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The map label for this gene is mviN1 [H]

Identifier: 78044987

GI number: 78044987

Start: 350127

End: 351671

Strand: Direct

Name: mviN1 [H]

Synonym: CHY_0409

Alternate gene names: 78044987

Gene position: 350127-351671 (Clockwise)

Preceding gene: 78044841

Following gene: 78044431

Centisome position: 14.58

GC content: 43.3

Gene sequence:

>1545_bases
ATGAGTACCAGAAAAAACGTTGCTAAAGCTGCAGGGATAATCCTAGCTTTGGGAATTGTTTCGCGGATCTTGGGTTTTGT
ACGGGAACAATTGCTGGCGGTAAAATTTGGGGCTACAGGGATAAGTGATGCTTATGTAGCGGCTTTTACCATACCGGATT
TCCTTTACAATTTACTGGTGGGAGGAGCGCTAAGTGCCGCCTTTATTCCGGTTTTTTCTTCGTATTTAGCTAAGAATGAA
GAGGAAGAAGCCTGGAAAATGGCCAGCACGGTCATAAATTTAGTAATAATAATTATGCTTTTTTGTATTGGCCTTGGTTT
TTTATTTACACCGGAACTGGTAAAACTTGTAGCACACAAATTTACCGGAGAAAGACTAAGCACTACCATTGAACTTACCC
GGATAATGCTACCGTCGGTTTTATTTACGGGATTAAACGGGTTTTTAATGGGAATGTTGAATTCCTACCAGCATTTTTTT
ACTCCGGCCCTGGGCAGTGTAATATATAACATAGTGATAATTCTTTTTGGCTATTTCTTAGCCGGCAAGCTGGGAATTAC
CTCCTTTGCTCTCGGGGTTGTGGCCGGGATGGTTTTAAATTTCATGGTACAGCTTCCAAGCTTAGCCCGGTACGGGTTAA
AATATCGGCCTATTATCGATATCCACCATCCCGGAGTAGTAAAAATGGCTCAATTGATGATTCCTACCCTGTTGGGATTG
GCGGTAAGCCAGATTAACCTAATCGTTAACCAAAATCTTGCTTCGGGATTGTCGGAAGGAAGCATTATGGCGCTGAGGCT
TGCCAATCGTTTGATGTATCTTCCTCTGGGGTTATTTGCTTCTGCAATAAGCATGGCTATTTTTCCAACTATGACCGGCT
TTGCTGCCCGGGGAGAAATGGATAATTTTAAAAAAAGCGTAGCTATGGGGATAAAATCAATATGGTTTATTATCCTGCCA
GCTCAGGTGGGTCTGATGGTTTTAAGCGTGCCGATTGTGCGGCTTTTATTTGAGATGGGAGAGTTTACCCCGGCAATGAC
CAGGGCGACGGCCTGGGCGCTGGTCTTTTACTGCGTTGGACTTTTTGCCCACTCAGCTTTGCAGGTGGTTTTACGGGGAT
TTTATTCCCTGCACGACACGATTACGCCGGTTACTACCAGCCTTTTAACCATCTTTTTAAACTATCTATTAAACGTGGCC
TTTATCCGCTACCTGGGTCATGGAGGGCTTGCTTTAGGCTTTTCGTTAACGGGCATATTTAACTTTGCTGTTTTGCTGTG
GCTTTTCCGCCGCAAAGTTGGCTCAATTTACGGGAAAGACATTTTAATTTCCGGAGTTAAATCGCTTTTGGCTTCGTTAT
TAATGGGAGTAACGGCCTATTTAATTGCCGGTGAGCTATCCGGATTTGCTGTAACCAAACACGGGCAATTAATTCAAGTT
GGTGCGGCAATTGCAGGGGCAGTAGTAGTATATGCGGCCACTACTTTGCTTTTAAAAATGGAAGAAGCGCTGTTTTTCTT
AAATTTAATCCGGAAAAAAGTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGCCAGTTTTTCTGGCTTTATTTTTTTTCCTTTACAAATTAAAAAAAAGTGATATATTTTTTAAAGGATTTAAATTTAA
AGGGAAGGGCTATTGGGGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGAGGTTTATTATGCCCAAACGCCAGGAGTTAATCAGGAATTTTTGTATTATTGCCCATATCGACCACGGAAAGTCTAC
CTTAGCGGACAGGCTTATAG

Product: integral membrane protein MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 514; Mature: 513

Protein sequence:

>514_residues
MSTRKNVAKAAGIILALGIVSRILGFVREQLLAVKFGATGISDAYVAAFTIPDFLYNLLVGGALSAAFIPVFSSYLAKNE
EEEAWKMASTVINLVIIIMLFCIGLGFLFTPELVKLVAHKFTGERLSTTIELTRIMLPSVLFTGLNGFLMGMLNSYQHFF
TPALGSVIYNIVIILFGYFLAGKLGITSFALGVVAGMVLNFMVQLPSLARYGLKYRPIIDIHHPGVVKMAQLMIPTLLGL
AVSQINLIVNQNLASGLSEGSIMALRLANRLMYLPLGLFASAISMAIFPTMTGFAARGEMDNFKKSVAMGIKSIWFIILP
AQVGLMVLSVPIVRLLFEMGEFTPAMTRATAWALVFYCVGLFAHSALQVVLRGFYSLHDTITPVTTSLLTIFLNYLLNVA
FIRYLGHGGLALGFSLTGIFNFAVLLWLFRRKVGSIYGKDILISGVKSLLASLLMGVTAYLIAGELSGFAVTKHGQLIQV
GAAIAGAVVVYAATTLLLKMEEALFFLNLIRKKV

Sequences:

>Translated_514_residues
MSTRKNVAKAAGIILALGIVSRILGFVREQLLAVKFGATGISDAYVAAFTIPDFLYNLLVGGALSAAFIPVFSSYLAKNE
EEEAWKMASTVINLVIIIMLFCIGLGFLFTPELVKLVAHKFTGERLSTTIELTRIMLPSVLFTGLNGFLMGMLNSYQHFF
TPALGSVIYNIVIILFGYFLAGKLGITSFALGVVAGMVLNFMVQLPSLARYGLKYRPIIDIHHPGVVKMAQLMIPTLLGL
AVSQINLIVNQNLASGLSEGSIMALRLANRLMYLPLGLFASAISMAIFPTMTGFAARGEMDNFKKSVAMGIKSIWFIILP
AQVGLMVLSVPIVRLLFEMGEFTPAMTRATAWALVFYCVGLFAHSALQVVLRGFYSLHDTITPVTTSLLTIFLNYLLNVA
FIRYLGHGGLALGFSLTGIFNFAVLLWLFRRKVGSIYGKDILISGVKSLLASLLMGVTAYLIAGELSGFAVTKHGQLIQV
GAAIAGAVVVYAATTLLLKMEEALFFLNLIRKKV
>Mature_513_residues
STRKNVAKAAGIILALGIVSRILGFVREQLLAVKFGATGISDAYVAAFTIPDFLYNLLVGGALSAAFIPVFSSYLAKNEE
EEAWKMASTVINLVIIIMLFCIGLGFLFTPELVKLVAHKFTGERLSTTIELTRIMLPSVLFTGLNGFLMGMLNSYQHFFT
PALGSVIYNIVIILFGYFLAGKLGITSFALGVVAGMVLNFMVQLPSLARYGLKYRPIIDIHHPGVVKMAQLMIPTLLGLA
VSQINLIVNQNLASGLSEGSIMALRLANRLMYLPLGLFASAISMAIFPTMTGFAARGEMDNFKKSVAMGIKSIWFIILPA
QVGLMVLSVPIVRLLFEMGEFTPAMTRATAWALVFYCVGLFAHSALQVVLRGFYSLHDTITPVTTSLLTIFLNYLLNVAF
IRYLGHGGLALGFSLTGIFNFAVLLWLFRRKVGSIYGKDILISGVKSLLASLLMGVTAYLIAGELSGFAVTKHGQLIQVG
AAIAGAVVVYAATTLLLKMEEALFFLNLIRKKV

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=431, Percent_Identity=32.4825986078886, Blast_Score=229, Evalue=2e-61,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55732; Mature: 55601

Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSTRKNVAKAAGIILALGIVSRILGFVREQLLAVKFGATGISDAYVAAFTIPDFLYNLLV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GGALSAAFIPVFSSYLAKNEEEEAWKMASTVINLVIIIMLFCIGLGFLFTPELVKLVAHK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTGERLSTTIELTRIMLPSVLFTGLNGFLMGMLNSYQHFFTPALGSVIYNIVIILFGYFL
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGKLGITSFALGVVAGMVLNFMVQLPSLARYGLKYRPIIDIHHPGVVKMAQLMIPTLLGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AVSQINLIVNQNLASGLSEGSIMALRLANRLMYLPLGLFASAISMAIFPTMTGFAARGEM
HHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
DNFKKSVAMGIKSIWFIILPAQVGLMVLSVPIVRLLFEMGEFTPAMTRATAWALVFYCVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFAHSALQVVLRGFYSLHDTITPVTTSLLTIFLNYLLNVAFIRYLGHGGLALGFSLTGIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
NFAVLLWLFRRKVGSIYGKDILISGVKSLLASLLMGVTAYLIAGELSGFAVTKHGQLIQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHH
GAAIAGAVVVYAATTLLLKMEEALFFLNLIRKKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
STRKNVAKAAGIILALGIVSRILGFVREQLLAVKFGATGISDAYVAAFTIPDFLYNLLV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8200538; 11677609 [H]