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The map label for this gene is 59712145

Identifier: 59712145

GI number: 59712145

Start: 1720237

End: 1722591

Strand: Direct

Name: 59712145

Synonym: VF_1538

Alternate gene names: NA

Gene position: 1720237-1722591 (Clockwise)

Preceding gene: 59712143

Following gene: 59712146

Centisome position: 59.37

GC content: 37.92

Gene sequence:

>2355_bases
ATGAAAAAACTCTATCGTTACGTTTTATTTACTTTTTTGTTGATATTCTCTCAGCTCAGTTTTGCCAATTGGGATCTCAC
TGACAATCAACCAATAGAGATTAGCGCTCAAGCGACAAATATTGAGGCGGATATTCGTGCACTTCCTGAACAGCATTTCT
TTTCAAATAACGATTATGCTCAAGTAAAACGATTACTTTCTACTACTATTTCGCAGCAAAAAGAGCATGCAACCGCTCTT
AAAGAGGCATTAGCCACTTACAGAGAAGACAGTAGCAATCAAAACTGGATTGCAGTAGAAACTGTTCATCAATCATTGAC
TTCACTAAACCTAAGTAAAGAGCAACTGCTTAAGCTAACAAATAGCACAACACGAGAGCAATTAACCGGTTTTGGTCCTT
ATGGTGTTACCCAATTCTATTCTGAGTTATCCATTACCAAACTCAATATCGAATATTATCTACATTACCAAATTCGTAGT
TTTAAAAACCTACTAAAAGACTTAACCATTTCACCAGTTCCAATTATTAGTGTTATTTTTAAAGTGCTTTGTGTTTTCTT
TATTTTTAGTTGGTGGATGAAAAATAGCTCTCGACTTATCAACGACTTTAAAACATCAAAATTAGAAAACGGCACCAAAC
CGAATTTCTTTATTAGAAGTATTTGGTATTTAACCCGTGCACATAAAGCAATAGCGTGGCTATTATTAATCACGGTCACA
TTACGAATCGTATCCACATTACCAAGCCTACAACACTTAATATTCTTAGAAATCTTCACTTGGTGGATTTTAGGTGGTTC
TATTGCTGTTAGCTTTATTCTTGAATTTATTTATCGCAATAGTAAGCATAACAAAAAAGAAATTATCGCTCTTCGTTTAT
CGACGGTTCGCCATTATGTTTGGGGGATAATTGTTGCAGGCGTAATTTTACAAATATCCTCTCGTACATTAGGACAAGGT
ACTATCTATGCGTGGATAAACTCTCTAATGTATTTATTTTTTGTGCTCCTTACTATTCATACATTAAGAAAGTGGAAACC
AACGGTTTTCGAAAGAATCGAACGTGTTGACCCTCTACCTCTATCTATTCAATGGGCGAAAAGAAATCAAAAGACTTTCC
TTATTTCAATCGCTGCTACCGCTTGTGGCGCCGCTTGGTTATCTTGGCGAGCACTTCAACACTCGATTATTGCACTGTTA
TCGCAATACGCTGCATTCAGTCACGCATTGGCTTACTTATTCAGAATTGAAGTAGCTAAGCAAACAGAAGTTGCACGTGA
GCAATCCAATCTCGTTCGTGTTAAAGGTACGGCAGCATTTGATTACATTGCTCCTGGTTCTGAAGATTCAGAGCTTATTG
AAGATTATGCTAAAGATGAAATGTCTGCTCTTTCACGTTACTTATTAACCGAAAGTCCTGCTGTATGTGTGCTATCTGGT
GAACGTGGTGTAGGTACAACTACCCTTCTTAATCGTATTTTAAATAAAGTAAAAAACGCGACACCGATTTATATTAATTG
CCCATACGATGGCTATTCTGCTTTGCTTCCTGAACTGGCAAAACAATTAGGACTAGATGAAGAATCAAGTGAGCGTGATA
TTCTTCAATACCTGCGTAACAGCGATACTTGTTATCTGCTTGCGTTTGATAGTGCGCAACGGTTAGTAAAACCCAAAGTG
AATGGCTTAGCCGATTTAATGAAACTAACTAATTTATTGCGTCGAGCTCGTAAAAGTCATCGAGTGGTACTGGCTATTGA
GAAATCGTGCTGGCGCTTTATTGACCGTGCTCGTGGCGAAAGATTACTATTTGATTTAGTAACTTTTATGCCTAAATGGG
ATGAAAAGCAAATTGGTCAATTATTAGAGTCGAGAATTACCCTATCTGAAGGTCAACCTACAATTTCATTTGATGGCTTA
GTGCTACCAAGACAGTGGGATGAAGAAAACCTAACAGAGGAAGAACGAGCGAGAAATGGATTCTATCGCATTCTTTGGGA
TTACTCTGATGGTAACCCTACAGTTGCACTTCGTTTCTTTAGATTATCACTTCACCGTGATAAAGACACTGATGCTATTT
TGGTTCGTTTATTTAGAGCACCGCACTCTGATGACTTAGAAACCATGCCAAAACCTATGTTGGCAGTACTTAGATCAATT
GTACAGTTGGAGGTCGCCTCTCCTGCTGATGTATGTGATTGTAGCCGCTTAAGCATGGCTGAAGTTATCAGTACGCTTCG
TTATTTCCAAAGTCGTGGCTACATTGAATGGAGTGATGATAAAGCAAGGATCTCTGATCACTGGTTCCGCCACATTACTA
ATGTTCTTCATCGTCAACATTTATTGGTGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAACATATTCAGTTTTTATTCAATATTCCTAGCTTTGTGACTGGTTTTTTTCAATAAGTTAGCTAAGGTATAATTAAAA
TTATTATTTATTTGGTTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGCTTCGTATTTTTATATTTTTTATAACGCTCGGATTTGGTTCGCTTGCATTTGCAGAAGAAGCACAATCTATCGACA
ACTTACAGCAGTTCGCTAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 784; Mature: 784

Protein sequence:

>784_residues
MKKLYRYVLFTFLLIFSQLSFANWDLTDNQPIEISAQATNIEADIRALPEQHFFSNNDYAQVKRLLSTTISQQKEHATAL
KEALATYREDSSNQNWIAVETVHQSLTSLNLSKEQLLKLTNSTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITKLNIEYYLHYQIRS
FKNLLKDLTISPVPIISVIFKVLCVFFIFSWWMKNSSRLINDFKTSKLENGTKPNFFIRSIWYLTRAHKAIAWLLLITVT
LRIVSTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFIYRNSKHNKKEIIALRLSTVRHYVWGIIVAGVILQISSRTLGQG
TIYAWINSLMYLFFVLLTIHTLRKWKPTVFERIERVDPLPLSIQWAKRNQKTFLISIAATACGAAWLSWRALQHSIIALL
SQYAAFSHALAYLFRIEVAKQTEVAREQSNLVRVKGTAAFDYIAPGSEDSELIEDYAKDEMSALSRYLLTESPAVCVLSG
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VQLEVASPADVCDCSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHRQHLLVK

Sequences:

>Translated_784_residues
MKKLYRYVLFTFLLIFSQLSFANWDLTDNQPIEISAQATNIEADIRALPEQHFFSNNDYAQVKRLLSTTISQQKEHATAL
KEALATYREDSSNQNWIAVETVHQSLTSLNLSKEQLLKLTNSTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITKLNIEYYLHYQIRS
FKNLLKDLTISPVPIISVIFKVLCVFFIFSWWMKNSSRLINDFKTSKLENGTKPNFFIRSIWYLTRAHKAIAWLLLITVT
LRIVSTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFIYRNSKHNKKEIIALRLSTVRHYVWGIIVAGVILQISSRTLGQG
TIYAWINSLMYLFFVLLTIHTLRKWKPTVFERIERVDPLPLSIQWAKRNQKTFLISIAATACGAAWLSWRALQHSIIALL
SQYAAFSHALAYLFRIEVAKQTEVAREQSNLVRVKGTAAFDYIAPGSEDSELIEDYAKDEMSALSRYLLTESPAVCVLSG
ERGVGTTTLLNRILNKVKNATPIYINCPYDGYSALLPELAKQLGLDEESSERDILQYLRNSDTCYLLAFDSAQRLVKPKV
NGLADLMKLTNLLRRARKSHRVVLAIEKSCWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWDEKQIGQLLESRITLSEGQPTISFDGL
VLPRQWDEENLTEEERARNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLHRDKDTDAILVRLFRAPHSDDLETMPKPMLAVLRSI
VQLEVASPADVCDCSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHRQHLLVK
>Mature_784_residues
MKKLYRYVLFTFLLIFSQLSFANWDLTDNQPIEISAQATNIEADIRALPEQHFFSNNDYAQVKRLLSTTISQQKEHATAL
KEALATYREDSSNQNWIAVETVHQSLTSLNLSKEQLLKLTNSTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITKLNIEYYLHYQIRS
FKNLLKDLTISPVPIISVIFKVLCVFFIFSWWMKNSSRLINDFKTSKLENGTKPNFFIRSIWYLTRAHKAIAWLLLITVT
LRIVSTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFIYRNSKHNKKEIIALRLSTVRHYVWGIIVAGVILQISSRTLGQG
TIYAWINSLMYLFFVLLTIHTLRKWKPTVFERIERVDPLPLSIQWAKRNQKTFLISIAATACGAAWLSWRALQHSIIALL
SQYAAFSHALAYLFRIEVAKQTEVAREQSNLVRVKGTAAFDYIAPGSEDSELIEDYAKDEMSALSRYLLTESPAVCVLSG
ERGVGTTTLLNRILNKVKNATPIYINCPYDGYSALLPELAKQLGLDEESSERDILQYLRNSDTCYLLAFDSAQRLVKPKV
NGLADLMKLTNLLRRARKSHRVVLAIEKSCWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWDEKQIGQLLESRITLSEGQPTISFDGL
VLPRQWDEENLTEEERARNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLHRDKDTDAILVRLFRAPHSDDLETMPKPMLAVLRSI
VQLEVASPADVCDCSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHRQHLLVK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90488; Mature: 90488

Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKLYRYVLFTFLLIFSQLSFANWDLTDNQPIEISAQATNIEADIRALPEQHFFSNNDYA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHCCHHHCCCCCCHH
QVKRLLSTTISQQKEHATALKEALATYREDSSNQNWIAVETVHQSLTSLNLSKEQLLKLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
NSTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITKLNIEYYLHYQIRSFKNLLKDLTISPVPIISVIF
CCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
KVLCVFFIFSWWMKNSSRLINDFKTSKLENGTKPNFFIRSIWYLTRAHKAIAWLLLITVT
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRIVSTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFIYRNSKHNKKEIIALRLSTVRHYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
WGIIVAGVILQISSRTLGQGTIYAWINSLMYLFFVLLTIHTLRKWKPTVFERIERVDPLP
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCC
LSIQWAKRNQKTFLISIAATACGAAWLSWRALQHSIIALLSQYAAFSHALAYLFRIEVAK
EEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTEVAREQSNLVRVKGTAAFDYIAPGSEDSELIEDYAKDEMSALSRYLLTESPAVCVLSG
HHHHHHHHCCEEEEECCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEC
ERGVGTTTLLNRILNKVKNATPIYINCPYDGYSALLPELAKQLGLDEESSERDILQYLRN
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHC
SDTCYLLAFDSAQRLVKPKVNGLADLMKLTNLLRRARKSHRVVLAIEKSCWRFIDRARGE
CCCEEEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCH
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HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCEECCCCCCCCCCCHHHHHCCC
FYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLHRDKDTDAILVRLFRAPHSDDLETMPKPMLAVLRSI
EEEEEEEECCCCCEEEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHH
VQLEVASPADVCDCSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHRQH
HHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVK
HCCC
>Mature Secondary Structure
MKKLYRYVLFTFLLIFSQLSFANWDLTDNQPIEISAQATNIEADIRALPEQHFFSNNDYA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHCCHHHCCCCCCHH
QVKRLLSTTISQQKEHATALKEALATYREDSSNQNWIAVETVHQSLTSLNLSKEQLLKLT
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NSTTREQLTGFGPYGVTQFYSELSITKLNIEYYLHYQIRSFKNLLKDLTISPVPIISVIF
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LRIVSTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFIYRNSKHNKKEIIALRLSTVRHYV
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LSIQWAKRNQKTFLISIAATACGAAWLSWRALQHSIIALLSQYAAFSHALAYLFRIEVAK
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QTEVAREQSNLVRVKGTAAFDYIAPGSEDSELIEDYAKDEMSALSRYLLTESPAVCVLSG
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VQLEVASPADVCDCSRLSMAEVISTLRYFQSRGYIEWSDDKARISDHWFRHITNVLHRQH
HHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVK
HCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA