Definition Vibrio fischeri ES114 chromosome chromosome II, complete sequence.
Accession NC_006841
Length 1,330,333

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The map label for this gene is 59713888

Identifier: 59713888

GI number: 59713888

Start: 782758

End: 789201

Strand: Reverse

Name: 59713888

Synonym: VF_A0705

Alternate gene names: NA

Gene position: 789201-782758 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59713890

Following gene: 59713887

Centisome position: 59.32

GC content: 40.56

Gene sequence:

>6444_bases
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ACAGTTACTCGAACCTGACACATCATTGGTTGCCGTTACAGTTGAAGGCGTAAATCTTGATGATGAAAATTCTCAGGAGT
TAACGGAATGGGACTCTGTTGATTGTGGTTTATTTTATGGTGGTCATACAATAGAGCAAGCTGAAAAGGTTGTCATTGAG
CAGCTAAAGTACTCTGCATCAACGCCTGAAAAAAATTGGACTGTTTCGGAGCTAACAAGTTCTAAATCGAAATCTTCAAA
TAACAGCATTGTAAAAGGGCTTGCTGATTCATTTACTGCAATATTAAAAGCTAGGCCAGAACTGATTGGTGCTGGTACGC
TAACAATTAGGCTAGTCAGTAATCGCCCTATTGGTATAGACCTTCAAAAGTCGCTTTCCGATTTTAGTAACAAAAAGTAT
GAAACGCTAAGAATTGCTAGTGGTCTTAACAAAGCCAATTTCAAGAAATTTATTAAACTCTTCGACTTTTCTGACTGTGG
CGCTGGTTCTCGATTTGAGCAGGAGGAAAGTGCAATTAATGAGATTCTAGCTCTTACATTGAGTGCTGATCGAGGGTTTG
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AAACGACCGTACTAAAACAGGTTGAAAATCTATTGCCCGAGGGTTCAGTTATGATTACATATGACTGTTATGGCGCTGGC
ACTTATATGGATAGTGAAGCCTATCGGCATAGATCGAAAGATGCCTACTTGCAATTAATTAATGAAACTTCGGCTCGATT
GCGATTACCTTTGTTGATTAGTCAGGATACTTCAGTAGATCTTATTAAGGCTTTTTCTTTAAGAATCGAAAGTGCAAGCA
AGGTTTTAGAGGCACAAGAAGATAATGCATTGTTGGTCGTCGTTATTGATGCTGCGGATAATTCTGTGACGGGTGCAAAC
CAATGTAAGCCAGAAGAAATCAGTTTCGTTCATGAATTGATTAAAATAGGCAATCTGCCAGCTAATGTTAGATTAATGAT
CTCTGCAAGAACTGGACGTTTAGATTCCTTATCAATTCCATCTAAATACAACTCAGTAGAAATTTCTAACTTCTCATTGG
AAGAAACAGAGCTCAATGTATTAAATCAATTTCCCGGTGTAGACAAAGCATGGGTAGAGGATTTTCATAATTTATCTAAT
CGAAATCCACGAGTACAAAGTTACGCATTCGACTATGCAAAATCAGATGTGGGCAAAGCGATTGAATTTTTAAGACCCAA
TGGAAAGGGGTTGGAACAAATCTTTGAAGCCCGCTTTGAAGAAGCAATTTTGAAGGAGGGTAATTCTGACGTCCTATCTC
TCGTTTGTTCATCGTTAGTAGCACTACCGTCACCAGTTCCAAAGCAACATTTAGCTAGTGTTGCAGGGATATCAATAGAA
AGGGTTAGTGATATTGTCTCTGATCTGCCAGGAATGCGAGTCCTTGATGGCAAGGTGGGATTTCTTGATGAAGATGTTGA
GTTCTTTGTCAGAGAAAAAGCTCGACCAAAGCTGCTGGAAGCTTATAAGCGTTCAGCAGCACACTTCAAAGCTAACCATG
AAAGTGATGAATATTCTGCCATGCATTTGGCTTCAGCGCTATTTTCAGCTGGGCAAGGCCAAGAAATCATAAAAATCATA
GAGAAAAATGAAGCACCAAAAGCTATAAAAGACCAAATAATTCGCCGAGAAGTACAACGTCAGCGGTTACAACTCGCGAT
GAAAGTGTGTCGTTCAGCGGGCGAGCCAGCAGATGCAATATTTACCTTACTGGTTGGCGCAGAGGCGATAAAAACAGATG
ATGCAGTAGATAAAATTATCGCTGAAAACCCCGATTTATCCGTCCATTTTGCGTCTGATACTGTAGGCCGAAATATACTT
TACTCGTCAAAAACATATGAAAGCCATGGTAGGTTCTTATCGCATATTATTGCCCGTGATGCAGCCGACAGGGATTTTAT
CGCTGCCCGCGAAAAGAAACGTATTCTTCGTGAATGGATTAATCGGAGAAGTGAAGATATTGAACGACAAAAATCCGAAC
AAAGCGATCGTCGGTACCAACATATAAATATGTGGCCATTAGAGCTTGCGGATATTACTGCTGTTGCTCATTCAGTGTTG
GATATGGAAGGTTACGAGGCTGCATACAAGTTCATTTGTATTTGGCAACCCAAAAGTATTCATTACAAAATCGCGAACAG
ATTATTGGATCGTCTGTTGTTATCGGACAAGGTAGCGGCAATTCAAGAGTTTTTGGATAGTGGTTGTATTCCAGAACCTT
GGTCATCATTGTTCAAAATACCTTTGGCGCTTGTTGGCTACCGTATTGATTGTTCCTCTCTTGAAAAGTCACTGTGCAAC
AAGGATATATTGAAATATTGCGATCTAAAAGAGCTAGAAAGGTACACTTCAGAAGGCTCAGACGGTTATAGCTACGCGGA
AATGTTACTTAATGGCTGTGAAATTTTGGCTGCCAATGGAATGAATTTATCCTCAGTTGAGCCAATTCTTGAATATCTAT
GCCCTGATAATTGGCGGTTAGTCAATAACATCTACACACACGATATTCTTAAAAACGATGTCGCTTTTAGAGCTTACTCT
TTGTTAATGCGCCATCGTGGTCTCAACGTAACAATAGAGTCCTATTGGATTGATTCACCTATACCTGAAGATCTTAATGA
GGCCGAGAAAAATAGGAAGAAGCAAAAACTATCGGAAAAGCATAAAGAGATAAAGGAAAGCCTGTCAGGTCTAATGTCTG
TTTATGCTGTTAGAGCGGACGTTTTGCTGTCCAATATCTTGCCGGAAAATGCTGAAGAGAAAGTTAAGTCTGCACTGGGT
TCTTTGTTTGCAAATTCCTGGAGGATGTCTAGGGAGCACTATTTTGAATCCATATGTAGTCACCTTTCTTTATCATTAGC
CAAGCTGTCTGTTGTGCCTGATATCAATATGAATATAGTGCTAAGCCTAACTAAGGGAGCGTTTAAACAATGGCCATCTG
TGTTTTCTTCTGGTCAGCGTAAAGTTATTGCAAATCTAATAAAAATACCAGAGTTGAGGTCGTTAGTTGTTAAGGATATT
TACGATCGCTCAGTTGAAGTAACAGCTCTAAAAACAGCAGCAAACGAAAAGATCAGCATTCTTTTGGATTTGTCCAGAAT
ATTACTGTTTGTGGATAAGGACGAAGCCAGAGAAGTATTTAAAATAGCGGTTGATATCGCTAATGACGTTGATGTCGATG
CTATGCATGACATGGCTCTTTTTTCAGCGTTATCTAAAAACGCTAAAAAGCACTTTTCGTCCACAGATTCGCGGAAGATA
GCAAGTCAAATAGCTGCGATAATAACGGAGTACGGCACTCTTCTTGATGGCTATGATAATTTTCCCTGGAATGATGCAAT
TTCTGCTGTTGCTATATTGGATATGCCGCAAGCAATCAGCCTTATCGGTTATTGGGAAGATTGTGATTTAGTTCAAGCCG
GCGATACTCTTCCTGCATTGATGTCGACAGGGGTTACAGAAGGAACTATAAGTTCTGCGCAGGCCGCATCTTTGCTCAAT
TTCTGTGATGATTTACATGAGGAGCTTGTGGTTAAACTAGCTTCAGTTACAAGTGTTCAAGATGCAAGTCAAGTTGTAGA
GGAAATTGCAAAAGCTGAGTTATTGAGATTCAACAGAAGCGGTAGTTCTAAAATATGTCAGGAGTTAAATGCGTTAGTTC
CATATTGCGATAGTAGTGAGTATTGGCATTCAGCACTTAATCAATTAGTTGAATTTAAATCACATACCAAAAAAAGTACT
AAGTCAAAAAATAGCAATGACATACTTGATTCGGCAACTAGGAAATTAAAGGATCGCGAGTTCCTTGAAGGTATAAAATT
AGCAGACGTTTCCTTTGAATCACCTTCCAGTTTTATGATTTCAATTCGCGCTAAGCGAAATGAAGCTAGAGGTGAAGATT
TATATATCACCAACGATGACATATTGAGATCTTTAATCAGTCAGTTGGAGTCAAAAGATCGTATTACCTTTCTGGATTTC
TTGACCGATGAACACGTAATTGATGATCTTGGCTATACATGGGCTAATACGTTAATTGACTGCATTAACCTATGGATAGG
GTCATCTCACTCTATATCTGCTTGGAAAGAGGAAAACCTACCAGTCTTAATTGCTAATCATTTGGGCGAGTTCTCTTATG
ATGAAAATTATGGTTACGACAAGCGGATGCTGAAAGATATTATTCATAGCCTTAACTTAAATAAAGAAGAAGCGGTTAGC
ATACTGCTAGATGGCCTGGAAAAAAATGCCGAATCTTTGCCCTTGACCAAGCTCTATTCGTTAGTCAGGCTGTTGACTGA
TTATTGCAGTGAGCAGCAGATTGCTGATGTCACAATTCGTTATGTTCAGCGACTAACCACACGGTTAAAACTTCCAACGG
ATAAAATTGAGTCGGAGTCTTTAGTTGAATCAGCATTAGCATGCCAACTCTACTCGTTCCTAGGCGACATAGATACTAGA
GTGAGGTGGCGAGCGGCACATAGTATTAGAGCGTCTGCTAGAATGGGAGATTTTAAGACAATTGTGGCGTTAACCGCTTT
GTATGAGCGAAAATCTATGCCCGGCTATCGTGAAGATAGTGTGCCTTTCTATTGGTTGTCAGCGCGTCTTTGGCTCATTG
TTACATTTGATCGAATTGCATCTGAGGTACCGGAAGCCATTGCACCTGTCGCACGCTGGTTGTTGAGCATTGCTACCGAC
CAAGACTTCCCGCATGTATTGATGCGCCATTTTGCTAAATCTTGTTTGATGAAACTTCTTTCAAATGGTTTTATTGATTT
TGATGAACAGGAAATTACAGCATTAGATGCTATCAATACTTCGGAATTAGCTACCAAAAAATCGAAAGGTAGAGTTTATC
GAGGCGGATTTCACAAAGGTAATAAAGAGAGAAGATTTAGCTTTGATTCGCTAGATACTCTCAGTTATGTGTATCCAGGC
GCGATAAGGTGCTTCTCTGATGTTGACCAAGAAATGTTCCTAGATGAGGCGGAAGCTTGGATCATGGATCGCTGGAATAG
TGGTTCTGATTTATCAACATGGGAAAATGAGCCACGAAAATATAAGTTTGAAAGAGCAAACTATAGCCTATACAGCCATA
GTCACGGCTCAATGCCGACGATAGAGCGACACAGTTATTACCTAGAATGGCACGCCATGTGGTGTAGCCTCGGCTCTCTA
ATGGCAGAAAAAGCGTTATCTGAGCCTAAATACGATGATGACGATTATGGAACACTAAACGGATTTTTGAGACAAAACGG
ATTAACTCAACCCCCGCACTGGTCAAGTGATCTTCGTTGTCCAACACCACTAGAAACACGTTTTCATCTTCCTCCTACCG
TCGAGGCAGAAGATTGGGTAGCAGCAATAACCGACAATGATTTTGAGTTGGAACTTGGTTTAACTTCCGAAGATGAAAGT
CTGGTTGTGGATTCATATCATGATATTCGCACCAGTAATCATCGCTCCAGTGTGAGAATATCTTCTTCCCTTGTTAGCCC
AGATACAGGATTATCATTGCTTCGGGCACTACAAACTTCCCGTGATTCTTGGGATTATCGTCTACCACCTGCTGGACATG
AATTTGAGATAGATGATGACCCATTTTTATTACGTGGTTGGCTCAACGAACACTCTGGTGATGCTCGTCTAGATGAAAAG
GATGTGTTTAATCATGATGTCCGCCTAATAGAAGCGACTCCGTCTGAAAATGTCGTTGAAATACTAGGATTGTGTCGTTC
AGATAGCTATCCCGTTAGTTGGCTTGACTCCTCTAATGGAGCAAGAGCATTTCATTATGAAGCATGGGGAGATACAAGAG
GTAACTCCCTGTGGAAAGAATACATTTTTGGTGAAGATGTAATCTCTAATGGACATCGCCTGAAAGTGTCATTACATCAC
CTTAAGCAATACCTAGATAAAGTTGGCTTTGATCTAATCCTTGAAGTCGAAATAACACGAAGAGTAACTAAAGATGGAAT
TACAGAGTATAACGAAAAGTCCGAAAAAGAAGCACGATACGCAAGACTCTATCTTCTCAGAAGAACTGGAGAAATCCTTA
CCACTGAAGGATGTGTTGGTACTTGGACATCACCTAGCGACTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATCAATCATTATGTGCTTGGTTGAATTATTCTTGTTGATTAGCTAGCAATCCAATAGAACCATAGCTCTCAAAAGAGA
TTTGTAGAAATTATCATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCTAGGCTTTTCAGATAGTTGTGACACTCTAGGTAAGTGGATGTCTCATTACCTAGTTGAGGTGATGGAAAGGGCAGAAC
ATGCAGAGAATCCAGAGGAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 2147; Mature: 2147

Protein sequence:

>2147_residues
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Sequences:

>Translated_2147_residues
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>Mature_2147_residues
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Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 241910; Mature: 241910

Theoretical pI: Translated: 5.09; Mature: 5.09

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHCCC
DCGLFYGGHTIEQAEKVVIEQLKYSASTPEKNWTVSELTSSKSKSSNNSIVKGLADSFTA
CCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ILKARPELIGAGTLTIRLVSNRPIGIDLQKSLSDFSNKKYETLRIASGLNKANFKKFIKL
HHHCCCCCEECCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHCCCHHHHHHHHHH
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HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
TWMNVSDPRALFPCPSRLKAVKNPVNRNAAVAIQTAMVNGDQFICLHGEGGSGKTTVLKQ
EEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHH
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HHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCHH
LIKAFSLRIESASKVLEAQEDNALLVVVIDAADNSVTGANQCKPEEISFVHELIKIGNLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
ANVRLMISARTGRLDSLSIPSKYNSVEISNFSLEETELNVLNQFPGVDKAWVEDFHNLSN
CCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCC
RNPRVQSYAFDYAKSDVGKAIEFLRPNGKGLEQIFEARFEEAILKEGNSDVLSLVCSSLV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
ALPSPVPKQHLASVAGISIERVSDIVSDLPGMRVLDGKVGFLDEDVEFFVREKARPKLLE
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AYKRSAAHFKANHESDEYSAMHLASALFSAGQGQEIIKIIEKNEAPKAIKDQIIRREVQR
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
QRLQLAMKVCRSAGEPADAIFTLLVGAEAIKTDDAVDKIIAENPDLSVHFASDTVGRNIL
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEE
YSSKTYESHGRFLSHIIARDAADRDFIAAREKKRILREWINRRSEDIERQKSEQSDRRYQ
ECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HINMWPLELADITAVAHSVLDMEGYEAAYKFICIWQPKSIHYKIANRLLDRLLLSDKVAA
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQEFLDSGCIPEPWSSLFKIPLALVGYRIDCSSLEKSLCNKDILKYCDLKELERYTSEGS
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCC
DGYSYAEMLLNGCEILAANGMNLSSVEPILEYLCPDNWRLVNNIYTHDILKNDVAFRAYS
CCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLMRHRGLNVTIESYWIDSPIPEDLNEAEKNRKKQKLSEKHKEIKESLSGLMSVYAVRAD
HHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLLSNILPENAEEKVKSALGSLFANSWRMSREHYFESICSHLSLSLAKLSVVPDINMNIV
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEE
LSLTKGAFKQWPSVFSSGQRKVIANLIKIPELRSLVVKDIYDRSVEVTALKTAANEKISI
EEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCEEE
LLDLSRILLFVDKDEAREVFKIAVDIANDVDVDAMHDMALFSALSKNAKKHFSSTDSRKI
EEEHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
ASQIAAIITEYGTLLDGYDNFPWNDAISAVAILDMPQAISLIGYWEDCDLVQAGDTLPAL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHH
MSTGVTEGTISSAQAASLLNFCDDLHEELVVKLASVTSVQDASQVVEEIAKAELLRFNRS
HHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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CHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
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>Mature Secondary Structure
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