| Definition | Legionella pneumophila str. Lens, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006369 |
| Length | 3,345,687 |
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The map label for this gene is sdeB
Identifier: 54295004
GI number: 54295004
Start: 2354046
End: 2359808
Strand: Direct
Name: sdeB
Synonym: lpl2084
Alternate gene names: NA
Gene position: 2354046-2359808 (Clockwise)
Preceding gene: 54295003
Following gene: 54295005
Centisome position: 70.36
GC content: 39.42
Gene sequence:
>5763_bases ATGCCTAAATACGTAGAAGGGGTAGAATTAACTCAAGAAGGCATGCATGCTATTTTTGCACGGATGGGGCATCCCGAGAT TAAAAGCGGTACTATTTATAACGGAGTACCTACTATTGATCAAGAAGCTATCGACAAGCAAGGTTTTATGCCTGTGTTAA CAGGGGTAGGACCTAAAAGAGACTCCGGTCACTGGATCATGTTAATCAAAGGAGCAGGCAACCAATACCATCTCTTTGAT CCAATGGGTAAAGTTTCAGGTGAAGGCTATCAAGACATTTTAGCCACTCAATTGCCCAAAGGCTCCACCCTTTCTGTTAT CCCCAATGAGCCCGGCTTAAACATGGGGCTATGCGGGTATTGGGTTGCCTCTGTTGGGCTAAAAGCTCGTGCTGAACTCA ACAAGGATAATCCTCCCAATTTAGAAACCATGGGTCAAATCACTACAGATGCAATGAAGGATGAATTAACTGACAATGGT TATCCGAAAATTACTGGCTGGTTAAGGGCTGTCTCTGATAAATTTCCAGCAGGTGATCCTCAACCTGATGCCAAAGCATT AAGAGAGGCTACAGAAAAAGATTTACATATTAATATCCCCTCCTCTGTTCCTCCAGTGAAAGATACTTCTCCTAAGGAGA TCCCTGTTAAACCCACTGCTCCTCAACAACCATCCGTACCCGTTTGGAATGGGTTTTCATTATTCACCGATGACACCGTT CGCACTGCCGCAAAATACGCCTATGACAATTATCTGGGGAAACCTTATACTGGCCCAGTGGAATCAACACCAGCCAATAT TGGCGGACAAATGGTATACCGACAAGTCCATGGCCTTGCTCATACTTTACGGACAATGGCTTATGCAGAAATCATTGTTG AAGAAGCACGTAAAGCAAAATTACGAGGGGAAACATTAGGAAAATTCAAAGATGGCCGTACTATTGCTGACGTCACTCCT 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Upstream 100 bases:
>100_bases TCTTAATACTGTAGTCCTATAATGAAAATAAACATAAGAATATTCACATCTATTAGAATCAATATTTGTATGTACAAATA TCCGTTTGGGAGAAAGTAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGCTTGTTCGATGGTGAAAAATCGAAGATGCTAGCAGATGAGAAGAGAAAGACATTGTGTTTTTATTTTCTCATTCTGT TAACTGCTTTAAAACATATC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Sid -Like Protein; Sid Related Protein-Like; Sid Proteins; SdeA Protein; SdeC Protein; SidE Protein
Number of amino acids: Translated: 1920; Mature: 1919
Protein sequence:
>1920_residues MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHPEIKSGTIYNGVPTIDQEAIDKQGFMPVLTGVGPKRDSGHWIMLIKGAGNQYHLFD PMGKVSGEGYQDILATQLPKGSTLSVIPNEPGLNMGLCGYWVASVGLKARAELNKDNPPNLETMGQITTDAMKDELTDNG YPKITGWLRAVSDKFPAGDPQPDAKALREATEKDLHINIPSSVPPVKDTSPKEIPVKPTAPQQPSVPVWNGFSLFTDDTV RTAAKYAYDNYLGKPYTGPVESTPANIGGQMVYRQVHGLAHTLRTMAYAEIIVEEARKAKLRGETLGKFKDGRTIADVTP EELKKIMIAQAFFVTGRDDEESAKNYAKYHEQSRDAFLKYVKENESTLIPDIFKDQEEVNFYARVIEDKNHDWDSTPAHV LINQGHMVDLVRVKQPPESFLQRYFSSMQRWIGTQATEAVFSIQRQFFHATYEAVTGFDSDNKEPHLVVSGLGRYVIGED GKPIREAPKQGEKEGELKVFSQTYKLKENERFMRVDEFLKLPEIQSTFPGSGKHLEGGMPGMNYMDYWDRLNSRERARCE NDVDFCLKQLQTAHDKAKIDPLKEAFQSSKEKGKRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIHDDHVSINGQKLEEKFFRDLLA KCDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKDTEFHSTDPQAVPVKIGDAWENRIRTKDGDVTQMKHDLIFLMQNDAWYFSRVN AIAQNRDKGSSFKEVLFTALMTPLTNKSLMDTSHAPAPKKVYRGLNLPEEFKNKLINQANVMIANTTDRLFTDHSSEAFK QIKLNDFSQMSGRTCASTTTTYELTKAWDSNVVFEMIDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSIYLPEDVALVPVKVTFDGKT TNGEDRCVFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFIKMQKEKVTHALDAIEKDKGSYNIDEQLKSLRTEMVRQAKLPLREGVF DRLSHRFSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMDMMQNALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLKQ QIEKKIMLQTQIIPALTECSEALDKQNVIEALEALNKLPAEKEIGKAKGIGQELREQITGVKQELTGNLESLQRATTTPI VQDAEKMRVRYETLVTDVTKRVTDFEKIKPANLENYNKAIADLNNMQQELDLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALEKRL QEAQPNLYPSLVEGTTKGIQEIEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKHGESTEPLDMSDLDKLKNQLQG VSQHLAQILLNGAKNSLDKIKDPATLEKEAPYIKRCLDHFAELENTLDSSVKAMKQKEDFNIYKNSLIEKQEKAYPEMLQ LQYKSEALITQLRNLCNIHHDNLVKTREEQQQLLNKTGGILGGFFSQITTAISQAEAKKANEFARFKTELNNDKNDVSQL IQFLVKKKPSELEENLGISKENAEQLHGLLKQLDAKATPIDKLQENTRLIDEISTKMGSKPVSPEHVATTKAREYYQFLL YETTQKIGNFEKVKPLDPESYKKAMSDLNNVQEALQFLRSEKSRIHDDKEKAVEFSDIEALEKRVQNTQPKLLTALLDKT TRDISALVKIPRKLTFEDIKSMTTKLNSYLETLELIRNERIKQHGESPELLDMSDLDSLKGQLQTFNQNLTGMILNATKD GLDRINDRANFNEGEPYVKACLDLLTELEKTLDSSVKGMKQKEDISACRNSLLDKQEKANSGMLDLQSKSKDLVTQLRDI CKIHHGNLAEARRTKLHSLDNQEGGLLGGLWSVTNKLGVTTDTVGIERMQIKMKEQALARFKTELNNDKYDTNQVIAFLA NKKPSELEEGLGISKENAEELHGLLSKLTSKMTSKIEIEENTQLIDEISTKIGTEPVKLELAHTVDEDESDTYRRESGYF
Sequences:
>Translated_1920_residues MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHPEIKSGTIYNGVPTIDQEAIDKQGFMPVLTGVGPKRDSGHWIMLIKGAGNQYHLFD PMGKVSGEGYQDILATQLPKGSTLSVIPNEPGLNMGLCGYWVASVGLKARAELNKDNPPNLETMGQITTDAMKDELTDNG YPKITGWLRAVSDKFPAGDPQPDAKALREATEKDLHINIPSSVPPVKDTSPKEIPVKPTAPQQPSVPVWNGFSLFTDDTV RTAAKYAYDNYLGKPYTGPVESTPANIGGQMVYRQVHGLAHTLRTMAYAEIIVEEARKAKLRGETLGKFKDGRTIADVTP EELKKIMIAQAFFVTGRDDEESAKNYAKYHEQSRDAFLKYVKENESTLIPDIFKDQEEVNFYARVIEDKNHDWDSTPAHV LINQGHMVDLVRVKQPPESFLQRYFSSMQRWIGTQATEAVFSIQRQFFHATYEAVTGFDSDNKEPHLVVSGLGRYVIGED GKPIREAPKQGEKEGELKVFSQTYKLKENERFMRVDEFLKLPEIQSTFPGSGKHLEGGMPGMNYMDYWDRLNSRERARCE NDVDFCLKQLQTAHDKAKIDPLKEAFQSSKEKGKRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIHDDHVSINGQKLEEKFFRDLLA KCDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKDTEFHSTDPQAVPVKIGDAWENRIRTKDGDVTQMKHDLIFLMQNDAWYFSRVN AIAQNRDKGSSFKEVLFTALMTPLTNKSLMDTSHAPAPKKVYRGLNLPEEFKNKLINQANVMIANTTDRLFTDHSSEAFK QIKLNDFSQMSGRTCASTTTTYELTKAWDSNVVFEMIDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSIYLPEDVALVPVKVTFDGKT TNGEDRCVFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFIKMQKEKVTHALDAIEKDKGSYNIDEQLKSLRTEMVRQAKLPLREGVF DRLSHRFSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMDMMQNALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLKQ QIEKKIMLQTQIIPALTECSEALDKQNVIEALEALNKLPAEKEIGKAKGIGQELREQITGVKQELTGNLESLQRATTTPI VQDAEKMRVRYETLVTDVTKRVTDFEKIKPANLENYNKAIADLNNMQQELDLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALEKRL QEAQPNLYPSLVEGTTKGIQEIEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKHGESTEPLDMSDLDKLKNQLQG VSQHLAQILLNGAKNSLDKIKDPATLEKEAPYIKRCLDHFAELENTLDSSVKAMKQKEDFNIYKNSLIEKQEKAYPEMLQ LQYKSEALITQLRNLCNIHHDNLVKTREEQQQLLNKTGGILGGFFSQITTAISQAEAKKANEFARFKTELNNDKNDVSQL IQFLVKKKPSELEENLGISKENAEQLHGLLKQLDAKATPIDKLQENTRLIDEISTKMGSKPVSPEHVATTKAREYYQFLL YETTQKIGNFEKVKPLDPESYKKAMSDLNNVQEALQFLRSEKSRIHDDKEKAVEFSDIEALEKRVQNTQPKLLTALLDKT TRDISALVKIPRKLTFEDIKSMTTKLNSYLETLELIRNERIKQHGESPELLDMSDLDSLKGQLQTFNQNLTGMILNATKD GLDRINDRANFNEGEPYVKACLDLLTELEKTLDSSVKGMKQKEDISACRNSLLDKQEKANSGMLDLQSKSKDLVTQLRDI CKIHHGNLAEARRTKLHSLDNQEGGLLGGLWSVTNKLGVTTDTVGIERMQIKMKEQALARFKTELNNDKYDTNQVIAFLA NKKPSELEEGLGISKENAEELHGLLSKLTSKMTSKIEIEENTQLIDEISTKIGTEPVKLELAHTVDEDESDTYRRESGYF >Mature_1919_residues PKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHPEIKSGTIYNGVPTIDQEAIDKQGFMPVLTGVGPKRDSGHWIMLIKGAGNQYHLFDP MGKVSGEGYQDILATQLPKGSTLSVIPNEPGLNMGLCGYWVASVGLKARAELNKDNPPNLETMGQITTDAMKDELTDNGY PKITGWLRAVSDKFPAGDPQPDAKALREATEKDLHINIPSSVPPVKDTSPKEIPVKPTAPQQPSVPVWNGFSLFTDDTVR TAAKYAYDNYLGKPYTGPVESTPANIGGQMVYRQVHGLAHTLRTMAYAEIIVEEARKAKLRGETLGKFKDGRTIADVTPE ELKKIMIAQAFFVTGRDDEESAKNYAKYHEQSRDAFLKYVKENESTLIPDIFKDQEEVNFYARVIEDKNHDWDSTPAHVL INQGHMVDLVRVKQPPESFLQRYFSSMQRWIGTQATEAVFSIQRQFFHATYEAVTGFDSDNKEPHLVVSGLGRYVIGEDG KPIREAPKQGEKEGELKVFSQTYKLKENERFMRVDEFLKLPEIQSTFPGSGKHLEGGMPGMNYMDYWDRLNSRERARCEN DVDFCLKQLQTAHDKAKIDPLKEAFQSSKEKGKRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIHDDHVSINGQKLEEKFFRDLLAK CDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKDTEFHSTDPQAVPVKIGDAWENRIRTKDGDVTQMKHDLIFLMQNDAWYFSRVNA IAQNRDKGSSFKEVLFTALMTPLTNKSLMDTSHAPAPKKVYRGLNLPEEFKNKLINQANVMIANTTDRLFTDHSSEAFKQ IKLNDFSQMSGRTCASTTTTYELTKAWDSNVVFEMIDPDGLLHPKQVGTHMAGSEDEFSIYLPEDVALVPVKVTFDGKTT NGEDRCVFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFIKMQKEKVTHALDAIEKDKGSYNIDEQLKSLRTEMVRQAKLPLREGVFD RLSHRFSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMDMMQNALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQMDVLKQQ IEKKIMLQTQIIPALTECSEALDKQNVIEALEALNKLPAEKEIGKAKGIGQELREQITGVKQELTGNLESLQRATTTPIV QDAEKMRVRYETLVTDVTKRVTDFEKIKPANLENYNKAIADLNNMQQELDLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALEKRLQ EAQPNLYPSLVEGTTKGIQEIEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKHGESTEPLDMSDLDKLKNQLQGV SQHLAQILLNGAKNSLDKIKDPATLEKEAPYIKRCLDHFAELENTLDSSVKAMKQKEDFNIYKNSLIEKQEKAYPEMLQL QYKSEALITQLRNLCNIHHDNLVKTREEQQQLLNKTGGILGGFFSQITTAISQAEAKKANEFARFKTELNNDKNDVSQLI QFLVKKKPSELEENLGISKENAEQLHGLLKQLDAKATPIDKLQENTRLIDEISTKMGSKPVSPEHVATTKAREYYQFLLY ETTQKIGNFEKVKPLDPESYKKAMSDLNNVQEALQFLRSEKSRIHDDKEKAVEFSDIEALEKRVQNTQPKLLTALLDKTT RDISALVKIPRKLTFEDIKSMTTKLNSYLETLELIRNERIKQHGESPELLDMSDLDSLKGQLQTFNQNLTGMILNATKDG LDRINDRANFNEGEPYVKACLDLLTELEKTLDSSVKGMKQKEDISACRNSLLDKQEKANSGMLDLQSKSKDLVTQLRDIC KIHHGNLAEARRTKLHSLDNQEGGLLGGLWSVTNKLGVTTDTVGIERMQIKMKEQALARFKTELNNDKYDTNQVIAFLAN KKPSELEEGLGISKENAEELHGLLSKLTSKMTSKIEIEENTQLIDEISTKIGTEPVKLELAHTVDEDESDTYRRESGYF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 217328; Mature: 217197
Theoretical pI: Translated: 6.02; Mature: 6.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHPEIKSGTIYNGVPTIDQEAIDKQGFMPVLTGVGPKR CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHCCCCCC DSGHWIMLIKGAGNQYHLFDPMGKVSGEGYQDILATQLPKGSTLSVIPNEPGLNMGLCGY CCCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHH WVASVGLKARAELNKDNPPNLETMGQITTDAMKDELTDNGYPKITGWLRAVSDKFPAGDP HHHHHCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC QPDAKALREATEKDLHINIPSSVPPVKDTSPKEIPVKPTAPQQPSVPVWNGFSLFTDDTV CCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCHHH RTAAKYAYDNYLGKPYTGPVESTPANIGGQMVYRQVHGLAHTLRTMAYAEIIVEEARKAK HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRGETLGKFKDGRTIADVTPEELKKIMIAQAFFVTGRDDEESAKNYAKYHEQSRDAFLKY HCHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKENESTLIPDIFKDQEEVNFYARVIEDKNHDWDSTPAHVLINQGHMVDLVRVKQPPESF HHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCHHHH LQRYFSSMQRWIGTQATEAVFSIQRQFFHATYEAVTGFDSDNKEPHLVVSGLGRYVIGED 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