Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is pdpD1

Identifier: 56708416

GI number:

Start: 1401453

End: 1405040

Strand: Reverse

Name: pdpD1

Synonym: FTT_1360c

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 56708418

Following gene: 56708415

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>3588_bases
ATGGATCAAGATATCAACGATTTATTATATGATACTAATGATTTGAAAAAAGAAAAAGTATGTGGCGGCTTTTTTGATTT
TATCAAAGCTTGGTTTTATAATGACGTTGAAAGACATATGTTTTTTGAAGATGAGATTATTGTGGCTCAGAAACTTAAAA
CGATGGATGTCATGGCTAATACATACGCCTTAGAGAGAAAAAAATATTTTGAAAAATTTCTCAAAGATTCTCATAAACAA
AAAGGTTTTTTTACAAGAATAAAAGATAGAGATTTTGCTTTTTATAAAGATCCTACTAGGGTTAAACTATGGAGTAGTAT
TACTGATACTGATGTCTATAGCTTTTTTATAAAGTCAAGCGTTAACCAAGTGCTTGGTGGTGGTAATATAGCTCAACTGA
CATCATTACCAAAATTTAAGTTTAATGCAATAGCATCAGTTAATAATGAAAACATCTCGGCAGCAGCTAATCTTGCAGCT
ACTGGAGCAAAAAGTTTTTTTGGAAGTTCATGTATAAATATTTGGTCTAATTTACCTGTATTTGATAGTGAAAGAGGAGA
TGTTAAATCATTTATTCCATTATACCTAAGAATAAGTGGTAAAGCTTCATCGGCATTATTTAATTATAATATAGATATAA
GTGCTAGCACAAATAGATTAAAATTTACTGAATCAAAATGCATGGAATTATTAAATAACTTTAAGGGCAATGTAAATCTT
AGATTAGTGGCTGCAAAAAGCTCTAGAGAAGCAAAAAGCTTTATTTATACTCCAAAATTTAAAGAAGATAGTAATAAGCA
TTTAAATGATTTAGGTTTTATTCTAAATACTCAGCAAGGTTCATATAGATATTTAGTTCCTGAAATTAGGGATGGACTTG
ATCTAATTAGAGAATATACATACCCCGAAATTGAACAGATTTATTTTGGTAGGAGTGCACTTTCTGGTTATTCAAAAAGT
AATTATGACAAGCAAAGTTTAGGTATTGAGAAAAATGGTGAGGGTCTTATGACTCTTAGGGTTAGTTCCAAAGATTATGA
AAATCCACTAATTCAGGTCAAAACATCAGTTAATGTAACTAGTTTTGATCTTTTATCAGGACAAATAAAAGGTAAGATTT
TAGCTGATGACTTAATTGGTTTTTCAGATGCTAAAGGTGCTATTAATAAGTTCAGAAACGAAGTTGATACAATTATTAAA
AACAATATTAGTGAAAGCTTTAAGTCTCCTTTTAAGATACCAAACTTATCTGAATTTAGTGATATGGAGATAAGAGTGAG
GTTTGGCTTATATTCTAAACAATCAGCATCCAAGTTGAGGACCATAAGAATCTCTATTCCTATGACTACTAAAATGTTAG
ATTTTAATCAAACATCTGGGTCATATAATACAAAATCAGGTATGGGTTATTCAATGGCTCAGAGACATCAATTAAAAGAA
GCAATACCTTATAATGAAGGTCTTCTAGAAAATTCTGCTCAGCAGGATTTTGATTTGGTTAAACCAACCGGAAATAGTAC
TCTTGGAGCTGTGCAAGATAATTTATCAAACATATATGATAAAAGTAGTACGTTTGACTCAGTAATAGGTTCTTTGAGAG
AGCTTTATAAACTTAAAGGTGAAGACCTAACAAATATTGATTCTCATGATATCCTTAATGTTTTATCACAAAACTCGTCT
TTATCAGGGTTATCTAGTAGTATCGCAGCAGATCTAAATGAGTTAAACTCTAAGTTTAAGGATATTACGTCTATAAATAA
AAAAACATCTGAAGCGATATTATCTACGAATTACCAGCAATATAATCCTAGTTTTAATAAAGCAAAAATATTCGATAATC
CAGATTCTTTCTATGTTCAAGATACTTTAATTAACTACTCACAAACCCTAAAAAAAGAAGAATTTAGAGATCAGATGTCA
ACAATAAATATTATTGAATTTGGTAGTGATGGTGACTTACCTATATTATTTAATCTTTGTAAAATGATGACTAGCGAGTC
AGCAAAAGATGGCGCAAAAAATTTTCTAAGTCAAAAGGAGAATGTTAATAAGACTAAAGAGTTTTTTGATGCTCTAGAAA
ATACCACTTCTGTAATAAGTCCAGAATCAAATATCAGTTATACATCTATTAATGTGCTTTGTAGCAAAAATGCTGGAGGT
GTAATTACTGAGAATAACAAAGCATCTTCTGTATCCCTAGGTTCAACTATTAGTTTAGCGGATTTTAATAGAATGTATTC
GCTTGACTCAAGAGTTTCTGTGCTTGGAGTATCTCCTTTAGAAGAGTTATCAAGTTTTTCAGCGAAAAAAAATGAATATA
AAATCACTTTTGAAGAATATTTTACTAAGTTAGCGATTCAAAGATATATGGAAGTTATTATGATAGATGATGAAGCTGAC
TTTATAAAATCATTTGTATTACCAATGATGGAGTGTCAAAAGAAACTATTAGATAATTTAGTTATTCTAAATAAGGATGC
TAAATGGAAAAGTAGTTCATCATTTAAGAGAGCTTTCTCAAATAGAGGTAGTTTTAGTTTTACTGGTTGGCTTAAAGAGA
GACTTCCTGGCTTTGATTTTGAGCTTTCTCAGGAGTATGCTTATTTTACTGGCTTAGTAATAAACTTTGCCTTTGAAGAA
GATAACTCTTCTTCTGAAACTGTAATTAAACTATGTAAAATTATAAAATCTTTAGATAGGCTTGTTCGAGGTTTTTATTT
CTTACTAAGAAGGATGGTGAAAAATAGAAATACTAAAGTTGGTTCTCATAATGTCTCTGAAAGTCACATTAATATGGTTA
AGCAGATTTTAACATCCTTATGTGAACCATATCAGATTTTAACTCAGAAGGTAAGCGATAATGCTGAACTGTTGTCTGCT
TTAGTTAATATGTTGAGTTTTATGGATAGCCTTGTTGAAGTACAGCGGCTATGTGCTTCGATTTGTATTCCAACCAGTGC
ATTTTTCACTTTAGTGAATGAAAATAAAAATTTGTTGAAAGATATTTGCTACACTGTCGAAAAAAGTGGTGTTACAGGAA
TAGTGGTTGAATCGACATTTAGCTATTCGCCAGAACTCTTCAAAGAAAATCAACAAGATATTAAGCTTAACATTAAAAAC
ACGTCAGTCAGAGTACGAGATGGTAAAGTCAAGAGGGTTACCAGCATTGATAGGAATGCTAATACTGAAGCTATCTTACA
AAGTATTTATGATAATATAATTGCGTTTGATGAACAAGATTTAGAAAGACTATTTACGGGGTTTAGGATTTTAAAACAAG
AAAATTCGACAAACACTAATAAAGCCGTTTTCAATATTGGTTTAACATATCATCCAATAACTAATAATGCTTTTGTTGAA
TTTAATAAGGATCAACAAAGTTTATTGTACTCATATAATAATTTAAGCAAAGATGCGTATGTTACAAAAATTAAAAGTAT
AGTTGATGCTAAAGTTGCTTTAAACCTTAGTTTTGAACATGAAGAGATTAGAAGTTCACAAGGTTTTAGTGTCTTAGCAA
CTGTACCAGCTAGAGGATATTCTATAGATGATTTAAATAGAAAGTATAGACCAATGATCTGGGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAACAATCATAAAAGCGCTGTAAAATAGGTTTATCCAATCATAAGGTTCATGTAAGAATAAAGATTATACTATGGTT
TACTTGTAAGAGTAGTAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAGCTGTATAAACATTGTGTTATTGGCGTTGTTAAGGTAACTTGCTTATAAGGTGTTGTGAAAAAAAGGACAATAAG
ATGGCAAAAAATAAAATCCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1195_residues
MDQDINDLLYDTNDLKKEKVCGGFFDFIKAWFYNDVERHMFFEDEIIVAQKLKTMDVMANTYALERKKYFEKFLKDSHKQ
KGFFTRIKDRDFAFYKDPTRVKLWSSITDTDVYSFFIKSSVNQVLGGGNIAQLTSLPKFKFNAIASVNNENISAAANLAA
TGAKSFFGSSCINIWSNLPVFDSERGDVKSFIPLYLRISGKASSALFNYNIDISASTNRLKFTESKCMELLNNFKGNVNL
RLVAAKSSREAKSFIYTPKFKEDSNKHLNDLGFILNTQQGSYRYLVPEIRDGLDLIREYTYPEIEQIYFGRSALSGYSKS
NYDKQSLGIEKNGEGLMTLRVSSKDYENPLIQVKTSVNVTSFDLLSGQIKGKILADDLIGFSDAKGAINKFRNEVDTIIK
NNISESFKSPFKIPNLSEFSDMEIRVRFGLYSKQSASKLRTIRISIPMTTKMLDFNQTSGSYNTKSGMGYSMAQRHQLKE
AIPYNEGLLENSAQQDFDLVKPTGNSTLGAVQDNLSNIYDKSSTFDSVIGSLRELYKLKGEDLTNIDSHDILNVLSQNSS
LSGLSSSIAADLNELNSKFKDITSINKKTSEAILSTNYQQYNPSFNKAKIFDNPDSFYVQDTLINYSQTLKKEEFRDQMS
TINIIEFGSDGDLPILFNLCKMMTSESAKDGAKNFLSQKENVNKTKEFFDALENTTSVISPESNISYTSINVLCSKNAGG
VITENNKASSVSLGSTISLADFNRMYSLDSRVSVLGVSPLEELSSFSAKKNEYKITFEEYFTKLAIQRYMEVIMIDDEAD
FIKSFVLPMMECQKKLLDNLVILNKDAKWKSSSSFKRAFSNRGSFSFTGWLKERLPGFDFELSQEYAYFTGLVINFAFEE
DNSSSETVIKLCKIIKSLDRLVRGFYFLLRRMVKNRNTKVGSHNVSESHINMVKQILTSLCEPYQILTQKVSDNAELLSA
LVNMLSFMDSLVEVQRLCASICIPTSAFFTLVNENKNLLKDICYTVEKSGVTGIVVESTFSYSPELFKENQQDIKLNIKN
TSVRVRDGKVKRVTSIDRNANTEAILQSIYDNIIAFDEQDLERLFTGFRILKQENSTNTNKAVFNIGLTYHPITNNAFVE
FNKDQQSLLYSYNNLSKDAYVTKIKSIVDAKVALNLSFEHEEIRSSQGFSVLATVPARGYSIDDLNRKYRPMIWV

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA