAFTYYLAGNPSRLVKPFLAIMVSITLVLLPLFVL
FAMQLQFLAYQDEVITWMQRFALWLDIALINIFLPTMLHPKDDWKSYWRNVIACYVPHRRVWLSFLLLYVGTNICLFASK
KEILLIGIALLVLSLLLLPILRGWKATHKVQKIIIPILIIVTFAIIALLFLVEVRDWIEITITSFISTETIREKVFPLSF
ILYALIIVLTVLWQQSAPRGSFALVVTLFLGTLFPLAFMVDGEHLEKIIAKGENATFLSNVLQDKRRLNLSEQHLFAKAL
KPEIITLISDGKWKEALPQIEPINLQGRHLRHAELNQAMLLGADLRFADLQGAYLSDADLQGAYLSDADLQGAHLRQAEL
QGAHLRQANLQGAYLRQADLQDANLSYTNLQGADFIGADLQGADLRFAHLQGANLFGAHLQGAYLFVAHLQGAYLSGAHL
QGADLSAAHLQGADLFGANLYAADIRRANTTLVDAQNIRLEPLSEKEATELRTTLKPLIKDNEDYNEVAERIKKATAPHG
EIPYFESILAEKNTPLRYKKCYNAENSAERRAFTKQLHPYLVSLASQSPEIARGIIQQIPISEPNTSSRKGLAAELAKHL
NDPKCKGLYELRDDEKEELRNWKEE

Sequences:

>Translated_745_residues
MTTPDPQVKPSTLPNDPLTLLEVANHSSERLAVQHTAFIAACVYVLIIVFGTTDLDLLIGKGVRLPFVDVEVPIVGFFAF
VPFILVLVHFNLLLQLQLLSRKLFAFDATVPQDDGIGGLRDRLHIFAFTYYLAGNPSRLVKPFLAIMVSITLVLLPLFVL
FAMQLQFLAYQDEVITWMQRFALWLDIALINIFLPTMLHPKDDWKSYWRNVIACYVPHRRVWLSFLLLYVGTNICLFASK
KEILLIGIALLVLSLLLLPILRGWKATHKVQKIIIPILIIVTFAIIALLFLVEVRDWIEITITSFISTETIREKVFPLSF
ILYALIIVLTVLWQQSAPRGSFALVVTLFLGTLFPLAFMVDGEHLEKIIAKGENATFLSNVLQDKRRLNLSEQHLFAKAL
KPEIITLISDGKWKEALPQIEPINLQGRHLRHAELNQAMLLGADLRFADLQGAYLSDADLQGAYLSDADLQGAHLRQAEL
QGAHLRQANLQGAYLRQADLQDANLSYTNLQGADFIGADLQGADLRFAHLQGANLFGAHLQGAYLFVAHLQGAYLSGAHL
QGADLSAAHLQGADLFGANLYAADIRRANTTLVDAQNIRLEPLSEKEATELRTTLKPLIKDNEDYNEVAERIKKATAPHG
EIPYFESILAEKNTPLRYKKCYNAENSAERRAFTKQLHPYLVSLASQSPEIARGIIQQIPISEPNTSSRKGLAAELAKHL
NDPKCKGLYELRDDEKEELRNWKEE
>Mature_744_residues
TTPDPQVKPSTLPNDPLTLLEVANHSSERLAVQHTAFIAACVYVLIIVFGTTDLDLLIGKGVRLPFVDVEVPIVGFFAFV
PFILVLVHFNLLLQLQLLSRKLFAFDATVPQDDGIGGLRDRLHIFAFTYYLAGNPSRLVKPFLAIMVSITLVLLPLFVLF
AMQLQFLAYQDEVITWMQRFALWLDIALINIFLPTMLHPKDDWKSYWRNVIACYVPHRRVWLSFLLLYVGTNICLFASKK
EILLIGIALLVLSLLLLPILRGWKATHKVQKIIIPILIIVTFAIIALLFLVEVRDWIEITITSFISTETIREKVFPLSFI
LYALIIVLTVLWQQSAPRGSFALVVTLFLGTLFPLAFMVDGEHLEKIIAKGENATFLSNVLQDKRRLNLSEQHLFAKALK
PEIITLISDGKWKEALPQIEPINLQGRHLRHAELNQAMLLGADLRFADLQGAYLSDADLQGAYLSDADLQGAHLRQAELQ
GAHLRQANLQGAYLRQADLQDANLSYTNLQGADFIGADLQGADLRFAHLQGANLFGAHLQGAYLFVAHLQGAYLSGAHLQ
GADLSAAHLQGADLFGANLYAADIRRANTTLVDAQNIRLEPLSEKEATELRTTLKPLIKDNEDYNEVAERIKKATAPHGE
IPYFESILAEKNTPLRYKKCYNAENSAERRAFTKQLHPYLVSLASQSPEIARGIIQQIPISEPNTSSRKGLAAELAKHLN
DPKCKGLYELRDDEKEELRNWKEE

Specific function: Unknown

COG id: COG1357

COG function: function code S; Uncharacterized low-complexity proteins

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 5 pentapeptide repeat domains [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI39753959, Length=184, Percent_Identity=33.695652173913, Blast_Score=91, Evalue=3e-18,
Organism=Drosophila melanogaster, GI221377802, Length=180, Percent_Identity=34.4444444444444, Blast_Score=85, Evalue=2e-16,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001646 [H]

Pfam domain/function: PF00805 Pentapeptide [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83607; Mature: 83476

Theoretical pI: Translated: 6.80; Mature: 6.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTTPDPQVKPSTLPNDPLTLLEVANHSSERLAVQHTAFIAACVYVLIIVFGTTDLDLLIG
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHC
KGVRLPFVDVEVPIVGFFAFVPFILVLVHFNLLLQLQLLSRKLFAFDATVPQDDGIGGLR
CCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHH
DRLHIFAFTYYLAGNPSRLVKPFLAIMVSITLVLLPLFVLFAMQLQFLAYQDEVITWMQR
HHHHHHHEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FALWLDIALINIFLPTMLHPKDDWKSYWRNVIACYVPHRRVWLSFLLLYVGTNICLFASK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECC
KEILLIGIALLVLSLLLLPILRGWKATHKVQKIIIPILIIVTFAIIALLFLVEVRDWIEI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TITSFISTETIREKVFPLSFILYALIIVLTVLWQQSAPRGSFALVVTLFLGTLFPLAFMV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DGEHLEKIIAKGENATFLSNVLQDKRRLNLSEQHLFAKALKPEIITLISDGKWKEALPQI
CHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHCCCC
EPINLQGRHLRHAELNQAMLLGADLRFADLQGAYLSDADLQGAYLSDADLQGAHLRQAEL
CCCCCCCCCCCHHHHCCHHEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHH
QGAHLRQANLQGAYLRQADLQDANLSYTNLQGADFIGADLQGADLRFAHLQGANLFGAHL
CCCHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHH
QGAYLFVAHLQGAYLSGAHLQGADLSAAHLQGADLFGANLYAADIRRANTTLVDAQNIRL
CHHHHEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEECCCCEE
EPLSEKEATELRTTLKPLIKDNEDYNEVAERIKKATAPHGEIPYFESILAEKNTPLRYKK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHH
CYNAENSAERRAFTKQLHPYLVSLASQSPEIARGIIQQIPISEPNTSSRKGLAAELAKHL
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHC
NDPKCKGLYELRDDEKEELRNWKEE
CCCCCCCCHHHCCCCHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TTPDPQVKPSTLPNDPLTLLEVANHSSERLAVQHTAFIAACVYVLIIVFGTTDLDLLIG
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHC
KGVRLPFVDVEVPIVGFFAFVPFILVLVHFNLLLQLQLLSRKLFAFDATVPQDDGIGGLR
CCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHH
DRLHIFAFTYYLAGNPSRLVKPFLAIMVSITLVLLPLFVLFAMQLQFLAYQDEVITWMQR
HHHHHHHEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FALWLDIALINIFLPTMLHPKDDWKSYWRNVIACYVPHRRVWLSFLLLYVGTNICLFASK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECC
KEILLIGIALLVLSLLLLPILRGWKATHKVQKIIIPILIIVTFAIIALLFLVEVRDWIEI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TITSFISTETIREKVFPLSFILYALIIVLTVLWQQSAPRGSFALVVTLFLGTLFPLAFMV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DGEHLEKIIAKGENATFLSNVLQDKRRLNLSEQHLFAKALKPEIITLISDGKWKEALPQI
CHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHCCCC
EPINLQGRHLRHAELNQAMLLGADLRFADLQGAYLSDADLQGAYLSDADLQGAHLRQAEL
CCCCCCCCCCCHHHHCCHHEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHH
QGAHLRQANLQGAYLRQADLQDANLSYTNLQGADFIGADLQGADLRFAHLQGANLFGAHL
CCCHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHH
QGAYLFVAHLQGAYLSGAHLQGADLSAAHLQGADLFGANLYAADIRRANTTLVDAQNIRL
CHHHHEEEHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEECCCCEE
EPLSEKEATELRTTLKPLIKDNEDYNEVAERIKKATAPHGEIPYFESILAEKNTPLRYKK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHH
CYNAENSAERRAFTKQLHPYLVSLASQSPEIARGIIQQIPISEPNTSSRKGLAAELAKHL
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHC
NDPKCKGLYELRDDEKEELRNWKEE
CCCCCCCCHHHCCCCHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA