Definition Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome, complete genome.
Accession NC_007413
Length 6,365,727

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The map label for this gene is 75908069

Identifier: 75908069

GI number: 75908069

Start: 2300833

End: 2304090

Strand: Direct

Name: 75908069

Synonym: Ava_1848

Alternate gene names: NA

Gene position: 2300833-2304090 (Clockwise)

Preceding gene: 75908068

Following gene: 75908070

Centisome position: 36.14

GC content: 38.24

Gene sequence:

>3258_bases
ATGAATCAAGTAAGTGCAAATGAACTGCAATATCGTGGGATTAACCGCACAATTTGTATTGGCTTAGGTGGTACTGGACG
AGATGTTTTGATGCGAATTAGACGGTTAATTGTTGACCGTTATGGAGATTTAAGCAATCTGCCAATTGTAAGTTTTGTTC
ATCTAGATACTGATAAAGCTGCAACACAAGTGACTGGCATTCGTACAGGAAGTACTTATCATGGTGTTGATCTCAGCTTT
CGAGAAGCCGAAAAAGTTAGCGCCACTATGTCCGCCAAGGAAGTAACGATGTTTGTGGAAGGACTAGAAAGGCGCTCAGA
ATATACTCGTTACGGCCCCTACGACCATATTGCTAGATGGTTTCCTCCCCAACTGTTGCGAAATATTAAAGCTGTGGAGG
AAGGTGCAAAAGGAATTAGACCTGTAGGGAGACTAGCTTTTTTTCATAATTATCAAAAGATAAAAATAGCGATTGAAACC
GCAGAAAGACTTAGTAGGGGACATGATGCTTTATTGCTGAGAAAGGGGTTAAGAGTTGAACCAGGATTGAATATTTTTGT
GATTGGTTCTCTGTGTGGTGGTACAGGGAGCGGTATGTTTTTGGATGTTGCTTATAGTCTTAGACATCTTTATGGTGAAC
AAGGCGCTCAGATTGTCAGCTATTTAGTGATTAGTCCAGAATTATATGGTAATACCCCTAATATGAGTGCTAATACTTAT
GCTGCTTTGAAAGAGTTAAATTACTACAGTACTCCAGGGACAAAATTTGCAGCCTGTTATGATATTGAAAATCTAGAATT
TCTACAAGAAAAGCGTCCGCCTTTTGACTACACTTATTTAGTTTCTCATCAGACAGGAGGCGAATATCAAATTCTTGATC
AAGGTAAGTTATGTAATGTGATCGCTCACAAGATAGCTCTAGATTTTTCCGGTGAGTTAGCACCTGTAATTAAAGGACAT
AGAGATAATTTTCTCCAACATATAATTCAGTGGGATAAACATCCACGTCCTAATGGTCAGAGGTATTTAACATTTGGGTT
AGCGGCGATTTATTTTCCCCGTGACACTATCGTGGAAATTGCCTTAATAAGGGTTAGTTTAGCATTAGTAAAGTTTTGGT
TAAATGGCAAAGGTCAAAGTCCAGATCCTCAGAAACTACTGGATCAATTTCTGATTCAATCTCGTTGGCATAATGACTTA
GCCAAAAAAGACGGCTTAACTACGAAAATAGCAGAATCAGTAGAGGATACAAATAAAAACTTTAGTAGCAATATTAGTAC
CTGGAGAAGTAAATTAGAGCGATCAATTTCTGAATGTCAGAATAAAGATGATCGTAACGGTATTCGTCAACAGTTACCAA
GGGAGTTTCGAGAGCAATTTCGGAAAGTGCAGCCGGGGGAAACAGAAAATGTCCGAGGTATTTGGCTGACAAAATTGCTC
CAGTCTTCTCCAAATATCACCAAGGAACTAAAGACTAATATTGACGATTATTTAATTCAGTTACTCACGCCAAGTGAGCC
TATTTTCTCTATTAAAAGCAGTCGTGATTGGCTAGATGCTTTACAACATGAACTACATAACTATCAATTCAATCTGCAAG
AAGCAATTACCGATTTTGGTGGGATGAAACGCGCGGAGGATATTGATAAAAAATGGCGAGATGCCGAGCAAATGATTGAA
GATATTGAGCATAAAATTGGTATTCCCATAATTAATACTAAGAATAGCCAAGTGCAAGCTGAAGTTAAAAGGGTAGTGCA
AGAAGTCTGCAAACTCATTAAACATAACTTTGATTTTACCGTCTTTCAAGAGGCTCTAAAAATAGTCAATGAATTACAAA
AACACGTTCAGGAAAGAGGGAATCAAGTTACTGCTTTTAGTAGAGTCATTGAAAATTTGCAAACTTTCTATGAGAAGCAA
GATAGTGATTTAAGACAGTTAAACTTTGATGAAATGAGTGGAGAAGCCATATTTGATAGTGAAGATATTGATCGCTGTTA
TCAAACTATGTTGCCAGAAGATGATCTTCGCAGACAATTGGTATTAGCTAGCTCGGAAATTACGGAACCTGCTGGAAGGG
GACAATCTTTGGCAAGTTTTATAGATAGAGAAAGAACTACGCCAGAACAGCTACAAACAGAAATTGACCTAAAGGTTGAC
AGTTTATTTGCTTCTCGCGTTACTAATATTGTCAACTCTGTGATTAAGCGTTTCATGCAAAAATATCCTTTAGCAGCGCG
TTCGACTCGGTTAGCGCAAGTTATGCAAGAAGCTGAACCTCTGCTGAGGCTGAATTTAAGTGACCCTTATTTCCGTGAAG
ACCCGGCGAAAAGTAGTAAATTAATTGGGTTTAAGGATAAGGATGAATTGGAGGTACGACAGTTTAAAACTGTATTAGCA
CAAGATTTAGGTATTGAATCAAGTGTGATAAAAGCGACACAATCTGAAGATGAGATTTTAATTGTCAATGAGTATGCTGG
TTTTCCTCTCAGGCTAATTAGTAGTCTGGAGAGGATGAGAAACCCCTATCTACGTGAACAAAATTCTGCCACATCTTTTC
TGCATAACGATTACCAAGTAGCATTTCCAGATATTATCCCCCCAGATGCGATCGCAATGGAAAAACTGGAAGATGTCTTC
TATCCTTGTTTGGCCTTTAGGTTACTCAAGGAAAACCAAGAAAATCAACAATTAGAATTTCAATATTATGATTCCTTGCG
TGATAGTTACAATACTGCTACTTTGAGTCCAGAGTGGAGTCAAGCCTTGGAAGAATTAGCTAACCGCAACGACATGACTG
AGGCTTTGCTACAGCTTTTAGAGCGAGAAATTTCTGTAATTTCTGGACAACCAGAACTTTGGGAAAATCAGTATTTACCA
AAACTAAGGCAATTTGTGCAGGCAGTAGATGATTTATCAGAAGATAGTCCCAATTATCCCTACAAACTCGCAGTAGTAGG
AACATCCGCCAGCACAGATCCTACAGTTAAAGAAGGAATTATTCATCGCTTTCGGAGAAAAATGAATGAGCGATTTAGCA
TATCTCAAAGTCGCGCTTTTGCACCAAATAATAATACATCAATGCAAACAGCTATTGCTGGTGAAATAGTCGTGGATATG
CCTGTTGATACTACTGATAATAGAGTCAGGCGGCGCTTAGAATTAGAGCGGTTGAAACAAGATTTAGATGAAGATTTTAT
TACTCAAGATGAATATGAGCGTGAAAAACAAAGGATTTTTGCTCAATATCCCCTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATATCTAGTTCCCGGTTTCGTTTAAATTGCCCAGACTTCCGCCAAGGTGAATACGAAATAAATATTAAACTTAATAAAT
AGGATTAGGGGTTGCATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTCATTTATAGATGGGTATCAATTAATATATTCCTATAGCAATTTCTACCTGAGCAAAAACAGCCAAAAAATCATCTGA
GATAGAAGAGGATATACACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1085; Mature: 1085

Protein sequence:

>1085_residues
MNQVSANELQYRGINRTICIGLGGTGRDVLMRIRRLIVDRYGDLSNLPIVSFVHLDTDKAATQVTGIRTGSTYHGVDLSF
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DSDLRQLNFDEMSGEAIFDSEDIDRCYQTMLPEDDLRRQLVLASSEITEPAGRGQSLASFIDRERTTPEQLQTEIDLKVD
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YPCLAFRLLKENQENQQLEFQYYDSLRDSYNTATLSPEWSQALEELANRNDMTEALLQLLEREISVISGQPELWENQYLP
KLRQFVQAVDDLSEDSPNYPYKLAVVGTSASTDPTVKEGIIHRFRRKMNERFSISQSRAFAPNNNTSMQTAIAGEIVVDM
PVDTTDNRVRRRLELERLKQDLDEDFITQDEYEREKQRIFAQYPL

Sequences:

>Translated_1085_residues
MNQVSANELQYRGINRTICIGLGGTGRDVLMRIRRLIVDRYGDLSNLPIVSFVHLDTDKAATQVTGIRTGSTYHGVDLSF
REAEKVSATMSAKEVTMFVEGLERRSEYTRYGPYDHIARWFPPQLLRNIKAVEEGAKGIRPVGRLAFFHNYQKIKIAIET
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AALKELNYYSTPGTKFAACYDIENLEFLQEKRPPFDYTYLVSHQTGGEYQILDQGKLCNVIAHKIALDFSGELAPVIKGH
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AKKDGLTTKIAESVEDTNKNFSSNISTWRSKLERSISECQNKDDRNGIRQQLPREFREQFRKVQPGETENVRGIWLTKLL
QSSPNITKELKTNIDDYLIQLLTPSEPIFSIKSSRDWLDALQHELHNYQFNLQEAITDFGGMKRAEDIDKKWRDAEQMIE
DIEHKIGIPIINTKNSQVQAEVKRVVQEVCKLIKHNFDFTVFQEALKIVNELQKHVQERGNQVTAFSRVIENLQTFYEKQ
DSDLRQLNFDEMSGEAIFDSEDIDRCYQTMLPEDDLRRQLVLASSEITEPAGRGQSLASFIDRERTTPEQLQTEIDLKVD
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QDLGIESSVIKATQSEDEILIVNEYAGFPLRLISSLERMRNPYLREQNSATSFLHNDYQVAFPDIIPPDAIAMEKLEDVF
YPCLAFRLLKENQENQQLEFQYYDSLRDSYNTATLSPEWSQALEELANRNDMTEALLQLLEREISVISGQPELWENQYLP
KLRQFVQAVDDLSEDSPNYPYKLAVVGTSASTDPTVKEGIIHRFRRKMNERFSISQSRAFAPNNNTSMQTAIAGEIVVDM
PVDTTDNRVRRRLELERLKQDLDEDFITQDEYEREKQRIFAQYPL
>Mature_1085_residues
MNQVSANELQYRGINRTICIGLGGTGRDVLMRIRRLIVDRYGDLSNLPIVSFVHLDTDKAATQVTGIRTGSTYHGVDLSF
REAEKVSATMSAKEVTMFVEGLERRSEYTRYGPYDHIARWFPPQLLRNIKAVEEGAKGIRPVGRLAFFHNYQKIKIAIET
AERLSRGHDALLLRKGLRVEPGLNIFVIGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHLYGEQGAQIVSYLVISPELYGNTPNMSANTY
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DIEHKIGIPIINTKNSQVQAEVKRVVQEVCKLIKHNFDFTVFQEALKIVNELQKHVQERGNQVTAFSRVIENLQTFYEKQ
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PVDTTDNRVRRRLELERLKQDLDEDFITQDEYEREKQRIFAQYPL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 124717; Mature: 124717

Theoretical pI: Translated: 5.59; Mature: 5.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNQVSANELQYRGINRTICIGLGGTGRDVLMRIRRLIVDRYGDLSNLPIVSFVHLDTDKA
CCCCCCCHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCHH
ATQVTGIRTGSTYHGVDLSFREAEKVSATMSAKEVTMFVEGLERRSEYTRYGPYDHIARW
HHHHEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHC
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
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KLRQFVQAVDDLSEDSPNYPYKLAVVGTSASTDPTVKEGIIHRFRRKMNERFSISQSRAF
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APNNNTSMQTAIAGEIVVDMPVDTTDNRVRRRLELERLKQDLDEDFITQDEYEREKQRIF
CCCCCCCCHHEECCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
AQYPL
HCCCC
>Mature Secondary Structure
MNQVSANELQYRGINRTICIGLGGTGRDVLMRIRRLIVDRYGDLSNLPIVSFVHLDTDKA
CCCCCCCHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCHH
ATQVTGIRTGSTYHGVDLSFREAEKVSATMSAKEVTMFVEGLERRSEYTRYGPYDHIARW
HHHHEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHC
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CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCC
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHCCCCEEECH
EDIDRCYQTMLPEDDLRRQLVLASSEITEPAGRGQSLASFIDRERTTPEQLQTEIDLKVD
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
SLFASRVTNIVNSVIKRFMQKYPLAARSTRLAQVMQEAEPLLRLNLSDPYFREDPAKSSK
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CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHC
NPYLREQNSATSFLHNDYQVAFPDIIPPDAIAMEKLEDVFYPCLAFRLLKENQENQQLEF
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APNNNTSMQTAIAGEIVVDMPVDTTDNRVRRRLELERLKQDLDEDFITQDEYEREKQRIF
CCCCCCCCHHEECCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
AQYPL
HCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA