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The map label for this gene is 54295583

Identifier: 54295583

GI number: 54295583

Start: 3041044

End: 3042963

Strand: Reverse

Name: 54295583

Synonym: lpl2670

Alternate gene names: NA

Gene position: 3042963-3041044 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54295589

Following gene: 54295582

Centisome position: 90.95

GC content: 32.14

Gene sequence:

>1920_bases
ATGTTAGTACAAGACATTCGTAGGTTTCTTGATGAGCTGAGGGAATCGAAAACTATTCTTCCCTGTGATAAAAGATTATC
CGCTATTTTACAAGAGCATTTCTCCCATAGAGACAGTCATGAAGAGTTAACCTCCAATGATATTCAAATTGTTTTGCAAT
GTTTTAGCGAACGCTGGATTGCTGACTCAGAGTGTGATTATCTGCTTTATCCTTCTCAGGCAAACCAGGTTTGGATCAAA
TTGGCTCATGTGATAGAACCATTCACAGATAAAAATTATTTGCAAATTTTGCTGCCCCACATAACCAATCAGTTTGATTT
TAATAATTTAACTCCATTGACTGAAACCGTTCGATTGGAAAATTTTTATCTTGGATATGATGGAAAAACTTTATATAGAA
AAAGAGGATTATGTGAACGTTTGCTTGATAATCAATTTGAGTTATCTACTTGCAGAACACTAAAAACCAAACAATGTGAA
GTAATGACTATTGAAGAATTAACGAGGTTATATAAAGGAAAATATTGCAATGGAGAATTTTCTATTGACAAGGAAAAATT
TGATAATTTTTGGGATTTTCTATACAAAAAAGCTTTTCCCCGAATGCAATCAAGAGGTGAAATTCCATTAGAAGTACTTC
CTCATTTGCTTATATTAATTGAGAGTTATTATCATTTAAAAAATTCTGGAGCAGATTTTAAATTATTTACAGCAGAGATT
CACAAATTTTTTAAAATATTATATCAGTTTAAATTAGAAAATATTAATTTTCTCTATGGGGTTAAAATTCTATATCATGG
AAAAGAATACTATCTATTAGAACTTTTTGTTTTAATCAACATGGCGCAATCTTATGATGTAGATGAACAGTTAAAAGCTA
TAATGAGTTGGCTGCATCAATTTAATCCTATATTAAAGGCATCAAATAAAGGGTTACTATCTTTTTATGCAGGATTGGAA
CCAAAATTCCACTCGGAAGGTCACTTGGAGAAGAGAGTAGAAACTGCCACAGATGATTTATTGTATCGTATTAAAACTTT
TTTAGTGTCATTATTTGTTACCCCATTCGAAGTTTTTCCTTTTTCAGGTAAAACAATCAGTTTTTGGGATATCAAAAATG
TAATCTTTTCGGAAGGACAAGAGATCCATAATCAGTTTACTCCTTTCATAATGACGAACAAATTAGACGCTTTAATTGCA
GTCTATAAAAAGATAATGGATGAGCACATTATCCCTTGCCAAAAAAATAAACACATTTGCAAATGGCTGACACACTATCA
ATCAACGCTGGATTGGTATCAGCTAGTAGAGGCGGGTGATTTATCTAAAATGGACGTTTATTGGTTTGACCCGGAATTAT
TATTTCATGTTTTAGTACATTTTAGATTGATTAATAAATCATTGGGCGAAAAAACTGTTAATTTTTTGGATGAATTAATA
CATACTTATGCTCAAAATAATAATGAGTTTCAAATTCAACTGAGAGTCAATATTTTATTTTCCAGATTCTTGAAGAGTTT
AGATGAGCAACAGAGACGAAAATTAATTTTAACTTTGTCATTGTTTGATCCTGTAGAGGCTAAAAGTAAATTTTTAACGA
ACTGCATTCATTATGTGACAAACCGACTATGTCAAATTAGCATGCATCAGTTAGTCAGTTCACCTAATTTTTTTGGCACT
TACCAATGCATAGATAGTAAGAAATTGTTAATTAATAAAACAGATGTAAAGCAAGTGAGTGCTATTTTGGAAGCCTTTAA
AGAAATGCTTCATTCGTTAGAAGAGCGTTGTAACCTTGAGCAATTGGAAAATATGCTCATTTTCCTGCGAAATATAAGCC
GCCCTATTTTGACTGTTGCGGAAATAGAAGAGGCGCAACAATCAGCCCGAGTTATCGATTATATAGGCGCTCCGACCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGCAAGCGTGACATTGTTTAGGTGATTCCAGTTCAATAGTATTGATAGAGAATGCTTGTTAGTTCAATTTGGTTTATTA
AGGATAGGCTGCAGACTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTAATTAACTGGAATTATCCTAATTTATTATTGTGCATTTTGATCTCATCGCGTTGATAAGGATTGATTGTCTTGGCCT
GGATGAGCAAAGCTTGCTCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 639; Mature: 639

Protein sequence:

>639_residues
MLVQDIRRFLDELRESKTILPCDKRLSAILQEHFSHRDSHEELTSNDIQIVLQCFSERWIADSECDYLLYPSQANQVWIK
LAHVIEPFTDKNYLQILLPHITNQFDFNNLTPLTETVRLENFYLGYDGKTLYRKRGLCERLLDNQFELSTCRTLKTKQCE
VMTIEELTRLYKGKYCNGEFSIDKEKFDNFWDFLYKKAFPRMQSRGEIPLEVLPHLLILIESYYHLKNSGADFKLFTAEI
HKFFKILYQFKLENINFLYGVKILYHGKEYYLLELFVLINMAQSYDVDEQLKAIMSWLHQFNPILKASNKGLLSFYAGLE
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VYKKIMDEHIIPCQKNKHICKWLTHYQSTLDWYQLVEAGDLSKMDVYWFDPELLFHVLVHFRLINKSLGEKTVNFLDELI
HTYAQNNNEFQIQLRVNILFSRFLKSLDEQQRRKLILTLSLFDPVEAKSKFLTNCIHYVTNRLCQISMHQLVSSPNFFGT
YQCIDSKKLLINKTDVKQVSAILEAFKEMLHSLEERCNLEQLENMLIFLRNISRPILTVAEIEEAQQSARVIDYIGAPT

Sequences:

>Translated_639_residues
MLVQDIRRFLDELRESKTILPCDKRLSAILQEHFSHRDSHEELTSNDIQIVLQCFSERWIADSECDYLLYPSQANQVWIK
LAHVIEPFTDKNYLQILLPHITNQFDFNNLTPLTETVRLENFYLGYDGKTLYRKRGLCERLLDNQFELSTCRTLKTKQCE
VMTIEELTRLYKGKYCNGEFSIDKEKFDNFWDFLYKKAFPRMQSRGEIPLEVLPHLLILIESYYHLKNSGADFKLFTAEI
HKFFKILYQFKLENINFLYGVKILYHGKEYYLLELFVLINMAQSYDVDEQLKAIMSWLHQFNPILKASNKGLLSFYAGLE
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YQCIDSKKLLINKTDVKQVSAILEAFKEMLHSLEERCNLEQLENMLIFLRNISRPILTVAEIEEAQQSARVIDYIGAPT
>Mature_639_residues
MLVQDIRRFLDELRESKTILPCDKRLSAILQEHFSHRDSHEELTSNDIQIVLQCFSERWIADSECDYLLYPSQANQVWIK
LAHVIEPFTDKNYLQILLPHITNQFDFNNLTPLTETVRLENFYLGYDGKTLYRKRGLCERLLDNQFELSTCRTLKTKQCE
VMTIEELTRLYKGKYCNGEFSIDKEKFDNFWDFLYKKAFPRMQSRGEIPLEVLPHLLILIESYYHLKNSGADFKLFTAEI
HKFFKILYQFKLENINFLYGVKILYHGKEYYLLELFVLINMAQSYDVDEQLKAIMSWLHQFNPILKASNKGLLSFYAGLE
PKFHSEGHLEKRVETATDDLLYRIKTFLVSLFVTPFEVFPFSGKTISFWDIKNVIFSEGQEIHNQFTPFIMTNKLDALIA
VYKKIMDEHIIPCQKNKHICKWLTHYQSTLDWYQLVEAGDLSKMDVYWFDPELLFHVLVHFRLINKSLGEKTVNFLDELI
HTYAQNNNEFQIQLRVNILFSRFLKSLDEQQRRKLILTLSLFDPVEAKSKFLTNCIHYVTNRLCQISMHQLVSSPNFFGT
YQCIDSKKLLINKTDVKQVSAILEAFKEMLHSLEERCNLEQLENMLIFLRNISRPILTVAEIEEAQQSARVIDYIGAPT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75527; Mature: 75527

Theoretical pI: Translated: 6.74; Mature: 6.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLVQDIRRFLDELRESKTILPCDKRLSAILQEHFSHRDSHEELTSNDIQIVLQCFSERWI
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCC
ADSECDYLLYPSQANQVWIKLAHVIEPFTDKNYLQILLPHITNQFDFNNLTPLTETVRLE
CCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHEEE
NFYLGYDGKTLYRKRGLCERLLDNQFELSTCRTLKTKQCEVMTIEELTRLYKGKYCNGEF
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCCCCC
SIDKEKFDNFWDFLYKKAFPRMQSRGEIPLEVLPHLLILIESYYHLKNSGADFKLFTAEI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHH
HKFFKILYQFKLENINFLYGVKILYHGKEYYLLELFVLINMAQSYDVDEQLKAIMSWLHQ
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
FNPILKASNKGLLSFYAGLEPKFHSEGHLEKRVETATDDLLYRIKTFLVSLFVTPFEVFP
CCHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEC
FSGKTISFWDIKNVIFSEGQEIHNQFTPFIMTNKLDALIAVYKKIMDEHIIPCQKNKHIC
CCCCEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
KWLTHYQSTLDWYQLVEAGDLSKMDVYWFDPELLFHVLVHFRLINKSLGEKTVNFLDELI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HTYAQNNNEFQIQLRVNILFSRFLKSLDEQQRRKLILTLSLFDPVEAKSKFLTNCIHYVT
HHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
NRLCQISMHQLVSSPNFFGTYQCIDSKKLLINKTDVKQVSAILEAFKEMLHSLEERCNLE
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
QLENMLIFLRNISRPILTVAEIEEAQQSARVIDYIGAPT
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLVQDIRRFLDELRESKTILPCDKRLSAILQEHFSHRDSHEELTSNDIQIVLQCFSERWI
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCC
ADSECDYLLYPSQANQVWIKLAHVIEPFTDKNYLQILLPHITNQFDFNNLTPLTETVRLE
CCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHEEE
NFYLGYDGKTLYRKRGLCERLLDNQFELSTCRTLKTKQCEVMTIEELTRLYKGKYCNGEF
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCCCCC
SIDKEKFDNFWDFLYKKAFPRMQSRGEIPLEVLPHLLILIESYYHLKNSGADFKLFTAEI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHH
HKFFKILYQFKLENINFLYGVKILYHGKEYYLLELFVLINMAQSYDVDEQLKAIMSWLHQ
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
FNPILKASNKGLLSFYAGLEPKFHSEGHLEKRVETATDDLLYRIKTFLVSLFVTPFEVFP
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FSGKTISFWDIKNVIFSEGQEIHNQFTPFIMTNKLDALIAVYKKIMDEHIIPCQKNKHIC
CCCCEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
KWLTHYQSTLDWYQLVEAGDLSKMDVYWFDPELLFHVLVHFRLINKSLGEKTVNFLDELI
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HTYAQNNNEFQIQLRVNILFSRFLKSLDEQQRRKLILTLSLFDPVEAKSKFLTNCIHYVT
HHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
NRLCQISMHQLVSSPNFFGTYQCIDSKKLLINKTDVKQVSAILEAFKEMLHSLEERCNLE
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
QLENMLIFLRNISRPILTVAEIEEAQQSARVIDYIGAPT
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA