| Definition | Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006831 |
| Length | 1,499,920 |
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The map label for this gene is 58617006
Identifier: 58617006
GI number: 58617006
Start: 467308
End: 469269
Strand: Reverse
Name: 58617006
Synonym: ERGA_CDS_02790
Alternate gene names: NA
Gene position: 469269-467308 (Counterclockwise)
Preceding gene: 58617007
Following gene: 58617005
Centisome position: 31.29
GC content: 27.57
Gene sequence:
>1962_bases ATGATAATTAATAACAGATCAAAAGTACCTCTTATTTTATTAGGTATATTAGTTACTATAGTCATCATAATACTTATAAC TTATTTTCAATTCATAAGACCACTGAACAAGGATTCTTTTGATAAGTATCTTATTGGCACTTTATACATCTTAGGTGCAT TTATTTTTTCCTTAGCATTAGATTTTATAGAATATCACTTTGGTTTTTCAATAAAATATATAGGTAGAGATCAGGCTTTA AATATTGATACAAGCAAACAATCTAGTATTTTCATAAGTATGTCTTCTGATGAACTATCTAAGATAGAACATGAATACAA GATTACAAAATTTTCTATTAAAGATACAAAAAGTAACTCTAGTCCTCAAATTTATATAGAATACTCTGCAGGATTACTTA GTAATATTACATCACCAGGTATTAATATTCACGAAACATTACTACTAAACACTAATGAAAGTATTGACATAATAAAAAAA CGTGAAGATGTTTCAGGGTTATTGATCAATACAGAAAATAATACTTTACAACAACAAATCCAAGGAAAACAAATAACTAG ATGTATTCCAACTCTACACAACAACTTAACACTTTCGCTCAGTCTATACTATGCTATATTTGATAGCTCTATAAATAATT TAACATACTATACTAAACAAGAGTTACATGACATTTTAATGAGCCAAGCTATTTGTGATGATACTACATCCAATGTTAAG CAAAGTGTATATGGTCACATAGTGTCAAAGATTTTAAAAGACTGTCCTGTCACAAAGTTAGATATCAATAATCCTTGGAT TAATACTAAAGAAGGTAAATTAGCTATAGCTTTTTTCACAAAGTTTAATCCTGAGAATGGTTTTGACATTGATGAATTAT CTATGAATTTAACAAGAGAGCTAAATATCAAGTTAAAACATATTACAGATTATGTTAAACATCTTCAATATAGTTATAAA TTATTTTATCAATCAACAAAAACACTAGATAGCATATTACAAGAATCAATAAAACATTCTGAAACAGATATTAATGAACC ACTTATGAAGCTAATAAACAAGCTAAAAAACACACTAAAACGCATACCTGAGTGTACTCAAAATTCTCAAGATATTCACA AGTTATCTATTAAATCAATAATAAAAGACCTACAGTATCAACTAGAAGATATACTGAATTATAGAGATCATCTCGAAAGT ACCTTAGAGCACCCAATAAACGATGCTACCCAAGATTCCCTAGCATTATTTGATGCTTTAATTACAAGATTACGTAATCC AATAAACAGTACACGAAACTACATTAACAATATTAAATACCATAGTAAAATAATACAAGATATTGAATACAATAAAGCAA TTATTTCTGAAATTAGAGATACATATTTTAATACATCTTATGATATAAATCACTATTCACATTTGTGGAAAAATCGTCTT TCTAAGGAAGGCTCACTTCATATTCTAGATATATTAAAAGAAAAAATTGATCAAAATACAGAACTTCAAGATATCTGTAA TCTTGCCGTAATTGATACTTTTGACACCAACACAAATAATCAAAGAACTAACGAAGCTATCAAACATATATTACCACAAC CAGAATCTGAACCATTGATAAGTATAACAGATAAAATAACATCTATGATAGATGCTAATACTGGGCTAATTAGTCCTGAT AATGACCTCATTAGTAAAAATGGAATATTACCTACACTATTCCCTGACAATCAACCTTGCTCTTTTCATGAATTAATAGA ACACGCAAGACATTACATAACAACCTTATGTAAGGAATATATGGTATCTTACATTGAAAGAGAAATACAAATAAATAATG TACAAGTAAATAATATCGTATGGTTACCTGAAAAAACAACAATAAGTAATCAGCATTCTATTATAACGTCACCAGAACAG GTCACAGATCTAAGTTCAACTACACAATATAAACAATCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAAATATTGATATATGTTAAAAAATAAAAATTTTAATTTTTCTTACATAATTATTTTTTTTATGATACTAAGTAGTTAA TTATTAATAATTTTTTTCTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTAGTATTTTGAACTATTTAAAGTTAAATTCTTATAATATTAATATATTTTAAATAAAAAGTGTTATTTATAGGATAT ATTAAAAGTTTACTAATTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 653; Mature: 653
Protein sequence:
>653_residues MIINNRSKVPLILLGILVTIVIIILITYFQFIRPLNKDSFDKYLIGTLYILGAFIFSLALDFIEYHFGFSIKYIGRDQAL NIDTSKQSSIFISMSSDELSKIEHEYKITKFSIKDTKSNSSPQIYIEYSAGLLSNITSPGINIHETLLLNTNESIDIIKK REDVSGLLINTENNTLQQQIQGKQITRCIPTLHNNLTLSLSLYYAIFDSSINNLTYYTKQELHDILMSQAICDDTTSNVK QSVYGHIVSKILKDCPVTKLDINNPWINTKEGKLAIAFFTKFNPENGFDIDELSMNLTRELNIKLKHITDYVKHLQYSYK LFYQSTKTLDSILQESIKHSETDINEPLMKLINKLKNTLKRIPECTQNSQDIHKLSIKSIIKDLQYQLEDILNYRDHLES TLEHPINDATQDSLALFDALITRLRNPINSTRNYINNIKYHSKIIQDIEYNKAIISEIRDTYFNTSYDINHYSHLWKNRL SKEGSLHILDILKEKIDQNTELQDICNLAVIDTFDTNTNNQRTNEAIKHILPQPESEPLISITDKITSMIDANTGLISPD NDLISKNGILPTLFPDNQPCSFHELIEHARHYITTLCKEYMVSYIEREIQINNVQVNNIVWLPEKTTISNQHSIITSPEQ VTDLSSTTQYKQS
Sequences:
>Translated_653_residues MIINNRSKVPLILLGILVTIVIIILITYFQFIRPLNKDSFDKYLIGTLYILGAFIFSLALDFIEYHFGFSIKYIGRDQAL NIDTSKQSSIFISMSSDELSKIEHEYKITKFSIKDTKSNSSPQIYIEYSAGLLSNITSPGINIHETLLLNTNESIDIIKK REDVSGLLINTENNTLQQQIQGKQITRCIPTLHNNLTLSLSLYYAIFDSSINNLTYYTKQELHDILMSQAICDDTTSNVK QSVYGHIVSKILKDCPVTKLDINNPWINTKEGKLAIAFFTKFNPENGFDIDELSMNLTRELNIKLKHITDYVKHLQYSYK LFYQSTKTLDSILQESIKHSETDINEPLMKLINKLKNTLKRIPECTQNSQDIHKLSIKSIIKDLQYQLEDILNYRDHLES TLEHPINDATQDSLALFDALITRLRNPINSTRNYINNIKYHSKIIQDIEYNKAIISEIRDTYFNTSYDINHYSHLWKNRL SKEGSLHILDILKEKIDQNTELQDICNLAVIDTFDTNTNNQRTNEAIKHILPQPESEPLISITDKITSMIDANTGLISPD NDLISKNGILPTLFPDNQPCSFHELIEHARHYITTLCKEYMVSYIEREIQINNVQVNNIVWLPEKTTISNQHSIITSPEQ VTDLSSTTQYKQS >Mature_653_residues MIINNRSKVPLILLGILVTIVIIILITYFQFIRPLNKDSFDKYLIGTLYILGAFIFSLALDFIEYHFGFSIKYIGRDQAL NIDTSKQSSIFISMSSDELSKIEHEYKITKFSIKDTKSNSSPQIYIEYSAGLLSNITSPGINIHETLLLNTNESIDIIKK REDVSGLLINTENNTLQQQIQGKQITRCIPTLHNNLTLSLSLYYAIFDSSINNLTYYTKQELHDILMSQAICDDTTSNVK QSVYGHIVSKILKDCPVTKLDINNPWINTKEGKLAIAFFTKFNPENGFDIDELSMNLTRELNIKLKHITDYVKHLQYSYK LFYQSTKTLDSILQESIKHSETDINEPLMKLINKLKNTLKRIPECTQNSQDIHKLSIKSIIKDLQYQLEDILNYRDHLES TLEHPINDATQDSLALFDALITRLRNPINSTRNYINNIKYHSKIIQDIEYNKAIISEIRDTYFNTSYDINHYSHLWKNRL SKEGSLHILDILKEKIDQNTELQDICNLAVIDTFDTNTNNQRTNEAIKHILPQPESEPLISITDKITSMIDANTGLISPD NDLISKNGILPTLFPDNQPCSFHELIEHARHYITTLCKEYMVSYIEREIQINNVQVNNIVWLPEKTTISNQHSIITSPEQ VTDLSSTTQYKQS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75218; Mature: 75218
Theoretical pI: Translated: 6.24; Mature: 6.24
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIINNRSKVPLILLGILVTIVIIILITYFQFIRPLNKDSFDKYLIGTLYILGAFIFSLAL CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DFIEYHFGFSIKYIGRDQALNIDTSKQSSIFISMSSDELSKIEHEYKITKFSIKDTKSNS HHHHHHHCCEEEEECCCCEECCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCC SPQIYIEYSAGLLSNITSPGINIHETLLLNTNESIDIIKKREDVSGLLINTENNTLQQQI CCEEEEEECCCHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHH QGKQITRCIPTLHNNLTLSLSLYYAIFDSSINNLTYYTKQELHDILMSQAICDDTTSNVK HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH QSVYGHIVSKILKDCPVTKLDINNPWINTKEGKLAIAFFTKFNPENGFDIDELSMNLTRE HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCHHH LNIKLKHITDYVKHLQYSYKLFYQSTKTLDSILQESIKHSETDINEPLMKLINKLKNTLK HCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RIPECTQNSQDIHKLSIKSIIKDLQYQLEDILNYRDHLESTLEHPINDATQDSLALFDAL HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH ITRLRNPINSTRNYINNIKYHSKIIQDIEYNKAIISEIRDTYFNTSYDINHYSHLWKNRL HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH SKEGSLHILDILKEKIDQNTELQDICNLAVIDTFDTNTNNQRTNEAIKHILPQPESEPLI CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SITDKITSMIDANTGLISPDNDLISKNGILPTLFPDNQPCSFHELIEHARHYITTLCKEY HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MVSYIEREIQINNVQVNNIVWLPEKTTISNQHSIITSPEQVTDLSSTTQYKQS HHHHHHHHHEECEEEECCEEECCCCCCCCCCCCEECCCHHHHCCHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIINNRSKVPLILLGILVTIVIIILITYFQFIRPLNKDSFDKYLIGTLYILGAFIFSLAL CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DFIEYHFGFSIKYIGRDQALNIDTSKQSSIFISMSSDELSKIEHEYKITKFSIKDTKSNS HHHHHHHCCEEEEECCCCEECCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCC SPQIYIEYSAGLLSNITSPGINIHETLLLNTNESIDIIKKREDVSGLLINTENNTLQQQI CCEEEEEECCCHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHH QGKQITRCIPTLHNNLTLSLSLYYAIFDSSINNLTYYTKQELHDILMSQAICDDTTSNVK HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH QSVYGHIVSKILKDCPVTKLDINNPWINTKEGKLAIAFFTKFNPENGFDIDELSMNLTRE HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCHHH LNIKLKHITDYVKHLQYSYKLFYQSTKTLDSILQESIKHSETDINEPLMKLINKLKNTLK HCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RIPECTQNSQDIHKLSIKSIIKDLQYQLEDILNYRDHLESTLEHPINDATQDSLALFDAL HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH ITRLRNPINSTRNYINNIKYHSKIIQDIEYNKAIISEIRDTYFNTSYDINHYSHLWKNRL HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH SKEGSLHILDILKEKIDQNTELQDICNLAVIDTFDTNTNNQRTNEAIKHILPQPESEPLI CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC SITDKITSMIDANTGLISPDNDLISKNGILPTLFPDNQPCSFHELIEHARHYITTLCKEY HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MVSYIEREIQINNVQVNNIVWLPEKTTISNQHSIITSPEQVTDLSSTTQYKQS HHHHHHHHHEECEEEECCEEECCCCCCCCCCCCEECCCHHHHCCHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA