Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 54294584

Identifier: 54294584

GI number: 54294584

Start: 1852250

End: 1853929

Strand: Direct

Name: 54294584

Synonym: lpl1660

Alternate gene names: NA

Gene position: 1852250-1853929 (Clockwise)

Preceding gene: 54294581

Following gene: 54294585

Centisome position: 55.36

GC content: 36.43

Gene sequence:

>1680_bases
ATGTTTTTGGCCAACTGCAATATAGAGGAATTAGTTACAGAGCATATAATACAATTTCTAGCGGATGAAGAATTATCTTT
CTCTGGCTTAAAAGATTTAATTCTGAGTAAAGCCCCAATTCCCTGGATTCATTCCTCAGTAACAGCCGCTCTGCTTAAAT
CCAGAGACTCCGATAAAACAGAAGTAAAAAAAAACCTTGAACAACAATCTTATAAAGCTCAAATGGCTGAAGACAAGATT
CAAAAAGAGCAGGATGAGGCCGAAGCAATAAAAGATAAAAAATTAAAGGAAATTTTAACTCGTGAATTAAACCACATCCC
AACTCAAATCAGTGAACAGCAAACGGAACTCAGATTACTTCATTACAAACTAGAGCGACTCTTTGAAAGTCAAACTAAAG
CCGATGTGATTCAACATCCTGATTCTTCTATGAAAAAGATAACGCCTTCTTCTAATCACTCTGCGTCGATTGAGCGTCTG
CAAAGATCTATTAATGAACGTGAGATTAAAATTCAATCACTTTTTGAACAAGAAATTAACAACAAGATAAAATTAAACGA
AATTGAAAAGCGTGCCAGCGTACGCTCACAACATCACACTAAAAGGGTTAAACGCGCTCAGGCAAGAATTGGATACAATA
GTACTGGAGAGGATATTCTCAGTACATTATCAGGAAAAAATCAATCCATTTTGTTGCGCAGTATTCAAAAACAACATCAT
GCTCTTGAAAAAAAATGCAGTGATCTCATTCAGGAAGCTGATCAGATTAATTACCCATTATTTCTTGAGGAACTTCAGAA
GCATTTAAATAAAAAAAAGCATAACTTATCTTCCCAAGAGGTCGATGCGTTAAAGTCTGTTATAAAATATATAAAGCAAC
ACCTGGAATTTGAGCATGAGGCAATCAATACACAATCCAGTCTCCATATTAAAAAGCAATCCATCAGTTCCCAGATTGTA
AAATTACGAGAACTACAAAATAAACTAAAAACTTTAAAAAACAATAACCCCCATTTGACAGCGGCAAATGAAGAATTAGC
TTCACGTATTTTGGTATTAACGACTATGAAAGAGCATCATGCTAACCTGCGTCATCGCTTGGGTACCCCTGCTTTGCTTT
TATTTGGATTAACGTTTCTGTTTTCAATTCCTCTTATTTTAACCATAAGCGGAGTAATTCCTTTTTTCATTGCGCCTGCG
CTGCTTTATATTTTGGTCTCAGCACCTCCAACCATCCTACTGCTATCAACTCTTGGTGTTGGCATAGCAGCTATTGTTTT
CAGCTTTAAAATGCATTCCAATGAATCAGCTATTAAATCCAATTTGCAAGCGATCGAAACAAACTCCAATCAAATGAGTC
GAAATTCCCAAAATTTAAAATCATTGGAAACGCTTACCATTCCCACTCTGGATATGCAAATCAAAAAAGATGAAAATTTA
AGAGATCAATTAATGCTTTCTTTGCAAAAACTGCAACGTCAAGCTGCTCAAGCTTTCCAGAAAGCAAAAGAAGTAGAGTG
CCTATCCTATGTTAACTCTTCTTTTTTAAATTCCGGCAATACCCAATCCAGTGACCCATCATTCTCCACGCATTCAGAAG
AGAGCGACAACGCACTAAATGACTCGAATGACTCTCTGGAAGCGCTGGAAGAAGAAGCAGTTAATGGGATAGCATCGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGTTGATTGCAGCGATTTTCTTGCCACATCCATCGTGGTGTGTTGCCTGAATATTCAAATTACACTAACATCATTTAAA
AATGATAATCTGGAGTGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTGTCTTTCTATCAATAAAATTTCAATGGAGCAAAACTGAGTATTAACCCCCTGTAATAAAACTGTTAGTCCCAATATT
GATAAATTAGTCTTTATGAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 559; Mature: 559

Protein sequence:

>559_residues
MFLANCNIEELVTEHIIQFLADEELSFSGLKDLILSKAPIPWIHSSVTAALLKSRDSDKTEVKKNLEQQSYKAQMAEDKI
QKEQDEAEAIKDKKLKEILTRELNHIPTQISEQQTELRLLHYKLERLFESQTKADVIQHPDSSMKKITPSSNHSASIERL
QRSINEREIKIQSLFEQEINNKIKLNEIEKRASVRSQHHTKRVKRAQARIGYNSTGEDILSTLSGKNQSILLRSIQKQHH
ALEKKCSDLIQEADQINYPLFLEELQKHLNKKKHNLSSQEVDALKSVIKYIKQHLEFEHEAINTQSSLHIKKQSISSQIV
KLRELQNKLKTLKNNNPHLTAANEELASRILVLTTMKEHHANLRHRLGTPALLLFGLTFLFSIPLILTISGVIPFFIAPA
LLYILVSAPPTILLLSTLGVGIAAIVFSFKMHSNESAIKSNLQAIETNSNQMSRNSQNLKSLETLTIPTLDMQIKKDENL
RDQLMLSLQKLQRQAAQAFQKAKEVECLSYVNSSFLNSGNTQSSDPSFSTHSEESDNALNDSNDSLEALEEEAVNGIAS

Sequences:

>Translated_559_residues
MFLANCNIEELVTEHIIQFLADEELSFSGLKDLILSKAPIPWIHSSVTAALLKSRDSDKTEVKKNLEQQSYKAQMAEDKI
QKEQDEAEAIKDKKLKEILTRELNHIPTQISEQQTELRLLHYKLERLFESQTKADVIQHPDSSMKKITPSSNHSASIERL
QRSINEREIKIQSLFEQEINNKIKLNEIEKRASVRSQHHTKRVKRAQARIGYNSTGEDILSTLSGKNQSILLRSIQKQHH
ALEKKCSDLIQEADQINYPLFLEELQKHLNKKKHNLSSQEVDALKSVIKYIKQHLEFEHEAINTQSSLHIKKQSISSQIV
KLRELQNKLKTLKNNNPHLTAANEELASRILVLTTMKEHHANLRHRLGTPALLLFGLTFLFSIPLILTISGVIPFFIAPA
LLYILVSAPPTILLLSTLGVGIAAIVFSFKMHSNESAIKSNLQAIETNSNQMSRNSQNLKSLETLTIPTLDMQIKKDENL
RDQLMLSLQKLQRQAAQAFQKAKEVECLSYVNSSFLNSGNTQSSDPSFSTHSEESDNALNDSNDSLEALEEEAVNGIAS
>Mature_559_residues
MFLANCNIEELVTEHIIQFLADEELSFSGLKDLILSKAPIPWIHSSVTAALLKSRDSDKTEVKKNLEQQSYKAQMAEDKI
QKEQDEAEAIKDKKLKEILTRELNHIPTQISEQQTELRLLHYKLERLFESQTKADVIQHPDSSMKKITPSSNHSASIERL
QRSINEREIKIQSLFEQEINNKIKLNEIEKRASVRSQHHTKRVKRAQARIGYNSTGEDILSTLSGKNQSILLRSIQKQHH
ALEKKCSDLIQEADQINYPLFLEELQKHLNKKKHNLSSQEVDALKSVIKYIKQHLEFEHEAINTQSSLHIKKQSISSQIV
KLRELQNKLKTLKNNNPHLTAANEELASRILVLTTMKEHHANLRHRLGTPALLLFGLTFLFSIPLILTISGVIPFFIAPA
LLYILVSAPPTILLLSTLGVGIAAIVFSFKMHSNESAIKSNLQAIETNSNQMSRNSQNLKSLETLTIPTLDMQIKKDENL
RDQLMLSLQKLQRQAAQAFQKAKEVECLSYVNSSFLNSGNTQSSDPSFSTHSEESDNALNDSNDSLEALEEEAVNGIAS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63316; Mature: 63316

Theoretical pI: Translated: 7.88; Mature: 7.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFLANCNIEELVTEHIIQFLADEELSFSGLKDLILSKAPIPWIHSSVTAALLKSRDSDKT
CEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
EVKKNLEQQSYKAQMAEDKIQKEQDEAEAIKDKKLKEILTRELNHIPTQISEQQTELRLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
HYKLERLFESQTKADVIQHPDSSMKKITPSSNHSASIERLQRSINEREIKIQSLFEQEIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NKIKLNEIEKRASVRSQHHTKRVKRAQARIGYNSTGEDILSTLSGKNQSILLRSIQKQHH
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
ALEKKCSDLIQEADQINYPLFLEELQKHLNKKKHNLSSQEVDALKSVIKYIKQHLEFEHE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AINTQSSLHIKKQSISSQIVKLRELQNKLKTLKNNNPHLTAANEELASRILVLTTMKEHH
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANLRHRLGTPALLLFGLTFLFSIPLILTISGVIPFFIAPALLYILVSAPPTILLLSTLGV
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
GIAAIVFSFKMHSNESAIKSNLQAIETNSNQMSRNSQNLKSLETLTIPTLDMQIKKDENL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCH
RDQLMLSLQKLQRQAAQAFQKAKEVECLSYVNSSFLNSGNTQSSDPSFSTHSEESDNALN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
DSNDSLEALEEEAVNGIAS
CCCHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MFLANCNIEELVTEHIIQFLADEELSFSGLKDLILSKAPIPWIHSSVTAALLKSRDSDKT
CEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
EVKKNLEQQSYKAQMAEDKIQKEQDEAEAIKDKKLKEILTRELNHIPTQISEQQTELRLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
HYKLERLFESQTKADVIQHPDSSMKKITPSSNHSASIERLQRSINEREIKIQSLFEQEIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NKIKLNEIEKRASVRSQHHTKRVKRAQARIGYNSTGEDILSTLSGKNQSILLRSIQKQHH
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
ALEKKCSDLIQEADQINYPLFLEELQKHLNKKKHNLSSQEVDALKSVIKYIKQHLEFEHE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AINTQSSLHIKKQSISSQIVKLRELQNKLKTLKNNNPHLTAANEELASRILVLTTMKEHH
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANLRHRLGTPALLLFGLTFLFSIPLILTISGVIPFFIAPALLYILVSAPPTILLLSTLGV
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
GIAAIVFSFKMHSNESAIKSNLQAIETNSNQMSRNSQNLKSLETLTIPTLDMQIKKDENL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCH
RDQLMLSLQKLQRQAAQAFQKAKEVECLSYVNSSFLNSGNTQSSDPSFSTHSEESDNALN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
DSNDSLEALEEEAVNGIAS
CCCHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA