| Definition | Legionella pneumophila str. Lens, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006369 |
| Length | 3,345,687 |
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The map label for this gene is yjiV [H]
Identifier: 54295408
GI number: 54295408
Start: 2839769
End: 2846089
Strand: Direct
Name: yjiV [H]
Synonym: lpl2494
Alternate gene names: 54295408
Gene position: 2839769-2846089 (Clockwise)
Preceding gene: 54295407
Following gene: 54295409
Centisome position: 84.88
GC content: 37.56
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CGTATAAGAGATTTGATCCTGAGTGGTTTGAGTTAGCATTTGATTTGACAATTGCACGTACTGTTTCATGCGGTTTAATG AAAATTTAGGGTATAAATAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AATGTGATTGAAATAATTTCTACAACTGTACACAGAAATTATTTCAATCCTCATATTATTATGTATTTTGCAACTAATTT TATCGTCATAGGTAGGTTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2106; Mature: 2106
Protein sequence:
>2106_residues MNKEYFSKLLPQIAERSGSAALSRLGFSHVPLYRHLKQQFSRPFGEVGSFLADPSFEATFGWEIAKLKMCDLANTLLTTD LVRAMDQPPKELAKDYRFASNLYPYMHQLESWQILANEIPQSLVVASGTGSGKTECFMVPILDRLTRLHQEQKSRLIGVR ALFLYPLNALINSQRERLRAWTYVYGENLRFCLFNGNTPNKIPAHLKQEYPSEVMDRDSLRASPPPILVTNATMLEYMLV RTDDAPILEKSQGKLEWVVLDEAHTYIGSQAAELSLLIRRVLHAFGVSPDTVRFVATSATIGDPNGEAGEKLKCFLADVA GVSLDRVHLVSGKRHIPLLPPEEIYTNSLEELSVLSDSDTSKDLYNILARHKTARDIRSSFIESEKKNKEKGGSGMVARL SDVCRNIFGNSDWFTLEQQINALRWLDLLSGTCDKNHSAFLPLRAHLFHQTISGIWACADPNCNEKCGSKLEDKEWPFGQ IYFEMRKHCRCGSPIYELVACDDCGTPHLIAAQRGDQLVPPINIKVIDEFELDIDANEEELNQDDTNVVNDRYNDAESSV LIVNRNINGVIEEVIDKQTRQLIEPTSGNEHLRLRVLGDSGSGLICPCCQGGSHGNRHRKLFQEARIGAPFSLGIILPSL LEFAPDGDDPAEHPYRGRRLLTFNDSRQGTARIAAKLQQESERDRIRGLVYHLALRDGLMQSDFEAKQLKDEIQELENIR EHVKEEGKTHIENLLVNRKKQLASLSKPKPISFEEMSQKLTNQSSDFERMLSHYRNDISYENFKGPEGSLSLARMFLIRE FGRRPKRLNNLESMGLVSVQYPALNNITRAHEGFNLIDWISFLKIALDFFVRAGGSLEIPEKIKSWLGMPFPQTRLVDQD RVDKEKTDRRWPRAYYTLPNGNKRLNYQSTLVRILACALKVDIETSLGADKVDAALTSAWRALTEGSGILYSNSGGRRVL PLSQIAFTPITNAWICPLTRRFLDTTIQDITPYLPLHYTNETVKCQKIEIPLYDQPFGGDASDLAQVIRARDWLSKQESI IQFKEEGLWPVLNDRAIELSPYFVTAEHSAQQPAYRLDRYEKAFKSGDLNLLSCSTTMEMGIDIGGIATVAMNNVPPHPA NYLQRAGRAGRRQEARSISLTLCKSNPHDQLVFSKTDWPFVTALPAPAVSLNSELIIQRHVNSLILKHFFSTQITGSEQD VLKLTCGWFFISEDNNSFAERFIAWCIAFNDANSRLLDGIRQLVRRSRYEGVDAKILIRESGKMMHNLYTSWFKEWDALE RQKINMKCLGVNSPAYKAVQNQLDRTTGEYLLKELATGGFLPAYGFPTHITVFDNLTISQIKRNKLEKEKIKDREDNNYR HRELASRDRITALREYAPGAEVVMDGLVYRSAGITLNWKIPATEKEAQEIQAIRYAWHCDKCNHSGSSLLLDETRFCLEC GTKIKLDDPKYHKTFIEPAGFAVDFLMDPDNDVSTQDFIPVELPWVSANGEWISLPNPALGRYRVTTRGHMFYQSSGLHG KGYAICLACGRAEPMVDENIPNKLQSHYKLRGGNDQNEKSKICIGSHENWAIKPGITLGHQCYTDVLEIQLKSELGIWIK DKEITMTLAVALRSALADLIGIQTTELGCDVKSARTEDNSICRSILIFDRYAAGYSSSASQYIENLFRKARNNLNCPVDC DSACPSCILDFDQRFVSESLNRLTALEVITENWLSTLRLPERYQFFGVNSRVECSNVVEAVLRTSRKFPESNITLFAGGA GDELDFGASNLRNLIYQIAASNRSVSLVIEKDSLSSMDMVERHLLAGLIEYPGRKISLHTVTELPKTKDAIILAEICIKG QTYRWGVNERSAINMGLLWGNTDGPLIVGNKLEPLNLKLESLLVEQLRLSDSTLGDIEIEILKDLDGSLQGFGQRFWKLV SSSSPNVASLFSNTSLDIEAISYHDRYLFSPLPVALLLELITGIRTLVGTSRWNNPFIEITTNNESANLNKRSCFIWDNW LDLEARNGAIINSLDYLGIEGKIKLLDKNKSLHGRMLEVKFSSNYVLTVRLDQGVSYWKANNYSKQKIFNFGDPDLSNQG IQLAELNVDIESNYFPTHVFIKVRQQ
Sequences:
>Translated_2106_residues MNKEYFSKLLPQIAERSGSAALSRLGFSHVPLYRHLKQQFSRPFGEVGSFLADPSFEATFGWEIAKLKMCDLANTLLTTD LVRAMDQPPKELAKDYRFASNLYPYMHQLESWQILANEIPQSLVVASGTGSGKTECFMVPILDRLTRLHQEQKSRLIGVR ALFLYPLNALINSQRERLRAWTYVYGENLRFCLFNGNTPNKIPAHLKQEYPSEVMDRDSLRASPPPILVTNATMLEYMLV RTDDAPILEKSQGKLEWVVLDEAHTYIGSQAAELSLLIRRVLHAFGVSPDTVRFVATSATIGDPNGEAGEKLKCFLADVA GVSLDRVHLVSGKRHIPLLPPEEIYTNSLEELSVLSDSDTSKDLYNILARHKTARDIRSSFIESEKKNKEKGGSGMVARL SDVCRNIFGNSDWFTLEQQINALRWLDLLSGTCDKNHSAFLPLRAHLFHQTISGIWACADPNCNEKCGSKLEDKEWPFGQ IYFEMRKHCRCGSPIYELVACDDCGTPHLIAAQRGDQLVPPINIKVIDEFELDIDANEEELNQDDTNVVNDRYNDAESSV LIVNRNINGVIEEVIDKQTRQLIEPTSGNEHLRLRVLGDSGSGLICPCCQGGSHGNRHRKLFQEARIGAPFSLGIILPSL LEFAPDGDDPAEHPYRGRRLLTFNDSRQGTARIAAKLQQESERDRIRGLVYHLALRDGLMQSDFEAKQLKDEIQELENIR EHVKEEGKTHIENLLVNRKKQLASLSKPKPISFEEMSQKLTNQSSDFERMLSHYRNDISYENFKGPEGSLSLARMFLIRE FGRRPKRLNNLESMGLVSVQYPALNNITRAHEGFNLIDWISFLKIALDFFVRAGGSLEIPEKIKSWLGMPFPQTRLVDQD RVDKEKTDRRWPRAYYTLPNGNKRLNYQSTLVRILACALKVDIETSLGADKVDAALTSAWRALTEGSGILYSNSGGRRVL PLSQIAFTPITNAWICPLTRRFLDTTIQDITPYLPLHYTNETVKCQKIEIPLYDQPFGGDASDLAQVIRARDWLSKQESI IQFKEEGLWPVLNDRAIELSPYFVTAEHSAQQPAYRLDRYEKAFKSGDLNLLSCSTTMEMGIDIGGIATVAMNNVPPHPA NYLQRAGRAGRRQEARSISLTLCKSNPHDQLVFSKTDWPFVTALPAPAVSLNSELIIQRHVNSLILKHFFSTQITGSEQD VLKLTCGWFFISEDNNSFAERFIAWCIAFNDANSRLLDGIRQLVRRSRYEGVDAKILIRESGKMMHNLYTSWFKEWDALE RQKINMKCLGVNSPAYKAVQNQLDRTTGEYLLKELATGGFLPAYGFPTHITVFDNLTISQIKRNKLEKEKIKDREDNNYR HRELASRDRITALREYAPGAEVVMDGLVYRSAGITLNWKIPATEKEAQEIQAIRYAWHCDKCNHSGSSLLLDETRFCLEC GTKIKLDDPKYHKTFIEPAGFAVDFLMDPDNDVSTQDFIPVELPWVSANGEWISLPNPALGRYRVTTRGHMFYQSSGLHG KGYAICLACGRAEPMVDENIPNKLQSHYKLRGGNDQNEKSKICIGSHENWAIKPGITLGHQCYTDVLEIQLKSELGIWIK DKEITMTLAVALRSALADLIGIQTTELGCDVKSARTEDNSICRSILIFDRYAAGYSSSASQYIENLFRKARNNLNCPVDC DSACPSCILDFDQRFVSESLNRLTALEVITENWLSTLRLPERYQFFGVNSRVECSNVVEAVLRTSRKFPESNITLFAGGA GDELDFGASNLRNLIYQIAASNRSVSLVIEKDSLSSMDMVERHLLAGLIEYPGRKISLHTVTELPKTKDAIILAEICIKG QTYRWGVNERSAINMGLLWGNTDGPLIVGNKLEPLNLKLESLLVEQLRLSDSTLGDIEIEILKDLDGSLQGFGQRFWKLV SSSSPNVASLFSNTSLDIEAISYHDRYLFSPLPVALLLELITGIRTLVGTSRWNNPFIEITTNNESANLNKRSCFIWDNW LDLEARNGAIINSLDYLGIEGKIKLLDKNKSLHGRMLEVKFSSNYVLTVRLDQGVSYWKANNYSKQKIFNFGDPDLSNQG IQLAELNVDIESNYFPTHVFIKVRQQ >Mature_2106_residues MNKEYFSKLLPQIAERSGSAALSRLGFSHVPLYRHLKQQFSRPFGEVGSFLADPSFEATFGWEIAKLKMCDLANTLLTTD LVRAMDQPPKELAKDYRFASNLYPYMHQLESWQILANEIPQSLVVASGTGSGKTECFMVPILDRLTRLHQEQKSRLIGVR ALFLYPLNALINSQRERLRAWTYVYGENLRFCLFNGNTPNKIPAHLKQEYPSEVMDRDSLRASPPPILVTNATMLEYMLV RTDDAPILEKSQGKLEWVVLDEAHTYIGSQAAELSLLIRRVLHAFGVSPDTVRFVATSATIGDPNGEAGEKLKCFLADVA GVSLDRVHLVSGKRHIPLLPPEEIYTNSLEELSVLSDSDTSKDLYNILARHKTARDIRSSFIESEKKNKEKGGSGMVARL SDVCRNIFGNSDWFTLEQQINALRWLDLLSGTCDKNHSAFLPLRAHLFHQTISGIWACADPNCNEKCGSKLEDKEWPFGQ IYFEMRKHCRCGSPIYELVACDDCGTPHLIAAQRGDQLVPPINIKVIDEFELDIDANEEELNQDDTNVVNDRYNDAESSV LIVNRNINGVIEEVIDKQTRQLIEPTSGNEHLRLRVLGDSGSGLICPCCQGGSHGNRHRKLFQEARIGAPFSLGIILPSL LEFAPDGDDPAEHPYRGRRLLTFNDSRQGTARIAAKLQQESERDRIRGLVYHLALRDGLMQSDFEAKQLKDEIQELENIR EHVKEEGKTHIENLLVNRKKQLASLSKPKPISFEEMSQKLTNQSSDFERMLSHYRNDISYENFKGPEGSLSLARMFLIRE FGRRPKRLNNLESMGLVSVQYPALNNITRAHEGFNLIDWISFLKIALDFFVRAGGSLEIPEKIKSWLGMPFPQTRLVDQD RVDKEKTDRRWPRAYYTLPNGNKRLNYQSTLVRILACALKVDIETSLGADKVDAALTSAWRALTEGSGILYSNSGGRRVL PLSQIAFTPITNAWICPLTRRFLDTTIQDITPYLPLHYTNETVKCQKIEIPLYDQPFGGDASDLAQVIRARDWLSKQESI IQFKEEGLWPVLNDRAIELSPYFVTAEHSAQQPAYRLDRYEKAFKSGDLNLLSCSTTMEMGIDIGGIATVAMNNVPPHPA NYLQRAGRAGRRQEARSISLTLCKSNPHDQLVFSKTDWPFVTALPAPAVSLNSELIIQRHVNSLILKHFFSTQITGSEQD VLKLTCGWFFISEDNNSFAERFIAWCIAFNDANSRLLDGIRQLVRRSRYEGVDAKILIRESGKMMHNLYTSWFKEWDALE RQKINMKCLGVNSPAYKAVQNQLDRTTGEYLLKELATGGFLPAYGFPTHITVFDNLTISQIKRNKLEKEKIKDREDNNYR HRELASRDRITALREYAPGAEVVMDGLVYRSAGITLNWKIPATEKEAQEIQAIRYAWHCDKCNHSGSSLLLDETRFCLEC GTKIKLDDPKYHKTFIEPAGFAVDFLMDPDNDVSTQDFIPVELPWVSANGEWISLPNPALGRYRVTTRGHMFYQSSGLHG KGYAICLACGRAEPMVDENIPNKLQSHYKLRGGNDQNEKSKICIGSHENWAIKPGITLGHQCYTDVLEIQLKSELGIWIK DKEITMTLAVALRSALADLIGIQTTELGCDVKSARTEDNSICRSILIFDRYAAGYSSSASQYIENLFRKARNNLNCPVDC DSACPSCILDFDQRFVSESLNRLTALEVITENWLSTLRLPERYQFFGVNSRVECSNVVEAVLRTSRKFPESNITLFAGGA GDELDFGASNLRNLIYQIAASNRSVSLVIEKDSLSSMDMVERHLLAGLIEYPGRKISLHTVTELPKTKDAIILAEICIKG QTYRWGVNERSAINMGLLWGNTDGPLIVGNKLEPLNLKLESLLVEQLRLSDSTLGDIEIEILKDLDGSLQGFGQRFWKLV SSSSPNVASLFSNTSLDIEAISYHDRYLFSPLPVALLLELITGIRTLVGTSRWNNPFIEITTNNESANLNKRSCFIWDNW LDLEARNGAIINSLDYLGIEGKIKLLDKNKSLHGRMLEVKFSSNYVLTVRLDQGVSYWKANNYSKQKIFNFGDPDLSNQG IQLAELNVDIESNYFPTHVFIKVRQQ
Specific function: Unknown
COG id: COG1205
COG function: function code R; Distinct helicase family with a unique C-terminal domain including a metal-binding cysteine cluster
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 237969; Mature: 237969
Theoretical pI: Translated: 6.72; Mature: 6.72
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKEYFSKLLPQIAERSGSAALSRLGFSHVPLYRHLKQQFSRPFGEVGSFLADPSFEATF CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCC GWEIAKLKMCDLANTLLTTDLVRAMDQPPKELAKDYRFASNLYPYMHQLESWQILANEIP CCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC QSLVVASGTGSGKTECFMVPILDRLTRLHQEQKSRLIGVRALFLYPLNALINSQRERLRA CEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WTYVYGENLRFCLFNGNTPNKIPAHLKQEYPSEVMDRDSLRASPPPILVTNATMLEYMLV HHEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHEEEE RTDDAPILEKSQGKLEWVVLDEAHTYIGSQAAELSLLIRRVLHAFGVSPDTVRFVATSAT ECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECC IGDPNGEAGEKLKCFLADVAGVSLDRVHLVSGKRHIPLLPPEEIYTNSLEELSVLSDSDT CCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCC SKDLYNILARHKTARDIRSSFIESEKKNKEKGGSGMVARLSDVCRNIFGNSDWFTLEQQI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHH NALRWLDLLSGTCDKNHSAFLPLRAHLFHQTISGIWACADPNCNEKCGSKLEDKEWPFGQ 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