Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 75909193

Identifier: 75909193

GI number: 75909193

Start: 3702420

End: 3704051

Strand: Direct

Name: 75909193

Synonym: Ava_2984

Alternate gene names: NA

Gene position: 3702420-3704051 (Clockwise)

Preceding gene: 75909192

Following gene: 75909198

Centisome position: 58.16

GC content: 36.76

Gene sequence:

>1632_bases
ATGGTTTATTTGCCGCATTCTTGTTTCATTATAAATCTTCATTTATGTATGGAAAATAAAACATCAGAAGAATGTTATAA
AATTCCTAACTGGTTGCTGATTATATCAACAGTCGCACTTGTTTTGGGAATATTTTTAAGATTTTATCATCTTGAACAAA
AAGTTTATTCTTTCGATGAAACTTTCTCCTCAACCTATATTTATGGGCAACACTCCCAAGCCTACCAAAATTTTGATAAT
TCTATTCTCAGCATCGGCGAACTGCAAAAATATCTCTTCATAGACGCAAATAAAACTTTAATTCAATCAGTTGAGCAAGT
AATTGAAAAACTTTATGTATTTCCTCCAATCTACCCAGTTTTGACAATTTTATGGTCGTATTTATTTAATCATTGGTTTG
ATAATGGACTAGTGATTCAAAGAAGTTTAGCTGCTTTATTAAGCGTGATTGCAATCTGGGGAATCTACTGGTTAGGATTG
GAGTTATTTGCATCTAAAACTACCGCATTTGTAGCGGCGGTAATTGTAGCTATTTCTCCCTTTCATTTACAATATGCCCA
AATCATCCGCCCCTATAGTATTTTGATAGCGACTACAGTCATTGCCTGTGGATACCTACTTAAAGCTATACGGTTTAACA
ATTTATTCTGGTGGCTGATTTATGGATTAAGTCTTGTGATTGGGCTTTACTCTAATTTGCTATTTGCACTTGTTTTAGTG
GCTCATACACTGTACGTCTTGATTAACGAGAACCTTAGAAATTTAAAAAGTCTCACTGCATATTTTTTGACATTAGGAAT
TAGTACCTTAGCTTTTTTACCTTGGTTATGGGCTTTTATAAATTCCAGTATGCTGAAATATTCGGTTGAACAAGTGTCTG
ATAAAAGTTCTTTGTTTGGGTTAATCAATGCTTGGTTAAAGGGTATACAGAACCTTTTTATTGACTTATATCATCCCTTT
TTTTCGCCTAATTTTCTCAAAGCTGCCCAGTATTTCTTCGCTCCAATTATATTAGCGATCGCCGCAATTTCTCTCTATAC
ACTTTGTCGATACGCACCGAGAAAAATCAGAAACTTTCTCCTGGCATTAGCGATCGCCACAGGAGTCAGCTTGATGGTGA
AAGATGTCATCAGTGGTAGTTCTATCACCACCAGAATGCGCTATTTGATTCCTTTCGTTTTAGCTATGGAATTGATAGCT
GCATACTTGATTGGTAGTTGGTTGACTGCTAGCCAATCTTCACACAGGCGATGGGGACAGTTTGCTTTATCAATTTTAAT
TTTGTGTGGTGTGAGTTCCTGTCTGGTAATTTCTGCTGCACCATCATGGAATGCCTTTGGTAGTCCCCATTTTCCCAAAG
AGTCGGCAATCATCAGTTCAGCCGATCACCCACTAGTTTTATGCACAAATCTAGACCGGGCATTATCCATGAGTTATCTA
GTTGACTCAGACACTAAATTTAAACTAATTCGAGATGATCTGACAATTCCCGATGGGTTTAACAGGGTTTTTGTTCTAGA
AGCATCAGCAAAAACCCTCAAACAACTAGCAGCCAAACATAAATTAGTGAATACTTTTCCCCAGGGTAGATTGTTTGAAA
TTGCGGGTGTTGTTAGATCCCCGACTTCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTAATACAAACCGTAAAAATAAGGTAATATCCATAATTAATGTCAATTCGATAAGCAACACATTATTGGGTGAAGACGC
GATGAATAGCGTCTCTACAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAGACGAGGATTTGATCTTAAAAAAACAACTGTAAATAAGCTGACAAAATTGGTTGTCCACCAAAGAGAGTGATAAAA
GCTCCTGAGGCGAGGAAAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 543; Mature: 543

Protein sequence:

>543_residues
MVYLPHSCFIINLHLCMENKTSEECYKIPNWLLIISTVALVLGIFLRFYHLEQKVYSFDETFSSTYIYGQHSQAYQNFDN
SILSIGELQKYLFIDANKTLIQSVEQVIEKLYVFPPIYPVLTILWSYLFNHWFDNGLVIQRSLAALLSVIAIWGIYWLGL
ELFASKTTAFVAAVIVAISPFHLQYAQIIRPYSILIATTVIACGYLLKAIRFNNLFWWLIYGLSLVIGLYSNLLFALVLV
AHTLYVLINENLRNLKSLTAYFLTLGISTLAFLPWLWAFINSSMLKYSVEQVSDKSSLFGLINAWLKGIQNLFIDLYHPF
FSPNFLKAAQYFFAPIILAIAAISLYTLCRYAPRKIRNFLLALAIATGVSLMVKDVISGSSITTRMRYLIPFVLAMELIA
AYLIGSWLTASQSSHRRWGQFALSILILCGVSSCLVISAAPSWNAFGSPHFPKESAIISSADHPLVLCTNLDRALSMSYL
VDSDTKFKLIRDDLTIPDGFNRVFVLEASAKTLKQLAAKHKLVNTFPQGRLFEIAGVVRSPTS

Sequences:

>Translated_543_residues
MVYLPHSCFIINLHLCMENKTSEECYKIPNWLLIISTVALVLGIFLRFYHLEQKVYSFDETFSSTYIYGQHSQAYQNFDN
SILSIGELQKYLFIDANKTLIQSVEQVIEKLYVFPPIYPVLTILWSYLFNHWFDNGLVIQRSLAALLSVIAIWGIYWLGL
ELFASKTTAFVAAVIVAISPFHLQYAQIIRPYSILIATTVIACGYLLKAIRFNNLFWWLIYGLSLVIGLYSNLLFALVLV
AHTLYVLINENLRNLKSLTAYFLTLGISTLAFLPWLWAFINSSMLKYSVEQVSDKSSLFGLINAWLKGIQNLFIDLYHPF
FSPNFLKAAQYFFAPIILAIAAISLYTLCRYAPRKIRNFLLALAIATGVSLMVKDVISGSSITTRMRYLIPFVLAMELIA
AYLIGSWLTASQSSHRRWGQFALSILILCGVSSCLVISAAPSWNAFGSPHFPKESAIISSADHPLVLCTNLDRALSMSYL
VDSDTKFKLIRDDLTIPDGFNRVFVLEASAKTLKQLAAKHKLVNTFPQGRLFEIAGVVRSPTS
>Mature_543_residues
MVYLPHSCFIINLHLCMENKTSEECYKIPNWLLIISTVALVLGIFLRFYHLEQKVYSFDETFSSTYIYGQHSQAYQNFDN
SILSIGELQKYLFIDANKTLIQSVEQVIEKLYVFPPIYPVLTILWSYLFNHWFDNGLVIQRSLAALLSVIAIWGIYWLGL
ELFASKTTAFVAAVIVAISPFHLQYAQIIRPYSILIATTVIACGYLLKAIRFNNLFWWLIYGLSLVIGLYSNLLFALVLV
AHTLYVLINENLRNLKSLTAYFLTLGISTLAFLPWLWAFINSSMLKYSVEQVSDKSSLFGLINAWLKGIQNLFIDLYHPF
FSPNFLKAAQYFFAPIILAIAAISLYTLCRYAPRKIRNFLLALAIATGVSLMVKDVISGSSITTRMRYLIPFVLAMELIA
AYLIGSWLTASQSSHRRWGQFALSILILCGVSSCLVISAAPSWNAFGSPHFPKESAIISSADHPLVLCTNLDRALSMSYL
VDSDTKFKLIRDDLTIPDGFNRVFVLEASAKTLKQLAAKHKLVNTFPQGRLFEIAGVVRSPTS

Specific function: Unknown

COG id: COG5305

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61356; Mature: 61356

Theoretical pI: Translated: 9.10; Mature: 9.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVYLPHSCFIINLHLCMENKTSEECYKIPNWLLIISTVALVLGIFLRFYHLEQKVYSFDE
CEECCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFSSTYIYGQHSQAYQNFDNSILSIGELQKYLFIDANKTLIQSVEQVIEKLYVFPPIYPV
HHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LTILWSYLFNHWFDNGLVIQRSLAALLSVIAIWGIYWLGLELFASKTTAFVAAVIVAISP
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
FHLQYAQIIRPYSILIATTVIACGYLLKAIRFNNLFWWLIYGLSLVIGLYSNLLFALVLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AHTLYVLINENLRNLKSLTAYFLTLGISTLAFLPWLWAFINSSMLKYSVEQVSDKSSLFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH
LINAWLKGIQNLFIDLYHPFFSPNFLKAAQYFFAPIILAIAAISLYTLCRYAPRKIRNFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LALAIATGVSLMVKDVISGSSITTRMRYLIPFVLAMELIAAYLIGSWLTASQSSHRRWGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
FALSILILCGVSSCLVISAAPSWNAFGSPHFPKESAIISSADHPLVLCTNLDRALSMSYL
HHHHHHHHHCCCHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHH
VDSDTKFKLIRDDLTIPDGFNRVFVLEASAKTLKQLAAKHKLVNTFPQGRLFEIAGVVRS
CCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCC
PTS
CCC
>Mature Secondary Structure
MVYLPHSCFIINLHLCMENKTSEECYKIPNWLLIISTVALVLGIFLRFYHLEQKVYSFDE
CEECCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFSSTYIYGQHSQAYQNFDNSILSIGELQKYLFIDANKTLIQSVEQVIEKLYVFPPIYPV
HHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LTILWSYLFNHWFDNGLVIQRSLAALLSVIAIWGIYWLGLELFASKTTAFVAAVIVAISP
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
FHLQYAQIIRPYSILIATTVIACGYLLKAIRFNNLFWWLIYGLSLVIGLYSNLLFALVLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AHTLYVLINENLRNLKSLTAYFLTLGISTLAFLPWLWAFINSSMLKYSVEQVSDKSSLFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH
LINAWLKGIQNLFIDLYHPFFSPNFLKAAQYFFAPIILAIAAISLYTLCRYAPRKIRNFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LALAIATGVSLMVKDVISGSSITTRMRYLIPFVLAMELIAAYLIGSWLTASQSSHRRWGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
FALSILILCGVSSCLVISAAPSWNAFGSPHFPKESAIISSADHPLVLCTNLDRALSMSYL
HHHHHHHHHCCCHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHH
VDSDTKFKLIRDDLTIPDGFNRVFVLEASAKTLKQLAAKHKLVNTFPQGRLFEIAGVVRS
CCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCC
PTS
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA