Definition Legionella pneumophila str. Lens, complete genome.
Accession NC_006369
Length 3,345,687

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The map label for this gene is sdeB

Identifier: 54295004

GI number: 54295004

Start: 2354046

End: 2359808

Strand: Direct

Name: sdeB

Synonym: lpl2084

Alternate gene names: NA

Gene position: 2354046-2359808 (Clockwise)

Preceding gene: 54295003

Following gene: 54295005

Centisome position: 70.36

GC content: 39.42

Gene sequence:

>5763_bases
ATGCCTAAATACGTAGAAGGGGTAGAATTAACTCAAGAAGGCATGCATGCTATTTTTGCACGGATGGGGCATCCCGAGAT
TAAAAGCGGTACTATTTATAACGGAGTACCTACTATTGATCAAGAAGCTATCGACAAGCAAGGTTTTATGCCTGTGTTAA
CAGGGGTAGGACCTAAAAGAGACTCCGGTCACTGGATCATGTTAATCAAAGGAGCAGGCAACCAATACCATCTCTTTGAT
CCAATGGGTAAAGTTTCAGGTGAAGGCTATCAAGACATTTTAGCCACTCAATTGCCCAAAGGCTCCACCCTTTCTGTTAT
CCCCAATGAGCCCGGCTTAAACATGGGGCTATGCGGGTATTGGGTTGCCTCTGTTGGGCTAAAAGCTCGTGCTGAACTCA
ACAAGGATAATCCTCCCAATTTAGAAACCATGGGTCAAATCACTACAGATGCAATGAAGGATGAATTAACTGACAATGGT
TATCCGAAAATTACTGGCTGGTTAAGGGCTGTCTCTGATAAATTTCCAGCAGGTGATCCTCAACCTGATGCCAAAGCATT
AAGAGAGGCTACAGAAAAAGATTTACATATTAATATCCCCTCCTCTGTTCCTCCAGTGAAAGATACTTCTCCTAAGGAGA
TCCCTGTTAAACCCACTGCTCCTCAACAACCATCCGTACCCGTTTGGAATGGGTTTTCATTATTCACCGATGACACCGTT
CGCACTGCCGCAAAATACGCCTATGACAATTATCTGGGGAAACCTTATACTGGCCCAGTGGAATCAACACCAGCCAATAT
TGGCGGACAAATGGTATACCGACAAGTCCATGGCCTTGCTCATACTTTACGGACAATGGCTTATGCAGAAATCATTGTTG
AAGAAGCACGTAAAGCAAAATTACGAGGGGAAACATTAGGAAAATTCAAAGATGGCCGTACTATTGCTGACGTCACTCCT
GAAGAGTTGAAAAAAATTATGATTGCTCAGGCTTTCTTCGTTACAGGAAGAGACGATGAGGAGTCTGCAAAAAATTATGC
CAAGTACCATGAGCAAAGCCGGGATGCTTTCCTAAAATATGTCAAAGAAAATGAATCCACCTTGATTCCTGATATCTTCA
AAGATCAGGAAGAAGTTAATTTTTATGCTCGAGTAATTGAAGATAAAAATCATGATTGGGATTCAACCCCAGCTCATGTA
CTGATTAACCAGGGTCATATGGTCGATTTGGTTCGGGTAAAGCAACCTCCTGAATCATTCTTACAGCGTTATTTCAGTTC
CATGCAACGTTGGATAGGCACCCAGGCCACCGAAGCCGTTTTTTCAATACAAAGACAGTTTTTTCATGCCACCTATGAAG
CAGTAACCGGCTTTGACTCCGATAACAAAGAACCTCATCTGGTTGTTTCCGGACTGGGACGTTATGTCATCGGTGAGGAT
GGTAAGCCCATAAGAGAAGCACCTAAACAAGGAGAAAAAGAAGGAGAGTTAAAAGTTTTCTCACAAACTTATAAATTGAA
AGAAAACGAACGCTTTATGCGAGTCGATGAGTTTTTAAAACTTCCCGAAATCCAAAGTACTTTCCCTGGTTCTGGTAAAC
ATTTAGAAGGCGGAATGCCCGGTATGAATTATATGGATTATTGGGATAGATTAAACTCCAGAGAAAGAGCACGATGTGAA
AATGATGTCGATTTTTGTTTGAAGCAATTACAAACAGCTCATGACAAAGCAAAAATTGATCCTCTGAAAGAAGCATTTCA
ATCCAGTAAAGAGAAAGGAAAAAGACAACCCAATATGGATGAAATTGCGGCCGCCCGCATCATTCAGCAAATCATGGCCA
ATCCTGATTGCATCCATGACGATCATGTGTCCATCAATGGCCAGAAACTGGAAGAAAAATTCTTCCGTGACTTGTTAGCC
AAATGCGATATGGCTGTTGTAGGCTCGCTGCTCAATGACACCGACATCAAAAATATCGATACTTTAATGCGACATGAGAA
AGACACCGAATTTCATTCGACAGATCCCCAAGCAGTTCCAGTGAAAATTGGAGACGCCTGGGAAAATAGAATAAGAACGA
AAGATGGCGACGTCACTCAAATGAAGCATGATTTAATTTTCCTCATGCAAAATGACGCATGGTACTTTAGCCGAGTCAAC
GCCATCGCACAAAACCGGGATAAAGGTTCCTCTTTCAAAGAAGTGTTGTTTACCGCCTTAATGACGCCTTTGACTAATAA
ATCATTAATGGATACATCTCACGCCCCAGCTCCAAAAAAAGTGTATCGCGGACTAAATCTTCCAGAAGAGTTTAAAAATA
AATTAATCAATCAAGCCAATGTGATGATTGCAAACACAACAGATCGACTCTTTACAGACCACTCATCAGAAGCCTTCAAA
CAAATCAAGTTAAATGATTTTAGCCAAATGTCTGGCAGAACCTGTGCCAGTACAACCACAACTTATGAACTTACAAAAGC
CTGGGATTCCAATGTTGTTTTTGAAATGATTGACCCGGATGGTTTACTGCATCCAAAACAAGTAGGAACCCATATGGCTG
GGTCAGAAGATGAATTTTCCATCTATTTACCGGAAGATGTTGCTCTGGTCCCTGTCAAAGTCACTTTTGATGGGAAAACA
ACAAACGGGGAAGATCGGTGTGTCTTTACACTGGTCGCCGTAAAAAGCCCTGACTTTATCCCTCGCCATGAAAGCGGCTA
TGCGGTTGAGCCCTTCATAAAAATGCAAAAAGAGAAAGTCACCCATGCATTGGATGCCATTGAAAAGGATAAAGGCAGCT
ATAACATCGACGAACAACTAAAAAGTCTAAGAACAGAAATGGTCAGGCAAGCCAAATTGCCTCTTAGAGAAGGGGTTTTT
GATAGACTCTCTCATCGTTTTTCTCTGGAAACCAGTGATAACAAAATATCTCCGGAACGCAGAGATTTTCTTAACCAGCA
CGTCATCCCTGTATTACAGGAATGCCATATTGCTCTTAGAACAAACAATATGGACATGATGCAAAATGCTTTGGCAAAAT
TCCCTACCGATAAGCAATGGTCTGCTTTTAAATCAGGGGAAGCAGTCAGAGCCAAAGCTCAAATGGATGTATTAAAGCAA
CAGATTGAAAAGAAAATCATGCTGCAAACTCAAATTATCCCGGCTCTCACGGAATGTAGCGAAGCGCTGGACAAACAAAA
TGTCATAGAAGCATTAGAAGCGCTTAATAAACTGCCTGCAGAAAAGGAAATAGGTAAAGCGAAGGGGATAGGACAAGAAT
TAAGAGAGCAAATCACGGGTGTCAAACAAGAGCTAACCGGAAATCTTGAATCCTTGCAACGTGCAACCACTACTCCAATT
GTACAAGATGCCGAAAAAATGAGAGTACGGTATGAAACCCTTGTCACAGACGTAACCAAACGAGTCACCGACTTTGAAAA
AATCAAACCGGCCAATCTTGAAAACTATAACAAAGCCATTGCTGACTTAAATAACATGCAACAAGAATTAGACCTTCTGC
GCAATGAAAAAATTCGCATGCATACTGACAAAGACAAAGCAGTGGACTTTTCTGACATAGAGGCCTTGGAAAAGAGATTA
CAAGAAGCACAGCCCAATTTATATCCCTCGCTTGTGGAAGGAACAACAAAAGGTATTCAAGAAATTGAAAAAATACCCAA
GTCAATCAGTTTTGACGATGTTAAATCCATGACATCCAAGATTAATGGTTACCTGGAAACCTTGGAATTCATTCGTAATG
AAAGAGTTAAAAAGCATGGTGAATCCACTGAGCCACTGGATATGTCTGATCTGGATAAATTAAAAAATCAACTACAAGGC
GTGAGTCAGCATTTAGCCCAAATTTTATTAAATGGAGCTAAAAACTCACTCGATAAAATCAAGGATCCGGCTACACTCGA
AAAAGAAGCCCCTTATATAAAACGATGTCTTGATCATTTTGCTGAGCTTGAAAACACACTGGATAGTTCAGTAAAAGCAA
TGAAACAAAAAGAAGACTTTAACATCTATAAAAACTCTCTAATAGAGAAGCAGGAGAAAGCCTATCCAGAAATGTTGCAA
TTGCAATACAAGAGTGAAGCATTGATTACACAATTACGTAATCTATGCAATATTCATCATGATAATTTGGTCAAAACGAG
AGAGGAACAACAACAGCTACTGAACAAGACCGGAGGAATATTAGGCGGTTTCTTTAGCCAGATAACGACTGCTATAAGTC
AAGCCGAGGCAAAGAAAGCAAATGAATTTGCAAGATTTAAAACTGAATTAAATAATGACAAAAATGATGTGAGTCAACTT
ATTCAATTTCTGGTAAAGAAAAAACCATCTGAATTGGAAGAAAATTTGGGCATATCAAAAGAAAATGCTGAGCAATTACA
TGGACTGTTAAAGCAACTGGATGCAAAAGCTACTCCAATAGATAAATTGCAGGAAAACACAAGATTAATTGATGAAATAT
CAACCAAAATGGGTAGTAAACCTGTCTCGCCAGAACATGTTGCCACAACAAAAGCGAGAGAATACTATCAATTTCTTCTA
TATGAAACGACACAAAAAATCGGTAACTTTGAAAAGGTCAAACCTTTGGATCCTGAAAGTTATAAAAAGGCTATGTCCGA
CTTAAATAACGTGCAAGAAGCATTACAATTCCTGCGTAGTGAAAAATCCCGAATACATGATGACAAAGAAAAAGCAGTAG
AATTCTCTGACATAGAAGCCTTGGAAAAACGAGTGCAAAATACTCAACCTAAATTACTGACAGCACTCCTGGATAAAACA
ACCAGAGACATCTCAGCATTAGTAAAAATACCCAGGAAATTGACCTTTGAAGATATAAAATCAATGACAACCAAGCTTAA
CAGTTACCTGGAAACCCTGGAATTGATTCGTAATGAAAGAATCAAACAACACGGTGAATCCCCTGAACTTCTGGATATGT
CCGATTTGGATAGTTTAAAAGGTCAATTGCAAACCTTTAATCAAAATTTGACTGGCATGATACTGAATGCTACTAAAGAT
GGTCTGGATAGAATCAATGACAGGGCTAACTTTAATGAAGGAGAACCTTACGTAAAAGCATGTCTTGATCTTTTAACAGA
ACTTGAAAAAACACTGGATAGTTCGGTAAAAGGAATGAAACAAAAAGAAGACATTAGCGCCTGTAGAAATTCTCTCCTTG
ATAAACAGGAAAAAGCCAATTCCGGAATGCTGGATTTGCAATCCAAGAGTAAAGATCTGGTTACCCAATTACGTGATATC
TGTAAAATTCATCACGGTAATTTAGCTGAAGCAAGAAGGACCAAGCTTCACTCACTTGATAATCAGGAAGGAGGATTATT
AGGGGGATTATGGTCTGTTACTAACAAACTAGGTGTTACCACAGACACAGTAGGTATCGAGAGGATGCAAATAAAAATGA
AGGAGCAAGCACTGGCAAGATTTAAAACAGAATTGAATAATGACAAATACGATACGAATCAAGTCATTGCCTTTTTAGCA
AATAAAAAACCATCAGAGCTGGAAGAAGGTTTAGGTATATCGAAAGAAAATGCCGAAGAATTACATGGACTGTTAAGTAA
ACTCACTAGTAAAATGACTTCGAAAATCGAAATTGAAGAAAATACACAGTTAATTGATGAAATTTCAACTAAAATAGGCA
CTGAACCTGTAAAACTCGAATTGGCTCACACGGTAGATGAAGATGAGAGTGATACCTATCGCCGAGAAAGTGGTTACTTT
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTAATACTGTAGTCCTATAATGAAAATAAACATAAGAATATTCACATCTATTAGAATCAATATTTGTATGTACAAATA
TCCGTTTGGGAGAAAGTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTGCTTGTTCGATGGTGAAAAATCGAAGATGCTAGCAGATGAGAAGAGAAAGACATTGTGTTTTTATTTTCTCATTCTGT
TAACTGCTTTAAAACATATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Sid -Like Protein; Sid Related Protein-Like; Sid Proteins; SdeA Protein; SdeC Protein; SidE Protein

Number of amino acids: Translated: 1920; Mature: 1919

Protein sequence:

>1920_residues
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YPKITGWLRAVSDKFPAGDPQPDAKALREATEKDLHINIPSSVPPVKDTSPKEIPVKPTAPQQPSVPVWNGFSLFTDDTV
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Sequences:

>Translated_1920_residues
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>Mature_1919_residues
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Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 217328; Mature: 217197

Theoretical pI: Translated: 6.02; Mature: 6.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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CCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCHHH
RTAAKYAYDNYLGKPYTGPVESTPANIGGQMVYRQVHGLAHTLRTMAYAEIIVEEARKAK
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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EIAAARIIQQIMANPDCIHDDHVSINGQKLEEKFFRDLLAKCDMAVVGSLLNDTDIKNID
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HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCC
VMIANTTDRLFTDHSSEAFKQIKLNDFSQMSGRTCASTTTTYELTKAWDSNVVFEMIDPD
EEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEECCC
GLLHPKQVGTHMAGSEDEFSIYLPEDVALVPVKVTFDGKTTNGEDRCVFTLVAVKSPDFI
CCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCC
PRHESGYAVEPFIKMQKEKVTHALDAIEKDKGSYNIDEQLKSLRTEMVRQAKLPLREGVF
CCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
DRLSHRFSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMDMMQNALAKFPTDKQW
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SAFKSGEAVRAKAQMDVLKQQIEKKIMLQTQIIPALTECSEALDKQNVIEALEALNKLPA
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EKEIGKAKGIGQELREQITGVKQELTGNLESLQRATTTPIVQDAEKMRVRYETLVTDVTK
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RVTDFEKIKPANLENYNKAIADLNNMQQELDLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIEALEKRL
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QEAQPNLYPSLVEGTTKGIQEIEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKHG
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CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
AELENTLDSSVKAMKQKEDFNIYKNSLIEKQEKAYPEMLQLQYKSEALITQLRNLCNIHH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
DNLVKTREEQQQLLNKTGGILGGFFSQITTAISQAEAKKANEFARFKTELNNDKNDVSQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
IQFLVKKKPSELEENLGISKENAEQLHGLLKQLDAKATPIDKLQENTRLIDEISTKMGSK
HHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PVSPEHVATTKAREYYQFLLYETTQKIGNFEKVKPLDPESYKKAMSDLNNVQEALQFLRS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKSRIHDDKEKAVEFSDIEALEKRVQNTQPKLLTALLDKTTRDISALVKIPRKLTFEDIK
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
SMTTKLNSYLETLELIRNERIKQHGESPELLDMSDLDSLKGQLQTFNQNLTGMILNATKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHH
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HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SGMLDLQSKSKDLVTQLRDICKIHHGNLAEARRTKLHSLDNQEGGLLGGLWSVTNKLGVT
CCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCC
TDTVGIERMQIKMKEQALARFKTELNNDKYDTNQVIAFLANKKPSELEEGLGISKENAEE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHH
LHGLLSKLTSKMTSKIEIEENTQLIDEISTKIGTEPVKLELAHTVDEDESDTYRRESGYF
HHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHCCCCCCHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
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