| Definition | Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006831 |
| Length | 1,499,920 |
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The map label for this gene is 58617263
Identifier: 58617263
GI number: 58617263
Start: 856552
End: 863454
Strand: Reverse
Name: 58617263
Synonym: ERGA_CDS_05360
Alternate gene names: NA
Gene position: 863454-856552 (Counterclockwise)
Preceding gene: 58617264
Following gene: 58617258
Centisome position: 57.57
GC content: 34.09
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GTCATCAGTCAGCTATAGATGTGGAAACAGAATCTCATGAAAGATCACAGGTGAAAAGGCGTGGTAAGAAAAAGGATGAG TAACGATTGGATGTTGTTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGCATATAATTTTTTTATATTAATTGTGTAACTTTAGGTAGTTGGATGTTAATACGGAAAGTAATTGTTTAAGTATCAA TGGATATGTAATATTTTGTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2300; Mature: 2300
Protein sequence:
>2300_residues MYNFIKNHFIKLLLLLLMTACESNQHPVPRCIPADVFTEGRTTSVSAYFDPTSENFMSDNKVLGNSVEDNQVVRWKYTGY VTNGHPIVLRAEGMWTSWAKKSNNVTEVQTNTTDYGDDDVDRYNAILAVDRVCGPYKKIEKTFSNGTNQCKVSCEMISGV QDNLETGTYGPPCWFRNGYGAYLLFKRPEDPEPNETITNMRYPTSPVMHIGYKPLELAGTHGISTSSKKIKDSSCKDVEL KPGWKIYIKILDRNYYDNVGGYTVTFIDGIKAEQEFSAFEWVRKEVRGRLDKAGEDLFKNIVKNPVFKNFVFSLLTLFLI FGSLAYILGIVRTPFADIIVRLLKISLMLLLISPNSWDFFYNHLLRLFIHGTDQIIAMINSYTGDYNPQAPFSFMDIMIR DKIFSPVIWKIKIRALIVANFSSIFAVLVIVIAVLIYIALCIYGFVIYLTAFVGITFLVGLMPLLLLGILFSQFKSLFDG WLTQCISFSLQAILIFTLISLFGTLIMNYYYRIFGFTVCYNEWMKVKICLFGRVGCLVDKSLFGWTPGQMYDPKVIGITS DFNVSDKKASSDDPDDIKMSGNARYKFTGGGWYISVPPDHKHKDFRYIDYPFLDPDTESDSNPYGVNVAKDSKLKELSHF VNALLTTDKKYVVARLVADIRVELEKLVKNNTITSESQNKVLNIIDERIKKDKDAGKSELDKYGDQNFKSQIIRSVIDNV IDGAAITPTSQEKLNEQYDYALIQGIRAGDLILWSEVGSLFLAALLIWQMRAFVQSVAVSLAGGSMMSQTIASMYEEGFL KTFSSIPVVGKVFKTIDGGLDSYKLLVGNYITETARRPLNMLQKVPVLGHAVKFTGKVAGGLTSSYGEYDRRHSSNFKQL NYARAFIGAHLGFSPLSAMKYLGGYAAGKMLGSRSGGLIHNMVQDRKAALDSLKAHILGPEQHKPSPYIPKKKEDDSNPF VKNDAKNLGGDSSSPGSKNYDGHVRGEPHSIARTDTGNVRGDSYDTNYAGNVIGDAAVAKGYAGGVVGSSGPITRLELQN QHSLLDDAGNVRVGKDNLADALEAREQLKTMRENTKDETALININYDIDRLDSALHKHLGHDFEQVTQDYASSHMAVQHS ADLSATDYSRLNIDDISKLDSTAQISSASVPDTGQDILHSNAAAQSSMLDVGRDEISDFISASALKEETIPHEVIELNVL GTSSGQSLSSETSVHVQDEVQVDRRETVTAPSDTAQPSALDVELSGGRVSEISSTGASQGETSPEQQLSSEVGVYVQDGV QVERSETVTSPSDTTQPSALDVELSGDGLSDISSTSVSQGETSPQSEEIELNVLGATSEQQLSSEVGVYVQDGVQVERSE AVTSPSDTTQPSTLDVELSGDGLSDISSTGVSQGETSSQSEDLEAIFDQTLIGENESHASTSDNDIEPIASDENVLLGHE NFDSLLDTDPLSHDTQESTGFIDEKSSNEFEESKELVDHKDTIENIPDVDHTPDAFGKELDVPQTSDQELIDMNAEGNSS VNVLSDQYQDTASELSSSESSDGSESRGSESDDKVLEPELQANTYYATDNEVLDVASLELGLSGVAVGNVEPAPEDSGTK PEAFEVESNESEGVVSVTEGHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGEFERDSNAEDTSIDKEVSGKPDIVEPV QEGSETKPEAVEVESNESEGVVSVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVEEFEVAEDTSVDKEVSGKPDI VEPAQEGSETKPEAVEVESNESEGVVSVTEEHSDSAASSGNIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGEFEVAEDTSVDKEVSG KPDIVEPAQEGSETKPEAVEVESNESEGVVDVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGESERDSNAEDAS IDGKEVSGKPDIVEPVQEGSETKPEAVEVEGNESEGVVDVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGESEV AEDASIDGKEVSGKPDIVEPVQEGSTEEESTSVLDEDSKRDVEESEEEGHDTSSDEGTEVDEVDSDGDDSADVEKGSNDT LENDLEAEESKVELTEELAVKDMPEESVTEGRGMKKASVVTDDMSEGLAAVHQVDSGKEFKLQEKMGLEGAQSIHIPKSL KSEEKDAVSKKSSTAKKTESTDSKDSAKEKKGTSTSSKTKKTSLPKIMSGVKILVNQYAKQISTGLSESFDKFFEDTESK KRGKRKRSKEDIESMVRDLEQLLVSLKDKKSKLTDPSEIANIEDDIRKLESTIKSILDNQ
Sequences:
>Translated_2300_residues MYNFIKNHFIKLLLLLLMTACESNQHPVPRCIPADVFTEGRTTSVSAYFDPTSENFMSDNKVLGNSVEDNQVVRWKYTGY VTNGHPIVLRAEGMWTSWAKKSNNVTEVQTNTTDYGDDDVDRYNAILAVDRVCGPYKKIEKTFSNGTNQCKVSCEMISGV QDNLETGTYGPPCWFRNGYGAYLLFKRPEDPEPNETITNMRYPTSPVMHIGYKPLELAGTHGISTSSKKIKDSSCKDVEL KPGWKIYIKILDRNYYDNVGGYTVTFIDGIKAEQEFSAFEWVRKEVRGRLDKAGEDLFKNIVKNPVFKNFVFSLLTLFLI FGSLAYILGIVRTPFADIIVRLLKISLMLLLISPNSWDFFYNHLLRLFIHGTDQIIAMINSYTGDYNPQAPFSFMDIMIR DKIFSPVIWKIKIRALIVANFSSIFAVLVIVIAVLIYIALCIYGFVIYLTAFVGITFLVGLMPLLLLGILFSQFKSLFDG WLTQCISFSLQAILIFTLISLFGTLIMNYYYRIFGFTVCYNEWMKVKICLFGRVGCLVDKSLFGWTPGQMYDPKVIGITS DFNVSDKKASSDDPDDIKMSGNARYKFTGGGWYISVPPDHKHKDFRYIDYPFLDPDTESDSNPYGVNVAKDSKLKELSHF VNALLTTDKKYVVARLVADIRVELEKLVKNNTITSESQNKVLNIIDERIKKDKDAGKSELDKYGDQNFKSQIIRSVIDNV IDGAAITPTSQEKLNEQYDYALIQGIRAGDLILWSEVGSLFLAALLIWQMRAFVQSVAVSLAGGSMMSQTIASMYEEGFL KTFSSIPVVGKVFKTIDGGLDSYKLLVGNYITETARRPLNMLQKVPVLGHAVKFTGKVAGGLTSSYGEYDRRHSSNFKQL NYARAFIGAHLGFSPLSAMKYLGGYAAGKMLGSRSGGLIHNMVQDRKAALDSLKAHILGPEQHKPSPYIPKKKEDDSNPF VKNDAKNLGGDSSSPGSKNYDGHVRGEPHSIARTDTGNVRGDSYDTNYAGNVIGDAAVAKGYAGGVVGSSGPITRLELQN QHSLLDDAGNVRVGKDNLADALEAREQLKTMRENTKDETALININYDIDRLDSALHKHLGHDFEQVTQDYASSHMAVQHS ADLSATDYSRLNIDDISKLDSTAQISSASVPDTGQDILHSNAAAQSSMLDVGRDEISDFISASALKEETIPHEVIELNVL GTSSGQSLSSETSVHVQDEVQVDRRETVTAPSDTAQPSALDVELSGGRVSEISSTGASQGETSPEQQLSSEVGVYVQDGV QVERSETVTSPSDTTQPSALDVELSGDGLSDISSTSVSQGETSPQSEEIELNVLGATSEQQLSSEVGVYVQDGVQVERSE AVTSPSDTTQPSTLDVELSGDGLSDISSTGVSQGETSSQSEDLEAIFDQTLIGENESHASTSDNDIEPIASDENVLLGHE NFDSLLDTDPLSHDTQESTGFIDEKSSNEFEESKELVDHKDTIENIPDVDHTPDAFGKELDVPQTSDQELIDMNAEGNSS VNVLSDQYQDTASELSSSESSDGSESRGSESDDKVLEPELQANTYYATDNEVLDVASLELGLSGVAVGNVEPAPEDSGTK PEAFEVESNESEGVVSVTEGHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGEFERDSNAEDTSIDKEVSGKPDIVEPV QEGSETKPEAVEVESNESEGVVSVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVEEFEVAEDTSVDKEVSGKPDI VEPAQEGSETKPEAVEVESNESEGVVSVTEEHSDSAASSGNIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGEFEVAEDTSVDKEVSG KPDIVEPAQEGSETKPEAVEVESNESEGVVDVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGESERDSNAEDAS IDGKEVSGKPDIVEPVQEGSETKPEAVEVEGNESEGVVDVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGESEV AEDASIDGKEVSGKPDIVEPVQEGSTEEESTSVLDEDSKRDVEESEEEGHDTSSDEGTEVDEVDSDGDDSADVEKGSNDT LENDLEAEESKVELTEELAVKDMPEESVTEGRGMKKASVVTDDMSEGLAAVHQVDSGKEFKLQEKMGLEGAQSIHIPKSL KSEEKDAVSKKSSTAKKTESTDSKDSAKEKKGTSTSSKTKKTSLPKIMSGVKILVNQYAKQISTGLSESFDKFFEDTESK KRGKRKRSKEDIESMVRDLEQLLVSLKDKKSKLTDPSEIANIEDDIRKLESTIKSILDNQ >Mature_2300_residues MYNFIKNHFIKLLLLLLMTACESNQHPVPRCIPADVFTEGRTTSVSAYFDPTSENFMSDNKVLGNSVEDNQVVRWKYTGY VTNGHPIVLRAEGMWTSWAKKSNNVTEVQTNTTDYGDDDVDRYNAILAVDRVCGPYKKIEKTFSNGTNQCKVSCEMISGV QDNLETGTYGPPCWFRNGYGAYLLFKRPEDPEPNETITNMRYPTSPVMHIGYKPLELAGTHGISTSSKKIKDSSCKDVEL KPGWKIYIKILDRNYYDNVGGYTVTFIDGIKAEQEFSAFEWVRKEVRGRLDKAGEDLFKNIVKNPVFKNFVFSLLTLFLI FGSLAYILGIVRTPFADIIVRLLKISLMLLLISPNSWDFFYNHLLRLFIHGTDQIIAMINSYTGDYNPQAPFSFMDIMIR DKIFSPVIWKIKIRALIVANFSSIFAVLVIVIAVLIYIALCIYGFVIYLTAFVGITFLVGLMPLLLLGILFSQFKSLFDG WLTQCISFSLQAILIFTLISLFGTLIMNYYYRIFGFTVCYNEWMKVKICLFGRVGCLVDKSLFGWTPGQMYDPKVIGITS DFNVSDKKASSDDPDDIKMSGNARYKFTGGGWYISVPPDHKHKDFRYIDYPFLDPDTESDSNPYGVNVAKDSKLKELSHF VNALLTTDKKYVVARLVADIRVELEKLVKNNTITSESQNKVLNIIDERIKKDKDAGKSELDKYGDQNFKSQIIRSVIDNV IDGAAITPTSQEKLNEQYDYALIQGIRAGDLILWSEVGSLFLAALLIWQMRAFVQSVAVSLAGGSMMSQTIASMYEEGFL KTFSSIPVVGKVFKTIDGGLDSYKLLVGNYITETARRPLNMLQKVPVLGHAVKFTGKVAGGLTSSYGEYDRRHSSNFKQL NYARAFIGAHLGFSPLSAMKYLGGYAAGKMLGSRSGGLIHNMVQDRKAALDSLKAHILGPEQHKPSPYIPKKKEDDSNPF VKNDAKNLGGDSSSPGSKNYDGHVRGEPHSIARTDTGNVRGDSYDTNYAGNVIGDAAVAKGYAGGVVGSSGPITRLELQN QHSLLDDAGNVRVGKDNLADALEAREQLKTMRENTKDETALININYDIDRLDSALHKHLGHDFEQVTQDYASSHMAVQHS ADLSATDYSRLNIDDISKLDSTAQISSASVPDTGQDILHSNAAAQSSMLDVGRDEISDFISASALKEETIPHEVIELNVL GTSSGQSLSSETSVHVQDEVQVDRRETVTAPSDTAQPSALDVELSGGRVSEISSTGASQGETSPEQQLSSEVGVYVQDGV QVERSETVTSPSDTTQPSALDVELSGDGLSDISSTSVSQGETSPQSEEIELNVLGATSEQQLSSEVGVYVQDGVQVERSE AVTSPSDTTQPSTLDVELSGDGLSDISSTGVSQGETSSQSEDLEAIFDQTLIGENESHASTSDNDIEPIASDENVLLGHE NFDSLLDTDPLSHDTQESTGFIDEKSSNEFEESKELVDHKDTIENIPDVDHTPDAFGKELDVPQTSDQELIDMNAEGNSS VNVLSDQYQDTASELSSSESSDGSESRGSESDDKVLEPELQANTYYATDNEVLDVASLELGLSGVAVGNVEPAPEDSGTK PEAFEVESNESEGVVSVTEGHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGEFERDSNAEDTSIDKEVSGKPDIVEPV QEGSETKPEAVEVESNESEGVVSVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVEEFEVAEDTSVDKEVSGKPDI VEPAQEGSETKPEAVEVESNESEGVVSVTEEHSDSAASSGNIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGEFEVAEDTSVDKEVSG KPDIVEPAQEGSETKPEAVEVESNESEGVVDVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGESERDSNAEDAS IDGKEVSGKPDIVEPVQEGSETKPEAVEVEGNESEGVVDVTEEHSDSAASSESIDKESSEDSQLDQTSMEEQDKVGESEV AEDASIDGKEVSGKPDIVEPVQEGSTEEESTSVLDEDSKRDVEESEEEGHDTSSDEGTEVDEVDSDGDDSADVEKGSNDT LENDLEAEESKVELTEELAVKDMPEESVTEGRGMKKASVVTDDMSEGLAAVHQVDSGKEFKLQEKMGLEGAQSIHIPKSL KSEEKDAVSKKSSTAKKTESTDSKDSAKEKKGTSTSSKTKKTSLPKIMSGVKILVNQYAKQISTGLSESFDKFFEDTESK KRGKRKRSKEDIESMVRDLEQLLVSLKDKKSKLTDPSEIANIEDDIRKLESTIKSILDNQ
Specific function: Unknown
COG id: COG3704
COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Cell membrane; Lipid-anchor (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR007688 [H]
Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 251471; Mature: 251471
Theoretical pI: Translated: 4.15; Mature: 4.15
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYNFIKNHFIKLLLLLLMTACESNQHPVPRCIPADVFTEGRTTSVSAYFDPTSENFMSDN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHCCCC KVLGNSVEDNQVVRWKYTGYVTNGHPIVLRAEGMWTSWAKKSNNVTEVQTNTTDYGDDDV CCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCHH DRYNAILAVDRVCGPYKKIEKTFSNGTNQCKVSCEMISGVQDNLETGTYGPPCWFRNGYG HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCCEECCCC AYLLFKRPEDPEPNETITNMRYPTSPVMHIGYKPLELAGTHGISTSSKKIKDSSCKDVEL EEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC KPGWKIYIKILDRNYYDNVGGYTVTFIDGIKAEQEFSAFEWVRKEVRGRLDKAGEDLFKN CCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVKNPVFKNFVFSLLTLFLIFGSLAYILGIVRTPFADIIVRLLKISLMLLLISPNSWDFF HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHH YNHLLRLFIHGTDQIIAMINSYTGDYNPQAPFSFMDIMIRDKIFSPVIWKIKIRALIVAN HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHEEHH FSSIFAVLVIVIAVLIYIALCIYGFVIYLTAFVGITFLVGLMPLLLLGILFSQFKSLFDG 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KVLGNSVEDNQVVRWKYTGYVTNGHPIVLRAEGMWTSWAKKSNNVTEVQTNTTDYGDDDV CCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCHH DRYNAILAVDRVCGPYKKIEKTFSNGTNQCKVSCEMISGVQDNLETGTYGPPCWFRNGYG HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCCEECCCC AYLLFKRPEDPEPNETITNMRYPTSPVMHIGYKPLELAGTHGISTSSKKIKDSSCKDVEL EEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC KPGWKIYIKILDRNYYDNVGGYTVTFIDGIKAEQEFSAFEWVRKEVRGRLDKAGEDLFKN CCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVKNPVFKNFVFSLLTLFLIFGSLAYILGIVRTPFADIIVRLLKISLMLLLISPNSWDFF HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHH YNHLLRLFIHGTDQIIAMINSYTGDYNPQAPFSFMDIMIRDKIFSPVIWKIKIRALIVAN HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHEEHH FSSIFAVLVIVIAVLIYIALCIYGFVIYLTAFVGITFLVGLMPLLLLGILFSQFKSLFDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLTQCISFSLQAILIFTLISLFGTLIMNYYYRIFGFTVCYNEWMKVKICLFGRVGCLVDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHCC 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