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The map label for this gene is 59712237

Identifier: 59712237

GI number: 59712237

Start: 1832228

End: 1833814

Strand: Reverse

Name: 59712237

Synonym: VF_1630

Alternate gene names: NA

Gene position: 1833814-1832228 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59712239

Following gene: 59712236

Centisome position: 63.29

GC content: 38.63

Gene sequence:

>1587_bases
ATGAACTTAGCTGATTTTTCAAATTCTCCAATTTCAATTTTGCCCCCGCTTATAGCTCTGGGTTTGGCAATTTTAACTCG
CCGAGTGTTACTTTCTCTTGGTGTAGGTATCGTATTAGGCGCAATCTTACTGTCTAATTATTCCGTATCAGGAACCGCTT
CTTATGTATTTAGTTCTGTCAAAGGTGTTTTCATCGATGGCAATTCTATTAATTCATGGAACATGAGTATTGTTGCTTTC
CTTATTTTGTTAGGAATGACAACTGCTTTATTAACTCTTTCAGGTGGCACACGTGCCTTTGCTGAATGGGCACAAACGAG
AATTAAAAGTAAACGCGGTGCAAAATTACTTGCTGCTTTTTTAGGCGTGTTTATTTTTGTTGATGATTACTTTAATAGCT
TAGCCGTTGGTTCAATATCCCGCCCTGTTACTGACCGTTTTTATGTATCACGTGCTAAGTTAGCTTATATTCTAGATTCA
ACAGCAGCTCCAATGTGTGTATTAATGCCAGCATCAAGTTGGGGTGCGTATATTATTACTATTATTGGTGGCATTTTAGT
TTCACATGGTGTGACTGAATATTCTGCTCTGGGTGCTTATGTTCGTTTAATTCCAATGAACTTTTACGCGGTATTTGCAC
TATTAATGGTATTTGCTGTTGTTTGGTTCCAACTTGATGTTGGTCCAATGCGTCATCATGAAAATGAAGCCGCTCGTGGT
AATGGTTTTGATGACCAGAGTGTTAATTCGGAATCAAAAGATTTAAATGAAGAGCTGAATATTGTTGAGAGTGAAACTGG
TAAAGTTTCAGATTTAATCTTCCCAATTATTACGTTAATTGTCGCAACGATCTCTTTCATGGTTTATACCGGTGGCGAAG
CGTTAGCAGCAGATGGTAAAGCGTTTAATATATTAGGTGCATTTGAAAATACCGATGTTGGTGCTTCACTTTGTTACGGT
GGTTTAATTGGTCTAGCATCTGCACTAATTACTGTATTCCGTCAAGGTCTGTCAGCTAAAGATATAGGTATGACAATGTG
GATTGGTGCGAAATCAATGTTTGGCGCTATTCTAATTCTGTTCTTTGCTTGGACTATTGGTTCAGTTATCGGTGATATGA
AAACTGGTACATATTTATCTAGTTTGGCACAAGGTAGCATTGGTATTCACTGGATCCCTGTAATATTGTTCTTATTATCA
GGAATTATGGCATTCAGTACTGGTACATCATGGGGTACTTTCGGCATTATGTTACCAATCGCTGGTGATATGGCTGGTGC
CACCGATATTGCATTAATTCTTCCTATGTTAGGTGCAGTTTTAGCTGGTTCAGTATTTGGTGATCACTGTTCGCCGATTT
CAGATACTACGATTCTGTCTTCGACAGGTGCTCGTTGTTGCCATATTGATCACGTATCAACTCAATTGCCTTATGCATTA
TCAATTGCAGCGGTTTCAGCTGTTGGCTATATTGTACTTGGTTTTACAAGTTCAGTATTGGTTGCATTTGCAGGTGCAAG
TGTTGCGTTTGTTTTAGCGTGTTTTGCTTTAATGATGATGTCGAAAAGACGCTCAGCAACAGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGGAGCGCTACTGTAGGGGAATGTTATTCATTCACTTCCTTAATAACGATATCTATCGTATCTGCAGTAGATCTCCAAC
CAGACTGGTTGTTGTAGATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTGTTAGATTTTAAAATAAACCGGCTTTAAATGGCCGGTTTTTTATTGCTTTTTTGACGTTAAATCGCGATCATAAGTC
CCTTAATATTCTTTATTTGG

Product: sodium:proton antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 528; Mature: 528

Protein sequence:

>528_residues
MNLADFSNSPISILPPLIALGLAILTRRVLLSLGVGIVLGAILLSNYSVSGTASYVFSSVKGVFIDGNSINSWNMSIVAF
LILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAAFLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS
TAAPMCVLMPASSWGAYIITIIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDVGPMRHHENEAARG
NGFDDQSVNSESKDLNEELNIVESETGKVSDLIFPIITLIVATISFMVYTGGEALAADGKAFNILGAFENTDVGASLCYG
GLIGLASALITVFRQGLSAKDIGMTMWIGAKSMFGAILILFFAWTIGSVIGDMKTGTYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLS
GIMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
SIAAVSAVGYIVLGFTSSVLVAFAGASVAFVLACFALMMMSKRRSATA

Sequences:

>Translated_528_residues
MNLADFSNSPISILPPLIALGLAILTRRVLLSLGVGIVLGAILLSNYSVSGTASYVFSSVKGVFIDGNSINSWNMSIVAF
LILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAAFLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS
TAAPMCVLMPASSWGAYIITIIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDVGPMRHHENEAARG
NGFDDQSVNSESKDLNEELNIVESETGKVSDLIFPIITLIVATISFMVYTGGEALAADGKAFNILGAFENTDVGASLCYG
GLIGLASALITVFRQGLSAKDIGMTMWIGAKSMFGAILILFFAWTIGSVIGDMKTGTYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLS
GIMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
SIAAVSAVGYIVLGFTSSVLVAFAGASVAFVLACFALMMMSKRRSATA
>Mature_528_residues
MNLADFSNSPISILPPLIALGLAILTRRVLLSLGVGIVLGAILLSNYSVSGTASYVFSSVKGVFIDGNSINSWNMSIVAF
LILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAAFLGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDS
TAAPMCVLMPASSWGAYIITIIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDVGPMRHHENEAARG
NGFDDQSVNSESKDLNEELNIVESETGKVSDLIFPIITLIVATISFMVYTGGEALAADGKAFNILGAFENTDVGASLCYG
GLIGLASALITVFRQGLSAKDIGMTMWIGAKSMFGAILILFFAWTIGSVIGDMKTGTYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLS
GIMAFSTGTSWGTFGIMLPIAGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
SIAAVSAVGYIVLGFTSSVLVAFAGASVAFVLACFALMMMSKRRSATA

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55652; Mature: 55652

Theoretical pI: Translated: 6.39; Mature: 6.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLADFSNSPISILPPLIALGLAILTRRVLLSLGVGIVLGAILLSNYSVSGTASYVFSSV
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCC
KGVFIDGNSINSWNMSIVAFLILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAAF
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPASSWGAYIIT
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHH
IIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDVGPMRHHENEAARG
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCC
NGFDDQSVNSESKDLNEELNIVESETGKVSDLIFPIITLIVATISFMVYTGGEALAADGK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCC
AFNILGAFENTDVGASLCYGGLIGLASALITVFRQGLSAKDIGMTMWIGAKSMFGAILIL
EEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHH
FFAWTIGSVIGDMKTGTYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLSGIMAFSTGTSWGTFGIMLPI
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEE
AGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCEEEECCCCCCCCHHH
SIAAVSAVGYIVLGFTSSVLVAFAGASVAFVLACFALMMMSKRRSATA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNLADFSNSPISILPPLIALGLAILTRRVLLSLGVGIVLGAILLSNYSVSGTASYVFSSV
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCC
KGVFIDGNSINSWNMSIVAFLILLGMTTALLTLSGGTRAFAEWAQTRIKSKRGAKLLAAF
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LGVFIFVDDYFNSLAVGSISRPVTDRFYVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPASSWGAYIIT
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHH
IIGGILVSHGVTEYSALGAYVRLIPMNFYAVFALLMVFAVVWFQLDVGPMRHHENEAARG
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCC
NGFDDQSVNSESKDLNEELNIVESETGKVSDLIFPIITLIVATISFMVYTGGEALAADGK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCC
AFNILGAFENTDVGASLCYGGLIGLASALITVFRQGLSAKDIGMTMWIGAKSMFGAILIL
EEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHH
FFAWTIGSVIGDMKTGTYLSSLAQGSIGIHWIPVILFLLSGIMAFSTGTSWGTFGIMLPI
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEEE
AGDMAGATDIALILPMLGAVLAGSVFGDHCSPISDTTILSSTGARCCHIDHVSTQLPYAL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCEEEECCCCCCCCHHH
SIAAVSAVGYIVLGFTSSVLVAFAGASVAFVLACFALMMMSKRRSATA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]